logo

Genes within 1Mb (chr6:139589381:G:GA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0691 0.0952 0.184 B L1
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 7.95e-01 0.0241 0.0927 0.184 B L1
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 1.11e-03 0.264 0.0799 0.184 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 8.05e-01 0.0119 0.0481 0.184 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 297383 sc-eQTL 3.94e-01 0.101 0.118 0.184 B L1
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0881 0.074 0.184 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 318019 sc-eQTL 4.54e-02 0.165 0.0818 0.184 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0562 0.104 0.184 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 5.14e-01 0.0566 0.0866 0.184 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0571 0.068 0.184 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0368 0.0499 0.184 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 9.47e-01 0.00563 0.0854 0.184 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 349728 sc-eQTL 4.06e-01 -0.07 0.084 0.184 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 3.29e-01 0.111 0.114 0.184 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 8.85e-01 0.0118 0.0816 0.184 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00864 0.0768 0.184 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 7.88e-01 0.0118 0.0437 0.184 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 7.01e-01 0.0319 0.0829 0.184 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 349728 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0892 0.101 0.184 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 2.93e-01 0.123 0.116 0.176 DC L1
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 5.62e-01 0.0559 0.0961 0.176 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 896810 sc-eQTL 7.99e-03 0.282 0.105 0.176 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 4.86e-01 0.066 0.0946 0.176 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0165 0.0927 0.176 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 6.78e-01 0.0457 0.11 0.176 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 896833 sc-eQTL 6.82e-01 0.0459 0.112 0.176 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0988 0.0822 0.184 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0265 0.0752 0.184 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 896810 sc-eQTL 2.52e-01 0.123 0.107 0.184 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 1.35e-01 0.0942 0.0628 0.184 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 1.37e-01 -0.122 0.0817 0.184 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 1.83e-01 -0.115 0.0865 0.184 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 896833 sc-eQTL 9.03e-01 0.0137 0.112 0.184 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 2.25e-01 0.123 0.101 0.185 NK L1
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 4.41e-01 0.0677 0.0877 0.185 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 5.73e-01 0.0472 0.0836 0.185 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 9.63e-01 0.00284 0.0611 0.185 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 5.32e-01 0.0507 0.0811 0.185 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0927 0.118 0.184 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 2.94e-01 0.09 0.0855 0.184 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0263 0.0922 0.184 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0346 0.0603 0.184 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 3.06e-02 0.152 0.0699 0.184 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0863 0.133 0.189 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 6.44e-01 0.0588 0.127 0.189 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 6.67e-01 0.0574 0.133 0.189 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 6.85e-01 0.049 0.12 0.189 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 297383 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00673 0.103 0.189 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0341 0.13 0.189 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 318019 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0469 0.13 0.189 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 7.22e-01 0.0414 0.116 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0523 0.101 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 1.68e-02 0.258 0.107 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0206 0.0924 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 297383 sc-eQTL 4.09e-02 0.23 0.112 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0593 0.104 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 318019 sc-eQTL 1.09e-01 0.18 0.112 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0242 0.118 0.185 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 5.80e-01 0.0564 0.102 0.185 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 8.89e-02 0.187 0.11 0.185 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0305 0.0872 0.185 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 297383 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0172 0.111 0.185 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 6.87e-02 -0.186 0.101 0.185 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 318019 sc-eQTL 3.80e-01 0.11 0.125 0.185 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 8.14e-01 0.0262 0.111 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 1.67e-01 0.134 0.0963 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 3.30e-01 0.0872 0.0893 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 6.01e-01 0.0328 0.0626 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 297383 sc-eQTL 9.92e-01 0.00122 0.117 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0203 0.0853 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 318019 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0423 0.112 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0775 0.109 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 2.96e-01 0.107 0.103 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 9.76e-02 0.162 0.0975 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 3.45e-01 0.0683 0.0721 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 297383 sc-eQTL 7.69e-01 0.0336 0.114 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 1.91e-02 -0.272 0.115 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 318019 sc-eQTL 9.78e-02 0.177 0.106 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 5.84e-01 0.0622 0.114 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 8.11e-01 0.0274 0.115 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0419 0.111 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 3.16e-02 0.217 0.1 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 5.86e-01 0.0556 0.102 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 349728 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0308 0.105 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 1.59e-01 -0.154 0.109 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 5.21e-01 0.0545 0.0847 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0127 0.0752 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0296 0.0506 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 6.22e-01 0.0424 0.086 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 349728 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0257 0.087 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 4.94e-01 0.074 0.108 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 1.86e-01 0.114 0.0861 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0573 0.0819 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0322 0.063 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 8.11e-01 0.0225 0.0937 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 349728 sc-eQTL 1.41e-01 -0.149 0.101 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 4.08e-01 0.0997 0.12 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0754 0.0936 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 6.58e-01 0.0452 0.102 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0295 0.0728 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00377 0.0956 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 349728 sc-eQTL 4.60e-01 0.0739 0.0999 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 6.35e-01 0.0588 0.124 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 8.30e-01 0.0194 0.0901 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0697 0.0964 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 2.04e-01 0.0991 0.0777 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 7.47e-02 0.162 0.0902 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 349728 sc-eQTL 3.73e-01 -0.097 0.109 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 4.91e-01 0.0819 0.119 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 3.52e-01 0.0853 0.0915 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 5.43e-01 0.0559 0.0918 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 7.37e-01 0.0162 0.0482 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 9.09e-01 0.0112 0.0975 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 349728 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0911 0.111 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 3.23e-01 0.134 0.135 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 4.63e-01 0.0728 0.0989 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0579 0.103 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 3.11e-01 0.104 0.102 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 6.62e-01 0.0461 0.105 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 349728 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0804 0.111 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 7.75e-01 0.0346 0.121 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0235 0.113 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0103 0.118 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 2.29e-01 -0.109 0.0902 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 6.95e-01 0.0387 0.0984 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 349728 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0129 0.112 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 2.76e-01 -0.143 0.131 0.18 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 7.03e-01 -0.038 0.0996 0.18 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0231 0.107 0.18 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 5.98e-01 0.0416 0.0789 0.18 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 6.75e-02 0.169 0.0922 0.18 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0374 0.119 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 3.96e-01 0.0915 0.108 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 3.59e-01 0.0923 0.1 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0336 0.0927 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 8.40e-01 0.02 0.0994 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 1.48e-01 0.159 0.11 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 7.87e-01 0.0256 0.0948 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 5.41e-01 0.055 0.0898 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0111 0.0608 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 8.42e-01 0.0161 0.0811 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 7.96e-03 0.328 0.122 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 5.71e-01 0.0661 0.116 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0583 0.115 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 6.01e-01 0.0496 0.0945 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 3.03e-01 0.104 0.101 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0888 0.112 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 4.75e-01 0.0689 0.0963 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0064 0.0996 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 5.36e-01 0.0398 0.0641 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 2.33e-01 0.0998 0.0835 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 7.42e-01 -0.047 0.143 0.185 PB L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 2.45e-01 0.18 0.154 0.185 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 7.74e-01 0.0398 0.138 0.185 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0355 0.0966 0.185 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 297383 sc-eQTL 6.79e-01 0.0584 0.141 0.185 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0364 0.106 0.185 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 318019 sc-eQTL 7.96e-02 0.249 0.141 0.185 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 1.83e-01 -0.163 0.122 0.185 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 4.00e-01 0.0814 0.0964 0.185 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0281 0.114 0.185 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0252 0.0734 0.185 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 4.63e-01 0.0641 0.0873 0.185 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0987 0.119 0.184 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 2.63e-01 -0.111 0.099 0.184 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 1.76e-01 -0.139 0.102 0.184 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 5.78e-01 0.0488 0.0875 0.184 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0388 0.0977 0.184 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 349728 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0681 0.112 0.184 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 2.94e-01 0.123 0.117 0.185 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 3.18e-01 0.112 0.112 0.185 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 896810 sc-eQTL 1.26e-02 0.271 0.108 0.185 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 1.07e-01 0.203 0.125 0.185 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0609 0.103 0.185 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 3.06e-01 0.112 0.109 0.185 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 896833 sc-eQTL 4.24e-01 0.0967 0.121 0.185 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 9.25e-01 0.00858 0.0912 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0175 0.0754 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 896810 sc-eQTL 6.05e-02 0.205 0.109 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 3.47e-02 0.206 0.097 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 1.87e-01 -0.109 0.0821 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 4.65e-01 -0.063 0.0861 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 896833 sc-eQTL 9.96e-01 0.000545 0.115 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 1.22e-02 -0.261 0.103 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 5.46e-01 0.0535 0.0883 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 896810 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0504 0.112 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0434 0.106 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0975 0.0919 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0385 0.0912 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 896833 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0141 0.123 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 1.64e-01 0.192 0.137 0.179 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 2.13e-01 0.163 0.131 0.179 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 4.04e-01 -0.113 0.136 0.179 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0319 0.102 0.179 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 4.80e-01 0.0834 0.118 0.179 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 3.80e-01 -0.107 0.122 0.178 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 2.93e-01 0.106 0.1 0.178 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 896810 sc-eQTL 1.78e-01 0.149 0.11 0.178 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 2.62e-01 0.128 0.114 0.178 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 8.24e-02 -0.181 0.104 0.178 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0619 0.101 0.178 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 896833 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0762 0.124 0.178 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0383 0.112 0.186 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0383 0.102 0.186 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 896810 sc-eQTL 6.90e-01 0.0429 0.107 0.186 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 7.32e-01 0.0278 0.081 0.186 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 3.97e-01 0.0827 0.0974 0.186 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0929 0.0826 0.186 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 896833 sc-eQTL 2.40e-01 0.14 0.119 0.186 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 1.75e-01 0.176 0.129 0.184 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0712 0.11 0.184 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 896810 sc-eQTL 9.13e-01 -0.011 0.101 0.184 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 7.19e-01 0.0367 0.102 0.184 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 4.44e-01 0.0852 0.111 0.184 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 9.98e-01 0.000306 0.131 0.184 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 896833 sc-eQTL 1.56e-01 -0.143 0.1 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 9.48e-01 0.0073 0.111 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0203 0.0988 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 5.94e-03 0.28 0.101 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 8.28e-01 0.0154 0.071 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 297383 sc-eQTL 3.89e-01 0.101 0.117 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 2.46e-01 -0.116 0.0994 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 318019 sc-eQTL 1.24e-01 0.178 0.115 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0395 0.104 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 1.40e-01 0.143 0.0966 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 9.56e-02 0.138 0.0823 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 5.15e-01 0.0378 0.058 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 297383 sc-eQTL 8.30e-01 0.0262 0.122 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0755 0.0882 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 318019 sc-eQTL 6.50e-01 0.0472 0.104 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 2.16e-01 -0.104 0.0835 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00482 0.0752 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 896810 sc-eQTL 2.55e-01 0.125 0.11 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 5.60e-02 0.172 0.0897 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 1.52e-01 -0.115 0.08 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0698 0.088 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 896833 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0376 0.118 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0765 0.112 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 8.73e-01 0.0154 0.096 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 896810 sc-eQTL 1.18e-01 0.167 0.106 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 3.24e-01 0.0655 0.0663 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 2.37e-01 -0.115 0.097 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 1.56e-01 -0.119 0.0834 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 896833 sc-eQTL 5.27e-01 0.0748 0.118 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 815872 sc-eQTL 1.73e-01 0.143 0.105 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 454301 sc-eQTL 5.23e-01 0.0574 0.0898 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 601120 sc-eQTL 8.84e-01 0.0128 0.0878 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 560636 sc-eQTL 9.27e-01 0.00516 0.0567 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 214733 sc-eQTL 5.22e-01 0.0524 0.0818 0.185 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000218565 AL592429.1 251363 eQTL 0.0298 0.0625 0.0287 0.0 0.0 0.171

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000164442 \N 214733 1.98e-05 1.23e-05 1.89e-06 6.9e-06 2.22e-06 4.14e-06 1.09e-05 1.51e-06 1.03e-05 5.49e-06 1.06e-05 3.3e-06 1.44e-05 3.6e-06 3.8e-06 5.84e-06 4.69e-06 6.9e-06 2.67e-06 2.79e-06 4.6e-06 7.44e-06 1.03e-05 3.3e-06 1.29e-05 4.34e-06 2.72e-06 3.44e-06 1.16e-05 8.22e-06 7.35e-06 1.11e-06 1.27e-06 3.24e-06 4.62e-06 2.19e-06 1.65e-06 1.95e-06 1.68e-06 5.32e-07 7.59e-07 1.8e-05 1.63e-06 1.68e-07 7.77e-07 1.29e-06 9.71e-07 6.85e-07 4.42e-07