logo

Genes within 1Mb (chr6:139567860:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 9.31e-01 0.00713 0.0827 0.239 B L1
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 8.62e-01 0.014 0.0804 0.239 B L1
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 8.36e-02 0.123 0.0706 0.239 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 8.75e-01 0.00656 0.0417 0.239 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 275862 sc-eQTL 4.66e-01 0.0747 0.102 0.239 B L1
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0206 0.0644 0.239 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 296498 sc-eQTL 8.13e-01 -0.017 0.0716 0.239 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 5.95e-01 0.0491 0.0922 0.239 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 3.84e-01 0.0669 0.0768 0.239 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0188 0.0605 0.239 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 8.47e-01 0.00857 0.0444 0.239 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 7.81e-01 0.021 0.0757 0.239 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 328207 sc-eQTL 2.21e-01 0.0914 0.0744 0.239 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 7.94e-01 0.0263 0.1 0.239 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 4.73e-01 0.0516 0.0718 0.239 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 5.82e-01 0.0373 0.0675 0.239 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 3.15e-01 0.0386 0.0384 0.239 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 5.70e-01 0.0415 0.073 0.239 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 328207 sc-eQTL 3.00e-01 0.092 0.0885 0.239 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0451 0.1 0.227 DC L1
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0831 0.0824 0.227 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 875289 sc-eQTL 5.25e-01 0.0585 0.0919 0.227 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 1.63e-01 0.113 0.081 0.227 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00378 0.0797 0.227 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 5.73e-01 0.0534 0.0945 0.227 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 875312 sc-eQTL 6.74e-01 0.0405 0.0961 0.227 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0345 0.0735 0.239 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 4.30e-01 -0.053 0.067 0.239 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 875289 sc-eQTL 3.64e-01 0.0873 0.0959 0.239 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 2.31e-01 0.0674 0.0561 0.239 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 5.05e-01 0.0489 0.0731 0.239 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 1.49e-01 -0.112 0.0771 0.239 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 875312 sc-eQTL 8.49e-01 0.0191 0.0999 0.239 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 4.19e-01 0.0723 0.0893 0.238 NK L1
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 4.17e-01 0.0628 0.0772 0.238 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0294 0.0736 0.238 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 6.48e-01 0.0245 0.0537 0.238 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 8.80e-01 0.0108 0.0715 0.238 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0942 0.107 0.239 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00898 0.0778 0.239 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 6.76e-01 0.035 0.0836 0.239 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 2.08e-01 -0.069 0.0546 0.239 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 1.47e-01 0.0929 0.0638 0.239 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 2.12e-01 0.151 0.121 0.24 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0214 0.116 0.24 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 6.20e-01 0.0601 0.121 0.24 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 7.38e-01 0.0366 0.11 0.24 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 275862 sc-eQTL 2.52e-01 -0.107 0.0935 0.24 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 1.42e-01 -0.173 0.117 0.24 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 296498 sc-eQTL 5.72e-02 -0.223 0.117 0.24 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 3.39e-01 -0.098 0.102 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0399 0.0888 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 5.27e-02 0.185 0.095 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 6.11e-01 0.0416 0.0816 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 275862 sc-eQTL 1.23e-01 0.154 0.0994 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 3.51e-01 0.0858 0.0918 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 296498 sc-eQTL 1.36e-01 0.148 0.0991 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0746 0.104 0.241 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 1.62e-01 0.126 0.0899 0.241 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 8.42e-01 0.0196 0.0979 0.241 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0492 0.0774 0.241 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 275862 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0915 0.0986 0.241 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0217 0.0908 0.241 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 296498 sc-eQTL 7.33e-01 0.038 0.111 0.241 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00408 0.0987 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 2.48e-01 0.0995 0.0858 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 8.19e-01 0.0183 0.0797 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0116 0.0557 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 275862 sc-eQTL 7.09e-01 -0.039 0.104 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 9.06e-01 0.00893 0.0759 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 296498 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0595 0.0995 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 4.14e-01 -0.081 0.099 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 4.19e-01 0.0755 0.0932 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 1.26e-01 0.136 0.0886 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 3.61e-01 0.0599 0.0654 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 275862 sc-eQTL 6.36e-02 0.192 0.103 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0715 0.106 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 296498 sc-eQTL 2.56e-01 0.11 0.097 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 9.98e-01 0.000249 0.1 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0337 0.101 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00993 0.0983 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 9.50e-02 0.149 0.0889 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0383 0.0899 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 328207 sc-eQTL 7.43e-01 0.0304 0.0928 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 4.43e-01 0.0741 0.0964 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 