logo

Genes within 1Mb (chr6:139598800:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 5.41e-01 0.0929 0.152 0.06 B L1
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 5.58e-01 0.0866 0.147 0.06 B L1
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 4.19e-01 0.105 0.13 0.06 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0671 0.0764 0.06 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 306802 sc-eQTL 4.09e-01 0.155 0.187 0.06 B L1
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 9.68e-01 0.00473 0.118 0.06 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 327438 sc-eQTL 2.14e-01 0.163 0.131 0.06 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 7.92e-01 0.0446 0.169 0.06 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 3.60e-01 0.129 0.141 0.06 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0622 0.111 0.06 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 2.53e-02 0.181 0.0803 0.06 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 8.93e-01 0.0186 0.139 0.06 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 359147 sc-eQTL 5.57e-01 0.0803 0.137 0.06 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 8.59e-01 0.0326 0.183 0.06 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 5.84e-01 0.072 0.131 0.06 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 1.41e-01 -0.182 0.123 0.06 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 9.70e-02 0.116 0.0698 0.06 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 3.52e-01 0.124 0.133 0.06 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 359147 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0551 0.162 0.06 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00335 0.185 0.061 DC L1
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 8.97e-01 0.0197 0.153 0.061 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 906229 sc-eQTL 5.57e-01 0.1 0.17 0.061 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 7.25e-01 0.0529 0.15 0.061 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0399 0.147 0.061 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 7.06e-01 0.066 0.175 0.061 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 906252 sc-eQTL 1.88e-01 0.234 0.177 0.061 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0672 0.133 0.06 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 2.98e-02 0.262 0.12 0.06 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 906229 sc-eQTL 3.65e-01 0.157 0.173 0.06 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 8.46e-01 0.0197 0.101 0.06 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 4.66e-02 0.262 0.131 0.06 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 2.19e-01 -0.171 0.139 0.06 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 906252 sc-eQTL 2.84e-01 0.193 0.18 0.06 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 1.29e-03 0.511 0.157 0.06 NK L1
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 1.22e-01 0.214 0.138 0.06 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0983 0.132 0.06 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 4.53e-02 0.192 0.0956 0.06 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 5.97e-01 0.0679 0.128 0.06 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 4.09e-01 0.161 0.194 0.06 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0305 0.141 0.06 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0821 0.151 0.06 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 2.19e-01 0.122 0.0987 0.06 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 9.22e-01 0.0114 0.116 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 3.68e-01 -0.189 0.209 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0183 0.2 0.066 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 2.66e-01 0.233 0.208 0.066 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 9.24e-01 0.0181 0.189 0.066 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 306802 sc-eQTL 3.71e-01 0.145 0.162 0.066 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 4.99e-01 -0.138 0.204 0.066 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 327438 sc-eQTL 5.05e-01 0.136 0.204 0.066 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 5.99e-01 0.0983 0.187 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 3.09e-01 0.164 0.161 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 5.82e-01 -0.096 0.174 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0351 0.149 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 306802 sc-eQTL 4.51e-01 -0.137 0.182 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 5.01e-01 0.113 0.167 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 327438 sc-eQTL 7.91e-02 0.318 0.18 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 4.32e-01 0.149 0.189 0.06 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 4.94e-01 0.112 0.164 0.06 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 3.28e-01 0.174 0.177 0.06 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 4.86e-01 0.0979 0.14 0.06 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 306802 sc-eQTL 5.77e-01 -0.1 0.179 0.06 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 5.11e-01 -0.108 0.165 0.06 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 327438 sc-eQTL 1.53e-01 0.289 0.201 0.06 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 7.11e-01 0.0658 0.177 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 1.11e-01 0.246 0.154 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 4.43e-01 0.11 0.143 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 1.48e-01 -0.144 0.0995 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 306802 sc-eQTL 6.29e-01 0.0906 0.187 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 4.59e-01 0.101 0.136 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 327438 sc-eQTL 6.12e-01 0.0908 0.179 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 8.05e-01 -0.043 0.174 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 5.68e-01 0.0933 0.163 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0501 0.156 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 9.39e-02 -0.192 0.114 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 306802 sc-eQTL 6.23e-02 0.338 0.18 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 5.61e-01 -0.108 0.185 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 327438 sc-eQTL 6.72e-02 0.311 0.169 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0317 0.187 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 1.83e-01 0.251 0.188 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 2.06e-01 -0.232 0.183 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 8.43e-01 0.0331 0.167 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 7.86e-01 0.0457 0.168 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 359147 sc-eQTL 4.13e-01 0.142 0.173 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0583 0.177 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 3.00e-01 0.143 0.137 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 5.94e-01 0.0652 0.122 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 6.53e-02 0.151 0.0816 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 8.60e-01 0.0247 0.14 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 359147 sc-eQTL 5.20e-01 0.0909 0.141 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 8.71e-01 0.0283 0.174 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 7.09e-01 0.0521 0.139 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0525 0.132 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 9.95e-02 0.167 0.101 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 9.99e-01 0.000282 0.151 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 359147 sc-eQTL 8.90e-01 0.0225 0.163 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 1.78e-01 0.26 0.193 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 4.94e-01 0.103 0.151 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 8.13e-01 0.0388 0.164 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 9.38e-03 0.302 0.115 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0883 0.154 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 359147 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0583 0.161 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 2.04e-01 0.255 0.2 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 3.22e-01 0.144 0.146 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 1.36e-01 -0.233 0.156 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 8.61e-02 0.217 0.126 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00183 0.147 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 359147 sc-eQTL 4.39e-01 -0.137 0.176 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 9.19e-01 0.0196 0.193 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 2.92e-01 0.157 0.148 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 2.40e-01 0.175 0.149 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 1.51e-02 0.189 0.0772 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 3.23e-01 0.156 0.158 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 359147 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0934 0.181 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 8.11e-01 -0.052 0.217 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 8.15e-01 0.0372 0.159 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0726 0.165 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0433 0.165 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 4.75e-01 0.121 0.169 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 359147 sc-eQTL 2.73e-01 0.196 0.178 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 4.62e-01 0.147 0.199 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 2.72e-01 0.205 0.186 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 5.37e-01 -0.12 0.194 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 3.58e-01 0.138 0.149 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 9.65e-01 0.00713 0.163 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 359147 sc-eQTL 9.20e-01 0.0185 0.185 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 4.48e-01 -0.163 0.214 0.058 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 6.90e-01 0.065 0.163 0.058 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 4.71e-01 -0.127 0.175 0.058 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 1.18e-01 -0.201 0.128 0.058 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0186 0.152 0.058 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 7.34e-03 0.504 0.186 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 1.39e-01 0.254 0.171 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 1.47e-02 -0.389 0.158 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0634 0.148 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 3.16e-01 0.159 0.158 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 9.27e-02 0.291 0.172 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 5.17e-01 0.0967 0.149 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 5.10e-01 0.0933 0.141 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 6.39e-02 0.177 0.095 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 8.92e-01 0.0174 0.128 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 8.00e-02 0.355 0.202 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 7.96e-01 0.0494 0.19 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 7.01e-03 -0.502 0.184 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 1.35e-02 0.379 0.152 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0785 0.165 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 1.55e-01 0.254 0.178 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 2.21e-03 0.466 0.15 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 9.77e-01 0.00451 0.159 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 2.42e-01 0.12 0.102 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 4.36e-01 0.104 0.133 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 5.01e-01 0.138 0.204 0.067 PB L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 1.85e-01 0.294 0.221 0.067 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 1.36e-01 0.294 0.195 0.067 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0777 0.138 0.067 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 306802 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000303 0.202 0.067 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 6.87e-02 -0.275 0.15 0.067 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 327438 sc-eQTL 2.43e-01 0.238 0.203 0.067 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 3.02e-01 0.208 0.2 0.059 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 3.29e-01 -0.154 0.158 0.059 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 7.11e-01 -0.069 0.186 0.059 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 5.51e-02 0.23 0.119 0.059 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 2.60e-01 -0.161 0.143 0.059 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 2.62e-02 0.425 0.19 0.06 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 3.03e-01 0.164 0.159 0.06 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 4.75e-01 -0.118 0.165 0.06 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 2.26e-03 0.425 0.137 0.06 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0913 0.157 0.06 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 359147 sc-eQTL 5.19e-01 -0.116 0.179 0.06 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 3.54e-01 -0.173 0.186 0.063 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 4.24e-01 -0.142 0.177 0.063 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 906229 sc-eQTL 3.45e-01 0.164 0.173 0.063 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 5.14e-01 0.131 0.2 0.063 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 8.08e-01 0.0398 0.164 0.063 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 5.12e-01 0.114 0.174 0.063 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 906252 sc-eQTL 1.23e-01 0.296 0.191 0.063 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 8.59e-01 0.0258 0.145 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 2.00e-02 0.277 0.118 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 906229 sc-eQTL 7.03e-01 0.0666 0.174 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 4.26e-01 0.124 0.155 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 6.15e-02 0.244 0.13 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 3.86e-01 -0.119 0.137 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 906252 sc-eQTL 3.51e-01 0.17 0.182 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 3.53e-01 -0.155 0.167 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 1.92e-01 0.184 0.141 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 906229 sc-eQTL 4.24e-01 0.143 0.179 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 5.10e-01 -0.111 0.169 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 2.24e-01 0.179 0.147 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 7.52e-01 -0.046 0.146 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 906252 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0984 0.196 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 1.43e-01 0.338 0.23 0.055 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 8.40e-01 0.0444 0.22 0.055 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 4.89e-01 0.157 0.227 0.055 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 1.99e-01 0.219 0.17 0.055 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 6.56e-01 0.0881 0.197 0.055 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0729 0.197 0.06 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 5.98e-01 0.0851 0.161 0.06 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 906229 sc-eQTL 8.77e-02 0.303 0.177 0.06 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 8.55e-01 0.0338 0.184 0.06 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 8.43e-03 0.439 0.165 0.06 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 8.24e-02 -0.282 0.162 0.06 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 906252 sc-eQTL 6.26e-01 0.0973 0.199 0.06 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 7.41e-02 0.318 0.177 0.061 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 4.17e-01 0.132 0.163 0.061 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 906229 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0318 0.171 0.061 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 6.37e-01 0.0609 0.129 0.061 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 1.91e-01 0.203 0.155 0.061 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 1.95e-02 -0.307 0.13 0.061 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 906252 sc-eQTL 1.80e-01 0.255 0.189 0.061 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 2.93e-01 0.215 0.204 0.071 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 2.37e-01 0.205 0.172 0.071 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 906229 sc-eQTL 4.32e-01 0.124 0.158 0.071 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 8.32e-01 0.034 0.16 0.071 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 6.64e-01 0.0761 0.175 0.071 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0249 0.206 0.071 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 906252 sc-eQTL 2.94e-01 -0.167 0.158 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 4.32e-01 0.141 0.179 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 4.47e-01 0.121 0.159 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 5.37e-01 0.102 0.165 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 5.02e-01 0.0768 0.114 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 306802 sc-eQTL 2.79e-01 -0.205 0.189 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 8.33e-01 0.0339 0.161 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 327438 sc-eQTL 7.97e-02 0.327 0.186 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 6.71e-01 0.0711 0.167 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 2.36e-01 0.185 0.156 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 3.63e-01 0.121 0.133 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 9.37e-02 -0.156 0.0927 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 306802 sc-eQTL 4.42e-01 0.15 0.195 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00271 0.142 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 327438 sc-eQTL 3.32e-01 0.162 0.166 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0846 0.134 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 3.67e-02 0.249 0.119 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 906229 sc-eQTL 6.39e-01 0.0822 0.175 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00645 0.144 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 6.91e-02 0.232 0.127 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0947 0.14 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 906252 sc-eQTL 7.10e-01 0.0699 0.188 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 3.57e-01 0.167 0.18 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 3.34e-01 0.149 0.154 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 906229 sc-eQTL 1.32e-01 0.258 0.171 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 7.44e-01 0.0348 0.107 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 7.93e-02 0.274 0.155 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 1.87e-02 -0.315 0.133 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 906252 sc-eQTL 1.76e-01 0.257 0.189 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 825291 sc-eQTL 4.85e-03 0.465 0.163 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 463720 sc-eQTL 1.79e-01 0.191 0.141 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 610539 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0354 0.139 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 570055 sc-eQTL 1.77e-02 0.211 0.0883 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 224152 sc-eQTL 8.30e-01 0.0278 0.129 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135540 NHSL1 906229 eQTL 0.0416 0.112 0.0547 0.0 0.0 0.0496

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina