logo

Genes within 1Mb (chr6:139538405:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 7.50e-01 0.0328 0.103 0.115 B L1
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 2.72e-01 -0.11 0.0996 0.115 B L1
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 1.91e-02 -0.206 0.0872 0.115 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 1.72e-01 0.0708 0.0516 0.115 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 246407 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0404 0.127 0.115 B L1
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0871 0.0798 0.115 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 267043 sc-eQTL 2.02e-01 0.114 0.0887 0.115 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 4.19e-01 0.0932 0.115 0.115 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 5.97e-01 0.0509 0.0961 0.115 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 8.17e-01 0.0175 0.0756 0.115 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 8.61e-01 -0.00969 0.0554 0.115 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0229 0.0946 0.115 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 298752 sc-eQTL 5.59e-01 0.0546 0.0932 0.115 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0913 0.125 0.115 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0412 0.0893 0.115 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 7.83e-02 -0.148 0.0835 0.115 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0298 0.0478 0.115 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 2.81e-01 -0.098 0.0906 0.115 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 298752 sc-eQTL 6.01e-01 0.0578 0.11 0.115 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 6.02e-01 0.0652 0.125 0.115 DC L1
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 9.64e-01 0.00461 0.103 0.115 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 845834 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0228 0.114 0.115 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 1.74e-01 -0.137 0.101 0.115 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 4.96e-01 0.0674 0.099 0.115 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 7.58e-01 0.0363 0.118 0.115 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 845857 sc-eQTL 3.48e-01 -0.112 0.119 0.115 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 5.87e-01 0.0496 0.0912 0.115 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 8.92e-01 0.0114 0.0833 0.115 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 845834 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0198 0.119 0.115 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0875 0.0696 0.115 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 2.96e-01 0.095 0.0907 0.115 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 2.55e-01 -0.109 0.0958 0.115 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 845857 sc-eQTL 7.26e-01 0.0436 0.124 0.115 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 1.69e-02 0.265 0.11 0.116 NK L1
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0487 0.0962 0.116 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 5.34e-01 0.0571 0.0916 0.116 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 7.99e-01 0.0171 0.0669 0.116 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 1.81e-01 -0.119 0.0886 0.116 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00178 0.13 0.115 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0132 0.0943 0.115 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0176 0.101 0.115 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 2.63e-01 0.0744 0.0662 0.115 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 4.57e-01 0.0579 0.0777 0.115 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 9.01e-01 0.0186 0.15 0.117 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0337 0.142 0.117 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 2.35e-01 0.177 0.149 0.117 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 1.69e-01 0.186 0.134 0.117 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 246407 sc-eQTL 3.46e-01 -0.109 0.115 0.117 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0582 0.145 0.117 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 267043 sc-eQTL 9.20e-02 0.244 0.144 0.117 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 7.03e-01 0.0485 0.127 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 1.18e-01 0.172 0.11 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 3.76e-01 -0.105 0.119 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 4.60e-01 0.0748 0.101 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 246407 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0673 0.124 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0164 0.114 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 267043 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0497 0.124 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 5.15e-01 0.084 0.129 0.116 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 2.62e-01 -0.125 0.111 0.116 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0328 0.121 0.116 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0328 0.0956 0.116 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 246407 sc-eQTL 7.80e-01 -0.034 0.122 0.116 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 9.29e-01 -0.01 0.112 0.116 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 267043 sc-eQTL 1.47e-01 0.2 0.137 0.116 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0806 0.122 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 2.17e-01 -0.132 0.106 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 1.03e-01 -0.161 0.0982 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0156 0.0691 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 246407 sc-eQTL 4.04e-01 -0.108 0.129 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 1.78e-01 -0.127 0.0938 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 267043 sc-eQTL 5.13e-01 0.0809 0.123 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 7.63e-02 0.212 0.119 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 6.33e-02 -0.209 0.112 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 1.74e-01 -0.146 0.107 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 7.79e-03 0.21 0.0781 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 246407 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0908 0.126 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 9.36e-01 0.0104 0.128 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 267043 sc-eQTL 2.93e-01 0.124 0.117 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 8.24e-01 0.0282 0.127 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 2.69e-01 0.141 0.127 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0632 0.124 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 2.56e-01 0.129 0.113 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 6.40e-01 0.0532 0.114 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 298752 sc-eQTL 4.11e-01 0.0964 0.117 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 9.76e-01 0.00362 0.122 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 8.20e-01 0.0215 0.0944 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 6.33e-02 0.155 0.0831 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 4.37e-01 0.0439 0.0563 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 9.86e-01 0.00167 0.0958 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 298752 sc-eQTL 5.19e-01 0.0625 0.0968 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 2.09e-01 0.148 0.118 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 9.94e-01 0.000688 0.0946 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0614 0.0896 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 9.93e-01 0.000601 0.069 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00885 0.103 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 298752 sc-eQTL 9.29e-01 0.00987 0.111 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 2.20e-01 0.162 0.132 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0109 0.103 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 6.23e-03 -0.304 0.11 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 5.50e-01 0.0478 0.0798 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 2.09e-01 -0.132 0.104 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 298752 sc-eQTL 2.13e-01 -0.137 0.109 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 5.51e-01 0.0813 0.136 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 6.66e-01 -0.043 0.0993 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 4.04e-02 -0.217 0.105 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0539 0.086 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0936 0.1 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 298752 sc-eQTL 2.80e-01 0.13 0.12 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 3.67e-01 -0.117 0.13 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 4.86e-01 0.0701 0.1 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0264 0.101 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 7.34e-01 0.018 0.0528 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0937 0.107 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 298752 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0309 0.122 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 2.57e-01 0.164 0.145 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0611 0.106 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 2.58e-01 -0.125 0.11 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00766 0.11 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 4.26e-01 0.09 0.113 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 298752 sc-eQTL 1.37e-01 0.177 0.119 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 3.76e-01 0.119 0.134 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 4.48e-02 -0.251 0.124 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 5.75e-02 -0.247 0.129 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 8.11e-02 0.175 0.0999 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 1.93e-01 -0.142 0.109 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 298752 sc-eQTL 7.73e-01 -0.036 0.124 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0218 0.143 0.117 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 5.97e-01 0.0575 0.108 0.117 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 4.72e-01 -0.084 0.117 0.117 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00874 0.0859 0.117 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 3.18e-01 0.101 0.101 0.117 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 1.31e-01 0.204 0.135 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 5.91e-01 -0.066 0.123 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0661 0.114 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 7.49e-01 0.0339 0.105 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0222 0.113 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 1.54e-01 0.17 0.119 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0727 0.103 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0434 0.0974 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 4.10e-01 0.0543 0.0659 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 6.09e-01 -0.045 0.0879 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 1.96e-01 0.186 0.143 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 9.05e-01 0.0161 0.134 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 2.76e-01 0.144 0.132 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 3.41e-01 -0.104 0.109 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0769 0.116 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 1.78e-02 0.292 0.122 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 3.74e-01 0.0948 0.106 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 2.44e-01 0.128 0.11 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 8.81e-01 0.0106 0.0709 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0833 0.0924 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 2.60e-02 0.302 0.134 0.141 PB L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0511 0.149 0.141 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0251 0.132 0.141 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0292 0.0926 0.141 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 246407 sc-eQTL 4.59e-01 0.1 0.135 0.141 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 6.23e-01 0.0502 0.102 0.141 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 267043 sc-eQTL 6.05e-02 0.255 0.134 0.141 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0881 0.135 0.117 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 6.10e-01 0.0543 0.106 0.117 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 6.04e-01 0.065 0.125 0.117 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 4.71e-01 0.0583 0.0807 0.117 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0583 0.0961 0.117 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 8.87e-02 0.222 0.13 0.115 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 1.24e-01 0.167 0.108 0.115 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 5.54e-01 0.0667 0.112 0.115 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 9.49e-01 0.0061 0.0958 0.115 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 1.47e-01 -0.155 0.106 0.115 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 298752 sc-eQTL 3.86e-01 0.106 0.122 0.115 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 6.63e-01 0.0544 0.125 0.12 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0438 0.119 0.12 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 845834 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00914 0.116 0.12 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 9.81e-02 -0.221 0.133 0.12 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 1.94e-01 0.142 0.109 0.12 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 4.61e-01 0.0856 0.116 0.12 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 845857 sc-eQTL 3.51e-01 -0.12 0.128 0.12 