logo

Genes within 1Mb (chr6:139617347:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 9.29e-01 0.00721 0.0808 0.288 B L1
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 4.23e-01 0.063 0.0785 0.288 B L1
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 4.91e-02 0.136 0.0688 0.288 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 6.77e-01 0.017 0.0408 0.288 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 325349 sc-eQTL 2.03e-01 0.127 0.0996 0.288 B L1
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 8.07e-01 0.0154 0.063 0.288 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 345985 sc-eQTL 2.96e-02 0.152 0.0692 0.288 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0436 0.0881 0.288 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 1.49e-01 0.106 0.0731 0.288 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0588 0.0576 0.288 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 5.95e-01 0.0226 0.0423 0.288 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 5.35e-01 0.0449 0.0723 0.288 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 377694 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0988 0.071 0.288 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00491 0.0961 0.288 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 3.14e-01 0.0693 0.0686 0.288 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 2.04e-01 0.0822 0.0645 0.288 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 7.87e-01 -0.00997 0.0368 0.288 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 3.11e-01 0.0708 0.0697 0.288 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 377694 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0205 0.0849 0.288 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 1.61e-01 0.136 0.0967 0.279 DC L1
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 7.04e-01 0.0304 0.08 0.279 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 924776 sc-eQTL 4.51e-02 0.178 0.0882 0.279 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 8.51e-02 0.135 0.0782 0.279 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 8.10e-01 0.0186 0.0772 0.279 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0653 0.0915 0.279 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 924799 sc-eQTL 9.90e-01 0.00115 0.0931 0.279 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0801 0.0681 0.288 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 6.05e-01 0.0323 0.0623 0.288 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 924776 sc-eQTL 1.04e-01 0.145 0.0887 0.288 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 6.52e-01 0.0236 0.0522 0.288 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0289 0.068 0.288 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 9.11e-03 -0.186 0.0708 0.288 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 924799 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0226 0.0928 0.288 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 1.75e-02 0.204 0.085 0.285 NK L1
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 1.60e-01 0.105 0.0741 0.285 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 6.96e-01 0.0277 0.0709 0.285 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 1.83e-01 0.0688 0.0516 0.285 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00457 0.0688 0.285 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 5.90e-01 0.0542 0.101 0.288 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0355 0.0728 0.288 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 5.69e-01 0.0446 0.0783 0.288 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 5.99e-01 0.027 0.0513 0.288 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 4.61e-02 0.119 0.0595 0.288 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 9.12e-01 0.0125 0.114 0.293 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 4.54e-01 0.0811 0.108 0.293 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 1.06e-01 0.183 0.112 0.293 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 9.00e-01 0.0128 0.103 0.293 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 325349 sc-eQTL 2.18e-01 0.108 0.0874 0.293 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 8.23e-01 0.0247 0.11 0.293 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 345985 sc-eQTL 2.32e-01 0.132 0.11 0.293 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 4.58e-01 0.0734 0.0986 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 5.16e-01 0.0556 0.0855 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 8.70e-02 0.158 0.0916 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0834 0.0783 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 325349 sc-eQTL 1.83e-01 0.128 0.0958 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 7.43e-01 0.029 0.0885 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 345985 sc-eQTL 1.36e-01 0.143 0.0954 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 1.80e-01 0.137 0.101 0.291 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 5.63e-01 0.051 0.088 0.291 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 3.76e-01 0.0846 0.0953 0.291 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0616 0.0754 0.291 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 325349 sc-eQTL 2.70e-01 -0.106 0.0961 0.291 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 1.35e-01 -0.132 0.0881 0.291 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 345985 sc-eQTL 2.62e-01 0.122 0.108 0.291 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 3.77e-01 0.0826 0.0934 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 5.57e-02 0.156 0.0809 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 3.14e-01 0.0761 0.0753 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 3.64e-01 0.0479 0.0527 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 325349 sc-eQTL 5.09e-01 0.0654 0.0988 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0605 0.0718 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 345985 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0784 0.0942 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0154 0.0924 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 3.47e-01 0.0819 0.0868 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 7.07e-01 0.0312 0.083 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 2.51e-02 0.136 0.0604 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 325349 sc-eQTL 2.04e-01 0.123 0.0964 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 1.33e-01 -0.148 0.0982 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 345985 sc-eQTL 1.11e-01 0.144 0.0901 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 4.57e-01 0.0713 0.0957 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 3.79e-01 0.0852 0.0966 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 1.62e-01 -0.131 0.0935 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 1.17e-01 0.134 0.0851 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 9.47e-01 0.00577 0.086 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 377694 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0301 0.0887 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 2.10e-01 -0.115 0.0915 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 1.84e-01 0.0948 0.0711 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0107 0.0633 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 7.56e-01 0.0133 0.0426 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 3.32e-01 0.0702 0.0722 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 377694 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0612 0.0731 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 4.13e-01 0.0744 0.0906 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 3.02e-01 0.075 0.0724 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0314 0.0688 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 5.94e-01 0.0283 0.0529 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 6.40e-01 0.0369 0.0787 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 377694 sc-eQTL 1.84e-01 -0.113 0.0847 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 5.43e-01 0.0622 0.102 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 6.31e-01 0.0381 0.0794 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0588 0.0864 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 6.59e-01 0.0272 0.0617 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0619 0.0809 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 377694 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0795 0.0846 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 3.81e-01 0.0909 0.104 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 3.87e-01 0.0653 0.0754 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000954 0.0809 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 3.35e-01 0.0631 0.0653 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 6.76e-01 0.0319 0.0761 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 377694 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0499 0.0913 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 9.56e-01 0.00551 0.0989 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 1.70e-01 0.105 0.076 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 6.42e-02 0.141 0.0759 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 3.19e-01 0.04 0.0401 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 2.78e-01 0.088 0.081 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 377694 sc-eQTL 8.90e-01 0.0129 0.0929 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 5.54e-01 0.0657 0.111 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 2.53e-01 0.0926 0.0808 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 4.99e-01 -0.057 0.0842 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 2.38e-01 0.099 0.0837 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 9.66e-01 0.00365 0.0863 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 377694 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0414 0.091 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 5.24e-01 0.0658 0.103 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 6.03e-01 0.0502 0.0965 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 5.70e-01 0.0571 0.1 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 8.01e-01 0.0195 0.0774 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 5.29e-01 0.053 0.0841 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 377694 sc-eQTL 9.78e-01 0.00262 0.0958 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 8.83e-01 0.0163 0.111 0.284 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0596 0.0843 0.284 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 6.17e-01 0.0456 0.0909 0.284 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 1.46e-01 0.0971 0.0665 0.284 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 1.32e-01 0.118 0.0783 0.284 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 7.85e-01 0.0272 0.0997 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 4.50e-01 0.0683 0.0903 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00697 0.0843 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 8.56e-01 0.0142 0.0777 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0108 0.0833 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 2.70e-02 0.204 0.0918 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 2.22e-01 0.0975 0.0796 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 3.25e-01 0.0745 0.0756 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 3.24e-01 0.0505 0.0512 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0246 0.0684 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 9.24e-03 0.275 0.105 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 3.83e-01 0.0868 0.0994 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 4.73e-01 0.0705 0.0982 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 5.72e-01 0.0457 0.0808 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0277 0.0863 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 4.95e-01 0.0652 0.0954 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 3.27e-01 0.0806 0.082 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0818 0.0847 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 4.03e-01 0.0458 0.0546 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 8.63e-01 0.0124 0.0714 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 2.54e-01 0.123 0.107 0.326 PB L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 3.95e-01 0.0997 0.117 0.326 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0534 0.104 0.326 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 6.42e-01 0.0339 0.0727 0.326 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 325349 sc-eQTL 3.85e-01 0.0924 0.106 0.326 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 9.75e-01 0.0025 0.08 0.326 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 345985 sc-eQTL 3.48e-02 0.225 0.105 0.326 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0406 0.102 0.291 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0442 0.0807 0.291 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0296 0.0951 0.291 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 7.70e-01 0.0179 0.0613 0.291 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 7.75e-01 0.0209 0.073 0.291 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0154 0.0987 0.288 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0517 0.0819 0.288 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00713 0.0849 0.288 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 1.06e-01 0.117 0.0719 0.288 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0783 0.0805 0.288 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 377694 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0356 0.0923 0.288 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0115 0.0972 0.293 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 4.75e-01 0.0662 0.0923 0.293 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 924776 sc-eQTL 6.42e-02 0.167 0.0896 0.293 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 7.13e-01 0.0384 0.104 0.293 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 8.81e-01 0.0128 0.0853 0.293 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0301 0.0904 0.293 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 924799 sc-eQTL 7.85e-01 0.0273 0.0998 0.293 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 6.38e-01 0.0353 0.075 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 4.82e-01 0.0436 0.0619 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 924776 sc-eQTL 8.22e-02 0.157 0.0896 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 2.51e-01 0.0926 0.0803 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0543 0.0677 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 3.87e-02 -0.146 0.0702 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 924799 sc-eQTL 5.05e-01 -0.063 0.0944 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 4.06e-02 -0.176 0.0854 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 6.23e-01 0.0359 0.0728 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 924776 sc-eQTL 8.90e-01 0.0128 0.0924 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0704 0.0873 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 9.90e-01 0.000937 0.076 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 1.28e-01 -0.114 0.0748 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 924799 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0415 0.101 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 3.08e-01 0.123 0.12 0.27 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 9.06e-01 0.0135 0.115 0.27 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0706 0.119 0.27 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 9.64e-01 0.00407 0.0894 0.27 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 2.95e-01 0.108 0.103 0.27 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0528 0.102 0.282 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 1.87e-01 0.11 0.0832 0.282 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 924776 sc-eQTL 1.97e-01 0.119 0.0917 0.282 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 8.29e-01 0.0206 0.0952 0.282 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0501 0.0868 0.282 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0614 0.0842 0.282 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 924799 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0331 0.103 0.282 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00239 0.0935 0.281 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 6.23e-01 0.042 0.0854 0.281 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 924776 sc-eQTL 1.85e-01 0.119 0.0894 0.281 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 6.19e-01 0.0337 0.0677 0.281 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 1.77e-01 0.11 0.0812 0.281 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 1.09e-02 -0.175 0.0681 0.281 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 924799 sc-eQTL 9.82e-01 0.00221 0.0998 0.281 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 1.02e-02 0.28 0.108 0.285 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 7.75e-01 0.0267 0.0932 0.285 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 924776 sc-eQTL 8.46e-01 0.0166 0.0852 0.285 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 1.09e-01 0.138 0.0856 0.285 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 1.53e-01 0.134 0.0936 0.285 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0661 0.111 0.285 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 924799 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0146 0.0856 0.285 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 1.03e-01 0.154 0.0939 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 6.37e-01 0.0397 0.0841 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 4.44e-02 0.175 0.0864 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0425 0.0604 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 325349 sc-eQTL 6.30e-01 0.0483 0.1 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00261 0.0849 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 345985 sc-eQTL 5.68e-02 0.187 0.0979 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 8.67e-01 0.0147 0.0875 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 3.77e-02 0.169 0.081 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 2.71e-01 0.0767 0.0696 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 1.05e-01 0.0792 0.0486 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 325349 sc-eQTL 3.97e-01 0.0868 0.102 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0787 0.0743 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 345985 sc-eQTL 8.95e-01 0.0115 0.0875 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0785 0.0686 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 6.20e-01 0.0306 0.0617 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 924776 sc-eQTL 2.09e-01 0.113 0.0899 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 6.74e-01 0.0313 0.0742 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0439 0.0659 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 7.56e-02 -0.128 0.0717 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 924799 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0479 0.0967 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0341 0.0949 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 3.18e-01 0.0809 0.0808 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 924776 sc-eQTL 6.97e-02 0.163 0.0894 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 7.18e-01 0.0203 0.0561 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0105 0.0821 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 2.25e-02 -0.161 0.0699 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 924799 sc-eQTL 9.74e-01 0.0033 0.0996 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 843838 sc-eQTL 1.41e-02 0.218 0.0881 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 482267 sc-eQTL 1.70e-01 0.104 0.0759 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 629086 sc-eQTL 6.63e-01 0.0325 0.0745 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 588602 sc-eQTL 2.03e-01 0.0611 0.0479 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 242699 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0119 0.0695 0.287 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000164442 CITED2 242699 eQTL 0.000307 -0.0872 0.0241 0.0123 0.0134 0.287

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000164442 CITED2 242699 1.29e-06 1.08e-06 2.95e-07 1.2e-06 3.79e-07 5.99e-07 1.5e-06 4.35e-07 1.66e-06 6.2e-07 1.95e-06 8.77e-07 2.46e-06 2.83e-07 5.1e-07 9.54e-07 9.36e-07 1.02e-06 7.2e-07 5.08e-07 7.54e-07 1.92e-06 1.12e-06 5.89e-07 2.25e-06 7.58e-07 9.72e-07 9.43e-07 1.59e-06 1.16e-06 7.79e-07 2.62e-07 2.66e-07 6.06e-07 5.3e-07 5.15e-07 6.99e-07 3.23e-07 4.84e-07 3.15e-07 2.83e-07 1.64e-06 1.93e-07 1.38e-07 3.05e-07 2.15e-07 2.79e-07 1.15e-07 2.07e-07