logo

Genes within 1Mb (chr6:139584484:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0638 0.119 0.1 B L1
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 8.81e-02 0.197 0.115 0.1 B L1
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0681 0.102 0.1 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 5.60e-01 0.0351 0.0602 0.1 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 292486 sc-eQTL 7.35e-01 0.05 0.148 0.1 B L1
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 1.86e-01 0.123 0.0926 0.1 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 313122 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0702 0.103 0.1 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0595 0.131 0.1 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 1.18e-01 0.17 0.108 0.1 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 2.15e-01 -0.106 0.0854 0.1 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 3.25e-01 0.0618 0.0627 0.1 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 6.15e-01 0.054 0.107 0.1 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 344831 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0693 0.106 0.1 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 3.87e-01 -0.125 0.144 0.1 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 7.08e-02 0.186 0.103 0.1 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 1.51e-01 0.139 0.0967 0.1 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0352 0.0553 0.1 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 1.51e-01 0.151 0.105 0.1 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 344831 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0259 0.128 0.1 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 3.51e-01 0.142 0.152 0.095 DC L1
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 6.68e-01 0.0537 0.125 0.095 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 891913 sc-eQTL 3.37e-01 -0.134 0.139 0.095 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 5.77e-01 0.0688 0.123 0.095 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 7.89e-01 0.0324 0.121 0.095 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 2.29e-02 -0.324 0.141 0.095 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 891936 sc-eQTL 4.44e-01 -0.112 0.145 0.095 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 9.14e-01 0.0113 0.105 0.1 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 3.41e-01 0.091 0.0953 0.1 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 891913 sc-eQTL 1.31e-01 0.206 0.136 0.1 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0501 0.08 0.1 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 3.66e-01 0.0943 0.104 0.1 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 6.65e-02 -0.202 0.109 0.1 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 891936 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00731 0.142 0.1 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 2.79e-01 0.147 0.135 0.097 NK L1
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 2.71e-01 0.129 0.117 0.097 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 5.92e-01 0.0599 0.112 0.097 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 2.53e-01 0.0933 0.0814 0.097 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00783 0.109 0.097 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 9.49e-01 0.01 0.155 0.1 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0945 0.112 0.1 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 7.60e-01 0.037 0.121 0.1 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 4.70e-01 0.0573 0.0791 0.1 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 4.66e-01 0.0677 0.0927 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 2.93e-01 0.174 0.165 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 2.37e-01 0.187 0.157 0.097 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 1.38e-01 0.244 0.164 0.097 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0908 0.149 0.097 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 292486 sc-eQTL 5.59e-02 0.244 0.127 0.097 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 4.32e-01 0.127 0.161 0.097 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 313122 sc-eQTL 4.95e-01 0.11 0.161 0.097 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 3.21e-01 -0.147 0.148 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 1.34e-01 0.192 0.128 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 6.02e-01 0.0722 0.138 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0968 0.118 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 292486 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0773 0.144 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 1.01e-01 0.217 0.132 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 313122 sc-eQTL 3.24e-01 -0.142 0.143 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 2.10e-01 0.189 0.15 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0242 0.13 0.101 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 6.51e-01 0.0638 0.141 0.101 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 8.19e-01 0.0255 0.112 0.101 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 292486 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0315 0.142 0.101 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 8.73e-01 0.0209 0.131 0.101 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 313122 sc-eQTL 9.95e-01 0.000923 0.161 0.101 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 9.95e-01 0.000971 0.142 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 4.65e-02 0.246 0.123 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0175 0.115 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0102 0.0802 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 292486 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0922 0.15 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0325 0.109 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 313122 sc-eQTL 8.00e-02 -0.25 0.142 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 9.25e-01 0.0131 0.138 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 4.66e-01 0.0951 0.13 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0651 0.124 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 4.06e-01 0.0761 0.0914 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 292486 sc-eQTL 2.87e-01 0.154 0.145 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 9.13e-01 0.0161 0.148 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 313122 sc-eQTL 3.25e-01 -0.134 0.135 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 3.90e-01 0.124 0.144 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 5.16e-01 0.0945 0.145 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 1.31e-01 -0.213 