logo

Genes within 1Mb (chr6:139614707:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 5.41e-01 0.0929 0.152 0.06 B L1
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 5.58e-01 0.0866 0.147 0.06 B L1
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 4.19e-01 0.105 0.13 0.06 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0671 0.0764 0.06 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 322709 sc-eQTL 4.09e-01 0.155 0.187 0.06 B L1
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 9.68e-01 0.00473 0.118 0.06 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 343345 sc-eQTL 2.14e-01 0.163 0.131 0.06 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 7.92e-01 0.0446 0.169 0.06 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 3.60e-01 0.129 0.141 0.06 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0622 0.111 0.06 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 2.53e-02 0.181 0.0803 0.06 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 8.93e-01 0.0186 0.139 0.06 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 375054 sc-eQTL 5.57e-01 0.0803 0.137 0.06 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 8.59e-01 0.0326 0.183 0.06 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 5.84e-01 0.072 0.131 0.06 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 1.41e-01 -0.182 0.123 0.06 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 9.70e-02 0.116 0.0698 0.06 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 3.52e-01 0.124 0.133 0.06 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 375054 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0551 0.162 0.06 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00335 0.185 0.061 DC L1
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 8.97e-01 0.0197 0.153 0.061 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 922136 sc-eQTL 5.57e-01 0.1 0.17 0.061 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 7.25e-01 0.0529 0.15 0.061 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0399 0.147 0.061 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 7.06e-01 0.066 0.175 0.061 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 922159 sc-eQTL 1.88e-01 0.234 0.177 0.061 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0672 0.133 0.06 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 2.98e-02 0.262 0.12 0.06 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 922136 sc-eQTL 3.65e-01 0.157 0.173 0.06 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 8.46e-01 0.0197 0.101 0.06 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 4.66e-02 0.262 0.131 0.06 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 2.19e-01 -0.171 0.139 0.06 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 922159 sc-eQTL 2.84e-01 0.193 0.18 0.06 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 1.29e-03 0.511 0.157 0.06 NK L1
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 1.22e-01 0.214 0.138 0.06 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0983 0.132 0.06 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 4.53e-02 0.192 0.0956 0.06 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 5.97e-01 0.0679 0.128 0.06 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 4.09e-01 0.161 0.194 0.06 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0305 0.141 0.06 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0821 0.151 0.06 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 2.19e-01 0.122 0.0987 0.06 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 9.22e-01 0.0114 0.116 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 3.68e-01 -0.189 0.209 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0183 0.2 0.066 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 2.66e-01 0.233 0.208 0.066 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 9.24e-01 0.0181 0.189 0.066 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 322709 sc-eQTL 3.71e-01 0.145 0.162 0.066 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 4.99e-01 -0.138 0.204 0.066 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 343345 sc-eQTL 5.05e-01 0.136 0.204 0.066 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 5.99e-01 0.0983 0.187 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 3.09e-01 0.164 0.161 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 5.82e-01 -0.096 0.174 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0351 0.149 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 322709 sc-eQTL 4.51e-01 -0.137 0.182 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 5.01e-01 0.113 0.167 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 343345 sc-eQTL 7.91e-02 0.318 0.18 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 4.32e-01 0.149 0.189 0.06 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 4.94e-01 0.112 0.164 0.06 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 3.28e-01 0.174 0.177 0.06 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 4.86e-01 0.0979 0.14 0.06 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 322709 sc-eQTL 5.77e-01 -0.1 0.179 0.06 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 5.11e-01 -0.108 0.165 0.06 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 343345 sc-eQTL 1.53e-01 0.289 0.201 0.06 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 7.11e-01 0.0658 0.177 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 1.11e-01 0.246 0.154 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 4.43e-01 0.11 0.143 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 1.48e-01 -0.144 0.0995 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 322709 sc-eQTL 6.29e-01 0.0906 0.187 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 4.59e-01 0.101 0.136 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 343345 sc-eQTL 6.12e-01 0.0908 0.179 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 8.05e-01 -0.043 0.174 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 5.68e-01 0.0933 0.163 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0501 0.156 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 9.39e-02 -0.192 0.114 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 322709 sc-eQTL 6.23e-02 0.338 0.18 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 5.61e-01 -0.108 0.185 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 343345 sc-eQTL 6.72e-02 0.311 0.169 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0317 0.187 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 1.83e-01 0.251 0.188 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 2.06e-01 -0.232 0.183 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 8.43e-01 0.0331 0.167 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 7.86e-01 0.0457 0.168 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 375054 sc-eQTL 4.13e-01 0.142 0.173 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0583 0.177 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 3.00e-01 0.143 0.137 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 5.94e-01 0.0652 0.122 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 6.53e-02 0.151 0.0816 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 8.60e-01 0.0247 0.14 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 375054 sc-eQTL 5.20e-01 0.0909 0.141 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 8.71e-01 0.0283 0.174 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 7.09e-01 0.0521 0.139 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0525 0.132 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 9.95e-02 0.167 0.101 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 9.99e-01 0.000282 0.151 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 375054 sc-eQTL 8.90e-01 0.0225 0.163 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 1.78e-01 0.26 0.193 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 4.94e-01 0.103 0.151 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 8.13e-01 0.0388 0.164 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 9.38e-03 0.302 0.115 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0883 0.154 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 375054 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0583 0.161 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 2.04e-01 0.255 0.2 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 3.22e-01 0.144 0.146 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 1.36e-01 -0.233 0.156 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 8.61e-02 0.217 0.126 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00183 0.147 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 375054 sc-eQTL 4.39e-01 -0.137 0.176 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 9.19e-01 0.0196 0.193 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 2.92e-01 0.157 0.148 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 2.40e-01 0.175 0.149 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 1.51e-02 0.189 0.0772 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 3.23e-01 0.156 0.158 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 375054 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0934 0.181 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 8.11e-01 -0.052 0.217 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 8.15e-01 0.0372 0.159 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0726 0.165 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0433 0.165 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 4.75e-01 0.121 0.169 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 375054 sc-eQTL 2.73e-01 0.196 0.178 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 4.62e-01 0.147 0.199 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 2.72e-01 0.205 0.186 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 5.37e-01 -0.12 0.194 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 3.58e-01 0.138 0.149 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 9.65e-01 0.00713 0.163 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 375054 sc-eQTL 9.20e-01 0.0185 0.185 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 4.48e-01 -0.163 0.214 0.058 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 6.90e-01 0.065 0.163 0.058 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 4.71e-01 -0.127 0.175 0.058 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 1.18e-01 -0.201 0.128 0.058 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0186 0.152 0.058 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 7.34e-03 0.504 0.186 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 1.39e-01 0.254 0.171 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 1.47e-02 -0.389 0.158 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0634 0.148 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 3.16e-01 0.159 0.158 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 9.27e-02 0.291 0.172 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 5.17e-01 0.0967 0.149 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 5.10e-01 0.0933 0.141 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 6.39e-02 0.177 0.095 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 8.92e-01 0.0174 0.128 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 8.00e-02 0.355 0.202 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 7.96e-01 0.0494 0.19 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 7.01e-03 -0.502 0.184 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 1.35e-02 0.379 0.152 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0785 0.165 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 1.55e-01 0.254 0.178 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 2.21e-03 0.466 0.15 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 9.77e-01 0.00451 0.159 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 2.42e-01 0.12 0.102 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 4.36e-01 0.104 0.133 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 5.01e-01 0.138 0.204 0.067 PB L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 1.85e-01 0.294 0.221 0.067 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 1.36e-01 0.294 0.195 0.067 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0777 0.138 0.067 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 322709 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000303 0.202 0.067 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 6.87e-02 -0.275 0.15 0.067 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 343345 sc-eQTL 2.43e-01 0.238 0.203 0.067 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 3.02e-01 0.208 0.2 0.059 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 3.29e-01 -0.154 0.158 0.059 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 7.11e-01 -0.069 0.186 0.059 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 5.51e-02 0.23 0.119 0.059 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 2.60e-01 -0.161 0.143 0.059 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 2.62e-02 0.425 0.19 0.06 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 3.03e-01 0.164 0.159 0.06 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 4.75e-01 -0.118 0.165 0.06 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 2.26e-03 0.425 0.137 0.06 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0913 0.157 0.06 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 375054 sc-eQTL 5.19e-01 -0.116 0.179 0.06 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 3.54e-01 -0.173 0.186 0.063 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 4.24e-01 -0.142 0.177 0.063 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 922136 sc-eQTL 3.45e-01 0.164 0.173 0.063 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 5.14e-01 0.131 0.2 0.063 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 8.08e-01 0.0398 0.164 0.063 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 5.12e-01 0.114 0.174 0.063 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 922159 sc-eQTL 1.23e-01 0.296 0.191 0.063 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 8.59e-01 0.0258 0.145 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 2.00e-02 0.277 0.118 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 922136 sc-eQTL 7.03e-01 0.0666 0.174 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 4.26e-01 0.124 0.155 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 6.15e-02 0.244 0.13 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 3.86e-01 -0.119 0.137 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 922159 sc-eQTL 3.51e-01 0.17 0.182 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 3.53e-01 -0.155 0.167 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 1.92e-01 0.184 0.141 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 922136 sc-eQTL 4.24e-01 0.143 0.179 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 5.10e-01 -0.111 0.169 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 2.24e-01 0.179 0.147 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 7.52e-01 -0.046 0.146 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 922159 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0984 0.196 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 1.43e-01 0.338 0.23 0.055 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 8.40e-01 0.0444 0.22 0.055 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 4.89e-01 0.157 0.227 0.055 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 1.99e-01 0.219 0.17 0.055 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 6.56e-01 0.0881 0.197 0.055 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0729 0.197 0.06 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 5.98e-01 0.0851 0.161 0.06 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 922136 sc-eQTL 8.77e-02 0.303 0.177 0.06 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 8.55e-01 0.0338 0.184 0.06 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 8.43e-03 0.439 0.165 0.06 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 8.24e-02 -0.282 0.162 0.06 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 922159 sc-eQTL 6.26e-01 0.0973 0.199 0.06 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 7.41e-02 0.318 0.177 0.061 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 4.17e-01 0.132 0.163 0.061 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 922136 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0318 0.171 0.061 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 6.37e-01 0.0609 0.129 0.061 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 1.91e-01 0.203 0.155 0.061 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 1.95e-02 -0.307 0.13 0.061 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 922159 sc-eQTL 1.80e-01 0.255 0.189 0.061 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 2.93e-01 0.215 0.204 0.071 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 2.37e-01 0.205 0.172 0.071 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 922136 sc-eQTL 4.32e-01 0.124 0.158 0.071 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 8.32e-01 0.034 0.16 0.071 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 6.64e-01 0.0761 0.175 0.071 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0249 0.206 0.071 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 922159 sc-eQTL 2.94e-01 -0.167 0.158 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 4.32e-01 0.141 0.179 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 4.47e-01 0.121 0.159 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 5.37e-01 0.102 0.165 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 5.02e-01 0.0768 0.114 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 322709 sc-eQTL 2.79e-01 -0.205 0.189 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 8.33e-01 0.0339 0.161 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 343345 sc-eQTL 7.97e-02 0.327 0.186 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 6.71e-01 0.0711 0.167 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 2.36e-01 0.185 0.156 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 3.63e-01 0.121 0.133 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 9.37e-02 -0.156 0.0927 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 322709 sc-eQTL 4.42e-01 0.15 0.195 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00271 0.142 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 343345 sc-eQTL 3.32e-01 0.162 0.166 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0846 0.134 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 3.67e-02 0.249 0.119 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 922136 sc-eQTL 6.39e-01 0.0822 0.175 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00645 0.144 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 6.91e-02 0.232 0.127 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0947 0.14 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 922159 sc-eQTL 7.10e-01 0.0699 0.188 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 3.57e-01 0.167 0.18 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 3.34e-01 0.149 0.154 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 922136 sc-eQTL 1.32e-01 0.258 0.171 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 7.44e-01 0.0348 0.107 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 7.93e-02 0.274 0.155 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 1.87e-02 -0.315 0.133 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 922159 sc-eQTL 1.76e-01 0.257 0.189 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 841198 sc-eQTL 4.85e-03 0.465 0.163 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 479627 sc-eQTL 1.79e-01 0.191 0.141 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 626446 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0354 0.139 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 585962 sc-eQTL 1.77e-02 0.211 0.0883 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 240059 sc-eQTL 8.30e-01 0.0278 0.129 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135540 NHSL1 922136 eQTL 0.0432 0.111 0.0549 0.0 0.0 0.0496

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina