logo

Genes within 1Mb (chr6:139544095:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 3.85e-02 -0.168 0.0807 0.248 B L1
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 3.20e-02 0.169 0.0785 0.248 B L1
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 9.31e-01 0.00607 0.0701 0.248 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0217 0.0412 0.248 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 252097 sc-eQTL 9.39e-02 0.169 0.1 0.248 B L1
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 1.11e-01 0.101 0.0632 0.248 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 272733 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0661 0.0705 0.248 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0155 0.0912 0.248 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 3.81e-01 0.0666 0.0759 0.248 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 3.77e-01 0.0528 0.0597 0.248 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 7.49e-01 0.014 0.0438 0.248 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0371 0.0748 0.248 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 304442 sc-eQTL 8.01e-01 0.0187 0.0738 0.248 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0345 0.0992 0.248 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 4.19e-01 0.0574 0.0709 0.248 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0564 0.0667 0.248 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 1.57e-01 0.0538 0.0379 0.248 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00856 0.0722 0.248 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 304442 sc-eQTL 3.67e-01 0.0792 0.0876 0.248 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 1.71e-01 0.138 0.1 0.255 DC L1
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 2.73e-01 0.091 0.0829 0.255 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 851524 sc-eQTL 1.57e-01 -0.131 0.092 0.255 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 1.26e-01 0.125 0.0813 0.255 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 9.04e-01 0.00967 0.0801 0.255 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 1.36e-01 0.141 0.0946 0.255 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 851547 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0765 0.0966 0.255 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 1.05e-01 -0.116 0.0715 0.248 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 3.33e-01 0.0635 0.0655 0.248 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 851524 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00561 0.094 0.248 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 1.63e-01 0.0767 0.0548 0.248 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 1.06e-01 -0.116 0.0712 0.248 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 9.18e-01 0.00778 0.0757 0.248 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 851547 sc-eQTL 4.33e-01 0.0767 0.0976 0.248 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0343 0.0873 0.249 NK L1
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 7.92e-01 0.0199 0.0755 0.249 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0987 0.0716 0.249 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 7.42e-01 0.0173 0.0525 0.249 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 6.14e-02 0.13 0.0692 0.249 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 5.72e-01 0.0593 0.105 0.248 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 9.23e-01 0.00735 0.0758 0.248 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 7.04e-01 -0.031 0.0815 0.248 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 4.94e-01 0.0365 0.0533 0.248 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 3.69e-01 0.0561 0.0624 0.248 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 1.39e-01 -0.171 0.115 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0571 0.11 0.242 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00999 0.115 0.242 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0238 0.104 0.242 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 252097 sc-eQTL 1.48e-01 -0.129 0.0888 0.242 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 8.92e-01 0.0153 0.112 0.242 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 272733 sc-eQTL 2.61e-01 -0.126 0.112 0.242 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 8.37e-03 -0.267 0.1 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 1.72e-01 0.12 0.0879 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 9.94e-03 0.244 0.0937 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 5.95e-02 0.152 0.0804 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 252097 sc-eQTL 2.26e-01 0.12 0.099 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 2.91e-01 0.0965 0.0912 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 272733 sc-eQTL 1.84e-01 -0.131 0.0986 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 1.14e-02 -0.264 0.103 0.244 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 1.76e-01 0.123 0.0902 0.244 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 2.82e-01 -0.106 0.098 0.244 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 5.69e-01 0.0443 0.0776 0.244 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 252097 sc-eQTL 4.98e-01 0.0673 0.099 0.244 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 1.16e-01 0.143 0.0906 0.244 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 272733 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0229 0.112 0.244 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0545 0.0968 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 4.70e-02 0.167 0.0837 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0205 0.0781 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 5.59e-01 0.032 0.0546 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 252097 sc-eQTL 1.61e-01 0.143 0.102 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 7.95e-01 0.0193 0.0745 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 272733 sc-eQTL 1.86e-01 0.129 0.0973 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0356 0.094 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 2.23e-01 0.108 0.0882 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0698 0.0843 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 2.71e-02 -0.137 0.0614 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 252097 sc-eQTL 7.07e-01 0.037 0.0984 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 2.85e-01 0.107 0.1 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 272733 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0208 0.0922 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 9.02e-01 0.0122 0.0987 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 8.78e-01 0.0154 0.0996 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 6.25e-01 0.0474 0.0967 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 9.23e-01 0.00855 0.0882 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 1.34e-01 0.133 0.0881 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 304442 sc-eQTL 8.21e-01 0.0207 0.0914 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 5.82e-01 0.0527 0.0956 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 3.87e-01 0.0644 0.0742 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 9.89e-01 0.000936 0.0659 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0282 0.0444 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 4.66e-01 -0.055 0.0753 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 304442 sc-eQTL 1.39e-01 0.113 0.0759 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 7.26e-02 -0.167 0.0924 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 7.42e-01 0.0245 0.0744 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 4.62e-01 0.0519 0.0705 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 4.57e-01 0.0404 0.0542 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 8.40e-01 0.0163 0.0807 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 304442 sc-eQTL 8.31e-02 -0.151 0.0866 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 7.10e-02 -0.191 0.106 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 9.83e-01 0.00175 0.0827 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00396 0.0901 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 4.42e-01 0.0494 0.0642 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 1.43e-01 0.123 0.0839 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 304442 sc-eQTL 8.15e-01 0.0207 0.0883 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 1.72e-01 -0.148 0.108 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 9.41e-01 0.00586 0.0792 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0277 0.0847 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 9.34e-01 0.00565 0.0686 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 2.38e-01 0.0941 0.0796 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 304442 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0238 0.0957 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0438 0.102 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 8.94e-01 0.0105 0.0789 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 1.49e-01 -0.114 0.0787 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 7.47e-01 0.0134 0.0415 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0259 0.0838 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 304442 sc-eQTL 1.63e-01 0.134 0.0955 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 2.09e-01 0.146 0.116 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0373 0.0852 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0531 0.0885 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 6.38e-01 0.0416 0.0882 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 6.10e-01 0.0463 0.0906 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 304442 sc-eQTL 5.09e-01 0.0633 0.0956 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 2.45e-01 0.124 0.106 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00812 0.1 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 7.86e-02 -0.183 0.103 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 6.09e-01 0.0411 0.0802 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 4.58e-01 0.0647 0.087 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 304442 sc-eQTL 2.02e-01 0.126 0.0987 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 9.12e-01 0.0124 0.112 0.247 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0389 0.0854 0.247 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0663 0.0919 0.247 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 5.00e-01 0.0456 0.0676 0.247 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 5.97e-02 0.149 0.0789 0.247 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 7.36e-02 -0.182 0.101 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 8.37e-01 0.0191 0.0923 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 4.97e-01 0.0585 0.086 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 5.67e-01 0.0454 0.0793 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 2.29e-01 0.102 0.0848 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0359 0.0954 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 8.40e-01 0.0166 0.0821 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0753 0.0777 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0278 0.0527 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 8.00e-02 0.123 0.0698 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 2.22e-01 -0.134 0.11 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 5.11e-01 0.0677 0.103 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 8.17e-01 0.0236 0.102 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 2.82e-01 0.0898 0.0833 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 5.64e-01 0.0515 0.0891 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 5.08e-01 0.0645 0.0972 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0332 0.0838 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0861 0.0863 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000519 0.0557 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 1.94e-01 0.0945 0.0725 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 5.70e-02 -0.227 0.118 0.233 PB L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 4.10e-01 -0.108 0.13 0.233 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 4.84e-01 0.0814 0.116 0.233 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0727 0.0809 0.233 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 252097 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0094 0.119 0.233 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00707 0.0893 0.233 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 272733 sc-eQTL 1.39e-01 -0.177 0.119 0.233 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 6.24e-01 0.0531 0.108 0.25 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 2.00e-01 -0.109 0.0848 0.25 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 2.18e-01 -0.124 0.1 0.25 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0829 0.0644 0.25 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00787 0.0771 0.25 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 9.04e-01 0.0121 0.1 0.248 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 1.59e-01 0.117 0.0828 0.248 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 5.37e-01 0.0531 0.086 0.248 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 8.89e-01 0.0103 0.0733 0.248 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 6.50e-01 0.0372 0.0818 0.248 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 304442 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0547 0.0935 0.248 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00339 0.102 0.246 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 3.23e-01 0.096 0.0969 0.246 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 851524 