0.141 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 7.28e-01 0.0449 0.129 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 3.29e-01 -0.126 0.129 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 344831 sc-eQTL 2.37e-01 -0.158 0.133 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0964 0.137 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 1.25e-01 0.163 0.106 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 4.08e-01 -0.078 0.0941 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0269 0.0634 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 8.82e-01 0.0161 0.108 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 344831 sc-eQTL 9.61e-01 0.00539 0.109 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0265 0.137 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 8.21e-01 0.0247 0.109 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0349 0.104 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 4.26e-01 0.0634 0.0796 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0102 0.119 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 344831 sc-eQTL 3.45e-01 -0.121 0.128 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0716 0.151 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 6.76e-02 0.215 0.117 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 3.66e-01 -0.116 0.128 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 5.79e-01 0.0509 0.0915 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 3.72e-01 -0.107 0.12 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 344831 sc-eQTL 9.06e-02 -0.212 0.125 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 1.46e-01 0.229 0.157 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 9.00e-02 0.194 0.114 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 9.47e-01 0.00811 0.123 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 7.61e-01 0.0303 0.0994 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0157 0.116 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 344831 sc-eQTL 9.64e-01 0.00624 0.139 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 3.70e-01 -0.135 0.15 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 1.07e-01 0.187 0.115 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 1.11e-01 0.185 0.116 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 5.63e-01 0.0354 0.061 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 2.71e-01 0.136 0.123 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 344831 sc-eQTL 6.31e-01 0.068 0.141 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 3.82e-01 -0.145 0.165 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 5.58e-01 0.0709 0.121 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 3.49e-01 -0.118 0.125 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 5.84e-01 0.0687 0.125 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 6.15e-01 0.0649 0.129 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 344831 sc-eQTL 4.95e-01 0.0928 0.136 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 7.50e-01 0.0501 0.157 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 4.17e-01 0.119 0.147 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 1.71e-01 0.209 0.152 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 2.34e-01 0.14 0.117 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 7.29e-01 0.0445 0.128 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 344831 sc-eQTL 4.46e-01 -0.111 0.145 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 4.68e-01 0.123 0.169 0.097 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 3.07e-01 -0.131 0.128 0.097 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 5.33e-01 0.0863 0.138 0.097 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 1.48e-01 0.147 0.101 0.097 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0081 0.12 0.097 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 8.38e-01 0.0331 0.162 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 8.01e-01 0.0369 0.147 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 9.71e-02 -0.226 0.136 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 5.10e-01 0.083 0.126 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0126 0.135 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 4.78e-01 0.104 0.146 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 1.05e-01 0.204 0.125 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 3.22e-01 0.118 0.119 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 1.45e-01 0.118 0.0805 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0191 0.108 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0428 0.169 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 2.79e-01 0.171 0.158 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 2.01e-01 0.199 0.155 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0604 0.128 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0169 0.137 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 3.13e-02 0.322 0.149 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 6.30e-01 0.0625 0.129 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0803 0.133 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0281 0.086 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0226 0.112 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 4.23e-01 0.121 0.151 0.133 PB L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 4.77e-01 0.117 0.164 0.133 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 4.23e-01 -0.117 0.146 0.133 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 8.40e-02 0.176 0.101 0.133 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 292486 sc-eQTL 4.51e-01 0.113 0.149 0.133 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0713 0.112 0.133 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 313122 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0551 0.151 0.133 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 6.36e-01 0.0734 0.155 0.102 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 9.57e-01 0.00654 0.122 0.102 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0385 0.143 0.102 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0743 0.0924 0.102 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00817 0.11 0.102 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 6.78e-01 0.0624 0.15 0.1 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0382 0.125 0.1 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0156 0.129 0.1 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 1.74e-01 0.149 0.109 0.1 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 2.94e-01 -0.129 0.122 0.1 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 344831 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0523 0.14 0.1 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0185 0.154 0.095 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 7.26e-01 0.0514 0.146 0.095 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 891913 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0624 0.143 0.095 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 1.23e-01 -0.254 0.164 0.095 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 5.69e-01 0.077 0.135 0.095 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 3.70e-02 -0.298 0.142 0.095 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 891936 sc-eQTL 3.22e-01 -0.157 0.158 0.095 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 3.73e-01 0.102 0.115 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 2.63e-01 0.106 0.0945 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 891913 sc-eQTL 1.06e-01 0.223 0.137 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0831 0.123 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 5.51e-01 0.0619 0.104 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 5.06e-02 -0.211 0.107 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 891936 sc-eQTL 3.92e-01 -0.124 0.144 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0037 0.132 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 8.56e-01 0.0204 0.112 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 891913 sc-eQTL 4.09e-01 0.117 0.142 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 3.58e-01 -0.123 0.134 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 1.18e-01 0.182 0.116 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 2.47e-01 -0.134 0.115 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 891936 sc-eQTL 7.50e-01 0.0495 0.155 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 9.80e-02 -0.329 0.197 0.082 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0108 0.189 0.082 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 7.91e-01 0.0521 0.196 0.082 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0201 0.147 0.082 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 2.53e-01 0.194 0.169 0.082 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0699 0.156 0.098 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 4.48e-02 0.257 0.127 0.098 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 891913 sc-eQTL 8.71e-01 0.023 0.142 0.098 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 3.58e-01 -0.135 0.146 0.098 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00971 0.134 0.098 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 7.81e-01 -0.036 0.13 0.098 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 891936 sc-eQTL 5.02e-01 0.107 0.159 0.098 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 4.99e-01 0.103 0.152 0.09 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 1.17e-02 0.349 0.137 0.09 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 891913 sc-eQTL 7.72e-02 0.258 0.145 0.09 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 7.98e-01 0.0283 0.11 0.09 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 1.70e-01 0.182 0.132 0.09 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 1.82e-01 -0.151 0.112 0.09 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 891936 sc-eQTL 9.67e-02 -0.27 0.162 0.09 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 8.10e-03 0.453 0.169 0.09 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 6.47e-01 0.067 0.146 0.09 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 891913 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0665 0.134 0.09 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 3.75e-01 0.12 0.135 0.09 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 5.52e-01 0.088 0.148 0.09 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 2.44e-01 -0.202 0.173 0.09 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 891936 sc-eQTL 5.01e-01 0.0905 0.134 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 7.92e-01 0.0375 0.142 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 3.22e-01 0.125 0.126 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 4.49e-01 0.0994 0.131 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0162 0.0908 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 292486 sc-eQTL 7.60e-01 0.046 0.15 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 1.52e-01 0.182 0.127 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 313122 sc-eQTL 7.77e-01 -0.042 0.148 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0674 0.133 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 4.78e-02 0.245 0.123 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0244 0.106 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 5.92e-01 0.0397 0.0741 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 292486 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0347 0.155 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 8.87e-01 -0.016 0.113 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 313122 sc-eQTL 1.15e-01 -0.208 0.132 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 6.48e-01 0.0481 0.105 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 5.97e-01 0.0501 0.0945 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 891913 sc-eQTL 1.18e-01 0.215 0.137 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 1.74e-01 -0.154 0.113 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 3.86e-01 0.0877 0.101 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 1.04e-01 -0.18 0.11 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 891936 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0246 0.148 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0398 0.148 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 2.71e-02 0.278 0.125 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 891913 sc-eQTL 3.15e-01 0.141 0.14 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0641 0.0875 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 4.82e-01 0.0901 0.128 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0553 0.11 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 891936 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0535 0.156 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 810975 sc-eQTL 2.93e-01 0.148 0.141 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 449404 sc-eQTL 2.14e-01 0.149 0.12 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 596223 sc-eQTL 2.85e-01 0.126 0.117 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 555739 sc-eQTL 2.48e-01 0.0875 0.0756 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 209836 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0252 0.11 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000164442 CITED2 209836 eQTL 0.00454 -0.102 0.036 0.00334 0.00117 0.1

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina