logo

Genes within 1Mb (chr6:139536204:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 8.51e-02 -0.141 0.0815 0.256 B L1
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 1.10e-02 0.202 0.0786 0.256 B L1
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 8.41e-01 0.0142 0.0706 0.256 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0325 0.0414 0.256 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 244206 sc-eQTL 7.68e-02 0.179 0.101 0.256 B L1
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 6.14e-02 0.119 0.0634 0.256 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 264842 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0764 0.071 0.256 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 9.62e-01 0.00443 0.0917 0.256 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 8.97e-02 0.13 0.076 0.256 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 3.46e-01 0.0567 0.06 0.256 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 5.28e-01 0.0278 0.0441 0.256 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0482 0.0752 0.256 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 296551 sc-eQTL 3.66e-01 0.0672 0.0741 0.256 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0792 0.101 0.256 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 1.21e-01 0.112 0.0718 0.256 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 1.38e-01 -0.101 0.0676 0.256 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 1.26e-01 0.0591 0.0385 0.256 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0458 0.0734 0.256 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 296551 sc-eQTL 1.78e-01 0.12 0.0888 0.256 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 1.39e-01 0.151 0.102 0.264 DC L1
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 1.71e-01 0.115 0.0839 0.264 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 843633 sc-eQTL 1.61e-01 -0.131 0.0933 0.264 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 1.80e-01 0.111 0.0826 0.264 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 6.69e-01 0.0348 0.0812 0.264 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 1.05e-01 0.156 0.0958 0.264 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 843656 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0757 0.0979 0.264 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 6.08e-02 -0.135 0.0717 0.256 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 8.50e-02 0.113 0.0655 0.256 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 843633 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0393 0.0944 0.256 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 4.36e-01 0.0431 0.0552 0.256 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 1.15e-01 -0.113 0.0715 0.256 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 9.00e-01 0.00954 0.0761 0.256 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 843656 sc-eQTL 3.88e-01 0.0847 0.098 0.256 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 9.39e-01 0.00669 0.088 0.258 NK L1
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 1.74e-01 0.103 0.0757 0.258 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0915 0.0722 0.258 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 4.53e-01 0.0397 0.0528 0.258 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 3.05e-01 0.0721 0.0701 0.258 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 4.14e-01 0.0865 0.106 0.256 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 7.05e-01 0.029 0.0767 0.256 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0176 0.0825 0.256 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 1.73e-01 0.0734 0.0538 0.256 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 5.95e-01 0.0336 0.0632 0.256 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 1.19e-01 -0.18 0.115 0.253 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0373 0.11 0.253 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0171 0.115 0.253 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 7.97e-01 0.0269 0.104 0.253 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 244206 sc-eQTL 1.64e-01 -0.124 0.089 0.253 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 6.23e-01 0.0555 0.112 0.253 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 264842 sc-eQTL 3.74e-01 -0.1 0.112 0.253 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 4.26e-02 -0.208 0.102 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 4.96e-02 0.175 0.0884 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 4.49e-02 0.192 0.0953 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 1.96e-01 0.106 0.0816 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 244206 sc-eQTL 3.73e-01 0.0893 0.1 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 3.52e-01 0.0859 0.0921 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 264842 sc-eQTL 1.96e-01 -0.129 0.0996 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 5.46e-02 -0.202 0.105 0.252 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 6.83e-02 0.166 0.0906 0.252 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0793 0.0988 0.252 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 4.65e-01 0.0572 0.0782 0.252 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 244206 sc-eQTL 9.07e-01 0.0116 0.0999 0.252 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 1.09e-01 0.147 0.0912 0.252 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 264842 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00306 0.113 0.252 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0173 0.0979 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 1.09e-02 0.216 0.084 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00559 0.079 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 7.51e-01 0.0175 0.0552 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 244206 sc-eQTL 1.53e-01 0.148 0.103 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 8.50e-01 0.0143 0.0752 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 264842 sc-eQTL 2.45e-01 0.115 0.0984 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0281 0.095 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 1.09e-01 0.143 0.0889 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0685 0.0852 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 2.11e-02 -0.144 0.062 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 244206 sc-eQTL 6.78e-01 0.0414 0.0994 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 3.21e-01 0.101 0.101 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 264842 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0144 0.0932 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 9.66e-01 0.00425 0.0996 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 4.29e-01 0.0796 0.1 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00153 0.0976 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 8.96e-01 0.0116 0.0889 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 2.55e-01 0.102 0.0891 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 296551 sc-eQTL 3.01e-01 0.0953 0.0919 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 4.36e-01 0.0752 0.0963 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 1.14e-01 0.118 0.0745 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 7.37e-01 0.0224 0.0665 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0134 0.0448 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0666 0.0759 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 296551 sc-eQTL 1.04e-01 0.125 0.0764 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 7.39e-02 -0.167 0.0929 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 4.32e-01 0.0589 0.0748 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 5.84e-01 0.0389 0.0709 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 3.20e-01 0.0543 0.0545 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 9.44e-01 0.0057 0.0812 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 296551 sc-eQTL 2.36e-01 -0.104 0.0874 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 2.83e-01 -0.115 0.107 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 4.75e-01 0.0597 0.0834 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 6.85e-01 -0.037 0.091 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 1.96e-01 0.0838 0.0646 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 1.78e-01 0.115 0.0848 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 296551 sc-eQTL 9.55e-01 0.00501 0.0891 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 1.58e-01 -0.155 0.11 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 4.10e-01 0.0661 0.08 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0649 0.0857 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 9.50e-01 0.00438 0.0694 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 5.53e-01 0.048 0.0808 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 296551 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00892 0.097 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0612 0.104 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 3.92e-01 0.0687 0.08 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 1.47e-01 -0.116 0.0799 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 5.59e-01 0.0247 0.0421 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0457 0.0851 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 296551 sc-eQTL 4.24e-02 0.197 0.0965 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 3.35e-01 0.113 0.117 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0234 0.086 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 2.68e-01 -0.099 0.0891 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00765 0.0891 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 8.45e-01 0.0179 0.0915 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 296551 sc-eQTL 7.43e-01 0.0318 0.0966 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 3.71e-01 0.097 0.108 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 7.42e-01 0.0335 0.101 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 9.07e-02 -0.178 0.105 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 4.48e-01 0.0618 0.0813 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 3.56e-01 0.0817 0.0883 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 296551 sc-eQTL 1.73e-01 0.137 0.1 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 7.13e-01 0.0422 0.115 0.255 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 6.86e-01 0.0353 0.0872 0.255 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0722 0.0938 0.255 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 5.79e-01 0.0383 0.069 0.255 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 4.80e-02 0.16 0.0806 0.255 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 1.80e-01 -0.138 0.103 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 4.15e-01 0.0762 0.0934 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 6.40e-01 0.0408 0.0872 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 6.87e-01 0.0324 0.0803 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 4.58e-01 0.064 0.0861 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 8.19e-01 -0.022 0.0961 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 2.69e-01 0.0914 0.0825 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0698 0.0782 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 8.96e-01 0.00693 0.0531 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 2.88e-01 0.0751 0.0706 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0796 0.11 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 2.35e-01 0.123 0.103 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 8.13e-01 0.0242 0.102 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 2.81e-01 0.0904 0.0835 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0658 0.0894 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 4.85e-01 0.0687 0.098 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 5.67e-01 0.0484 0.0845 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0779 0.0871 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0111 0.0562 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 5.77e-01 0.041 0.0734 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 4.50e-02 -0.235 0.116 0.241 PB L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0772 0.128 0.241 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 4.83e-01 0.0803 0.114 0.241 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0687 0.0797 0.241 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 244206 sc-eQTL 9.89e-01 0.00159 0.117 0.241 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00922 0.0879 0.241 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 264842 sc-eQTL 9.20e-02 -0.198 0.116 0.241 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 8.29e-01 0.0237 0.11 0.259 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0977 0.0862 0.259 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0939 0.102 0.259 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0404 0.0656 0.259 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0719 0.0781 0.259 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 6.79e-01 0.0419 0.101 0.256 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 6.29e-02 0.156 0.0833 0.256 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 2.58e-01 0.0982 0.0867 0.256 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 7.13e-01 0.0273 0.074 0.256 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 4.53e-01 0.0621 0.0825 0.256 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 296551 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0564 0.0945 0.256 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 9.49e-01 0.00659 0.103 0.256 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 1.74e-01 0.133 0.0975 0.256 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 843633 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0552 0.0958 0.256 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 5.95e-02 0.207 0.109 0.256 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 8.69e-02 0.154 0.0896 0.256 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 9.46e-01 0.00651 0.0958 0.256 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 843656 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0342 0.106 0.256 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 1.05e-01 -0.127 0.078 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 2.28e-01 0.0781 0.0646 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 843633 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0486 0.0944 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0291 0.0843 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 1.42e-01 -0.104 0.0706 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 9.70e-01 0.00277 0.0742 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 843656 sc-eQTL 3.20e-01 0.0983 0.0987 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0805 0.0903 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 5.21e-01 0.0491 0.0764 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 843633 sc-eQTL 1.41e-01 -0.142 0.0964 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 1.85e-01 0.121 0.0913 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 1.49e-01 -0.115 0.0793 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 3.73e-01 0.0703 0.0787 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 843656 sc-eQTL 9.36e-01 0.00852 0.106 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 7.29e-01 -0.044 0.127 0.245 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0317 0.12 0.245 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 9.57e-01 0.00669 0.124 0.245 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 4.78e-02 0.184 0.0924 0.245 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 3.93e-01 0.0923 0.108 0.245 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 8.21e-01 0.0246 0.108 0.251 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 1.06e-01 -0.143 0.0884 0.251 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 843633 sc-eQTL 9.25e-02 0.165 0.0974 0.251 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0504 0.101 0.251 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00412 0.0925 0.251 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 3.42e-01 0.0853 0.0896 0.251 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 843656 sc-eQTL 3.83e-01 0.0961 0.11 0.251 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 1.17e-01 -0.155 0.0988 0.256 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 1.19e-01 0.141 0.0903 0.256 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 843633 sc-eQTL 9.09e-02 -0.161 0.0948 0.256 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 2.80e-01 0.0777 0.0718 0.256 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0296 0.0867 0.256 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 3.10e-01 0.0747 0.0734 0.256 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 843656 sc-eQTL 7.26e-01 0.0372 0.106 0.256 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0287 0.119 0.257 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 5.46e-01 0.0608 0.1 0.257 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 843633 sc-eQTL 6.05e-02 -0.172 0.0908 0.257 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 6.62e-01 0.0407 0.093 0.257 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 2.94e-01 -0.107 0.101 0.257 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 7.28e-02 0.214 0.118 0.257 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 843656 sc-eQTL 2.06e-01 -0.117 0.0918 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 1.41e-03 -0.31 0.0959 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 6.38e-02 0.162 0.0867 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 5.46e-02 0.174 0.0899 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 2.37e-01 0.0742 0.0626 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 244206 sc-eQTL 7.75e-01 0.0298 0.104 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 7.86e-02 0.155 0.0876 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 264842 sc-eQTL 9.62e-02 -0.17 0.102 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 8.87e-01 -0.013 0.0912 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 1.10e-02 0.215 0.084 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0614 0.0726 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0516 0.0509 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 244206 sc-eQTL 1.94e-01 0.139 0.106 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 4.56e-01 0.0579 0.0774 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 264842 sc-eQTL 4.57e-01 0.0678 0.091 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 6.43e-02 -0.134 0.0721 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 1.67e-01 0.09 0.0649 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 843633 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0992 0.0951 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 6.83e-01 0.0321 0.0784 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 1.30e-01 -0.105 0.0694 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00994 0.0764 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 843656 sc-eQTL 5.53e-01 0.0607 0.102 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0415 0.0993 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 4.28e-01 0.0673 0.0847 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 843633 sc-eQTL 3.64e-01 0.0856 0.0941 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 5.37e-01 0.0363 0.0587 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0485 0.0859 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 4.28e-01 0.0588 0.0739 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 843656 sc-eQTL 5.51e-01 0.0622 0.104 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 762695 sc-eQTL 7.89e-01 0.0244 0.0914 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 401124 sc-eQTL 1.58e-01 0.11 0.0776 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 547943 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0964 0.0759 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 507459 sc-eQTL 6.87e-01 0.0199 0.0492 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 161556 sc-eQTL 2.52e-01 0.0814 0.0709 0.256 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135540 \N 843633 2.74e-07 1.3e-07 4.47e-08 1.81e-07 9.79e-08 9.9e-08 1.53e-07 5.48e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.54e-07 9e-08 1.47e-07 6.76e-08 6.04e-08 7.36e-08 4.17e-08 1.27e-07 5.75e-08 4.23e-08 1.19e-07 1.27e-07 1.39e-07 3.03e-08 1.46e-07 1.21e-07 1.07e-07 9.74e-08 1.12e-07 1.03e-07 9.7e-08 3.26e-08 3.66e-08 8e-08 6.67e-08 3.53e-08 5.31e-08 8.61e-08 6.37e-08 3.76e-08 5.42e-08 1.35e-07 5.27e-08 1.24e-08 5.15e-08 1.84e-08 1.22e-07 3.78e-09 5.04e-08