logo

Genes within 1Mb (chr6:139585482:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0601 0.125 0.092 B L1
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 4.71e-02 0.24 0.12 0.092 B L1
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0832 0.107 0.092 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 6.78e-01 0.0261 0.0629 0.092 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 293484 sc-eQTL 9.34e-01 0.0127 0.154 0.092 B L1
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 3.09e-01 0.0987 0.0969 0.092 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 314120 sc-eQTL 9.53e-01 0.00643 0.108 0.092 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0431 0.137 0.092 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 1.38e-01 0.17 0.114 0.092 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0896 0.0898 0.092 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 2.62e-01 0.0741 0.0659 0.092 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 5.48e-01 0.0678 0.113 0.092 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 345829 sc-eQTL 2.84e-01 -0.119 0.111 0.092 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 8.77e-02 -0.257 0.15 0.092 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 3.47e-02 0.227 0.107 0.092 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 2.98e-01 0.106 0.101 0.092 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0449 0.0578 0.092 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 2.73e-01 0.12 0.11 0.092 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 345829 sc-eQTL 5.00e-01 0.09 0.133 0.092 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 4.32e-01 0.124 0.158 0.09 DC L1
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 5.79e-01 0.0723 0.13 0.09 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 892911 sc-eQTL 4.50e-01 -0.109 0.145 0.09 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 5.45e-01 0.0775 0.128 0.09 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 8.13e-01 0.0296 0.125 0.09 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 1.56e-02 -0.358 0.147 0.09 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 892934 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0877 0.151 0.09 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 8.74e-01 0.0175 0.11 0.092 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 2.93e-01 0.106 0.1 0.092 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 892911 sc-eQTL 9.43e-02 0.24 0.143 0.092 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0209 0.0843 0.092 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 4.06e-01 0.0913 0.11 0.092 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 6.75e-02 -0.212 0.115 0.092 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 892934 sc-eQTL 7.75e-01 0.0428 0.15 0.092 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 6.09e-01 0.0727 0.142 0.088 NK L1
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 9.47e-02 0.205 0.122 0.088 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 2.71e-01 0.129 0.117 0.088 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 1.75e-01 0.116 0.085 0.088 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 8.31e-01 0.0242 0.113 0.088 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 6.68e-01 0.0699 0.163 0.092 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 4.46e-01 -0.09 0.118 0.092 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 4.85e-01 0.0886 0.127 0.092 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 5.34e-01 0.0517 0.083 0.092 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 7.34e-01 0.0331 0.0973 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 2.95e-01 0.181 0.172 0.089 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 2.45e-01 0.191 0.164 0.089 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 1.16e-01 0.27 0.171 0.089 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 4.11e-01 -0.128 0.156 0.089 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 293484 sc-eQTL 3.83e-02 0.276 0.132 0.089 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 4.16e-01 0.137 0.168 0.089 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 314120 sc-eQTL 6.19e-01 0.0837 0.168 0.089 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 3.62e-01 -0.139 0.153 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 8.03e-02 0.231 0.132 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 6.83e-01 0.0584 0.143 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 3.39e-01 -0.116 0.121 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 293484 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0889 0.149 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 2.35e-01 0.163 0.137 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 314120 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0554 0.148 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 2.31e-01 0.186 0.155 0.093 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0679 0.134 0.093 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 8.45e-01 0.0285 0.146 0.093 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0505 0.115 0.093 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 293484 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0643 0.147 0.093 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0261 0.135 0.093 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 314120 sc-eQTL 6.95e-01 0.0651 0.166 0.093 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00834 0.148 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 6.70e-02 0.236 0.128 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 9.23e-01 0.0116 0.119 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0155 0.0834 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 293484 sc-eQTL 2.87e-01 -0.166 0.156 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00421 0.114 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 314120 sc-eQTL 2.31e-01 -0.178 0.149 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 7.68e-01 0.0427 0.144 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 2.35e-01 0.161 0.135 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 3.94e-01 -0.11 0.129 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 3.77e-01 0.0843 0.0952 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 293484 sc-eQTL 2.77e-01 0.164 0.151 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 7.95e-01 0.0401 0.154 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 314120 sc-eQTL 6.36e-01 -0.067 0.141 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 3.63e-01 0.137 0.15 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 4.91e-01 0.104 0.151 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 1.18e-01 -0.23 0.146 