3.73e-01 0.0669 0.0749 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0099 0.0665 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 5.00e-01 0.0302 0.0447 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 3.41e-01 0.0724 0.0759 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 328207 sc-eQTL 8.26e-02 0.133 0.0764 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 3.17e-01 0.096 0.0958 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 1.62e-01 0.107 0.0764 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00742 0.0728 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 8.66e-01 0.00942 0.056 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0247 0.0832 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 328207 sc-eQTL 3.93e-01 0.0768 0.0898 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 1.75e-01 0.145 0.106 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 6.38e-01 0.0392 0.0831 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 6.76e-01 0.0379 0.0906 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0401 0.0645 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0144 0.0848 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 328207 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0534 0.0887 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 2.92e-01 -0.116 0.11 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 6.63e-01 0.035 0.08 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0344 0.0857 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 9.36e-01 0.00558 0.0693 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 7.02e-01 0.0309 0.0807 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 328207 sc-eQTL 7.43e-01 0.0318 0.0968 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 2.54e-01 0.121 0.105 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 4.41e-01 0.063 0.0815 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 9.24e-01 0.00783 0.0818 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 4.72e-01 0.0309 0.0429 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 5.18e-01 0.0562 0.0867 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 328207 sc-eQTL 2.59e-01 0.112 0.099 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 8.98e-01 0.0154 0.12 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 1.34e-01 0.131 0.0872 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 5.72e-01 0.0515 0.0911 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 3.27e-01 0.0891 0.0906 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 6.52e-01 0.0421 0.0933 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 328207 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0907 0.0983 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 2.48e-01 0.126 0.109 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0563 0.102 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0187 0.106 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 8.36e-01 0.0169 0.0818 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 7.67e-01 0.0264 0.0889 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 328207 sc-eQTL 4.11e-01 0.0833 0.101 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0631 0.113 0.24 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 8.62e-01 0.015 0.0861 0.24 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 5.36e-01 0.0574 0.0926 0.24 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 7.36e-01 -0.023 0.0682 0.24 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 5.70e-01 0.0456 0.0802 0.24 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 3.17e-01 0.105 0.105 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 1.28e-01 0.144 0.0946 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0119 0.0888 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0289 0.0818 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 3.11e-01 0.0888 0.0875 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 5.55e-01 0.0574 0.0972 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0413 0.0836 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 7.43e-01 0.026 0.0793 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0025 0.0537 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00799 0.0716 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 6.39e-02 0.203 0.109 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 3.09e-01 0.104 0.102 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 2.79e-01 -0.11 0.101 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0228 0.0833 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 5.41e-01 0.0545 0.0889 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 7.90e-01 0.0265 0.0995 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 9.79e-02 0.142 0.0851 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0682 0.0883 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 4.00e-01 0.048 0.0569 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 5.59e-01 0.0436 0.0743 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 9.35e-01 0.0102 0.124 0.222 PB L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 9.47e-01 0.00894 0.135 0.222 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 5.51e-01 0.0718 0.12 0.222 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0403 0.0841 0.222 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 275862 sc-eQTL 9.26e-01 0.0115 0.123 0.222 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0957 0.0921 0.222 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 296498 sc-eQTL 3.16e-01 0.124 0.124 0.222 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0214 0.11 0.235 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 3.19e-01 0.0867 0.0868 0.235 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0893 0.102 0.235 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 5.25e-01 0.042 0.066 0.235 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 3.05e-01 0.0807 0.0785 0.235 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 1.20e-01 -0.16 0.103 0.239 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0291 0.0858 0.239 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 9.74e-01 0.00293 0.0888 0.239 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 4.57e-01 0.0562 0.0755 0.239 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 7.68e-01 0.0249 0.0844 0.239 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 328207 sc-eQTL 3.62e-01 -0.088 0.0964 0.239 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 8.69e-01 0.0169 0.102 0.239 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0164 0.0969 0.239 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 875289 sc-eQTL 8.10e-02 0.165 0.0941 0.239 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 3.04e-01 0.112 0.109 0.239 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 2.02e-01 -0.114 0.089 0.239 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 6.57e-02 0.174 0.0939 0.239 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 875312 sc-eQTL 4.38e-01 0.0812 0.105 0.239 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00506 0.0806 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 7.64e-01 -0.02 0.0665 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 875289 sc-eQTL 5.61e-01 0.0564 0.0969 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 2.80e-01 0.0934 0.0863 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 4.03e-01 0.0609 0.0727 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0707 0.076 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 875312 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00559 0.102 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 5.89e-02 -0.175 0.0923 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00648 0.0787 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 875289 sc-eQTL 1.23e-02 0.248 0.0982 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0557 0.0942 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 4.25e-01 0.0654 0.0819 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0158 0.0812 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 875312 sc-eQTL 8.43e-01 0.0217 0.109 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 7.30e-01 0.0425 0.123 0.245 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 5.84e-01 -0.064 0.117 0.245 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0892 0.121 0.245 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 7.53e-02 -0.161 0.09 0.245 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 6.61e-02 0.192 0.104 0.245 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0895 0.107 0.233 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 5.20e-01 0.0568 0.0881 0.233 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 875289 sc-eQTL 4.50e-01 0.0736 0.0971 0.233 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 4.48e-01 0.0763 0.1 0.233 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 7.63e-01 0.0277 0.0917 0.233 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00447 0.089 0.233 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 875312 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0574 0.109 0.233 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 9.13e-01 -0.011 0.101 0.233 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0685 0.0918 0.233 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 875289 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0532 0.0965 0.233 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 8.62e-01 0.0126 0.0728 0.233 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 3.54e-01 0.0814 0.0875 0.233 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 7.95e-01 0.0194 0.0744 0.233 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 875312 sc-eQTL 3.83e-01 0.0937 0.107 0.233 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 2.08e-01 -0.142 0.113 0.226 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 1.47e-01 -0.139 0.0953 0.226 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 875289 sc-eQTL 1.19e-01 -0.136 0.0871 0.226 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 4.31e-01 0.07 0.0887 0.226 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 3.80e-01 0.0853 0.0969 0.226 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0247 0.114 0.226 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 875312 sc-eQTL 2.72e-02 -0.193 0.0868 0.226 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0609 0.0981 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0168 0.0874 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 1.10e-01 0.145 0.0901 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 9.49e-01 -0.004 0.0628 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 275862 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0252 0.104 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 9.57e-01 0.00476 0.0882 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 296498 sc-eQTL 7.89e-01 0.0275 0.103 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0135 0.0932 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 3.81e-01 0.0764 0.087 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 2.95e-01 0.0779 0.0741 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 6.85e-01 0.0212 0.0521 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 275862 sc-eQTL 5.57e-01 0.0641 0.109 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0149 0.0792 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 296498 sc-eQTL 9.12e-01 0.0103 0.0931 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0527 0.0743 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0256 0.0667 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 875289 sc-eQTL 1.45e-01 0.142 0.097 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 2.81e-01 0.0866 0.08 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 4.46e-01 0.0545 0.0713 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0653 0.078 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 875312 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0283 0.105 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0686 0.0994 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0368 0.0849 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 875289 sc-eQTL 6.38e-01 0.0446 0.0945 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 5.25e-01 0.0374 0.0588 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 7.13e-01 0.0318 0.0861 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 8.86e-01 0.0107 0.0742 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 875312 sc-eQTL 4.06e-01 0.0869 0.104 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 794351 sc-eQTL 4.70e-01 0.0674 0.0931 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 432780 sc-eQTL 6.47e-01 0.0364 0.0795 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 579599 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0304 0.0777 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 539115 sc-eQTL 5.20e-01 0.0323 0.0501 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 193212 sc-eQTL 9.43e-01 0.00518 0.0725 0.237 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112406 \N 432780 1.25e-06 9.53e-07 3.2e-07 6.31e-07 2.66e-07 4.59e-07 1.07e-06 3.24e-07 1.14e-06 3.76e-07 1.39e-06 6.06e-07 1.73e-06 2.8e-07 4.12e-07 6.57e-07 7.7e-07 5.75e-07 7.55e-07 4.65e-07 3.6e-07 9.46e-07 7.16e-07 5.39e-07 1.95e-06 2.44e-07 6.88e-07 5.63e-07 9.32e-07 1.26e-06 5.67e-07 3.9e-08 1.34e-07 4.87e-07 5.34e-07 4.69e-07 3.79e-07 2.03e-07 1.49e-07 1.92e-07 1.91e-07 1.57e-06 5.37e-08 1.06e-07 1.88e-07 8.83e-08 1.97e-07 8.67e-08 8.38e-08
ENSG00000231329 \N 328207 1.29e-06 1.42e-06 2.29e-07 1.28e-06 4.25e-07 6.24e-07 1.52e-06 4.35e-07 1.66e-06 6.73e-07 2.01e-06 1.14e-06 2.62e-06 4.66e-07 4.81e-07 9.62e-07 9.77e-07 1.08e-06 5.51e-07 5.08e-07 7.55e-07 1.92e-06 1.1e-06 5.89e-07 2.44e-06 6.58e-07 1.03e-06 8.66e-07 1.57e-06 1.47e-06 7.58e-07 2.85e-07 2.54e-07 5.62e-07 7.57e-07 6.26e-07 6.86e-07 3.36e-07 4.73e-07 2.08e-07 3.05e-07 2.12e-06 2.92e-07 2.06e-07 2.99e-07 2.36e-07 2.33e-07 1.41e-07 1.85e-07