logo

Genes within 1Mb (chr6:139534842:TA:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 7.45e-02 -0.147 0.0821 0.244 B L1
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 1.00e-02 0.206 0.0792 0.244 B L1
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 6.92e-01 0.0282 0.0711 0.244 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0218 0.0418 0.244 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 242844 sc-eQTL 5.84e-02 0.193 0.102 0.244 B L1
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 1.32e-01 0.097 0.0641 0.244 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 263480 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0502 0.0716 0.244 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 9.25e-01 0.00865 0.0924 0.244 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 1.39e-01 0.114 0.0767 0.244 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 3.96e-01 0.0515 0.0605 0.244 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 6.45e-01 0.0205 0.0444 0.244 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0281 0.0758 0.244 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 295189 sc-eQTL 3.81e-01 0.0656 0.0747 0.244 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0689 0.101 0.244 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 1.39e-01 0.107 0.0721 0.244 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0745 0.068 0.244 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 1.43e-01 0.0568 0.0386 0.244 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0183 0.0737 0.244 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 295189 sc-eQTL 1.37e-01 0.133 0.0891 0.244 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 1.42e-01 0.15 0.102 0.25 DC L1
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 2.12e-01 0.105 0.0838 0.25 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 842271 sc-eQTL 1.49e-01 -0.135 0.0932 0.25 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 7.75e-02 0.146 0.0822 0.25 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 8.94e-01 0.0108 0.0811 0.25 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 1.41e-01 0.142 0.0957 0.25 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 842294 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0735 0.0978 0.25 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 1.43e-01 -0.107 0.0725 0.244 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 1.89e-01 0.0872 0.0662 0.244 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 842271 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0212 0.0952 0.244 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 1.39e-01 0.0823 0.0555 0.244 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 1.01e-01 -0.119 0.0721 0.244 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 8.53e-01 0.0143 0.0767 0.244 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 842294 sc-eQTL 4.68e-01 0.0719 0.0989 0.244 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0179 0.0884 0.245 NK L1
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 3.40e-01 0.0729 0.0762 0.245 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 1.32e-01 -0.11 0.0724 0.245 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 6.03e-01 0.0276 0.0531 0.245 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 7.78e-02 0.124 0.0701 0.245 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 5.98e-01 0.0561 0.106 0.244 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 7.89e-01 0.0207 0.077 0.244 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0157 0.0828 0.244 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 3.30e-01 0.0529 0.0541 0.244 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 3.96e-01 0.0539 0.0634 0.244 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 2.13e-01 -0.144 0.115 0.24 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0425 0.11 0.24 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0118 0.115 0.24 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00591 0.104 0.24 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 242844 sc-eQTL 1.12e-01 -0.142 0.0888 0.24 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000496 0.113 0.24 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 263480 sc-eQTL 2.24e-01 -0.137 0.112 0.24 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 2.08e-02 -0.237 0.102 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 1.15e-01 0.141 0.0888 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 1.93e-02 0.224 0.0951 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 1.35e-01 0.122 0.0815 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 242844 sc-eQTL 3.64e-01 0.0911 0.1 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 4.05e-01 0.077 0.0923 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 263480 sc-eQTL 2.48e-01 -0.116 0.0998 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 1.81e-02 -0.25 0.105 0.239 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 1.34e-01 0.137 0.0914 0.239 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0788 0.0995 0.239 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 4.65e-01 0.0576 0.0787 0.239 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 242844 sc-eQTL 4.44e-01 0.077 0.1 0.239 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 8.43e-02 0.159 0.0917 0.239 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 263480 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00142 0.113 0.239 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0241 0.0986 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 1.79e-02 0.202 0.0848 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00364 0.0796 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 5.71e-01 0.0315 0.0556 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 242844 sc-eQTL 1.57e-01 0.147 0.104 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 8.94e-01 0.0101 0.0758 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 263480 sc-eQTL 2.00e-01 0.127 0.0991 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0397 0.0954 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 1.02e-01 0.146 0.0892 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0503 0.0856 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 2.45e-02 -0.141 0.0623 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 242844 sc-eQTL 6.81e-01 0.0411 0.0999 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 3.34e-01 0.0985 0.102 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 263480 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00851 0.0936 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 8.94e-01 0.0133 0.0998 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 7.14e-01 0.037 0.101 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 8.46e-01 0.019 0.0978 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 9.27e-01 0.00822 0.0891 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 2.50e-01 0.103 0.0892 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 295189 sc-eQTL 5.55e-01 0.0545 0.0923 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 4.76e-01 0.0693 0.097 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 1.63e-01 0.105 0.0751 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 9.68e-01 0.00266 0.067 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0247 0.045 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0474 0.0765 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 295189 sc-eQTL 5.44e-02 0.148 0.0767 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 1.20e-01 -0.146 0.0938 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 4.32e-01 0.0593 0.0753 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 4.21e-01 0.0576 0.0714 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 3.07e-01 0.0561 0.0549 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 8.41e-01 0.0165 0.0818 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 295189 sc-eQTL 2.22e-01 -0.108 0.0881 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 1.28e-01 -0.164 0.107 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 5.56e-01 0.0494 0.0837 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00284 0.0913 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 4.61e-01 0.0481 0.065 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 1.16e-01 0.134 0.085 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 295189 sc-eQTL 8.20e-01 0.0204 0.0894 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 1.63e-01 -0.154 0.11 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 3.40e-01 0.0767 0.0802 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0719 0.0859 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0107 0.0696 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 2.74e-01 0.0886 0.0808 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 295189 sc-eQTL 9.35e-01 0.00796 0.0972 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0728 0.104 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 5.27e-01 0.0508 0.0802 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 1.17e-01 -0.126 0.08 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 7.41e-01 0.014 0.0422 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0298 0.0853 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 295189 sc-eQTL 7.37e-02 0.174 0.097 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 4.03e-01 0.0992 0.118 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0263 0.0868 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0817 0.09 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 8.77e-01 0.014 0.0899 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 5.81e-01 0.051 0.0923 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 295189 sc-eQTL 4.84e-01 0.0683 0.0974 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 2.48e-01 0.126 0.109 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 9.21e-01 0.0102 0.102 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 1.17e-01 -0.167 0.106 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 6.48e-01 0.0375 0.082 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 3.88e-01 0.077 0.089 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 295189 sc-eQTL 9.05e-02 0.171 0.101 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 7.24e-01 0.0404 0.114 0.242 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00482 0.0869 0.242 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0687 0.0934 0.242 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 4.46e-01 0.0525 0.0687 0.242 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 6.59e-02 0.149 0.0803 0.242 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 1.45e-01 -0.15 0.103 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 7.44e-01 0.0306 0.0936 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 5.99e-01 0.0459 0.0873 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 7.32e-01 0.0276 0.0805 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 4.08e-01 0.0715 0.0862 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 7.80e-01 -0.027 0.0965 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 4.26e-01 0.0661 0.0829 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0851 0.0785 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00308 0.0533 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 9.36e-02 0.119 0.0706 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 2.32e-01 -0.133 0.111 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 3.14e-01 0.105 0.104 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 9.14e-01 0.0112 0.103 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 3.83e-01 0.0738 0.0845 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00166 0.0904 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 5.12e-01 0.0641 0.0974 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 7.61e-01 0.0255 0.084 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 2.73e-01 -0.095 0.0865 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00158 0.0559 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 1.47e-01 0.106 0.0726 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 9.98e-02 -0.195 0.118 0.226 PB L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0886 0.129 0.226 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 6.08e-01 0.059 0.115 0.226 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0751 0.0802 0.226 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 242844 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00523 0.118 0.226 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0135 0.0886 0.226 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 263480 sc-eQTL 1.18e-01 -0.185 0.118 0.226 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 7.38e-01 0.0367 0.11 0.246 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0861 0.086 0.246 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 3.01e-01 -0.105 0.101 0.246 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0798 0.0653 0.246 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0111 0.078 0.246 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 6.81e-01 0.0418 0.101 0.244 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 1.11e-01 0.134 0.0838 0.244 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 4.43e-01 0.0669 0.0871 0.244 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0124 0.0743 0.244 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 5.30e-01 0.0521 0.0829 0.244 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 295189 sc-eQTL 7.84e-01 -0.026 0.0949 0.244 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 8.30e-01 0.0221 0.103 0.241 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 1.48e-01 0.142 0.0976 0.241 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 842271 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0529 0.0959 0.241 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 3.78e-02 0.229 0.109 0.241 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 1.65e-01 0.126 0.09 0.241 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 9.55e-01 0.00545 0.096 0.241 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 842294 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0148 0.106 0.241 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 2.03e-01 -0.101 0.0788 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 4.84e-01 0.0458 0.0652 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 842271 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0328 0.0951 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 9.44e-01 0.00599 0.0849 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 1.26e-01 -0.109 0.0711 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00225 0.0747 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 842294 sc-eQTL 4.62e-01 0.0733 0.0995 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0509 0.091 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 7.17e-01 0.0279 0.077 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 842271 sc-eQTL 1.87e-01 -0.129 0.0972 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 9.92e-02 0.152 0.0917 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 1.13e-01 -0.127 0.0798 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 3.37e-01 0.0763 0.0793 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 842294 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00147 0.107 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0825 0.126 0.239 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0726 0.12 0.239 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0181 0.124 0.239 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 1.36e-01 0.139 0.0929 0.239 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 2.03e-01 0.137 0.107 0.239 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0173 0.109 0.238 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 1.14e-01 -0.141 0.0889 0.238 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 842271 sc-eQTL 6.37e-02 0.182 0.0978 0.238 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0195 0.102 0.238 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0321 0.0929 0.238 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 2.27e-01 0.109 0.0899 0.238 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 842294 sc-eQTL 3.36e-01 0.106 0.11 0.238 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 6.16e-02 -0.185 0.0982 0.242 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 2.23e-01 0.11 0.0902 0.242 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 842271 sc-eQTL 1.21e-01 -0.147 0.0946 0.242 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 2.47e-01 0.083 0.0715 0.242 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0221 0.0864 0.242 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 1.31e-01 0.111 0.0729 0.242 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 842294 sc-eQTL 6.32e-01 0.0507 0.106 0.242 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00871 0.119 0.24 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 7.20e-01 0.0363 0.101 0.24 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 842271 sc-eQTL 2.70e-02 -0.203 0.091 0.24 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 4.37e-01 0.0728 0.0935 0.24 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 1.26e-01 -0.156 0.102 0.24 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 1.02e-01 0.196 0.119 0.24 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 842294 sc-eQTL 1.00e-01 -0.152 0.0921 0.24 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 4.49e-04 -0.341 0.0957 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 1.12e-01 0.139 0.0871 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 3.96e-02 0.186 0.09 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 2.35e-01 0.0748 0.0628 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 242844 sc-eQTL 4.60e-01 0.0771 0.104 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 1.06e-01 0.143 0.0879 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 263480 sc-eQTL 1.09e-01 -0.164 0.102 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0286 0.0918 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 1.54e-02 0.207 0.0846 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 5.21e-01 -0.047 0.0731 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0422 0.0512 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 242844 sc-eQTL 1.79e-01 0.144 0.107 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 5.19e-01 0.0503 0.078 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 263480 sc-eQTL 3.46e-01 0.0864 0.0915 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0953 0.073 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 3.49e-01 0.0616 0.0656 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 842271 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0824 0.096 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 2.98e-01 0.0824 0.0789 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 1.04e-01 -0.114 0.0699 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0126 0.077 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 842294 sc-eQTL 6.88e-01 0.0415 0.103 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0889 0.0999 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 5.61e-01 0.0497 0.0853 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 842271 sc-eQTL 2.49e-01 0.109 0.0947 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 4.52e-01 0.0445 0.0591 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0508 0.0865 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 1.92e-01 0.0972 0.0743 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 842294 sc-eQTL 4.99e-01 0.0711 0.105 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 761333 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00612 0.0918 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 399762 sc-eQTL 2.57e-01 0.0887 0.078 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 546581 sc-eQTL 1.08e-01 -0.123 0.076 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 506097 sc-eQTL 6.38e-01 0.0233 0.0493 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 160194 sc-eQTL 5.07e-02 0.139 0.0707 0.244 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135540 \N 842271 1.01e-06 9.37e-07 7.45e-08 3.77e-07 9.24e-08 3.39e-07 4.25e-07 5.33e-08 3.66e-07 8.53e-08 1.86e-07 1.08e-07 7.02e-07 1.34e-07 1.27e-07 1.33e-07 4.25e-08 3.79e-07 7.39e-08 4.78e-08 1.39e-07 2.51e-07 2.33e-07 2.95e-08 4.88e-07 1.31e-07 1.37e-07 1.17e-07 1.76e-07 1.06e-07 1.39e-07 3.76e-08 3.28e-08 9.5e-08 4.41e-08 3.04e-08 5.59e-08 9.44e-08 6.54e-08 3.86e-08 3.07e-08 5.96e-07 5.21e-08 9.61e-08 8.03e-08 8.07e-09 9.96e-08 4.41e-09 4.91e-08