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0543 0.095 0.246 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 5.46e-02 0.21 0.108 0.246 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 1.23e-01 0.138 0.089 0.246 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 9.85e-01 0.00179 0.095 0.246 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 851547 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0197 0.105 0.246 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 1.66e-01 -0.108 0.0778 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 5.79e-01 0.0358 0.0645 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 851524 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0136 0.094 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 8.65e-01 0.0142 0.0839 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 1.16e-01 -0.111 0.0702 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 9.88e-01 0.0011 0.0738 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 851547 sc-eQTL 3.92e-01 0.0843 0.0983 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0531 0.0897 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 8.11e-01 0.0181 0.0759 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 851524 sc-eQTL 1.99e-01 -0.124 0.0958 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 7.47e-02 0.162 0.0903 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 1.67e-01 -0.109 0.0787 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 3.64e-01 0.0711 0.0782 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 851547 sc-eQTL 9.66e-01 0.00445 0.105 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0725 0.124 0.239 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0778 0.118 0.239 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0392 0.122 0.239 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 1.19e-01 0.143 0.091 0.239 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 1.97e-01 0.136 0.105 0.239 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00612 0.107 0.242 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 1.63e-01 -0.122 0.0874 0.242 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 851524 sc-eQTL 7.78e-02 0.17 0.096 0.242 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0252 0.1 0.242 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0362 0.0912 0.242 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 2.07e-01 0.112 0.0882 0.242 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 851547 sc-eQTL 3.46e-01 0.102 0.108 0.242 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 7.34e-02 -0.176 0.0975 0.247 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 3.32e-01 0.0871 0.0897 0.247 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 851524 sc-eQTL 1.35e-01 -0.141 0.0939 0.247 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 3.43e-01 0.0675 0.071 0.247 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00615 0.0858 0.247 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 1.77e-01 0.0981 0.0725 0.247 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 851547 sc-eQTL 5.77e-01 0.0586 0.105 0.247 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 9.12e-01 -0.013 0.117 0.246 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 7.04e-01 0.0379 0.0994 0.246 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 851524 sc-eQTL 4.22e-02 -0.184 0.0897 0.246 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 4.55e-01 0.0688 0.0919 0.246 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 9.93e-02 -0.165 0.0998 0.246 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 1.26e-01 0.181 0.117 0.246 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 851547 sc-eQTL 1.27e-01 -0.139 0.0907 0.246 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 9.37e-05 -0.374 0.0939 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 1.91e-01 0.113 0.0863 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 4.19e-02 0.182 0.089 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 2.18e-01 0.0766 0.062 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 252097 sc-eQTL 4.28e-01 0.0817 0.103 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 9.12e-02 0.147 0.0869 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 272733 sc-eQTL 9.02e-02 -0.172 0.101 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0507 0.0901 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 5.24e-02 0.163 0.0836 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0673 0.0718 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0388 0.0504 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 252097 sc-eQTL 1.88e-01 0.139 0.105 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 4.05e-01 0.0639 0.0766 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 272733 sc-eQTL 4.00e-01 0.0758 0.09 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 1.34e-01 -0.108 0.0719 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 4.64e-01 0.0475 0.0648 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 851524 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0691 0.0947 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 2.50e-01 0.0897 0.0778 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 1.18e-01 -0.108 0.069 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 8.54e-01 -0.014 0.076 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 851547 sc-eQTL 6.19e-01 0.0507 0.102 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0774 0.0983 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 6.33e-01 0.0402 0.084 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 851524 sc-eQTL 2.99e-01 0.0972 0.0933 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 5.47e-01 0.0351 0.0582 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0457 0.0851 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 2.38e-01 0.0866 0.0731 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 851547 sc-eQTL 3.92e-01 0.0884 0.103 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 770586 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0144 0.0909 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 409015 sc-eQTL 7.33e-01 0.0265 0.0775 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 555834 sc-eQTL 1.61e-01 -0.106 0.0754 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 515350 sc-eQTL 9.87e-01 0.000815 0.0489 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 169447 sc-eQTL 5.07e-02 0.138 0.07 0.248 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135540 \N 851524 2.61e-07 1.11e-07 3.65e-08 1.82e-07 8.83e-08 9.71e-08 1.41e-07 5.33e-08 1.41e-07 4.38e-08 1.6e-07 7.88e-08 1.3e-07 6.21e-08 5.4e-08 7.5e-08 4.48e-08 1.14e-07 5.19e-08 4.03e-08 1.05e-07 1.28e-07 1.3e-07 4.13e-08 1.31e-07 1.19e-07 1.12e-07 8.71e-08 1.02e-07 1.12e-07 9.58e-08 4.1e-08 2.91e-08 8.82e-08 8.93e-08 4.02e-08 4.75e-08 9.65e-08 7.63e-08 3.03e-08 4.19e-08 1.35e-07 3.91e-08 1.35e-08 7.79e-08 1.69e-08 1.24e-07 4.09e-09 5.04e-08