logo

Genes within 1Mb (chr6:139607541:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 9.32e-01 0.0085 0.1 0.147 B L1
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 6.24e-01 0.0478 0.0974 0.147 B L1
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 1.07e-02 0.218 0.0848 0.147 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00315 0.0506 0.147 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 315543 sc-eQTL 4.11e-01 0.102 0.124 0.147 B L1
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0593 0.078 0.147 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 336179 sc-eQTL 3.65e-02 0.181 0.0859 0.147 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0867 0.11 0.147 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 2.87e-01 0.0982 0.092 0.147 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0707 0.0724 0.147 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 4.64e-02 -0.106 0.0527 0.147 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 6.11e-01 0.0463 0.0908 0.147 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 367888 sc-eQTL 1.38e-01 -0.133 0.0891 0.147 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 2.50e-01 0.137 0.119 0.147 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 5.95e-01 0.0454 0.0853 0.147 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 7.23e-01 0.0285 0.0803 0.147 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0509 0.0456 0.147 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 5.08e-01 0.0576 0.0867 0.147 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 367888 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0133 0.105 0.147 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 3.17e-01 0.119 0.119 0.142 DC L1
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 6.77e-01 0.041 0.0981 0.142 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 914970 sc-eQTL 1.58e-02 0.262 0.108 0.142 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 2.25e-01 0.117 0.0962 0.142 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0143 0.0946 0.142 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 3.76e-01 0.0994 0.112 0.142 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 914993 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0405 0.114 0.142 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0744 0.0867 0.147 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0359 0.0792 0.147 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 914970 sc-eQTL 8.84e-01 0.0166 0.114 0.147 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 6.86e-01 0.0269 0.0665 0.147 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 9.52e-03 -0.223 0.0852 0.147 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 2.15e-01 -0.113 0.0912 0.147 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 914993 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0763 0.118 0.147 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 6.83e-01 0.0435 0.107 0.148 NK L1
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 5.79e-01 0.0512 0.0921 0.148 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 7.30e-01 0.0304 0.0878 0.148 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0515 0.064 0.148 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 9.81e-01 -0.002 0.0852 0.148 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0458 0.124 0.147 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 1.80e-01 0.12 0.0891 0.147 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00379 0.0962 0.147 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 3.25e-01 -0.062 0.0629 0.147 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 7.92e-03 0.195 0.0726 0.147 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0393 0.139 0.148 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 8.90e-01 0.0184 0.132 0.148 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 4.72e-01 0.0997 0.138 0.148 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 7.69e-01 0.0368 0.125 0.148 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 315543 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0627 0.107 0.148 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 9.80e-01 0.00335 0.135 0.148 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 336179 sc-eQTL 3.91e-01 0.116 0.135 0.148 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 4.74e-01 0.087 0.121 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0522 0.105 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 8.10e-02 0.197 0.113 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0879 0.0964 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 315543 sc-eQTL 2.78e-02 0.259 0.117 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 9.70e-01 0.00404 0.109 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 336179 sc-eQTL 4.56e-01 0.088 0.118 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00102 0.124 0.149 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 6.87e-01 0.0432 0.107 0.149 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 5.99e-01 0.0611 0.116 0.149 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 2.50e-01 -0.106 0.0915 0.149 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 315543 sc-eQTL 1.00e+00 -5.5e-06 0.117 0.149 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 1.04e-01 -0.174 0.107 0.149 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 336179 sc-eQTL 6.99e-01 0.0511 0.132 0.149 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 3.55e-01 0.107 0.116 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 2.31e-01 0.121 0.101 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 2.24e-01 0.114 0.0934 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 3.63e-01 0.0597 0.0654 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 315543 sc-eQTL 5.83e-01 0.0675 0.123 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0822 0.0891 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 336179 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0492 0.117 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 6.63e-01 0.0499 0.114 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 2.46e-01 0.125 0.107 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 3.38e-01 0.0984 0.103 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 9.16e-02 0.127 0.0751 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 315543 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0415 0.12 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 1.39e-01 -0.181 0.122 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 336179 sc-eQTL 1.82e-01 0.15 0.112 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 9.37e-01 0.00928 0.118 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 5.93e-01 0.0636 0.119 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0395 0.115 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 1.82e-01 0.14 0.105 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 6.61e-01 0.0463 0.106 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 367888 sc-eQTL 8.36e-01 0.0225 0.109 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 2.02e-01 -0.147 0.115 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 3.41e-01 0.0854 0.0895 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00426 0.0795 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 2.78e-01 -0.058 0.0534 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 2.42e-01 0.106 0.0907 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 367888 sc-eQTL 1.35e-01 -0.137 0.0915 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 9.46e-01 0.00784 0.115 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 1.50e-01 0.132 0.0916 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0948 0.087 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 1.26e-01 -0.102 0.0667 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 2.37e-01 0.118 0.0994 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 367888 sc-eQTL 1.97e-01 -0.139 0.107 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 6.18e-01 0.0639 0.128 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 9.20e-01 0.0101 0.0996 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 6.79e-01 -0.045 0.109 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 1.19e-01 -0.12 0.077 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 7.92e-01 0.0268 0.102 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 367888 sc-eQTL 4.63e-01 0.078 0.106 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 9.88e-01 0.00192 0.128 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 8.91e-01 0.0128 0.0935 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0219 0.1 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0102 0.0809 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 2.80e-01 0.102 0.094 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 367888 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0154 0.113 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 2.96e-01 0.13 0.124 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 1.93e-01 0.124 0.0953 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 7.87e-01 0.026 0.0959 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0509 0.0502 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 8.37e-01 0.021 0.102 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 367888 sc-eQTL 8.83e-01 0.0171 0.116 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 1.86e-01 0.184 0.139 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 5.72e-01 0.0577 0.102 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0507 0.106 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 8.22e-01 0.0238 0.106 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 6.37e-01 0.0513 0.109 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 367888 sc-eQTL 1.78e-01 -0.154 0.114 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 6.55e-01 0.0569 0.127 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0228 0.119 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00799 0.124 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 1.80e-01 -0.128 0.095 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 5.04e-01 0.0693 0.104 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 367888 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0609 0.118 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0567 0.136 0.145 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 9.80e-01 0.00263 0.103 0.145 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0317 0.111 0.145 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 3.91e-01 0.07 0.0815 0.145 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 8.12e-03 0.252 0.0945 0.145 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0562 0.124 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 8.38e-01 0.023 0.112 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 5.94e-02 0.197 0.104 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0396 0.0964 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00288 0.103 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 2.99e-01 0.12 0.115 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 6.21e-01 0.0492 0.0993 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 8.74e-01 -0.015 0.0941 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0689 0.0636 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0223 0.085 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 8.95e-02 0.222 0.13 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 5.72e-01 0.0693 0.122 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 3.80e-01 0.106 0.121 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0436 0.0993 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0229 0.106 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 2.79e-01 -0.128 0.118 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 8.31e-01 0.0217 0.102 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0371 0.105 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 9.96e-01 0.000306 0.0675 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 5.82e-01 0.0485 0.0881 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 9.11e-01 0.0155 0.138 0.159 PB L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 8.79e-02 0.256 0.149 0.159 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 2.91e-01 -0.141 0.133 0.159 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0691 0.0934 0.159 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 315543 sc-eQTL 9.33e-01 0.0115 0.137 0.159 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 1.40e-01 0.152 0.102 0.159 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 336179 sc-eQTL 3.13e-01 0.139 0.137 0.159 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 6.33e-02 -0.237 0.127 0.15 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 8.79e-01 0.0154 0.101 0.15 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 5.58e-01 0.0696 0.119 0.15 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0661 0.0765 0.15 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 5.21e-01 0.0587 0.0912 0.15 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 5.48e-02 -0.237 0.123 0.147 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0735 0.103 0.147 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0277 0.106 0.147 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 2.43e-01 -0.106 0.0904 0.147 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0364 0.101 0.147 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 367888 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0304 0.116 0.147 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 8.06e-01 0.0295 0.12 0.151 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 1.46e-01 0.166 0.113 0.151 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 914970 sc-eQTL 7.99e-02 0.195 0.111 0.151 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 4.16e-01 0.105 0.128 0.151 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0327 0.105 0.151 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 5.05e-01 0.0744 0.111 0.151 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 914993 sc-eQTL 7.69e-01 0.0362 0.123 0.151 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00127 0.0951 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0101 0.0786 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 914970 sc-eQTL 6.76e-01 0.0479 0.114 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 1.75e-01 0.138 0.102 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 5.95e-03 -0.235 0.0845 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 5.56e-01 -0.053 0.0898 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 914993 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0699 0.12 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 2.13e-02 -0.249 0.107 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00468 0.0918 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 914970 sc-eQTL 1.79e-01 -0.156 0.116 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 3.68e-01 -0.099 0.11 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 4.55e-02 -0.191 0.0948 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0868 0.0945 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 914993 sc-eQTL 6.38e-01 -0.06 0.127 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 8.75e-02 0.251 0.146 0.139 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 1.49e-01 0.202 0.139 0.139 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 2.38e-01 -0.171 0.144 0.139 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 4.26e-01 -0.087 0.109 0.139 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 7.90e-01 0.0335 0.126 0.139 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 5.02e-01 0.0857 0.127 0.144 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 3.26e-01 0.103 0.104 0.144 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 914970 sc-eQTL 8.42e-01 0.0231 0.115 0.144 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 4.49e-01 0.0902 0.119 0.144 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 1.03e-02 -0.277 0.107 0.144 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 9.86e-01 0.0018 0.106 0.144 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 914993 sc-eQTL 2.45e-01 -0.15 0.129 0.144 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0444 0.117 0.149 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0419 0.107 0.149 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 914970 sc-eQTL 3.05e-01 0.115 0.112 0.149 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00128 0.0849 0.149 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 9.75e-01 0.00316 0.102 0.149 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0887 0.0866 0.149 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 914993 sc-eQTL 7.95e-01 0.0326 0.125 0.149 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 6.38e-02 0.248 0.133 0.141 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0893 0.114 0.141 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 914970 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0206 0.104 0.141 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 1.11e-01 0.168 0.105 0.141 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 3.80e-01 0.101 0.115 0.141 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 5.04e-01 0.0907 0.135 0.141 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 914993 sc-eQTL 2.99e-01 -0.109 0.104 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 5.98e-01 0.0615 0.116 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 6.43e-01 -0.048 0.103 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 1.14e-01 0.169 0.107 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 3.75e-01 -0.066 0.0743 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 315543 sc-eQTL 3.43e-01 0.117 0.123 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0628 0.104 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 336179 sc-eQTL 2.05e-01 0.154 0.121 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 5.24e-01 0.0695 0.109 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 1.38e-01 0.151 0.101 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 1.79e-01 0.117 0.0865 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 2.62e-01 0.0683 0.0607 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 315543 sc-eQTL 8.22e-01 0.0288 0.128 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0903 0.0924 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 336179 sc-eQTL 6.38e-01 0.0512 0.109 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 1.19e-01 -0.136 0.0869 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0156 0.0784 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 914970 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0304 0.115 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 4.29e-01 0.0746 0.0942 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 4.88e-03 -0.234 0.0823 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0688 0.0917 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 914993 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0711 0.123 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 6.76e-01 0.0497 0.119 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 8.42e-01 0.0202 0.101 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 914970 sc-eQTL 2.65e-01 0.126 0.112 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 5.62e-01 0.0407 0.0701 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 7.84e-02 -0.18 0.102 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 1.78e-01 -0.119 0.0881 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 914993 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0521 0.125 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 834032 sc-eQTL 5.84e-01 0.0606 0.11 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 472461 sc-eQTL 4.96e-01 0.0642 0.0942 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 619280 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0174 0.0921 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 578796 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0612 0.0593 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 232893 sc-eQTL 9.21e-01 0.00849 0.0859 0.149 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000164442 CITED2 232893 eQTL 0.0233 -0.0677 0.0298 0.0015 0.0 0.151
ENSG00000218565 AL592429.1 269523 eQTL 0.0196 0.0676 0.0289 0.0 0.0 0.151

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000164442 CITED2 232893 3.55e-06 2.53e-06 2.74e-07 2.02e-06 4.56e-07 7.7e-07 1.65e-06 3.83e-07 1.79e-06 9.12e-07 2.49e-06 1.42e-06 3.51e-06 1.38e-06 4.72e-07 1.21e-06 9.71e-07 1.85e-06 6.25e-07 7.4e-07 6.59e-07 2.44e-06 1.82e-06 9.16e-07 3.75e-06 1.02e-06 1.21e-06 1.05e-06 1.69e-06 1.82e-06 1.49e-06 2.31e-07 3.71e-07 8.88e-07 1e-06 6.72e-07 6.89e-07 3.25e-07 6.79e-07 2.05e-07 2.8e-07 4.11e-06 4.58e-07 1.86e-07 3.42e-07 3.35e-07 2.28e-07 2.49e-07 2.23e-07