logo

Genes within 1Mb (chr6:139540568:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 5.55e-01 0.0612 0.104 0.111 B L1
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0802 0.101 0.111 B L1
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 5.29e-02 -0.172 0.0884 0.111 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 2.41e-01 0.0614 0.0522 0.111 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 248570 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0242 0.128 0.111 B L1
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0859 0.0806 0.111 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 269206 sc-eQTL 2.51e-01 0.103 0.0896 0.111 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 2.88e-01 0.124 0.116 0.111 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 3.73e-01 0.0867 0.0971 0.111 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 7.78e-01 0.0216 0.0765 0.111 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00235 0.0561 0.111 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0246 0.0958 0.111 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 300915 sc-eQTL 2.96e-01 0.0987 0.0942 0.111 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 3.83e-01 -0.11 0.126 0.111 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00259 0.0902 0.111 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 5.41e-02 -0.163 0.0841 0.111 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0355 0.0482 0.111 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 2.10e-01 -0.115 0.0913 0.111 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 300915 sc-eQTL 3.26e-01 0.109 0.111 0.111 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 5.41e-01 0.077 0.126 0.11 DC L1
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 9.14e-01 0.0112 0.104 0.11 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 847997 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0353 0.115 0.11 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 2.03e-01 -0.13 0.102 0.11 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 4.56e-01 0.0746 0.0999 0.11 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 8.66e-01 0.02 0.119 0.11 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 848020 sc-eQTL 3.39e-01 -0.115 0.12 0.11 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 5.45e-01 0.0555 0.0915 0.111 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 7.31e-01 0.0288 0.0836 0.111 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 847997 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0375 0.12 0.111 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0831 0.0699 0.111 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 3.16e-01 0.0914 0.091 0.111 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 2.44e-01 -0.112 0.0962 0.111 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 848020 sc-eQTL 6.94e-01 0.049 0.124 0.111 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 3.67e-03 0.324 0.11 0.112 NK L1
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 9.45e-01 0.00672 0.0971 0.112 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 4.30e-01 0.073 0.0923 0.112 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 7.55e-01 0.0211 0.0675 0.112 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 1.14e-01 -0.141 0.0892 0.112 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 8.45e-01 0.0257 0.131 0.111 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 9.70e-01 0.00357 0.095 0.111 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00743 0.102 0.111 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 2.50e-01 0.077 0.0667 0.111 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 5.05e-01 0.0523 0.0782 0.111 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 8.11e-01 0.0359 0.15 0.115 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0249 0.143 0.115 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 3.09e-01 0.152 0.149 0.115 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 1.92e-01 0.176 0.135 0.115 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 248570 sc-eQTL 2.76e-01 -0.126 0.115 0.115 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0282 0.146 0.115 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 269206 sc-eQTL 1.06e-01 0.235 0.144 0.115 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 5.44e-01 0.0776 0.128 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 5.60e-02 0.211 0.11 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 2.61e-01 -0.134 0.119 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 6.84e-01 0.0415 0.102 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 248570 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0913 0.124 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0215 0.115 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 269206 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0405 0.124 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 4.82e-01 0.0916 0.13 0.112 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 3.26e-01 -0.111 0.112 0.112 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00786 0.122 0.112 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0341 0.0964 0.112 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 248570 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0332 0.123 0.112 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00939 0.113 0.112 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 269206 sc-eQTL 1.47e-01 0.201 0.138 0.112 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0596 0.124 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 3.05e-01 -0.111 0.108 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 1.78e-01 -0.134 0.0994 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0244 0.0698 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 248570 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0973 0.131 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 1.95e-01 -0.123 0.0947 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 269206 sc-eQTL 7.15e-01 0.0457 0.125 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 5.92e-02 0.228 0.12 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 9.83e-02 -0.188 0.113 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 2.43e-01 -0.127 0.108 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 1.43e-02 0.195 0.0789 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 248570 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0998 0.127 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00197 0.129 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 269206 sc-eQTL 2.63e-01 0.133 0.118 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 7.03e-01 0.0484 0.127 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 2.15e-01 0.159 0.127 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 3.96e-01 -0.105 0.124 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 1.92e-01 0.148 0.113 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 9.54e-01 0.00656 0.114 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 300915 sc-eQTL 2.97e-01 0.122 0.117 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 9.51e-01 0.00765 0.123 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 6.19e-01 0.0477 0.0957 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 3.88e-02 0.175 0.0841 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 3.59e-01 0.0525 0.0571 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 9.78e-01 0.00267 0.0971 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 300915 sc-eQTL 4.16e-01 0.0799 0.0981 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 7.87e-02 0.21 0.119 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 8.04e-01 0.0239 0.0959 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 4.61e-01 -0.067 0.0908 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 9.29e-01 0.00628 0.0699 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0237 0.104 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 300915 sc-eQTL 5.64e-01 0.0648 0.112 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 1.32e-01 0.199 0.132 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 9.04e-01 0.0124 0.103 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 6.75e-03 -0.302 0.11 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 5.51e-01 0.0478 0.08 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 2.57e-01 -0.119 0.105 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 300915 sc-eQTL 2.32e-01 -0.131 0.11 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 5.36e-01 0.0845 0.136 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 8.57e-01 0.0179 0.0994 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 3.65e-02 -0.222 0.105 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0742 0.0859 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0966 0.1 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 300915 sc-eQTL 1.51e-01 0.173 0.12 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 3.47e-01 -0.123 0.13 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 2.87e-01 0.107 0.101 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 7.37e-01 -0.034 0.101 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 7.57e-01 0.0164 0.053 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0942 0.107 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 300915 sc-eQTL 9.92e-01 0.00123 0.123 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 4.66e-01 0.107 0.146 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0327 0.107 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 1.10e-01 -0.177 0.11 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0343 0.111 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 5.05e-01 0.0759 0.114 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 300915 sc-eQTL 7.94e-02 0.21 0.119 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 4.64e-01 0.0983 0.134 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 8.05e-02 -0.219 0.125 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 1.02e-01 -0.213 0.13 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 1.09e-01 0.161 0.1 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 1.95e-01 -0.142 0.109 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 300915 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0097 0.125 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 8.67e-01 0.0239 0.143 0.113 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 3.22e-01 0.108 0.108 0.113 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0766 0.117 0.113 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0212 0.086 0.113 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 2.70e-01 0.112 0.101 0.113 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 7.53e-02 0.242 0.135 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0261 0.124 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0945 0.115 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00108 0.106 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0555 0.114 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 6.44e-02 0.222 0.119 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0247 0.103 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0299 0.098 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 2.19e-01 0.0815 0.0662 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0602 0.0884 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 1.19e-01 0.225 0.144 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 6.55e-01 0.0606 0.135 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 3.50e-01 0.125 0.133 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 2.19e-01 -0.135 0.109 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 1.76e-01 -0.159 0.117 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 1.11e-02 0.315 0.123 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 1.67e-01 0.148 0.107 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 1.69e-01 0.152 0.111 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0145 0.0715 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0968 0.0931 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 2.09e-02 0.314 0.134 0.137 PB L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 8.62e-01 -0.026 0.15 0.137 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 9.16e-01 -0.014 0.133 0.137 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0267 0.093 0.137 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 248570 sc-eQTL 4.38e-01 0.106 0.135 0.137 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 7.57e-01 0.0318 0.102 0.137 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 269206 sc-eQTL 5.81e-02 0.259 0.135 0.137 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0864 0.136 0.113 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 4.12e-01 0.0881 0.107 0.113 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 5.78e-01 0.0705 0.126 0.113 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 4.40e-01 0.0631 0.0815 0.113 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0637 0.0971 0.113 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 4.90e-02 0.259 0.131 0.111 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 8.39e-02 0.189 0.109 0.111 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 3.92e-01 0.0971 0.113 0.111 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0136 0.0966 0.111 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 2.29e-01 -0.13 0.107 0.111 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 300915 sc-eQTL 2.64e-01 0.138 0.123 0.111 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 7.12e-01 0.0466 0.126 0.115 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0253 0.12 0.115 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 847997 sc-eQTL 9.08e-01 0.0136 0.117 0.115 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 1.38e-01 -0.201 0.135 0.115 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 1.47e-01 0.16 0.11 0.115 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 5.24e-01 0.0748 0.117 0.115 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 848020 sc-eQTL 3.09e-01 -0.132 0.129 0.115 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 2.19e-01 0.122 0.099 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 5.76e-01 0.0459 0.082 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 847997 sc-eQTL 9.47e-01 0.00798 0.12 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0991 0.106 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 2.98e-01 0.0934 0.0895 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0945 0.0936 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 848020 sc-eQTL 4.14e-01 -0.102 0.125 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 6.49e-01 -0.052 0.114 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 2.63e-01 -0.108 0.0963 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 847997 sc-eQTL 2.77e-01 -0.133 0.122 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 2.94e-01 -0.122 0.116 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 3.56e-01 0.0929 0.101 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 6.87e-02 -0.181 0.0989 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 848020 sc-eQTL 7.29e-01 0.0465 0.134 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 6.10e-01 -0.078 0.153 0.1 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0523 0.145 0.1 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 8.32e-01 -0.032 0.15 0.1 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 9.29e-01 0.0101 0.113 0.1 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 7.53e-01 0.0411 0.13 0.1 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 3.78e-02 0.272 0.13 0.113 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 7.56e-01 0.0336 0.108 0.113 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 847997 sc-eQTL 4.96e-01 -0.081 0.119 0.113 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 6.58e-01 0.0544 0.123 0.113 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 4.41e-01 0.0864 0.112 0.113 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 8.80e-01 0.0165 0.109 0.113 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 848020 sc-eQTL 7.98e-01 0.0342 0.133 0.113 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0376 0.123 0.111 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 3.64e-01 0.102 0.112 0.111 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 847997 sc-eQTL 2.36e-01 0.14 0.118 0.111 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0545 0.089 0.111 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 9.90e-01 0.00133 0.107 0.111 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0586 0.091 0.111 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 848020 sc-eQTL 9.81e-01 0.00311 0.131 0.111 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 2.90e-01 0.15 0.142 0.119 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 2.29e-01 0.145 0.12 0.119 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 847997 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0899 0.11 0.119 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 9.36e-01 0.00896 0.111 0.119 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 9.87e-01 0.00193 0.122 0.119 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0121 0.143 0.119 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 848020 sc-eQTL 2.10e-01 0.138 0.11 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 2.96e-01 0.128 0.123 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 5.27e-01 0.0692 0.109 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0807 0.113 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 5.31e-01 0.0493 0.0785 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 248570 sc-eQTL 2.08e-01 -0.164 0.13 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0334 0.11 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 269206 sc-eQTL 4.52e-01 0.0966 0.128 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 5.39e-01 0.0704 0.114 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 1.72e-01 -0.146 0.107 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 1.55e-01 -0.13 0.0909 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 3.93e-01 0.0547 0.0639 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 248570 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0985 0.134 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 1.55e-01 -0.138 0.097 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 269206 sc-eQTL 1.42e-01 0.168 0.114 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 7.69e-01 0.027 0.0919 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0176 0.0824 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 847997 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0346 0.12 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 1.26e-01 -0.151 0.0985 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 2.54e-01 0.101 0.0879 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 2.52e-01 -0.11 0.0962 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 848020 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0108 0.129 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 4.14e-01 0.101 0.124 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 5.36e-01 0.0656 0.106 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 847997 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0212 0.118 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00893 0.0733 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 5.85e-01 0.0586 0.107 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0277 0.0924 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 848020 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0107 0.13 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 767059 sc-eQTL 2.78e-03 0.346 0.114 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 405488 sc-eQTL 7.33e-01 0.034 0.0994 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 552307 sc-eQTL 3.06e-01 0.0995 0.0969 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 511823 sc-eQTL 6.67e-01 0.027 0.0627 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 165920 sc-eQTL 1.45e-01 -0.132 0.0902 0.11 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000164440 TXLNB 248570 eQTL 0.0405 -0.0778 0.0379 0.0 0.0 0.138

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112406 \N 405488 9.22e-05 4.83e-06 5.92e-07 3.75e-06 1.65e-06 2.03e-06 5.71e-06 8.94e-07 4.8e-06 2.41e-06 4.22e-06 3.32e-06 9.33e-06 2.17e-06 1.42e-06 3.9e-06 2.24e-06 3.93e-06 1.41e-06 8.79e-07 2.89e-06 4.63e-06 4.64e-06 1.71e-06 9.2e-06 2.3e-06 1.8e-06 1.72e-06 4.41e-06 7.75e-06 2.85e-06 1.56e-07 6.11e-07 1.64e-06 3.31e-06 2.66e-06 7.29e-07 3.84e-07 1.23e-06 3.63e-07 3.53e-07 5.69e-06 2.21e-06 1.67e-07 3.58e-07 9.83e-07 1.17e-06 1.95e-07 1.09e-07
ENSG00000164440 TXLNB 248570 0.000158 7.87e-06 1.29e-06 4.85e-06 2.25e-06 4.28e-06 9.52e-06 9.79e-07 7.82e-06 4.11e-06 7.56e-06 3.84e-06 1.24e-05 2.18e-06 9.55e-07 6.54e-06 3.78e-06 6.22e-06 1.63e-06 1.5e-06 3.4e-06 7.69e-06 7.06e-06 2.02e-06 1.39e-05 3.86e-06 2.55e-06 1.97e-06 7.98e-06 1.03e-05 4.1e-06 2.73e-07 5.21e-07 2.75e-06 4.89e-06 3.76e-06 9.25e-07 4.74e-07 8.31e-07 3.63e-07 1.52e-07 9.36e-06 2.7e-06 1.65e-07 7.17e-07 9.69e-07 1.4e-06 2.87e-07 2.97e-07