logo

Genes within 1Mb (chr6:139596041:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 9.73e-01 0.00274 0.0815 0.282 B L1
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 3.07e-01 0.081 0.079 0.282 B L1
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 3.94e-02 0.144 0.0693 0.282 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 7.61e-01 0.0125 0.0411 0.282 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 304043 sc-eQTL 2.55e-01 0.115 0.1 0.282 B L1
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 9.67e-01 0.00259 0.0635 0.282 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 324679 sc-eQTL 1.31e-02 0.174 0.0696 0.282 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 5.57e-01 -0.052 0.0885 0.282 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 1.65e-01 0.102 0.0735 0.282 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0628 0.0579 0.282 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 8.22e-01 0.00957 0.0426 0.282 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 4.52e-01 0.0548 0.0726 0.282 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 356388 sc-eQTL 1.37e-01 -0.106 0.0713 0.282 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0199 0.0965 0.282 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 2.78e-01 0.0749 0.0689 0.282 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 4.19e-01 0.0526 0.0649 0.282 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0112 0.037 0.282 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 3.23e-01 0.0694 0.0701 0.282 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 356388 sc-eQTL 8.70e-01 -0.014 0.0853 0.282 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 1.46e-01 0.142 0.0972 0.275 DC L1
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 7.02e-01 0.0308 0.0805 0.275 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 903470 sc-eQTL 4.44e-02 0.179 0.0887 0.275 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 6.96e-02 0.143 0.0786 0.275 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 8.57e-01 0.014 0.0776 0.275 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0477 0.092 0.275 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 903493 sc-eQTL 9.02e-01 0.0115 0.0936 0.275 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0833 0.0686 0.282 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 4.70e-01 0.0454 0.0627 0.282 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 903470 sc-eQTL 8.88e-02 0.153 0.0893 0.282 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 4.74e-01 0.0377 0.0526 0.282 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0544 0.0684 0.282 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 6.50e-03 -0.196 0.0712 0.282 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 903493 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00421 0.0935 0.282 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 4.18e-02 0.176 0.0857 0.279 NK L1
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 8.44e-02 0.129 0.0743 0.279 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 5.14e-01 0.0466 0.0712 0.279 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 2.24e-01 0.0632 0.0518 0.279 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 7.83e-01 0.0191 0.0691 0.279 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 4.93e-01 0.0695 0.101 0.282 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0252 0.0733 0.282 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 5.91e-01 0.0423 0.0788 0.282 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 7.17e-01 0.0188 0.0516 0.282 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 4.79e-02 0.119 0.0599 0.282 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 9.37e-01 0.00896 0.114 0.291 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 4.34e-01 0.0848 0.108 0.291 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 8.71e-02 0.193 0.112 0.291 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 9.69e-01 0.00402 0.103 0.291 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 304043 sc-eQTL 2.01e-01 0.112 0.0874 0.291 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 8.24e-01 0.0246 0.11 0.291 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 324679 sc-eQTL 2.52e-01 0.127 0.11 0.291 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 4.04e-01 0.083 0.0991 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 4.07e-01 0.0714 0.0859 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 1.18e-01 0.145 0.0922 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0901 0.0787 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 304043 sc-eQTL 1.62e-01 0.135 0.0963 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 6.99e-01 0.0344 0.089 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 324679 sc-eQTL 9.43e-02 0.161 0.0958 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 2.27e-01 0.122 0.101 0.284 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 6.47e-01 0.0402 0.0877 0.284 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 3.48e-01 0.0893 0.0949 0.284 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0711 0.0751 0.284 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 304043 sc-eQTL 2.16e-01 -0.119 0.0956 0.284 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 1.08e-01 -0.142 0.0877 0.284 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 324679 sc-eQTL 2.06e-01 0.137 0.108 0.284 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 3.55e-01 0.0873 0.0942 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 3.74e-02 0.171 0.0814 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 2.77e-01 0.0827 0.0759 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 4.55e-01 0.0398 0.0532 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 304043 sc-eQTL 6.86e-01 0.0404 0.0997 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0383 0.0725 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 324679 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0544 0.0951 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0195 0.0931 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 1.85e-01 0.116 0.0872 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 8.27e-01 0.0183 0.0836 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 3.71e-02 0.128 0.0609 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 304043 sc-eQTL 2.61e-01 0.109 0.0971 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 2.00e-01 -0.127 0.099 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 324679 sc-eQTL 7.55e-02 0.162 0.0906 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 4.82e-01 0.0676 0.096 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 3.39e-01 0.0927 0.0968 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 1.94e-01 -0.122 0.0938 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 1.17e-01 0.134 0.0853 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 8.30e-01 0.0185 0.0862 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 356388 sc-eQTL 8.14e-01 -0.021 0.0889 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 1.84e-01 -0.123 0.092 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 1.75e-01 0.0972 0.0715 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0184 0.0637 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 9.71e-01 0.00156 0.0429 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 3.01e-01 0.0754 0.0726 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 356388 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0723 0.0735 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 5.08e-01 0.0604 0.0911 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 2.85e-01 0.0779 0.0728 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0471 0.0691 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 8.58e-01 0.00955 0.0532 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 6.39e-01 0.0372 0.0791 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 356388 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0998 0.0852 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 7.27e-01 0.0359 0.103 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 7.34e-01 0.0271 0.0798 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0672 0.0869 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 9.31e-01 0.0054 0.0621 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0557 0.0814 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 356388 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0701 0.0851 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 4.84e-01 0.0732 0.104 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 3.64e-01 0.069 0.0759 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0179 0.0814 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 3.08e-01 0.0671 0.0657 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 6.64e-01 0.0333 0.0767 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 356388 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0329 0.092 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0149 0.0997 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 1.39e-01 0.114 0.0766 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 1.34e-01 0.115 0.0767 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 3.23e-01 0.04 0.0404 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 2.73e-01 0.0897 0.0816 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 356388 sc-eQTL 9.67e-01 0.00388 0.0936 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 5.91e-01 0.06 0.111 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 1.80e-01 0.109 0.0812 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0692 0.0846 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 3.36e-01 0.0813 0.0843 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 9.28e-01 0.00787 0.0868 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 356388 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0413 0.0916 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 5.66e-01 0.0595 0.104 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 5.85e-01 0.053 0.097 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 7.00e-01 0.0389 0.101 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 8.69e-01 0.0128 0.0778 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 5.35e-01 0.0525 0.0845 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 356388 sc-eQTL 8.87e-01 0.0137 0.0962 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 8.62e-01 0.0196 0.112 0.277 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0649 0.085 0.277 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 6.04e-01 0.0476 0.0917 0.277 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 3.24e-01 0.0666 0.0673 0.277 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 1.03e-01 0.129 0.0789 0.277 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 6.18e-01 0.0501 0.1 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 3.84e-01 0.0791 0.0907 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00586 0.0848 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 9.40e-01 0.00589 0.0781 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 8.07e-01 0.0205 0.0838 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 9.32e-02 0.156 0.0927 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 1.34e-01 0.12 0.0799 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 2.25e-01 0.0922 0.0758 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 2.89e-01 0.0546 0.0514 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00735 0.0687 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 9.42e-03 0.277 0.106 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 2.63e-01 0.112 0.1 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 6.59e-01 0.0438 0.099 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 5.75e-01 0.0457 0.0814 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0137 0.087 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 6.26e-01 0.0468 0.0959 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 2.63e-01 0.0925 0.0824 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0565 0.0852 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 4.92e-01 0.0378 0.0549 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 5.72e-01 0.0405 0.0717 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 2.61e-01 0.122 0.108 0.319 PB L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 3.32e-01 0.115 0.118 0.319 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0412 0.105 0.319 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 6.20e-01 0.0366 0.0736 0.319 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 304043 sc-eQTL 2.92e-01 0.113 0.107 0.319 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 9.54e-01 0.00467 0.081 0.319 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 324679 sc-eQTL 3.04e-02 0.233 0.106 0.319 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0302 0.103 0.285 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 6.40e-01 -0.038 0.0811 0.285 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0304 0.0955 0.285 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 7.55e-01 0.0193 0.0616 0.285 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 7.51e-01 0.0233 0.0734 0.285 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0432 0.0994 0.282 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0373 0.0826 0.282 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0239 0.0855 0.282 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 3.20e-01 0.0724 0.0727 0.282 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 4.31e-01 -0.064 0.0812 0.282 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 356388 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0758 0.0928 0.282 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0208 0.0979 0.288 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 4.47e-01 0.0709 0.093 0.288 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 903470 sc-eQTL 6.55e-02 0.167 0.0903 0.288 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 5.50e-01 0.0629 0.105 0.288 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 9.12e-01 0.00955 0.0859 0.288 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0123 0.0911 0.288 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 903493 sc-eQTL 7.19e-01 0.0363 0.101 0.288 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 6.63e-01 0.0329 0.0755 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 3.91e-01 0.0535 0.0623 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 903470 sc-eQTL 7.15e-02 0.163 0.0902 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 2.21e-01 0.0992 0.0808 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0753 0.068 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 2.88e-02 -0.155 0.0705 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 903493 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0289 0.0951 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 4.10e-02 -0.177 0.0859 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 5.60e-01 0.0427 0.0733 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 903470 sc-eQTL 9.20e-01 0.00939 0.0929 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0604 0.0878 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0265 0.0764 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 1.64e-01 -0.105 0.0753 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 903493 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0578 0.102 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 2.32e-01 0.146 0.122 0.264 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 8.25e-01 0.0257 0.116 0.264 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0632 0.12 0.264 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0025 0.0903 0.264 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 3.30e-01 0.101 0.104 0.264 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 5.33e-01 -0.064 0.102 0.276 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 1.98e-01 0.108 0.0838 0.276 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 903470 sc-eQTL 2.16e-01 0.115 0.0924 0.276 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 6.50e-01 0.0436 0.0958 0.276 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 3.98e-01 -0.074 0.0873 0.276 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 3.65e-01 -0.077 0.0848 0.276 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 903493 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0313 0.104 0.276 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 8.37e-01 0.0194 0.0942 0.276 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 4.70e-01 0.0623 0.086 0.276 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 903470 sc-eQTL 1.13e-01 0.143 0.0899 0.276 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 5.86e-01 0.0371 0.0682 0.276 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 1.32e-01 0.124 0.0817 0.276 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 1.44e-02 -0.17 0.0687 0.276 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 903493 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00298 0.101 0.276 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 4.03e-03 0.315 0.108 0.28 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 7.36e-01 0.0317 0.0939 0.28 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 903470 sc-eQTL 8.08e-01 0.0208 0.0859 0.28 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 1.10e-01 0.139 0.0863 0.28 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 2.03e-01 0.121 0.0945 0.28 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0538 0.112 0.28 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 903493 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0108 0.0863 0.28 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 8.80e-02 0.162 0.0943 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 5.39e-01 0.052 0.0844 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 5.41e-02 0.168 0.0868 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0435 0.0606 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 304043 sc-eQTL 6.59e-01 0.0444 0.1 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0128 0.0853 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 324679 sc-eQTL 4.28e-02 0.2 0.0982 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 8.46e-01 0.0172 0.0883 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 2.32e-02 0.186 0.0815 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 2.51e-01 0.0807 0.0702 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 1.51e-01 0.0708 0.0491 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 304043 sc-eQTL 6.06e-01 0.0534 0.103 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0585 0.075 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 324679 sc-eQTL 6.49e-01 0.0402 0.0882 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0833 0.069 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 5.01e-01 0.0418 0.062 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 903470 sc-eQTL 1.83e-01 0.121 0.0904 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 5.64e-01 0.0431 0.0746 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0667 0.0662 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 6.67e-02 -0.133 0.0721 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 903493 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0378 0.0974 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0375 0.0955 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 2.47e-01 0.0944 0.0812 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 903470 sc-eQTL 5.49e-02 0.173 0.0899 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 6.15e-01 0.0284 0.0564 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0134 0.0826 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 1.60e-02 -0.17 0.0702 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 903493 sc-eQTL 9.33e-01 0.00845 0.1 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 822532 sc-eQTL 3.88e-02 0.185 0.0889 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 460961 sc-eQTL 9.21e-02 0.129 0.0761 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 607780 sc-eQTL 4.94e-01 0.0512 0.0748 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 567296 sc-eQTL 2.09e-01 0.0606 0.0481 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 221393 sc-eQTL 8.62e-01 0.0121 0.0698 0.28 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000164442 CITED2 221393 eQTL 0.000316 -0.0879 0.0243 0.0119 0.0129 0.284

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000164442 CITED2 221393 1.34e-06 1.18e-06 3.29e-07 1.25e-06 3.6e-07 5.98e-07 1.48e-06 3.75e-07 1.38e-06 6.29e-07 1.84e-06 7.82e-07 2.51e-06 2.77e-07 5.42e-07 9.16e-07 9.2e-07 7.83e-07 8.36e-07 6.26e-07 6.81e-07 1.72e-06 1.04e-06 5.48e-07 2.38e-06 5.67e-07 9.02e-07 8.09e-07 1.55e-06 1.21e-06 7.84e-07 1.54e-07 2.02e-07 6.44e-07 5.28e-07 4.81e-07 6.25e-07 2.15e-07 4.99e-07 3.11e-07 2.85e-07 1.7e-06 8.31e-08 6.48e-08 2.16e-07 1.26e-07 2.33e-07 7.69e-08 8.28e-08