logo

Genes within 1Mb (chr6:139610132:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 9.40e-01 0.00773 0.103 0.137 B L1
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 4.38e-01 0.0777 0.1 0.137 B L1
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 8.58e-01 0.0158 0.0885 0.137 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 7.57e-01 0.0161 0.052 0.137 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 318134 sc-eQTL 4.51e-01 0.0961 0.127 0.137 B L1
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 3.90e-01 0.069 0.0801 0.137 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 338770 sc-eQTL 3.16e-01 0.0895 0.089 0.137 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 9.24e-01 0.0108 0.113 0.137 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 5.26e-01 0.0597 0.0941 0.137 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00989 0.074 0.137 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 2.81e-02 0.119 0.0537 0.137 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 6.11e-01 0.0472 0.0926 0.137 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 370479 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0295 0.0914 0.137 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 1.70e-01 -0.17 0.123 0.137 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 3.83e-01 0.0774 0.0885 0.137 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 3.74e-01 0.0741 0.0832 0.137 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 3.86e-01 0.0412 0.0474 0.137 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 4.10e-01 0.0743 0.09 0.137 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 370479 sc-eQTL 9.65e-01 0.00486 0.109 0.137 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 4.07e-01 0.105 0.127 0.135 DC L1
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00127 0.105 0.135 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 917561 sc-eQTL 9.70e-01 0.00439 0.116 0.135 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 2.42e-01 0.12 0.103 0.135 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 6.82e-01 0.0414 0.101 0.135 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 9.76e-02 -0.198 0.119 0.135 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 917584 sc-eQTL 6.21e-01 0.0603 0.122 0.135 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0618 0.0899 0.137 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 2.07e-01 0.104 0.0818 0.137 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 917561 sc-eQTL 4.09e-02 0.24 0.117 0.137 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 6.09e-01 0.0353 0.0689 0.137 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 8.99e-02 0.152 0.0891 0.137 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 1.20e-02 -0.237 0.0934 0.137 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 917584 sc-eQTL 5.85e-01 0.067 0.122 0.137 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 2.26e-02 0.254 0.111 0.133 NK L1
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 1.01e-01 0.159 0.0963 0.133 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 4.83e-01 0.0649 0.0922 0.133 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 1.51e-02 0.163 0.0664 0.133 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 7.05e-01 0.0339 0.0895 0.133 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 2.64e-01 0.145 0.13 0.137 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 7.38e-02 -0.168 0.0935 0.137 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 5.31e-01 0.0635 0.101 0.137 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 1.27e-01 0.101 0.066 0.137 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0225 0.0776 0.137 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 6.88e-01 0.057 0.142 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 4.91e-01 0.0931 0.135 0.145 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 1.02e-01 0.231 0.141 0.145 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0589 0.128 0.145 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 318134 sc-eQTL 1.90e-02 0.256 0.108 0.145 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 7.79e-01 0.0388 0.138 0.145 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 338770 sc-eQTL 4.54e-01 0.103 0.138 0.145 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 8.78e-01 0.0195 0.127 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 1.13e-01 0.174 0.109 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 7.85e-01 0.0324 0.118 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0642 0.101 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 318134 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0369 0.124 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 5.66e-01 0.0653 0.114 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 338770 sc-eQTL 1.62e-01 0.172 0.123 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 9.98e-02 0.212 0.128 0.138 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 8.66e-01 0.0188 0.112 0.138 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 6.75e-01 0.0508 0.121 0.138 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000875 0.0958 0.138 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 318134 sc-eQTL 1.63e-01 -0.17 0.122 0.138 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0492 0.112 0.138 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 338770 sc-eQTL 1.86e-01 0.182 0.137 0.138 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 7.11e-01 0.0448 0.121 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 1.72e-01 0.144 0.105 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 6.89e-01 0.039 0.0973 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00481 0.0681 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 318134 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0121 0.127 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 7.39e-01 0.0309 0.0927 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 338770 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0374 0.122 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0699 0.118 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 6.85e-01 0.0452 0.111 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0555 0.106 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 4.20e-01 0.0631 0.0781 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 318134 sc-eQTL 1.02e-01 0.202 0.123 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0314 0.126 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 338770 sc-eQTL 3.23e-01 0.115 0.116 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 4.44e-01 0.0938 0.122 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 5.77e-01 0.069 0.124 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 2.24e-01 -0.146 0.12 