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 7.40e-01 0.0445 0.134 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 3.21e-01 -0.134 0.134 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 345829 sc-eQTL 2.68e-01 -0.154 0.139 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0583 0.143 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 1.04e-01 0.181 0.111 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0843 0.0986 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0251 0.0665 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 8.56e-01 0.0205 0.113 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 345829 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0464 0.114 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0152 0.143 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 6.80e-01 0.0471 0.114 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0305 0.108 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 4.43e-01 0.0638 0.083 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 8.08e-01 -0.03 0.124 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 345829 sc-eQTL 3.71e-01 -0.12 0.133 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 4.21e-01 -0.128 0.159 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 1.14e-01 0.195 0.123 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 2.75e-01 -0.147 0.134 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 7.05e-01 0.0364 0.096 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 2.78e-01 -0.137 0.126 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 345829 sc-eQTL 1.41e-01 -0.194 0.131 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 6.82e-01 0.0676 0.165 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 6.85e-02 0.218 0.119 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 8.11e-01 0.0308 0.128 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 7.88e-01 0.028 0.104 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0546 0.121 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 345829 sc-eQTL 4.00e-01 0.122 0.145 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 1.89e-01 -0.207 0.158 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 8.18e-02 0.212 0.121 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 3.05e-01 0.126 0.122 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 6.08e-01 0.033 0.0642 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 2.40e-01 0.153 0.129 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 345829 sc-eQTL 5.36e-01 0.0921 0.148 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 2.43e-01 -0.2 0.171 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 3.04e-01 0.129 0.125 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 3.63e-01 -0.119 0.13 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 7.26e-01 0.0456 0.13 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00976 0.134 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 345829 sc-eQTL 3.87e-01 0.122 0.141 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 7.62e-01 0.0498 0.164 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 4.52e-01 0.115 0.153 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 2.90e-01 0.169 0.159 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 3.44e-01 0.117 0.123 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 6.66e-01 0.0579 0.134 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 345829 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0548 0.152 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 4.12e-01 0.145 0.176 0.091 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 3.34e-01 -0.13 0.134 0.091 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 3.12e-01 0.146 0.144 0.091 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 3.15e-01 0.107 0.106 0.091 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00901 0.125 0.091 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 6.49e-01 0.0777 0.17 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 6.50e-01 0.0702 0.154 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 1.34e-01 -0.216 0.143 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 3.35e-01 0.128 0.132 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 7.83e-01 0.0394 0.142 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 7.80e-01 0.0426 0.153 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 3.62e-02 0.274 0.13 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 1.29e-01 0.189 0.124 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 7.32e-02 0.151 0.0837 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00273 0.112 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0938 0.178 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 1.18e-01 0.26 0.166 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 1.69e-01 0.226 0.164 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0295 0.135 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 8.89e-01 0.0202 0.144 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 2.17e-01 0.194 0.157 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 5.86e-01 0.0737 0.135 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0109 0.14 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0363 0.09 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 9.64e-01 0.00528 0.118 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 3.92e-01 0.135 0.158 0.122 PB L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 6.00e-01 0.0904 0.172 0.122 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 4.57e-01 -0.114 0.153 0.122 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 1.28e-01 0.162 0.106 0.122 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 293484 sc-eQTL 4.36e-01 0.122 0.156 0.122 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0685 0.118 0.122 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 314120 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0333 0.158 0.122 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 5.75e-01 0.0913 0.162 0.093 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00585 0.128 0.093 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0653 0.151 0.093 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0397 0.0972 0.093 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0357 0.116 0.093 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00342 0.155 0.092 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 9.39e-01 0.00992 0.129 0.092 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0257 0.133 0.092 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 4.00e-01 0.0958 0.113 0.092 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 2.16e-01 -0.157 0.126 0.092 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 345829 sc-eQTL 4.87e-01 -0.101 0.145 0.092 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0688 0.16 0.09 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 7.59e-01 0.0468 0.152 0.09 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 892911 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0393 0.149 0.09 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 1.68e-01 -0.237 0.171 0.09 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 6.31e-01 0.0675 0.14 0.09 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 2.65e-02 -0.329 0.147 0.09 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 892934 sc-eQTL 3.82e-01 -0.144 0.164 0.09 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 5.18e-01 0.0781 0.12 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 3.52e-01 0.0926 0.0994 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 892911 sc-eQTL 8.80e-02 0.247 0.144 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 4.25e-01 -0.103 0.129 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 5.71e-01 0.0617 0.109 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 3.32e-02 -0.242 0.113 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 892934 sc-eQTL 8.80e-01 -0.023 0.152 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 5.31e-01 0.0879 0.14 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00145 0.118 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 892911 sc-eQTL 2.85e-01 0.16 0.15 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0542 0.142 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 2.08e-01 0.155 0.123 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 3.19e-01 -0.122 0.122 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 892934 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0191 0.164 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 1.26e-01 -0.311 0.202 0.079 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 8.42e-01 0.0386 0.193 0.079 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 6.31e-01 0.096 0.2 0.079 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0136 0.15 0.079 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 2.57e-01 0.196 0.173 0.079 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 5.16e-01 -0.107 0.164 0.089 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 1.42e-01 0.198 0.134 0.089 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 892911 sc-eQTL 9.76e-01 0.0045 0.149 0.089 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 3.28e-01 -0.151 0.154 0.089 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00993 0.14 0.089 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0133 0.136 0.089 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 892934 sc-eQTL 6.70e-01 0.0714 0.167 0.089 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 4.32e-01 0.125 0.159 0.084 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 6.76e-03 0.392 0.143 0.084 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 892911 sc-eQTL 2.25e-02 0.348 0.151 0.084 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 4.50e-01 0.0872 0.115 0.084 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 1.55e-01 0.198 0.138 0.084 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 3.58e-01 -0.108 0.118 0.084 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 892934 sc-eQTL 2.78e-01 -0.185 0.17 0.084 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 2.82e-03 0.534 0.176 0.085 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 3.87e-01 0.133 0.153 0.085 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 892911 sc-eQTL 6.58e-01 -0.062 0.14 0.085 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 3.57e-01 0.131 0.142 0.085 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 4.67e-01 0.113 0.155 0.085 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 2.11e-01 -0.228 0.181 0.085 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 892934 sc-eQTL 3.29e-01 0.137 0.14 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 5.17e-01 0.0952 0.147 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 2.47e-01 0.151 0.13 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 7.22e-01 0.0483 0.136 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0532 0.0939 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 293484 sc-eQTL 7.20e-01 0.0559 0.156 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 3.32e-01 0.128 0.132 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 314120 sc-eQTL 8.72e-01 0.0248 0.153 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0641 0.138 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 4.00e-02 0.265 0.128 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0184 0.11 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 5.33e-01 0.0483 0.0773 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 293484 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0925 0.162 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00418 0.118 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 314120 sc-eQTL 3.66e-01 -0.125 0.138 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 5.37e-01 0.0683 0.111 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 6.63e-01 0.0433 0.0992 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 892911 sc-eQTL 7.14e-02 0.261 0.144 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 2.59e-01 -0.135 0.119 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 4.48e-01 0.0805 0.106 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 1.00e-01 -0.191 0.116 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 892934 sc-eQTL 9.87e-01 0.00258 0.156 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0929 0.155 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 2.11e-02 0.304 0.131 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 892911 sc-eQTL 3.09e-01 0.15 0.147 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 5.06e-01 -0.061 0.0915 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 3.80e-01 0.118 0.134 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0366 0.115 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 892934 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0119 0.163 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 811973 sc-eQTL 6.40e-01 0.069 0.147 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 450402 sc-eQTL 7.19e-02 0.226 0.125 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 597221 sc-eQTL 9.58e-02 0.204 0.122 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 556737 sc-eQTL 1.17e-01 0.124 0.0788 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 210834 sc-eQTL 9.55e-01 0.00651 0.115 0.088 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000164442 CITED2 210834 eQTL 0.00354 -0.109 0.0372 0.00383 0.00144 0.0952

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina