logo

Genes within 1Mb (chr6:139546670:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 8.34e-01 0.0262 0.125 0.083 B L1
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 2.75e-01 -0.132 0.121 0.083 B L1
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 2.98e-01 -0.111 0.107 0.083 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 1.37e-01 0.0934 0.0627 0.083 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 254672 sc-eQTL 8.88e-01 0.0217 0.154 0.083 B L1
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0712 0.0971 0.083 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 275308 sc-eQTL 3.18e-01 0.108 0.108 0.083 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 2.26e-01 0.17 0.14 0.083 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 9.62e-01 0.00563 0.117 0.083 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 9.40e-01 0.0069 0.0921 0.083 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0586 0.0675 0.083 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 5.07e-01 0.0766 0.115 0.083 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 307017 sc-eQTL 4.46e-01 0.0867 0.114 0.083 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 7.48e-01 0.0481 0.149 0.083 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0103 0.107 0.083 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 2.95e-01 -0.105 0.1 0.083 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0718 0.0571 0.083 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0903 0.109 0.083 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 307017 sc-eQTL 1.55e-01 0.188 0.132 0.083 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 6.02e-01 0.0797 0.152 0.077 DC L1
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 9.50e-01 0.00783 0.126 0.077 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 854099 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0731 0.14 0.077 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0719 0.124 0.077 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 7.59e-01 0.0372 0.121 0.077 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 5.93e-01 0.077 0.144 0.077 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 854122 sc-eQTL 4.44e-01 -0.112 0.146 0.077 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 2.72e-01 0.12 0.109 0.083 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0247 0.0993 0.083 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 854099 sc-eQTL 4.30e-01 -0.112 0.142 0.083 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0247 0.0833 0.083 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 4.47e-01 0.0825 0.108 0.083 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 3.22e-01 -0.114 0.114 0.083 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 854122 sc-eQTL 6.81e-01 0.061 0.148 0.083 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 3.77e-03 0.387 0.132 0.082 NK L1
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 9.03e-01 0.0143 0.116 0.082 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0468 0.111 0.082 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0126 0.0809 0.082 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0604 0.108 0.082 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 3.51e-01 0.147 0.157 0.083 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 3.25e-01 -0.112 0.114 0.083 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0664 0.122 0.083 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 8.83e-01 0.0118 0.0802 0.083 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 5.79e-01 0.0522 0.0939 0.083 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0942 0.172 0.089 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 3.84e-01 0.142 0.163 0.089 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 1.44e-01 0.25 0.17 0.089 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 9.12e-02 0.261 0.154 0.089 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 254672 sc-eQTL 2.12e-02 -0.304 0.131 0.089 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 9.74e-01 0.00545 0.167 0.089 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 275308 sc-eQTL 3.03e-01 0.172 0.166 0.089 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 3.98e-01 0.129 0.153 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 4.06e-01 0.11 0.132 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0251 0.143 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 8.36e-01 0.0252 0.122 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 254672 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0858 0.149 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 6.68e-01 0.0589 0.137 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 275308 sc-eQTL 4.27e-01 -0.118 0.148 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 6.16e-01 0.0775 0.154 0.084 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 4.27e-01 -0.106 0.133 0.084 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0796 0.144 0.084 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0329 0.114 0.084 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 254672 sc-eQTL 3.02e-01 0.15 0.145 0.084 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0176 0.134 0.084 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 275308 sc-eQTL 4.05e-01 0.137 0.164 0.084 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0956 0.148 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0989 0.129 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0712 0.12 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 9.65e-01 0.00365 0.0837 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 254672 sc-eQTL 4.85e-01 -0.11 0.157 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 2.68e-01 -0.126 0.114 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 275308 sc-eQTL 8.08e-01 0.0364 0.15 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 2.49e-01 0.168 0.145 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 4.76e-02 -0.27 0.136 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 1.33e-01 -0.196 0.13 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 4.16e-02 0.195 0.0952 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 254672 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0956 0.152 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 5.13e-01 0.102 0.155 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 275308 sc-eQTL 1.20e-01 0.221 0.142 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 6.06e-01 0.0767 0.149 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 2.90e-01 0.159 0.15 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0979 0.146 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 2.47e-01 0.154 0.132 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0207 0.133 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 307017 sc-eQTL 4.51e-01 0.104 0.137 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0113 0.148 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0167 0.115 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 1.71e-01 0.139 0.101 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00353 0.0686 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 2.63e-01 0.13 0.116 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 307017 sc-eQTL 5.60e-01 0.0688 0.118 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 9.41e-03 0.369 0.141 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0284 0.114 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0099 0.108 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 6.27e-01 0.0406 0.0833 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 2.69e-01 0.137 0.124 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 307017 sc-eQTL 4.11e-01 0.11 0.134 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 2.64e-01 0.177 0.158 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00607 0.123 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 6.84e-02 -0.244 0.133 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0586 0.0957 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 3.08e-01 -0.128 0.125 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 307017 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0799 0.132 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 9.87e-02 0.266 0.16 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 6.81e-01 0.0483 0.117 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 2.48e-01 -0.145 0.125 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0756 0.102 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 3.11e-01 -0.12 0.118 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 307017 sc-eQTL 2.79e-01 0.154 0.142 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0427 0.156 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 5.41e-01 0.0737 0.12 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0806 0.121 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0529 0.0633 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0312 0.128 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 307017 sc-eQTL 5.75e-01 0.0822 0.147 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 2.69e-01 0.188 0.17 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 2.62e-01 -0.14 0.124 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 3.95e-02 -0.266 0.128 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0834 0.129 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 2.13e-01 0.165 0.132 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 307017 sc-eQTL 5.86e-02 0.264 0.139 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 1.52e-01 0.228 0.158 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 9.88e-01 0.00229 0.149 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 3.85e-01 -0.135 0.155 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000621 0.12 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 2.87e-01 -0.138 0.13 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 307017 sc-eQTL 7.74e-01 0.0425 0.148 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 1.14e-01 0.273 0.172 0.084 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 6.49e-01 -0.06 0.131 0.084 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0994 0.141 0.084 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 3.93e-01 -0.089 0.104 0.084 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 4.46e-01 0.0936 0.122 0.084 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 2.09e-01 0.199 0.158 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0734 0.144 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0601 0.134 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 2.90e-01 -0.131 0.123 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0037 0.133 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 2.54e-02 0.324 0.144 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 6.35e-01 0.0596 0.125 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 3.74e-01 -0.106 0.119 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 2.49e-01 0.0928 0.0803 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00835 0.107 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 6.45e-01 0.0766 0.166 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 7.13e-01 0.0573 0.155 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 5.88e-01 0.0832 0.153 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 1.22e-01 -0.195 0.125 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0416 0.135 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 3.77e-04 0.523 0.145 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 7.86e-01 0.0349 0.128 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 8.35e-01 0.0277 0.133 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00722 0.0855 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00186 0.112 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 5.30e-02 0.31 0.159 0.107 PB L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 4.55e-01 -0.131 0.175 0.107 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00773 0.156 0.107 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0779 0.109 0.107 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 254672 sc-eQTL 5.23e-01 0.102 0.159 0.107 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 4.97e-01 0.0817 0.12 0.107 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 275308 sc-eQTL 1.40e-01 0.237 0.16 0.107 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 6.36e-01 0.0773 0.163 0.085 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 6.10e-01 0.0654 0.128 0.085 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 4.22e-01 -0.122 0.151 0.085 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00798 0.0975 0.085 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0318 0.116 0.085 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 1.89e-01 0.204 0.155 0.083 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 4.14e-01 0.106 0.129 0.083 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 5.66e-01 0.0767 0.133 0.083 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0855 0.114 0.083 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 2.25e-01 -0.154 0.127 0.083 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 307017 sc-eQTL 7.02e-01 0.0557 0.145 0.083 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 3.20e-01 -0.155 0.155 0.078 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 7.60e-01 0.0454 0.148 0.078 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 854099 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0312 0.145 0.078 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0615 0.167 0.078 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 3.26e-01 0.134 0.136 0.078 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 3.52e-01 0.135 0.145 0.078 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 854122 sc-eQTL 5.23e-01 -0.102 0.16 0.078 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 3.70e-02 0.246 0.117 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 9.41e-01 0.00725 0.0979 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 854099 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0177 0.143 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 3.16e-01 -0.128 0.127 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 6.13e-01 0.0543 0.107 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 2.45e-01 -0.13 0.112 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 854122 sc-eQTL 1.84e-01 -0.198 0.149 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0376 0.137 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 1.67e-01 -0.159 0.115 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 854099 sc-eQTL 2.28e-01 -0.176 0.146 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0958 0.138 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 3.13e-01 0.121 0.12 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 3.46e-01 -0.112 0.119 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 854122 sc-eQTL 1.86e-01 0.212 0.16 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 4.46e-01 -0.145 0.19 0.073 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 1.19e-01 -0.28 0.179 0.073 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 8.48e-01 0.0358 0.187 0.073 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 3.19e-01 -0.14 0.14 0.073 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 2.33e-01 0.193 0.161 0.073 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 1.13e-01 0.253 0.159 0.08 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 6.26e-01 0.064 0.131 0.08 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 854099 sc-eQTL 3.81e-01 -0.127 0.144 0.08 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 6.13e-01 0.0756 0.149 0.08 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 7.09e-01 0.051 0.136 0.08 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0357 0.132 0.08 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 854122 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0255 0.162 0.08 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 2.55e-01 -0.17 0.149 0.077 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 4.59e-01 0.101 0.136 0.077 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 854099 sc-eQTL 9.55e-02 0.239 0.143 0.077 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0147 0.108 0.077 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 8.94e-01 0.0174 0.13 0.077 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 8.76e-01 0.0173 0.111 0.077 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 854122 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0151 0.16 0.077 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 2.87e-02 0.374 0.169 0.076 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 5.30e-01 0.0916 0.146 0.076 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 854099 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0652 0.133 0.076 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0346 0.135 0.076 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 4.70e-01 -0.107 0.147 0.076 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0556 0.173 0.076 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 854122 sc-eQTL 4.17e-01 0.109 0.134 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 2.43e-01 0.172 0.146 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0117 0.131 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0328 0.135 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 4.51e-01 0.0708 0.0938 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 254672 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0939 0.155 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00171 0.132 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 275308 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0119 0.153 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 9.58e-01 0.00717 0.137 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 1.85e-01 -0.17 0.128 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0848 0.109 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 3.14e-01 0.0773 0.0766 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 254672 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0692 0.161 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 2.60e-01 -0.132 0.116 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 275308 sc-eQTL 7.10e-02 0.247 0.136 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 2.97e-01 0.114 0.109 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0577 0.0976 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 854099 sc-eQTL 6.20e-01 -0.071 0.143 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 2.88e-01 -0.125 0.117 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 4.46e-01 0.0797 0.104 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0893 0.114 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 854122 sc-eQTL 8.89e-01 0.0214 0.153 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 8.41e-01 0.0304 0.151 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 6.00e-01 0.0678 0.129 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 854099 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0198 0.144 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 7.97e-01 0.023 0.0895 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 5.03e-01 0.0877 0.131 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0316 0.113 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 854122 sc-eQTL 8.20e-01 0.0361 0.159 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 773161 sc-eQTL 1.16e-03 0.451 0.137 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 411590 sc-eQTL 6.00e-01 0.0628 0.12 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 558409 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0263 0.117 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 517925 sc-eQTL 5.29e-01 0.0477 0.0755 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 172022 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0479 0.109 0.082 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000164440 TXLNB 254672 eQTL 0.00461 -0.118 0.0417 0.00118 0.0 0.106

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112406 \N 411590 1.11e-06 9.45e-07 2.75e-07 3.63e-07 9.86e-08 3.08e-07 6.52e-07 1.55e-07 7.11e-07 3.1e-07 1.08e-06 4.28e-07 1.35e-06 2.08e-07 3.16e-07 3.4e-07 6.37e-07 4.4e-07 2.79e-07 1.8e-07 2.5e-07 5.5e-07 4.74e-07 1.8e-07 1.47e-06 2.56e-07 4.7e-07 3.62e-07 5.03e-07 7.63e-07 4.61e-07 4.06e-08 5.71e-08 1.69e-07 3.23e-07 1.36e-07 1.45e-07 1.08e-07 1.11e-07 8.51e-09 4.36e-08 9.76e-07 6.04e-08 1.24e-08 1.45e-07 3.46e-08 1.27e-07 1.24e-08 6.15e-08
ENSG00000164440 TXLNB 254672 1.4e-06 2.43e-06 3.08e-07 1.41e-06 3.47e-07 6.47e-07 1.35e-06 3.95e-07 1.72e-06 6.9e-07 2.05e-06 8.26e-07 2.73e-06 6.19e-07 4.76e-07 9.98e-07 1.05e-06 1.1e-06 6.56e-07 5.27e-07 7.61e-07 1.97e-06 1.19e-06 5.64e-07 2.42e-06 7.38e-07 1.02e-06 8.31e-07 1.62e-06 1.29e-06 7.56e-07 2.96e-07 2.89e-07 6e-07 6.82e-07 4.74e-07 7.46e-07 2.74e-07 5e-07 2.42e-07 3.03e-07 2.5e-06 3.55e-07 1.41e-07 2.1e-07 2.18e-07 2.09e-07 3.68e-08 1.58e-07