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 5.40e-01 0.0672 0.109 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00442 0.11 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 370479 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0514 0.113 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0262 0.118 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 4.84e-01 0.0644 0.0919 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0051 0.0816 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 1.86e-01 0.0726 0.0547 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 7.59e-01 0.0287 0.0933 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 370479 sc-eQTL 7.51e-01 0.03 0.0943 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 4.70e-01 0.0845 0.117 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00339 0.0934 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 5.67e-01 0.0508 0.0885 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 6.46e-02 0.125 0.0675 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0399 0.101 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 370479 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0274 0.109 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0231 0.132 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 8.26e-01 0.0226 0.103 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0675 0.112 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 1.10e-01 0.127 0.0792 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 2.75e-01 -0.114 0.104 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 370479 sc-eQTL 8.76e-02 -0.187 0.109 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 3.75e-01 0.119 0.134 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 2.58e-01 0.11 0.0974 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00928 0.105 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 1.51e-01 0.121 0.0842 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0354 0.0985 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 370479 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0263 0.118 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 2.23e-01 -0.158 0.129 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 6.12e-01 0.0509 0.1 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 5.18e-02 0.195 0.0996 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 1.11e-02 0.133 0.0519 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 1.77e-01 0.144 0.106 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 370479 sc-eQTL 9.96e-01 0.000626 0.122 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0891 0.142 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 2.69e-01 0.115 0.103 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0358 0.108 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 3.33e-01 0.104 0.107 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0312 0.11 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 370479 sc-eQTL 4.41e-01 0.0899 0.116 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 8.96e-01 0.0175 0.134 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 4.86e-01 0.0877 0.126 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 5.60e-01 0.0763 0.131 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 1.21e-01 0.156 0.1 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 8.45e-01 0.0215 0.11 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 370479 sc-eQTL 5.52e-01 0.0742 0.125 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 6.04e-01 0.0746 0.144 0.134 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 3.19e-01 -0.109 0.109 0.134 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 3.99e-01 0.0993 0.117 0.134 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 6.91e-01 0.0344 0.0865 0.134 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0704 0.102 0.134 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 1.64e-01 0.186 0.133 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 3.40e-01 0.116 0.121 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 3.63e-02 -0.236 0.112 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 5.37e-01 0.0644 0.104 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 6.11e-01 0.057 0.112 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 2.48e-01 0.14 0.121 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 1.36e-01 0.155 0.103 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 6.23e-02 0.183 0.0978 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 9.01e-03 0.173 0.0657 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 9.41e-01 0.00654 0.089 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 1.29e-01 0.214 0.14 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 4.57e-01 0.0982 0.132 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0455 0.13 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 2.15e-01 0.133 0.107 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0022 0.114 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 8.01e-02 0.217 0.123 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 2.49e-01 0.123 0.107 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0311 0.11 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 3.74e-01 0.0632 0.0709 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 8.03e-01 0.0231 0.0928 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 3.54e-01 0.127 0.136 0.163 PB L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 7.58e-01 -0.046 0.149 0.163 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 8.45e-01 0.0259 0.132 0.163 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 1.68e-01 0.127 0.0919 0.163 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 318134 sc-eQTL 2.05e-01 0.171 0.134 0.163 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 1.81e-01 -0.136 0.101 0.163 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 338770 sc-eQTL 1.32e-01 0.205 0.135 0.163 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 1.28e-01 0.201 0.132 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 3.21e-01 -0.104 0.104 0.137 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 3.52e-01 -0.114 0.123 0.137 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 1.64e-01 0.11 0.0789 0.137 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0165 0.0944 0.137 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 1.34e-01 0.191 0.127 0.137 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00891 0.106 0.137 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 9.04e-01 0.0133 0.109 0.137 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 1.82e-02 0.219 0.092 0.137 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0488 0.104 0.137 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 370479 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0906 0.119 0.137 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0609 0.127 0.139 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0807 0.121 0.139 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 917561 sc-eQTL 5.80e-01 0.0656 0.118 0.139 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0218 0.136 0.139 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 5.99e-01 0.0587 0.112 0.139 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 3.25e-01 -0.116 0.118 0.139 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 917584 sc-eQTL 8.93e-01 0.0176 0.131 0.139 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 5.85e-01 0.0535 0.0979 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 2.47e-01 0.0936 0.0807 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 917561 sc-eQTL 6.03e-02 0.221 0.117 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 8.30e-01 0.0226 0.105 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 1.38e-01 0.131 0.0881 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 1.63e-02 -0.221 0.0913 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 917584 sc-eQTL 8.62e-01 0.0215 0.123 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0212 0.113 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 4.66e-01 0.0699 0.0957 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 917561 sc-eQTL 1.15e-01 0.191 0.121 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00146 0.115 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 9.12e-02 0.168 0.0992 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0919 0.0987 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 917584 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0428 0.133 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0416 0.155 0.127 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 2.70e-01 -0.162 0.147 0.127 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 5.94e-01 0.0813 0.152 0.127 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 3.77e-01 0.101 0.114 0.127 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 3.57e-01 0.122 0.132 0.127 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 1.45e-01 -0.193 0.132 0.133 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 6.26e-01 0.053 0.109 0.133 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 917561 sc-eQTL 1.57e-01 0.17 0.119 0.133 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0413 0.124 0.133 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 1.08e-01 0.182 0.112 0.133 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 2.16e-01 -0.136 0.109 0.133 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 917584 sc-eQTL 4.35e-01 0.105 0.134 0.133 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 7.02e-01 0.0482 0.126 0.129 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 1.37e-01 0.171 0.114 0.129 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 917561 sc-eQTL 3.29e-01 0.118 0.121 0.129 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 3.53e-01 0.0846 0.0909 0.129 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 3.75e-02 0.227 0.109 0.129 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 3.63e-02 -0.194 0.0921 0.129 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 917584 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0344 0.134 0.129 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 1.09e-01 0.227 0.141 0.141 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 1.70e-01 0.165 0.119 0.141 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 917561 sc-eQTL 6.90e-01 0.0438 0.11 0.141 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 4.68e-01 0.0808 0.111 0.141 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 4.88e-01 0.0845 0.121 0.141 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 2.18e-01 -0.176 0.142 0.141 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 917584 sc-eQTL 3.91e-01 0.0947 0.11 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 1.05e-01 0.197 0.121 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 2.20e-01 0.133 0.108 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 4.36e-01 0.0877 0.112 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0129 0.078 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 318134 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0252 0.129 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 6.18e-01 0.0547 0.109 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 338770 sc-eQTL 1.83e-01 0.169 0.127 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0257 0.113 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 1.88e-01 0.14 0.106 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 7.01e-01 0.0347 0.0903 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 5.44e-01 0.0385 0.0633 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 318134 sc-eQTL 7.67e-01 0.0394 0.133 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 1.00e+00 -1.42e-05 0.0964 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 338770 sc-eQTL 9.30e-01 0.00997 0.113 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 9.51e-01 0.00554 0.0901 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 3.32e-01 0.0784 0.0806 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 917561 sc-eQTL 4.50e-02 0.236 0.117 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00814 0.0971 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 9.59e-02 0.144 0.0858 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 7.65e-02 -0.167 0.0939 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 917584 sc-eQTL 9.91e-01 0.00139 0.127 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 2.89e-01 -0.133 0.125 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 2.33e-01 0.127 0.107 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 917561 sc-eQTL 1.88e-01 0.156 0.118 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 9.40e-01 0.00558 0.074 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 9.54e-02 0.18 0.108 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 7.76e-02 -0.164 0.0927 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 917584 sc-eQTL 5.84e-01 0.0721 0.131 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 836623 sc-eQTL 3.34e-02 0.246 0.115 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 475052 sc-eQTL 1.49e-01 0.143 0.0986 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 621871 sc-eQTL 1.93e-01 0.126 0.0965 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 581387 sc-eQTL 6.30e-03 0.169 0.0614 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 235484 sc-eQTL 9.30e-01 0.00798 0.0903 0.134 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000164442 CITED2 235484 eQTL 0.0215 -0.0752 0.0327 0.00139 0.0 0.132

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina