logo

Genes within 1Mb (chr6:139606067:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 9.40e-01 0.00773 0.103 0.137 B L1
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 4.38e-01 0.0777 0.1 0.137 B L1
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 8.58e-01 0.0158 0.0885 0.137 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 7.57e-01 0.0161 0.052 0.137 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 314069 sc-eQTL 4.51e-01 0.0961 0.127 0.137 B L1
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 3.90e-01 0.069 0.0801 0.137 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 334705 sc-eQTL 3.16e-01 0.0895 0.089 0.137 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 9.24e-01 0.0108 0.113 0.137 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 5.26e-01 0.0597 0.0941 0.137 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00989 0.074 0.137 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 2.81e-02 0.119 0.0537 0.137 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 6.11e-01 0.0472 0.0926 0.137 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 366414 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0295 0.0914 0.137 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 1.70e-01 -0.17 0.123 0.137 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 3.83e-01 0.0774 0.0885 0.137 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 3.74e-01 0.0741 0.0832 0.137 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 3.86e-01 0.0412 0.0474 0.137 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 4.10e-01 0.0743 0.09 0.137 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 366414 sc-eQTL 9.65e-01 0.00486 0.109 0.137 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 4.07e-01 0.105 0.127 0.135 DC L1
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00127 0.105 0.135 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 913496 sc-eQTL 9.70e-01 0.00439 0.116 0.135 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 2.42e-01 0.12 0.103 0.135 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 6.82e-01 0.0414 0.101 0.135 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 9.76e-02 -0.198 0.119 0.135 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 913519 sc-eQTL 6.21e-01 0.0603 0.122 0.135 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0618 0.0899 0.137 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 2.07e-01 0.104 0.0818 0.137 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 913496 sc-eQTL 4.09e-02 0.24 0.117 0.137 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 6.09e-01 0.0353 0.0689 0.137 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 8.99e-02 0.152 0.0891 0.137 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 1.20e-02 -0.237 0.0934 0.137 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 913519 sc-eQTL 5.85e-01 0.067 0.122 0.137 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 2.26e-02 0.254 0.111 0.133 NK L1
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 1.01e-01 0.159 0.0963 0.133 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 4.83e-01 0.0649 0.0922 0.133 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 1.51e-02 0.163 0.0664 0.133 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 7.05e-01 0.0339 0.0895 0.133 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 2.64e-01 0.145 0.13 0.137 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 7.38e-02 -0.168 0.0935 0.137 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 5.31e-01 0.0635 0.101 0.137 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 1.27e-01 0.101 0.066 0.137 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0225 0.0776 0.137 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 6.88e-01 0.057 0.142 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 4.91e-01 0.0931 0.135 0.145 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 1.02e-01 0.231 0.141 0.145 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0589 0.128 0.145 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 314069 sc-eQTL 1.90e-02 0.256 0.108 0.145 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 7.79e-01 0.0388 0.138 0.145 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 334705 sc-eQTL 4.54e-01 0.103 0.138 0.145 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 8.78e-01 0.0195 0.127 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 1.13e-01 0.174 0.109 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 7.85e-01 0.0324 0.118 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0642 0.101 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 314069 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0369 0.124 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 5.66e-01 0.0653 0.114 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 334705 sc-eQTL 1.62e-01 0.172 0.123 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 9.98e-02 0.212 0.128 0.138 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 8.66e-01 0.0188 0.112 0.138 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 6.75e-01 0.0508 0.121 0.138 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000875 0.0958 0.138 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 314069 sc-eQTL 1.63e-01 -0.17 0.122 0.138 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0492 0.112 0.138 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 334705 sc-eQTL 1.86e-01 0.182 0.137 0.138 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 7.11e-01 0.0448 0.121 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 1.72e-01 0.144 0.105 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 6.89e-01 0.039 0.0973 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00481 0.0681 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 314069 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0121 0.127 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 7.39e-01 0.0309 0.0927 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 334705 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0374 0.122 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0699 0.118 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 6.85e-01 0.0452 0.111 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0555 0.106 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 4.20e-01 0.0631 0.0781 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 314069 sc-eQTL 1.02e-01 0.202 0.123 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0314 0.126 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 334705 sc-eQTL 3.23e-01 0.115 0.116 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 4.44e-01 0.0938 0.122 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 5.77e-01 0.069 0.124 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 2.24e-01 -0.146 0.12 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 5.40e-01 0.0672 0.109 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00442 0.11 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 366414 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0514 0.113 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0262 0.118 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 4.84e-01 0.0644 0.0919 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0051 0.0816 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 1.86e-01 0.0726 0.0547 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 7.59e-01 0.0287 0.0933 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 366414 sc-eQTL 7.51e-01 0.03 0.0943 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 4.70e-01 0.0845 0.117 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00339 0.0934 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 5.67e-01 0.0508 0.0885 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 6.46e-02 0.125 0.0675 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0399 0.101 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 366414 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0274 0.109 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0231 0.132 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 8.26e-01 0.0226 0.103 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0675 0.112 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 1.10e-01 0.127 0.0792 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 2.75e-01 -0.114 0.104 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 366414 sc-eQTL 8.76e-02 -0.187 0.109 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 3.75e-01 0.119 0.134 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 2.58e-01 0.11 0.0974 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00928 0.105 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 1.51e-01 0.121 0.0842 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0354 0.0985 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 366414 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0263 0.118 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 2.23e-01 -0.158 0.129 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 6.12e-01 0.0509 0.1 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 5.18e-02 0.195 0.0996 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 1.11e-02 0.133 0.0519 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 1.77e-01 0.144 0.106 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 366414 sc-eQTL 9.96e-01 0.000626 0.122 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0891 0.142 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 2.69e-01 0.115 0.103 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0358 0.108 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 3.33e-01 0.104 0.107 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0312 0.11 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 366414 sc-eQTL 4.41e-01 0.0899 0.116 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 8.96e-01 0.0175 0.134 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 4.86e-01 0.0877 0.126 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 5.60e-01 0.0763 0.131 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 1.21e-01 0.156 0.1 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 8.45e-01 0.0215 0.11 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 366414 sc-eQTL 5.52e-01 0.0742 0.125 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 6.04e-01 0.0746 0.144 0.134 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 3.19e-01 -0.109 0.109 0.134 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 3.99e-01 0.0993 0.117 0.134 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 6.91e-01 0.0344 0.0865 0.134 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0704 0.102 0.134 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 1.64e-01 0.186 0.133 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 3.40e-01 0.116 0.121 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 3.63e-02 -0.236 0.112 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 5.37e-01 0.0644 0.104 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 6.11e-01 0.057 0.112 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 2.48e-01 0.14 0.121 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 1.36e-01 0.155 0.103 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 6.23e-02 0.183 0.0978 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 9.01e-03 0.173 0.0657 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 9.41e-01 0.00654 0.089 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 1.29e-01 0.214 0.14 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 4.57e-01 0.0982 0.132 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0455 0.13 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 2.15e-01 0.133 0.107 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0022 0.114 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 8.01e-02 0.217 0.123 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 2.49e-01 0.123 0.107 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0311 0.11 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 3.74e-01 0.0632 0.0709 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 8.03e-01 0.0231 0.0928 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 3.54e-01 0.127 0.136 0.163 PB L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 7.58e-01 -0.046 0.149 0.163 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 8.45e-01 0.0259 0.132 0.163 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 1.68e-01 0.127 0.0919 0.163 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 314069 sc-eQTL 2.05e-01 0.171 0.134 0.163 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 1.81e-01 -0.136 0.101 0.163 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 334705 sc-eQTL 1.32e-01 0.205 0.135 0.163 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 1.28e-01 0.201 0.132 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 3.21e-01 -0.104 0.104 0.137 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 3.52e-01 -0.114 0.123 0.137 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 1.64e-01 0.11 0.0789 0.137 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0165 0.0944 0.137 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 1.34e-01 0.191 0.127 0.137 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00891 0.106 0.137 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 9.04e-01 0.0133 0.109 0.137 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 1.82e-02 0.219 0.092 0.137 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0488 0.104 0.137 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 366414 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0906 0.119 0.137 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0609 0.127 0.139 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0807 0.121 0.139 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 913496 sc-eQTL 5.80e-01 0.0656 0.118 0.139 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0218 0.136 0.139 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 5.99e-01 0.0587 0.112 0.139 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 3.25e-01 -0.116 0.118 0.139 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 913519 sc-eQTL 8.93e-01 0.0176 0.131 0.139 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 5.85e-01 0.0535 0.0979 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 2.47e-01 0.0936 0.0807 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 913496 sc-eQTL 6.03e-02 0.221 0.117 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 8.30e-01 0.0226 0.105 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 1.38e-01 0.131 0.0881 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 1.63e-02 -0.221 0.0913 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 913519 sc-eQTL 8.62e-01 0.0215 0.123 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0212 0.113 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 4.66e-01 0.0699 0.0957 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 913496 sc-eQTL 1.15e-01 0.191 0.121 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00146 0.115 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 9.12e-02 0.168 0.0992 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0919 0.0987 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 913519 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0428 0.133 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0416 0.155 0.127 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 2.70e-01 -0.162 0.147 0.127 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 5.94e-01 0.0813 0.152 0.127 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 3.77e-01 0.101 0.114 0.127 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 3.57e-01 0.122 0.132 0.127 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 1.45e-01 -0.193 0.132 0.133 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 6.26e-01 0.053 0.109 0.133 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 913496 sc-eQTL 1.57e-01 0.17 0.119 0.133 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0413 0.124 0.133 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 1.08e-01 0.182 0.112 0.133 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 2.16e-01 -0.136 0.109 0.133 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 913519 sc-eQTL 4.35e-01 0.105 0.134 0.133 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 7.02e-01 0.0482 0.126 0.129 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 1.37e-01 0.171 0.114 0.129 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 913496 sc-eQTL 3.29e-01 0.118 0.121 0.129 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 3.53e-01 0.0846 0.0909 0.129 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 3.75e-02 0.227 0.109 0.129 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 3.63e-02 -0.194 0.0921 0.129 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 913519 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0344 0.134 0.129 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 1.09e-01 0.227 0.141 0.141 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 1.70e-01 0.165 0.119 0.141 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 913496 sc-eQTL 6.90e-01 0.0438 0.11 0.141 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 4.68e-01 0.0808 0.111 0.141 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 4.88e-01 0.0845 0.121 0.141 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 2.18e-01 -0.176 0.142 0.141 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 913519 sc-eQTL 3.91e-01 0.0947 0.11 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 1.05e-01 0.197 0.121 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 2.20e-01 0.133 0.108 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 4.36e-01 0.0877 0.112 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0129 0.078 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 314069 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0252 0.129 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 6.18e-01 0.0547 0.109 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 334705 sc-eQTL 1.83e-01 0.169 0.127 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0257 0.113 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 1.88e-01 0.14 0.106 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 7.01e-01 0.0347 0.0903 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 5.44e-01 0.0385 0.0633 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 314069 sc-eQTL 7.67e-01 0.0394 0.133 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 1.00e+00 -1.42e-05 0.0964 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 334705 sc-eQTL 9.30e-01 0.00997 0.113 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 9.51e-01 0.00554 0.0901 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 3.32e-01 0.0784 0.0806 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 913496 sc-eQTL 4.50e-02 0.236 0.117 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00814 0.0971 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 9.59e-02 0.144 0.0858 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 7.65e-02 -0.167 0.0939 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 913519 sc-eQTL 9.91e-01 0.00139 0.127 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 2.89e-01 -0.133 0.125 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 2.33e-01 0.127 0.107 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 913496 sc-eQTL 1.88e-01 0.156 0.118 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 9.40e-01 0.00558 0.074 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 9.54e-02 0.18 0.108 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 7.76e-02 -0.164 0.0927 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 913519 sc-eQTL 5.84e-01 0.0721 0.131 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 832558 sc-eQTL 3.34e-02 0.246 0.115 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 470987 sc-eQTL 1.49e-01 0.143 0.0986 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 617806 sc-eQTL 1.93e-01 0.126 0.0965 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 577322 sc-eQTL 6.30e-03 0.169 0.0614 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 231419 sc-eQTL 9.30e-01 0.00798 0.0903 0.134 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000164442 CITED2 231419 eQTL 0.0195 -0.0758 0.0324 0.00147 0.0 0.132

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000231329 \N 366414 1.26e-06 6.81e-07 1.48e-07 4.34e-07 9.23e-08 2.67e-07 6.29e-07 2.03e-07 6.71e-07 3.04e-07 9.92e-07 4.94e-07 1.05e-06 1.57e-07 3.1e-07 3.57e-07 5.06e-07 4.25e-07 2.65e-07 1.91e-07 2.51e-07 5.2e-07 4.4e-07 2.65e-07 1.2e-06 2.49e-07 4e-07 3.78e-07 5.43e-07 7.42e-07 3.93e-07 5.35e-08 5.78e-08 2.06e-07 3.5e-07 1.82e-07 1.11e-07 1.07e-07 7.81e-08 2.24e-08 1.01e-07 7.7e-07 4.41e-08 1.04e-08 1.96e-07 2.07e-08 1.27e-07 2.31e-08 6.46e-08