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 2.27e-01 0.119 0.0986 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 6.86e-01 0.0331 0.0817 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 845834 sc-eQTL 8.10e-01 0.0286 0.119 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0941 0.106 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 3.03e-01 0.092 0.0892 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0866 0.0933 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 845857 sc-eQTL 3.80e-01 -0.109 0.124 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0503 0.114 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 2.59e-01 -0.109 0.0959 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 845834 sc-eQTL 2.37e-01 -0.144 0.122 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 2.94e-01 -0.121 0.115 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 3.19e-01 0.1 0.1 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 8.54e-02 -0.17 0.0986 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 845857 sc-eQTL 7.55e-01 0.0417 0.134 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0924 0.151 0.103 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0629 0.144 0.103 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 7.42e-01 -0.049 0.149 0.103 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 8.25e-01 0.0248 0.112 0.103 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 7.77e-01 0.0366 0.129 0.103 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 4.42e-02 0.262 0.13 0.118 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 7.33e-01 0.0366 0.107 0.118 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 845834 sc-eQTL 4.84e-01 -0.083 0.118 0.118 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 6.74e-01 0.0515 0.122 0.118 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 5.47e-01 0.0673 0.112 0.118 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 7.93e-01 0.0285 0.108 0.118 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 845857 sc-eQTL 7.26e-01 0.0466 0.133 0.118 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0235 0.122 0.115 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 4.98e-01 0.0757 0.111 0.115 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 845834 sc-eQTL 1.61e-01 0.164 0.117 0.115 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0713 0.0883 0.115 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 7.96e-01 0.0275 0.106 0.115 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0583 0.0903 0.115 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 845857 sc-eQTL 8.79e-01 0.0199 0.13 0.115 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 3.55e-01 0.13 0.14 0.124 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 2.04e-01 0.151 0.119 0.124 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 845834 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0354 0.109 0.124 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 8.87e-01 0.0157 0.11 0.124 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0114 0.121 0.124 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0142 0.142 0.124 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 845857 sc-eQTL 1.72e-01 0.149 0.109 0.124 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 4.43e-01 0.0938 0.122 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 7.46e-01 0.0353 0.109 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0776 0.113 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 4.25e-01 0.0624 0.0781 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 246407 sc-eQTL 2.44e-01 -0.151 0.129 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0371 0.11 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 267043 sc-eQTL 3.73e-01 0.114 0.127 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 7.17e-01 0.0412 0.114 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 9.96e-02 -0.174 0.105 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 7.04e-02 -0.163 0.0898 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 3.21e-01 0.063 0.0633 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 246407 sc-eQTL 4.27e-01 -0.106 0.133 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 1.70e-01 -0.132 0.0961 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 267043 sc-eQTL 1.05e-01 0.184 0.113 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 8.26e-01 0.0202 0.0916 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0283 0.0821 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 845834 sc-eQTL 8.68e-01 -0.02 0.12 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 1.16e-01 -0.155 0.0982 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 2.43e-01 0.102 0.0876 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 2.94e-01 -0.101 0.096 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 845857 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0197 0.129 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 4.04e-01 0.103 0.123 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 6.31e-01 0.0506 0.105 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 845834 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0105 0.117 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0206 0.0728 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 5.19e-01 0.0689 0.107 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0246 0.0918 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 845857 sc-eQTL 9.71e-01 0.00466 0.129 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 sc-eQTL 1.33e-02 0.284 0.114 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 403325 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0221 0.0986 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 550144 sc-eQTL 4.06e-01 0.0801 0.0962 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 509660 sc-eQTL 7.74e-01 0.0178 0.0622 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 163757 sc-eQTL 2.14e-01 -0.112 0.0895 0.114 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 764896 pQTL 0.0487 0.0902 0.0457 0.0 0.0 0.143
ENSG00000164440 TXLNB 246407 eQTL 0.0445 -0.0755 0.0375 0.0 0.0 0.14

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112406 \N 403325 1.26e-06 5.67e-07 1.03e-07 4.43e-07 1.01e-07 3.22e-07 5.28e-07 5.78e-08 2.66e-07 1.28e-07 7.32e-07 1.91e-07 9.23e-07 1.01e-07 1.9e-07 1.39e-07 8.64e-08 3.02e-07 9.97e-08 8.11e-08 1.33e-07 3.1e-07 2.77e-07 4.27e-08 7.42e-07 1.82e-07 2.22e-07 1.86e-07 3.43e-07 4.3e-07 2.19e-07 4.77e-08 4.27e-08 1.21e-07 3.52e-07 4.68e-08 6.29e-08 5.25e-08 5.8e-08 5.64e-08 8.02e-08 1.26e-06 2.67e-08 1.97e-08 3.48e-08 8.24e-09 9.07e-08 1.89e-09 4.8e-08
ENSG00000164440 TXLNB 246407 2.82e-06 1.4e-06 3.26e-07 1.2e-06 1.56e-07 7.77e-07 1.51e-06 2.73e-07 1.41e-06 3.66e-07 2.1e-06 5.83e-07 2.72e-06 2.81e-07 4.92e-07 8.12e-07 7.74e-07 7.02e-07 6.62e-07 6.68e-07 3.6e-07 1.78e-06 8.53e-07 3.29e-07 2.42e-06 3.02e-07 9.35e-07 6.93e-07 1.47e-06 1.23e-06 7.1e-07 3.28e-08 1.28e-07 5.67e-07 5.66e-07 2.96e-07 3.12e-07 1.45e-07 1.12e-07 1.16e-07 2.75e-07 3.43e-06 2.32e-07 4.22e-08 1.67e-07 7.64e-08 1.8e-07 7.25e-09 4.97e-08