logo

Genes within 1Mb (chr6:139548683:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00301 0.122 0.092 B L1
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 1.32e-01 -0.178 0.118 0.092 B L1
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 2.35e-01 -0.124 0.104 0.092 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 4.32e-01 0.0484 0.0615 0.092 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 256685 sc-eQTL 9.28e-01 0.0136 0.151 0.092 B L1
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0795 0.0948 0.092 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 277321 sc-eQTL 3.27e-01 0.104 0.105 0.092 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 3.67e-01 0.123 0.136 0.092 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0573 0.114 0.092 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 6.73e-01 0.0378 0.0896 0.092 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0465 0.0657 0.092 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 8.12e-01 0.0267 0.112 0.092 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 309030 sc-eQTL 8.84e-01 0.0161 0.111 0.092 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 7.67e-01 0.0436 0.147 0.092 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0448 0.105 0.092 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 6.13e-01 -0.05 0.0986 0.092 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0564 0.0561 0.092 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 2.79e-01 -0.116 0.106 0.092 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 309030 sc-eQTL 2.39e-01 0.153 0.129 0.092 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 8.20e-01 0.034 0.149 0.083 DC L1
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0454 0.123 0.083 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 856112 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0594 0.137 0.083 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 2.62e-01 -0.136 0.121 0.083 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 5.06e-01 0.0788 0.118 0.083 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 6.97e-01 0.0548 0.141 0.083 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 856135 sc-eQTL 1.95e-01 -0.185 0.142 0.083 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 2.23e-01 0.13 0.106 0.092 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0601 0.0969 0.092 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 856112 sc-eQTL 3.56e-01 -0.128 0.139 0.092 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0603 0.0812 0.092 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 8.86e-02 0.18 0.105 0.092 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0697 0.112 0.092 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 856135 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0505 0.144 0.092 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 1.34e-02 0.323 0.13 0.09 NK L1
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 9.90e-01 0.00135 0.114 0.09 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0459 0.108 0.09 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 8.98e-01 0.0101 0.0789 0.09 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0584 0.105 0.09 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 6.46e-01 0.0705 0.153 0.092 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0467 0.111 0.092 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0635 0.119 0.092 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 7.91e-01 0.0208 0.0782 0.092 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 6.59e-01 0.0405 0.0915 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 5.36e-01 -0.103 0.166 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 2.81e-01 0.17 0.158 0.099 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 4.43e-02 0.331 0.164 0.099 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 1.35e-01 0.223 0.149 0.099 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 256685 sc-eQTL 1.84e-02 -0.3 0.126 0.099 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0439 0.161 0.099 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 277321 sc-eQTL 2.41e-01 0.189 0.161 0.099 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 2.79e-01 0.163 0.15 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 8.68e-01 0.0216 0.13 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0854 0.14 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 8.68e-01 0.0199 0.119 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 256685 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0723 0.146 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 6.51e-01 0.0609 0.135 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 277321 sc-eQTL 4.61e-01 -0.108 0.146 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 8.28e-01 0.0328 0.151 0.093 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0599 0.13 0.093 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0565 0.141 0.093 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0134 0.112 0.093 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 256685 sc-eQTL 3.31e-01 0.139 0.142 0.093 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 7.78e-01 -0.037 0.131 0.093 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 277321 sc-eQTL 2.59e-01 0.182 0.161 0.093 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 4.04e-01 -0.122 0.145 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 3.13e-01 -0.128 0.127 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0405 0.117 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0491 0.0821 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 256685 sc-eQTL 4.44e-01 -0.118 0.154 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 3.36e-01 -0.108 0.112 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 277321 sc-eQTL 9.35e-01 0.0119 0.147 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 3.32e-01 0.139 0.143 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 1.74e-02 -0.318 0.133 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 8.22e-02 -0.223 0.127 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 1.71e-01 0.129 0.0941 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 256685 sc-eQTL 4.85e-01 -0.105 0.149 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 5.02e-01 0.103 0.153 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 277321 sc-eQTL 2.80e-01 0.152 0.14 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 5.75e-01 0.0815 0.145 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 4.38e-01 0.114 0.146 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0552 0.142 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 2.99e-01 0.135 0.129 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0168 0.13 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 309030 sc-eQTL 4.44e-01 0.103 0.134 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0436 0.144 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0623 0.112 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 1.13e-01 0.157 0.0986 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 9.18e-01 0.00692 0.0668 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 4.88e-01 0.0786 0.113 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 309030 sc-eQTL 9.39e-01 0.00879 0.115 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 2.34e-02 0.315 0.138 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0591 0.112 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 8.60e-01 0.0187 0.106 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 5.87e-01 0.0443 0.0814 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 3.28e-01 0.119 0.121 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 309030 sc-eQTL 5.47e-01 0.0788 0.131 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 4.71e-01 0.112 0.155 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0484 0.121 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 3.93e-02 -0.271 0.131 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0455 0.094 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 2.51e-01 -0.142 0.123 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 309030 sc-eQTL 3.81e-01 -0.113 0.129 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 1.10e-01 0.252 0.157 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00511 0.115 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 4.04e-01 -0.103 0.123 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0596 0.0996 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 1.83e-01 -0.154 0.116 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 309030 sc-eQTL 3.23e-01 0.137 0.139 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 4.60e-01 -0.113 0.153 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 8.70e-01 0.0194 0.118 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0125 0.118 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 4.99e-01 -0.042 0.062 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0948 0.125 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 309030 sc-eQTL 8.29e-01 0.031 0.144 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 6.43e-01 0.0775 0.167 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 1.76e-01 -0.165 0.122 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 7.40e-02 -0.226 0.126 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0618 0.126 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 4.61e-01 0.096 0.13 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 309030 sc-eQTL 4.68e-02 0.272 0.136 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 2.49e-01 0.179 0.155 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 8.69e-01 -0.024 0.145 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0794 0.151 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00968 0.116 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 2.23e-01 -0.154 0.126 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 309030 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0249 0.144 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 9.82e-02 0.279 0.168 0.093 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 8.51e-01 0.0242 0.128 0.093 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0853 0.138 0.093 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0973 0.101 0.093 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 6.10e-01 0.0611 0.12 0.093 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 2.40e-01 0.18 0.153 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00218 0.139 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0298 0.13 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 1.73e-01 -0.163 0.119 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0163 0.128 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 1.07e-01 0.229 0.142 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000646 0.123 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 2.57e-01 -0.132 0.116 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 1.78e-01 0.106 0.0783 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00909 0.105 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 7.84e-01 0.0443 0.162 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 7.14e-01 0.0555 0.151 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 7.77e-01 0.0423 0.149 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 2.92e-01 -0.129 0.122 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0571 0.131 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 1.03e-03 0.472 0.142 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 6.55e-01 0.056 0.125 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 6.10e-01 0.066 0.129 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 9.45e-01 0.00577 0.0833 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 8.77e-01 0.0168 0.109 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 5.24e-02 0.31 0.158 0.115 PB L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 2.64e-01 -0.196 0.174 0.115 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0267 0.156 0.115 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0539 0.109 0.115 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 256685 sc-eQTL 6.83e-01 0.0651 0.159 0.115 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 3.80e-01 0.105 0.119 0.115 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 277321 sc-eQTL 1.88e-01 0.211 0.159 0.115 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00381 0.16 0.093 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 4.83e-01 0.0885 0.126 0.093 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0524 0.148 0.093 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 9.79e-01 0.00256 0.0958 0.093 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 9.29e-01 0.0102 0.114 0.093 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 2.48e-01 0.177 0.153 0.092 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 6.97e-01 0.0496 0.127 0.092 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 6.01e-01 0.069 0.132 0.092 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0451 0.112 0.092 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 4.05e-01 -0.104 0.125 0.092 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 309030 sc-eQTL 7.26e-01 0.0502 0.143 0.092 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 2.99e-01 -0.158 0.151 0.085 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0243 0.144 0.085 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 856112 sc-eQTL 9.99e-01 0.000132 0.141 0.085 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 4.77e-01 -0.116 0.163 0.085 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 2.69e-01 0.147 0.133 0.085 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 3.37e-01 0.136 0.141 0.085 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 856135 sc-eQTL 2.76e-01 -0.17 0.155 0.085 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 4.53e-02 0.231 0.115 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0396 0.0956 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 856112 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00331 0.139 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 3.01e-01 -0.129 0.124 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 1.38e-01 0.155 0.104 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 3.50e-01 -0.102 0.109 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 856135 sc-eQTL 3.85e-02 -0.301 0.144 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00443 0.133 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 8.89e-02 -0.191 0.112 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 856112 sc-eQTL 1.34e-01 -0.214 0.142 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 7.61e-01 -0.041 0.135 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 2.01e-01 0.15 0.117 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 3.01e-01 -0.12 0.116 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 856135 sc-eQTL 3.81e-01 0.137 0.156 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 3.30e-01 -0.18 0.185 0.079 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 1.58e-01 -0.248 0.175 0.079 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 8.13e-01 0.043 0.182 0.079 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 3.92e-01 -0.117 0.137 0.079 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 3.92e-01 0.135 0.157 0.079 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 1.28e-01 0.236 0.155 0.089 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 6.86e-01 0.0516 0.128 0.089 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 856112 sc-eQTL 3.69e-01 -0.127 0.14 0.089 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 5.61e-01 0.0846 0.145 0.089 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 7.75e-01 0.0379 0.133 0.089 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 9.32e-01 0.011 0.129 0.089 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 856135 sc-eQTL 5.23e-01 -0.101 0.158 0.089 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 2.00e-01 -0.186 0.145 0.086 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 8.92e-01 0.0182 0.133 0.086 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 856112 sc-eQTL 1.63e-01 0.195 0.139 0.086 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0778 0.105 0.086 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 5.44e-01 0.0772 0.127 0.086 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 7.23e-01 0.0383 0.108 0.086 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 856135 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00659 0.155 0.086 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 4.02e-02 0.345 0.167 0.082 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 8.18e-01 0.0331 0.143 0.082 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 856112 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0722 0.131 0.082 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0781 0.132 0.082 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0914 0.145 0.082 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0807 0.17 0.082 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 856135 sc-eQTL 5.26e-01 0.0834 0.131 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 2.54e-01 0.165 0.144 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0591 0.128 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0491 0.133 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 4.21e-01 0.0743 0.0922 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 256685 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0856 0.153 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00846 0.13 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 277321 sc-eQTL 9.15e-01 0.0162 0.151 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0277 0.135 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 1.00e-01 -0.207 0.125 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0818 0.107 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 7.48e-01 0.0242 0.0754 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 256685 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0856 0.158 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 2.93e-01 -0.121 0.114 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 277321 sc-eQTL 1.44e-01 0.197 0.134 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 2.15e-01 0.132 0.106 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 3.29e-01 -0.093 0.0951 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 856112 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0822 0.139 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 3.78e-01 -0.101 0.114 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 1.03e-01 0.166 0.101 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0735 0.112 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 856135 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0894 0.149 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 9.06e-01 0.0175 0.148 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 9.19e-01 0.0128 0.126 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 856112 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0513 0.14 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0514 0.0872 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 2.23e-01 0.156 0.127 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 9.33e-01 0.00931 0.11 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 856135 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0132 0.155 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 775174 sc-eQTL 6.63e-03 0.37 0.135 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 413603 sc-eQTL 8.03e-01 0.0292 0.117 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 560422 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0466 0.114 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 519938 sc-eQTL 3.27e-01 0.0724 0.0736 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 174035 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0478 0.107 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000164440 TXLNB 256685 eQTL 0.00721 -0.109 0.0404 0.0 0.0 0.116

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112406 \N 413603 1.17e-06 6.56e-07 1.11e-07 4.32e-07 1.05e-07 2.63e-07 6.08e-07 1.65e-07 6.03e-07 2.81e-07 9.73e-07 4.62e-07 9.97e-07 1.59e-07 2.77e-07 3.36e-07 4.29e-07 4.33e-07 2.25e-07 1.78e-07 2.17e-07 4.81e-07 4.2e-07 2.24e-07 1.13e-06 2.74e-07 3.37e-07 3.18e-07 4.39e-07 6.42e-07 3.66e-07 6.63e-08 4.42e-08 1.73e-07 3.42e-07 1.21e-07 1.11e-07 7.75e-08 6.63e-08 2.77e-08 1.02e-07 7.36e-07 2.8e-08 2e-08 1.47e-07 1.33e-08 1.1e-07 7.25e-09 5.56e-08
ENSG00000164440 TXLNB 256685 1.36e-06 1.22e-06 2.65e-07 1.26e-06 3.82e-07 6.06e-07 1.47e-06 3.9e-07 1.57e-06 5.89e-07 2.08e-06 8.26e-07 2.49e-06 2.95e-07 5.18e-07 9.92e-07 9.17e-07 1.05e-06 8.59e-07 5.15e-07 8.11e-07 1.93e-06 1.09e-06 6.27e-07 2.49e-06 6.95e-07 9.37e-07 9.43e-07 1.59e-06 1.2e-06 8.22e-07 2.57e-07 2.33e-07 5.94e-07 5.49e-07 4.6e-07 6.17e-07 2.21e-07 4.67e-07 2.97e-07 2.79e-07 1.8e-06 9.55e-08 9.66e-08 2.8e-07 1.35e-07 2.2e-07 5.32e-08 1.36e-07