logo

Genes within 1Mb (chr6:139538208:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 8.84e-01 0.0154 0.105 0.105 B L1
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 2.21e-01 -0.126 0.102 0.105 B L1
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 3.09e-02 -0.195 0.0896 0.105 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 9.51e-02 0.0887 0.0529 0.105 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 246210 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0461 0.13 0.105 B L1
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 1.67e-01 -0.114 0.0818 0.105 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 266846 sc-eQTL 1.11e-01 0.145 0.0908 0.105 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 4.40e-01 0.0912 0.118 0.105 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 9.87e-01 0.0016 0.0983 0.105 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 9.09e-01 0.00889 0.0773 0.105 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0314 0.0566 0.105 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 9.92e-01 0.000973 0.0968 0.105 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 298555 sc-eQTL 7.62e-01 0.029 0.0954 0.105 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0427 0.128 0.105 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0737 0.0914 0.105 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 1.64e-01 -0.12 0.0858 0.105 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0441 0.049 0.105 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0576 0.093 0.105 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 298555 sc-eQTL 5.83e-01 0.0622 0.113 0.105 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 5.40e-01 0.078 0.127 0.104 DC L1
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0159 0.105 0.104 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 845637 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0297 0.117 0.104 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0881 0.103 0.104 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 7.52e-01 0.0319 0.101 0.104 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 9.20e-01 0.0121 0.12 0.104 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 845660 sc-eQTL 3.08e-01 -0.124 0.122 0.104 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 3.58e-01 0.0858 0.0932 0.105 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0403 0.0852 0.105 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 845637 sc-eQTL 7.61e-01 0.0372 0.122 0.105 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0428 0.0714 0.105 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 3.93e-01 0.0795 0.0928 0.105 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 2.88e-01 -0.105 0.0981 0.105 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 845660 sc-eQTL 9.09e-01 0.0146 0.127 0.105 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 3.05e-02 0.246 0.113 0.105 NK L1
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 2.55e-01 -0.112 0.0985 0.105 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 5.76e-01 0.0526 0.094 0.105 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0153 0.0687 0.105 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0516 0.0913 0.105 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0212 0.133 0.105 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0324 0.0965 0.105 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0286 0.104 0.105 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 7.92e-01 0.0179 0.0679 0.105 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 2.49e-01 0.0916 0.0793 0.105 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 6.97e-01 0.0596 0.153 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0327 0.146 0.107 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 2.10e-01 0.191 0.152 0.107 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 3.08e-01 0.141 0.138 0.107 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 246210 sc-eQTL 1.98e-01 -0.152 0.118 0.107 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 3.76e-01 -0.132 0.148 0.107 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 266846 sc-eQTL 1.96e-01 0.192 0.148 0.107 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0168 0.131 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 2.36e-01 0.134 0.113 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0626 0.122 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 3.10e-01 0.106 0.104 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 246210 sc-eQTL 5.79e-01 -0.071 0.128 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0138 0.118 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 266846 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0329 0.127 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 9.03e-01 0.0161 0.132 0.106 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 1.28e-01 -0.173 0.113 0.106 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0375 0.124 0.106 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0279 0.0978 0.106 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 246210 sc-eQTL 5.50e-01 0.0747 0.125 0.106 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 9.85e-01 0.00222 0.115 0.106 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 266846 sc-eQTL 1.73e-01 0.192 0.14 0.106 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 3.77e-01 -0.111 0.126 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 9.73e-02 -0.181 0.109 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 9.41e-02 -0.169 0.101 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 8.80e-01 0.0107 0.071 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 246210 sc-eQTL 3.47e-01 -0.125 0.133 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 2.03e-01 -0.123 0.0963 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 266846 sc-eQTL 4.75e-01 0.0907 0.127 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 9.21e-02 0.208 0.123 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 4.70e-02 -0.231 0.115 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 2.33e-01 -0.132 0.111 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 6.71e-03 0.22 0.0804 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 246210 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0986 0.129 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 9.07e-01 0.0155 0.132 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 266846 sc-eQTL 2.18e-01 0.149 0.121 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 6.97e-01 0.0505 0.129 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 6.53e-01 0.0589 0.131 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0401 0.127 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 2.54e-01 0.132 0.115 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 5.66e-01 0.0667 0.116 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 298555 sc-eQTL 7.51e-01 0.038 0.12 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0222 0.124 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0188 0.0967 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 1.38e-01 0.127 0.0853 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 7.21e-01 0.0207 0.0577 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 7.81e-01 0.0272 0.098 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 298555 sc-eQTL 4.68e-01 0.072 0.099 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 1.19e-01 0.188 0.12 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 8.04e-01 -0.024 0.0966 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0366 0.0916 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0183 0.0704 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 9.99e-01 7.79e-05 0.105 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 298555 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0123 0.113 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 5.08e-01 0.09 0.136 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0612 0.106 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 2.23e-02 -0.262 0.114 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00452 0.0821 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 2.87e-01 -0.115 0.108 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 298555 sc-eQTL 3.34e-01 -0.109 0.113 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 4.43e-01 0.107 0.139 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0612 0.102 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 6.19e-02 -0.203 0.108 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0788 0.0879 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0279 0.103 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 298555 sc-eQTL 2.41e-01 0.144 0.123 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 4.37e-01 -0.104 0.134 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 7.72e-01 0.03 0.103 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0517 0.103 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00453 0.0543 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0681 0.11 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 298555 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0796 0.125 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 3.07e-01 0.15 0.147 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0708 0.108 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 3.07e-01 -0.114 0.112 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 7.73e-01 0.0322 0.112 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 2.93e-01 0.121 0.114 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 298555 sc-eQTL 3.49e-02 0.254 0.12 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 2.82e-01 0.147 0.137 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 1.93e-02 -0.298 0.126 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 6.63e-02 -0.244 0.132 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 2.03e-01 0.131 0.102 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 1.63e-01 -0.156 0.111 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 298555 sc-eQTL 9.69e-01 0.00494 0.127 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0216 0.147 0.106 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0116 0.112 0.106 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0784 0.12 0.106 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0116 0.0885 0.106 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 2.60e-01 0.117 0.104 0.106 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 2.79e-01 0.15 0.138 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 2.82e-01 -0.135 0.125 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0562 0.117 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 7.40e-01 0.0357 0.108 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00779 0.116 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 1.14e-01 0.195 0.122 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 2.57e-01 -0.12 0.106 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0655 0.1 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 6.41e-01 0.0318 0.068 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 9.49e-01 0.00584 0.0907 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 4.77e-01 0.105 0.147 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0183 0.138 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 3.44e-01 0.129 0.136 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 2.05e-01 -0.142 0.112 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 7.79e-01 0.0336 0.12 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 1.27e-02 0.315 0.125 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 7.50e-01 0.035 0.109 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 1.96e-01 0.146 0.113 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00117 0.0728 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 9.43e-01 0.00678 0.095 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 1.19e-02 0.349 0.136 0.13 PB L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0654 0.153 0.13 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0166 0.136 0.13 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0302 0.0949 0.13 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 246210 sc-eQTL 4.95e-01 0.0948 0.138 0.13 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 7.28e-01 0.0364 0.104 0.13 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 266846 sc-eQTL 2.71e-02 0.307 0.137 0.13 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0571 0.139 0.107 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 5.38e-01 0.0673 0.109 0.107 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 8.21e-01 0.0291 0.129 0.107 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0178 0.0829 0.107 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 8.63e-01 0.0171 0.0988 0.107 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 1.11e-01 0.215 0.134 0.105 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 2.65e-01 0.125 0.112 0.105 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 8.24e-01 0.0258 0.116 0.105 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0545 0.0988 0.105 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 1.35e-01 -0.165 0.11 0.105 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 298555 sc-eQTL 2.58e-01 0.143 0.126 0.105 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 6.47e-01 0.0588 0.128 0.107 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0579 0.122 0.107 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 845637 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00479 0.119 0.107 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 2.35e-01 -0.163 0.137 0.107 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 3.43e-01 0.107 0.112 0.107 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 5.40e-01 0.0732 0.119 0.107 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 845660 sc-eQTL 4.07e-01 -0.109 0.131 0.107 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 1.23e-01 0.156 0.101 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0137 0.0838 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 845637 sc-eQTL 4.93e-01 0.0838 0.122 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0464 0.109 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 3.84e-01 0.0799 0.0915 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0893 0.0957 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 845660 sc-eQTL 2.47e-01 -0.148 0.127 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0184 0.117 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 1.32e-01 -0.148 0.098 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 845637 sc-eQTL 2.97e-01 -0.13 0.125 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0867 0.118 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 4.57e-01 0.0765 0.103 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 8.26e-02 -0.176 0.101 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 845660 sc-eQTL 8.24e-01 0.0305 0.137 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 3.21e-01 -0.153 0.154 0.097 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 3.90e-01 -0.126 0.146 0.097 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0877 0.151 0.097 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0411 0.114 0.097 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 4.25e-01 0.105 0.131 0.097 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 1.01e-01 0.22 0.133 0.107 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 7.58e-01 0.034 0.11 0.107 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 845637 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0549 0.122 0.107 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 4.37e-01 0.0977 0.125 0.107 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 8.36e-01 0.0237 0.115 0.107 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 5.20e-01 0.0717 0.111 0.107 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 845660 sc-eQTL 6.71e-01 0.0579 0.136 0.107 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0683 0.125 0.104 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 7.45e-01 0.0372 0.114 0.104 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 845637 sc-eQTL 9.85e-02 0.198 0.119 0.104 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0736 0.0905 0.104 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 6.57e-01 0.0486 0.109 0.104 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 9.90e-01 0.00113 0.0927 0.104 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 845660 sc-eQTL 8.63e-01 0.0231 0.134 0.104 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 1.98e-01 0.182 0.141 0.11 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 3.74e-01 0.107 0.12 0.11 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 845637 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0794 0.109 0.11 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 6.62e-01 0.0486 0.111 0.11 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0747 0.121 0.11 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0433 0.143 0.11 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 845660 sc-eQTL 3.84e-01 0.096 0.11 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 7.79e-01 0.0353 0.126 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 9.86e-01 0.00199 0.112 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0671 0.116 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 3.82e-01 0.0703 0.0803 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 246210 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0852 0.133 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0448 0.113 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 266846 sc-eQTL 3.81e-01 0.115 0.131 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 9.71e-01 0.00418 0.117 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 4.21e-02 -0.221 0.108 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 1.04e-01 -0.151 0.0924 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 2.10e-01 0.0818 0.065 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 246210 sc-eQTL 4.31e-01 -0.108 0.136 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 2.00e-01 -0.127 0.0988 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 266846 sc-eQTL 6.28e-02 0.216 0.116 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 4.77e-01 0.0667 0.0936 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0752 0.0839 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 845637 sc-eQTL 8.59e-01 0.0218 0.123 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0865 0.101 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 3.39e-01 0.0859 0.0897 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 2.61e-01 -0.111 0.0982 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 845660 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0507 0.132 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 7.19e-01 0.0455 0.126 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 8.11e-01 0.0259 0.108 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 845637 sc-eQTL 8.21e-01 0.0272 0.12 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0133 0.0748 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 5.45e-01 0.0664 0.109 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 6.78e-01 0.0392 0.0942 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 845660 sc-eQTL 8.77e-01 0.0205 0.133 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 764699 sc-eQTL 2.01e-02 0.275 0.117 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 403128 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0762 0.101 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 549947 sc-eQTL 4.62e-01 0.073 0.099 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 509463 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00339 0.064 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 163560 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0402 0.0924 0.103 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000164440 TXLNB 246210 eQTL 0.0293 -0.0843 0.0386 0.0 0.0 0.13

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112406 \N 403128 1.21e-06 9.01e-07 3.27e-07 4.4e-07 1.38e-07 3.22e-07 1.02e-06 2.62e-07 1.03e-06 3.24e-07 1.13e-06 6.07e-07 1.3e-06 2.54e-07 4.33e-07 6.36e-07 7.79e-07 5.53e-07 4.49e-07 6.07e-07 2.83e-07 7.58e-07 7.95e-07 5.36e-07 1.69e-06 2.55e-07 6.13e-07 5.27e-07 8.56e-07 9.22e-07 4.61e-07 5.06e-08 1.32e-07 2.46e-07 3.42e-07 3.59e-07 2.96e-07 1.21e-07 1.23e-07 8.66e-09 2.44e-07 1.09e-06 5.53e-08 1.22e-08 1.93e-07 7.16e-08 1.76e-07 8.96e-08 8.83e-08
ENSG00000164440 TXLNB 246210 1.81e-06 2.46e-06 3e-07 1.69e-06 4.87e-07 7.29e-07 1.44e-06 4.22e-07 1.78e-06 7.42e-07 1.84e-06 1.45e-06 2.67e-06 9.31e-07 5.05e-07 1.15e-06 1.09e-06 1.46e-06 5.32e-07 1.13e-06 6.75e-07 1.94e-06 2.02e-06 1.02e-06 2.68e-06 1.05e-06 1.18e-06 1.29e-06 1.8e-06 1.62e-06 7.74e-07 2.37e-07 3.85e-07 7.63e-07 9.25e-07 7.45e-07 6.46e-07 3.25e-07 4.83e-07 2.06e-07 3.2e-07 2.62e-06 4.81e-07 1.41e-07 3.38e-07 2.95e-07 4.17e-07 2.22e-07 2.29e-07