logo

Genes within 1Mb (chr6:139577311:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 3.27e-01 -0.128 0.131 0.088 B L1
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0864 0.127 0.088 B L1
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0637 0.112 0.088 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 1.73e-01 0.09 0.0658 0.088 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 285313 sc-eQTL 3.10e-01 0.164 0.162 0.088 B L1
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 8.95e-01 0.0135 0.102 0.088 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 305949 sc-eQTL 3.08e-01 0.116 0.113 0.088 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0503 0.139 0.088 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0237 0.116 0.088 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0864 0.0912 0.088 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 8.83e-02 -0.114 0.0666 0.088 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 9.35e-01 0.00933 0.114 0.088 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 337658 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0812 0.113 0.088 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 9.18e-01 0.0157 0.152 0.088 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 8.20e-01 0.0249 0.109 0.088 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 2.22e-01 -0.125 0.102 0.088 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 4.96e-02 -0.114 0.0579 0.088 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0459 0.111 0.088 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 337658 sc-eQTL 3.14e-01 -0.136 0.134 0.088 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 5.12e-01 0.101 0.155 0.086 DC L1
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0191 0.127 0.086 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 884740 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0868 0.142 0.086 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0346 0.125 0.086 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0238 0.123 0.086 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 4.49e-01 -0.111 0.146 0.086 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 884763 sc-eQTL 1.12e-02 -0.373 0.146 0.086 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0342 0.111 0.088 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0245 0.101 0.088 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 884740 sc-eQTL 8.49e-01 0.0275 0.145 0.088 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 8.81e-01 0.0127 0.0847 0.088 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 2.32e-01 -0.132 0.11 0.088 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 1.04e-01 -0.189 0.116 0.088 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 884763 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0473 0.15 0.088 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 2.20e-01 0.17 0.138 0.086 NK L1
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0172 0.12 0.086 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0147 0.114 0.086 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0577 0.0832 0.086 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0732 0.111 0.086 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0459 0.163 0.088 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 8.82e-02 -0.201 0.118 0.088 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0409 0.127 0.088 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0301 0.0833 0.088 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 4.38e-01 0.0758 0.0975 0.088 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 9.99e-03 -0.459 0.176 0.094 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 4.40e-01 0.132 0.171 0.094 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 1.11e-01 0.285 0.178 0.094 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 6.05e-01 0.0841 0.162 0.094 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 285313 sc-eQTL 8.35e-01 0.0289 0.139 0.094 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 6.92e-01 0.0693 0.175 0.094 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 305949 sc-eQTL 7.94e-01 0.0458 0.175 0.094 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 7.48e-01 0.0502 0.156 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 9.92e-01 0.00138 0.135 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 5.71e-01 0.0827 0.146 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 2.37e-01 -0.147 0.124 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 285313 sc-eQTL 2.47e-01 0.176 0.152 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 4.07e-01 0.116 0.14 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 305949 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0295 0.152 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 3.33e-01 0.154 0.159 0.088 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 3.20e-01 -0.137 0.138 0.088 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0076 0.15 0.088 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 9.20e-01 -0.012 0.118 0.088 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 285313 sc-eQTL 1.49e-01 0.217 0.15 0.088 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 3.17e-01 -0.139 0.138 0.088 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 305949 sc-eQTL 3.16e-01 0.171 0.17 0.088 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 9.91e-01 0.00179 0.156 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 8.88e-01 0.0192 0.136 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0832 0.126 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 4.61e-01 0.0652 0.0882 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 285313 sc-eQTL 8.22e-01 0.0372 0.165 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 3.46e-01 -0.113 0.12 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 305949 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0284 0.158 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 5.63e-01 0.0862 0.149 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 3.24e-01 -0.138 0.14 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 1.08e-01 -0.214 0.133 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 1.75e-01 0.133 0.098 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 285313 sc-eQTL 1.34e-01 -0.233 0.155 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 7.10e-01 0.0592 0.159 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 305949 sc-eQTL 5.81e-01 0.0806 0.146 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 1.44e-01 0.223 0.152 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 8.64e-01 0.0264 0.154 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 2.13e-01 -0.187 0.149 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 7.02e-01 0.0523 0.137 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 5.69e-01 0.0782 0.137 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 337658 sc-eQTL 6.52e-01 0.0639 0.141 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 2.66e-01 -0.164 0.147 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0434 0.114 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0823 0.101 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 1.51e-01 -0.0978 0.0679 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 9.71e-01 0.00428 0.116 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 337658 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0772 0.117 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 3.31e-01 0.14 0.144 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 2.36e-01 -0.137 0.115 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0512 0.109 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0907 0.0838 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 9.02e-01 0.0153 0.125 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 337658 sc-eQTL 9.04e-01 0.0162 0.135 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 3.60e-01 -0.148 0.162 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 8.24e-01 0.028 0.126 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0809 0.137 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 7.33e-02 -0.175 0.0972 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 3.72e-01 -0.115 0.128 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 337658 sc-eQTL 2.98e-01 -0.14 0.134 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 2.12e-01 0.212 0.17 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0489 0.124 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 2.55e-01 -0.151 0.132 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0422 0.107 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 4.21e-01 -0.101 0.125 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 337658 sc-eQTL 4.57e-01 0.112 0.15 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0621 0.159 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 4.49e-01 0.0929 0.122 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 3.18e-01 -0.123 0.123 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0574 0.0643 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 9.33e-01 0.011 0.13 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 337658 sc-eQTL 4.75e-01 -0.107 0.149 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 8.34e-01 0.0368 0.175 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 4.30e-01 -0.101 0.128 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 3.50e-02 -0.279 0.132 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0962 0.132 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 4.26e-01 0.109 0.136 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 337658 sc-eQTL 8.81e-01 0.0215 0.144 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 9.55e-02 0.279 0.167 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 1.76e-01 0.212 0.156 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0843 0.163 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 3.70e-01 -0.113 0.126 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 6.94e-01 0.054 0.137 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 337658 sc-eQTL 5.08e-01 -0.103 0.156 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 2.34e-01 0.213 0.179 0.084 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 1.30e-02 -0.337 0.134 0.084 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0834 0.147 0.084 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0261 0.108 0.084 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 3.96e-01 0.108 0.127 0.084 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 9.12e-01 0.0179 0.163 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0439 0.147 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 3.00e-01 -0.143 0.137 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0295 0.127 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 3.22e-01 -0.135 0.136 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 3.90e-01 0.129 0.15 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 5.52e-01 0.077 0.129 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 5.98e-01 0.0648 0.123 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0162 0.0831 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 3.29e-01 -0.108 0.111 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 2.85e-01 0.186 0.173 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 8.42e-01 0.0324 0.163 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 1.03e-01 0.261 0.159 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0285 0.132 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 9.37e-01 0.0112 0.141 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 2.31e-02 0.348 0.152 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0921 0.132 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 1.88e-01 -0.18 0.136 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 9.87e-01 0.00144 0.0881 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0366 0.115 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 6.65e-01 0.0739 0.17 0.104 PB L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 5.92e-01 0.0995 0.185 0.104 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 5.43e-01 -0.1 0.165 0.104 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 2.47e-01 0.133 0.115 0.104 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 285313 sc-eQTL 4.39e-01 0.13 0.168 0.104 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 5.45e-01 0.0769 0.127 0.104 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 305949 sc-eQTL 4.17e-01 0.138 0.17 0.104 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 6.35e-01 0.0787 0.166 0.089 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 2.84e-01 0.14 0.13 0.089 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 3.75e-01 -0.136 0.153 0.089 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0406 0.0991 0.089 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0234 0.118 0.089 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 4.76e-01 0.112 0.157 0.088 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0672 0.131 0.088 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0769 0.135 0.088 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 3.74e-01 -0.102 0.115 0.088 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 5.29e-02 -0.248 0.127 0.088 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 337658 sc-eQTL 1.55e-01 -0.209 0.146 0.088 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0369 0.158 0.088 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0145 0.151 0.088 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 884740 sc-eQTL 3.67e-01 -0.133 0.147 0.088 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 3.55e-01 -0.157 0.169 0.088 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0917 0.139 0.088 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0426 0.147 0.088 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 884763 sc-eQTL 4.07e-02 -0.331 0.161 0.088 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 2.29e-01 0.145 0.12 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 7.05e-01 0.0378 0.0998 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 884740 sc-eQTL 4.00e-01 0.122 0.145 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0246 0.13 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 1.80e-01 -0.146 0.109 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 1.91e-01 -0.149 0.114 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 884763 sc-eQTL 2.44e-02 -0.341 0.151 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 4.50e-01 -0.106 0.14 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0523 0.118 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 884740 sc-eQTL 1.95e-01 -0.194 0.15 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 5.50e-01 -0.085 0.142 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0136 0.123 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 4.31e-02 -0.246 0.121 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 884763 sc-eQTL 5.59e-02 0.313 0.163 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 1.15e-01 -0.314 0.198 0.076 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 1.21e-01 -0.293 0.188 0.076 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 5.29e-01 0.124 0.196 0.076 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 3.30e-01 -0.144 0.147 0.076 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 1.65e-01 0.236 0.169 0.076 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 6.74e-01 0.0691 0.164 0.087 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 9.96e-01 0.000738 0.135 0.087 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 884740 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0706 0.148 0.087 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 8.99e-01 0.0196 0.153 0.087 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 2.70e-01 -0.154 0.14 0.087 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 7.66e-02 -0.24 0.135 0.087 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 884763 sc-eQTL 1.99e-01 0.214 0.166 0.087 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 1.69e-01 -0.212 0.153 0.084 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 2.62e-01 0.158 0.14 0.084 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 884740 sc-eQTL 4.60e-02 0.294 0.146 0.084 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00957 0.111 0.084 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 5.53e-01 0.0797 0.134 0.084 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 9.03e-01 -0.014 0.114 0.084 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 884763 sc-eQTL 4.23e-02 -0.332 0.163 0.084 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 4.86e-02 0.353 0.178 0.082 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 5.94e-01 0.0813 0.152 0.082 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 884740 sc-eQTL 8.51e-01 0.0262 0.139 0.082 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 9.50e-01 0.00878 0.141 0.082 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 8.80e-01 0.0233 0.154 0.082 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0452 0.181 0.082 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 884763 sc-eQTL 5.46e-01 0.0846 0.14 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 5.95e-01 0.0808 0.152 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0882 0.135 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 5.79e-01 0.0779 0.14 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 8.94e-01 0.013 0.0971 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 285313 sc-eQTL 2.36e-02 0.362 0.159 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 8.75e-01 0.0214 0.136 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 305949 sc-eQTL 6.44e-01 0.0733 0.159 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0292 0.144 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00601 0.135 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0991 0.115 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 6.62e-02 0.148 0.0801 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 285313 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0398 0.169 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 2.93e-01 -0.129 0.123 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 305949 sc-eQTL 3.61e-01 0.132 0.144 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 8.55e-01 0.0204 0.111 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0128 0.0999 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 884740 sc-eQTL 7.07e-01 0.055 0.146 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0853 0.12 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 2.99e-01 -0.111 0.107 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 2.18e-01 -0.144 0.117 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 884763 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0482 0.157 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 3.30e-01 -0.151 0.154 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 8.02e-01 0.0331 0.132 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 884740 sc-eQTL 4.62e-01 0.108 0.147 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0279 0.0914 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0659 0.134 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 3.82e-01 -0.101 0.115 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 884763 sc-eQTL 4.43e-01 -0.125 0.162 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 803802 sc-eQTL 1.82e-01 0.192 0.144 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 442231 sc-eQTL 9.78e-01 0.00343 0.123 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 589050 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00424 0.12 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 548566 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0262 0.0775 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 202663 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0598 0.112 0.086 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000164442 CITED2 202663 eQTL 0.00499 -0.0964 0.0343 0.00386 0.00113 0.113

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina