logo

Genes within 1Mb (chr6:139526584:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 7.83e-01 0.0289 0.105 0.113 B L1
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0367 0.102 0.113 B L1
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 1.35e-01 -0.134 0.0895 0.113 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 2.11e-01 0.0661 0.0527 0.113 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 234586 sc-eQTL 3.50e-01 -0.121 0.129 0.113 B L1
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 1.59e-01 -0.115 0.0812 0.113 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 255222 sc-eQTL 5.32e-01 0.0567 0.0906 0.113 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 5.96e-01 0.062 0.117 0.113 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 6.09e-01 0.0499 0.0974 0.113 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 9.18e-01 0.00788 0.0766 0.113 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0411 0.0562 0.113 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 8.15e-01 0.0225 0.096 0.113 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 286931 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0112 0.0946 0.113 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0389 0.127 0.113 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0525 0.0907 0.113 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 1.29e-01 -0.13 0.0849 0.113 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0524 0.0485 0.113 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0152 0.0923 0.113 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 286931 sc-eQTL 9.06e-01 0.0133 0.112 0.113 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 5.55e-01 0.0749 0.127 0.113 DC L1
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0444 0.104 0.113 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 834013 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0996 0.116 0.113 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 2.72e-01 -0.113 0.102 0.113 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 6.18e-01 0.0502 0.101 0.113 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 8.30e-01 0.0257 0.119 0.113 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 834036 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0725 0.121 0.113 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 2.89e-01 0.0983 0.0925 0.113 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0276 0.0846 0.113 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 834013 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0481 0.121 0.113 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0386 0.0709 0.113 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 8.98e-02 0.156 0.0917 0.113 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0848 0.0975 0.113 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 834036 sc-eQTL 9.47e-01 0.00831 0.126 0.113 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 3.61e-02 0.237 0.113 0.114 NK L1
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 2.89e-01 -0.104 0.098 0.114 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 7.02e-01 0.0358 0.0936 0.114 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0178 0.0683 0.114 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0456 0.0908 0.114 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0335 0.133 0.113 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0147 0.0962 0.113 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0449 0.103 0.113 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 9.09e-01 0.00774 0.0677 0.113 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 1.28e-01 0.121 0.0789 0.113 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 6.97e-01 0.0575 0.148 0.117 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0787 0.14 0.117 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 2.31e-01 0.176 0.147 0.117 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 3.14e-01 0.134 0.133 0.117 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 234586 sc-eQTL 9.84e-02 -0.188 0.113 0.117 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 3.43e-01 -0.136 0.143 0.117 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 255222 sc-eQTL 6.48e-01 0.0656 0.143 0.117 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0186 0.13 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 3.85e-02 0.233 0.112 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0466 0.122 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 2.82e-01 0.112 0.103 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 234586 sc-eQTL 2.59e-01 -0.143 0.127 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00416 0.117 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 255222 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0918 0.126 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0141 0.132 0.114 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 1.56e-01 -0.161 0.113 0.114 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0204 0.123 0.114 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0277 0.0975 0.114 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 234586 sc-eQTL 5.85e-01 0.068 0.124 0.114 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00975 0.114 0.114 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 255222 sc-eQTL 5.04e-01 0.0939 0.14 0.114 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0796 0.125 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 2.16e-01 -0.134 0.108 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 1.68e-01 -0.138 0.1 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0123 0.0703 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 234586 sc-eQTL 2.73e-01 -0.144 0.131 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 2.30e-01 -0.115 0.0955 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 255222 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00732 0.126 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 2.02e-01 0.157 0.123 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 2.28e-01 -0.14 0.116 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 2.24e-01 -0.135 0.11 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 2.58e-02 0.181 0.0806 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 234586 sc-eQTL 3.70e-01 -0.116 0.129 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 7.35e-01 0.0447 0.132 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 255222 sc-eQTL 4.58e-01 0.0898 0.121 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 7.93e-01 0.0339 0.129 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 8.07e-01 0.0319 0.13 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0297 0.126 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 3.61e-01 0.105 0.115 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 5.84e-01 0.0633 0.116 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 286931 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00873 0.119 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0531 0.123 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 6.91e-01 0.0381 0.0956 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 1.44e-01 0.124 0.0844 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 8.66e-01 -0.00969 0.0571 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 6.94e-01 0.0382 0.097 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 286931 sc-eQTL 7.34e-01 0.0334 0.0981 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 3.18e-01 0.12 0.12 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 6.70e-01 0.041 0.0959 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0803 0.0908 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 9.95e-01 0.000445 0.07 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 5.75e-01 0.0584 0.104 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 286931 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0817 0.112 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 4.24e-01 0.108 0.135 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0418 0.105 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 2.55e-02 -0.255 0.113 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 9.75e-01 0.00261 0.0817 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 9.41e-01 -0.008 0.107 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 286931 sc-eQTL 3.02e-01 -0.116 0.112 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 5.05e-01 0.0925 0.139 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0455 0.101 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 8.06e-03 -0.285 0.106 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0761 0.0874 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 9.55e-01 0.0057 0.102 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 286931 sc-eQTL 7.29e-01 0.0424 0.122 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 3.70e-01 -0.119 0.132 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 7.42e-01 0.0337 0.102 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 6.54e-01 -0.046 0.102 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 8.82e-01 -0.00801 0.0538 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00853 0.109 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 286931 sc-eQTL 4.16e-01 -0.101 0.124 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 3.24e-01 0.145 0.146 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 3.04e-01 -0.11 0.107 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0987 0.111 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0108 0.111 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 1.30e-01 0.173 0.113 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 286931 sc-eQTL 1.10e-02 0.304 0.119 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 2.61e-01 0.153 0.136 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 5.74e-02 -0.242 0.126 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 6.83e-02 -0.241 0.132 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 2.32e-01 0.122 0.102 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 6.94e-02 -0.201 0.11 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 286931 sc-eQTL 8.00e-01 -0.032 0.126 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0129 0.147 0.115 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 9.00e-01 0.0141 0.112 0.115 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0694 0.12 0.115 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00282 0.0883 0.115 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 2.06e-01 0.132 0.104 0.115 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 5.19e-01 0.089 0.138 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 3.69e-01 -0.112 0.125 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 6.91e-01 0.0463 0.117 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 8.55e-01 0.0196 0.107 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0147 0.115 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 1.43e-01 0.179 0.122 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 2.51e-01 -0.121 0.105 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 2.80e-01 -0.108 0.0997 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 6.04e-01 0.0352 0.0677 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 9.51e-01 0.00553 0.0903 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 5.61e-01 0.0856 0.147 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0929 0.137 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 5.97e-01 0.0719 0.136 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 3.12e-01 -0.113 0.111 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 6.13e-01 0.0603 0.119 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 1.52e-02 0.306 0.125 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 8.01e-01 0.0275 0.109 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 2.33e-01 0.134 0.112 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0181 0.0726 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 8.70e-01 0.0155 0.0948 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 1.29e-02 0.356 0.141 0.13 PB L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00881 0.158 0.13 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 9.48e-01 0.00918 0.14 0.13 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0551 0.0979 0.13 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 234586 sc-eQTL 6.88e-01 0.0576 0.143 0.13 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 7.35e-01 0.0365 0.108 0.13 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 255222 sc-eQTL 3.07e-02 0.31 0.142 0.13 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0711 0.138 0.115 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 5.10e-01 0.0717 0.109 0.115 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 6.06e-01 0.0661 0.128 0.115 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0312 0.0826 0.115 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00662 0.0985 0.115 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 3.36e-01 0.13 0.135 0.113 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 1.35e-01 0.168 0.112 0.113 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 1.80e-01 0.156 0.116 0.113 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0548 0.0991 0.113 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 1.88e-01 -0.145 0.11 0.113 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 286931 sc-eQTL 5.72e-02 0.24 0.125 0.113 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 9.65e-01 0.00561 0.129 0.112 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0309 0.123 0.112 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 834013 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0739 0.12 0.112 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0986 0.139 0.112 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 2.77e-01 0.123 0.113 0.112 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 5.96e-01 0.0638 0.12 0.112 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 834036 sc-eQTL 3.99e-01 -0.112 0.133 0.112 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 2.34e-01 0.12 0.101 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0328 0.0835 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 834013 sc-eQTL 7.09e-01 0.0454 0.122 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0664 0.109 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 6.56e-02 0.168 0.0907 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0372 0.0956 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 834036 sc-eQTL 3.74e-01 -0.113 0.127 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0318 0.116 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 1.86e-01 -0.129 0.0975 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 834013 sc-eQTL 3.86e-02 -0.256 0.123 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 4.38e-01 -0.091 0.117 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 1.33e-01 0.153 0.101 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 1.10e-01 -0.161 0.1 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 834036 sc-eQTL 7.40e-01 0.0452 0.136 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 3.26e-01 -0.152 0.155 0.106 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 4.63e-01 -0.108 0.147 0.106 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0301 0.152 0.106 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0689 0.115 0.106 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 6.86e-01 0.0536 0.132 0.106 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 2.72e-02 0.295 0.132 0.116 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 9.48e-01 0.00713 0.11 0.116 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 834013 sc-eQTL 1.81e-01 -0.162 0.121 0.116 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 7.44e-01 0.041 0.125 0.116 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 2.52e-01 0.131 0.114 0.116 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 8.30e-01 0.0238 0.111 0.116 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 834036 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0184 0.136 0.116 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0494 0.125 0.113 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 5.35e-01 0.0708 0.114 0.113 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 834013 sc-eQTL 8.92e-02 0.203 0.119 0.113 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0484 0.0903 0.113 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 6.58e-01 0.0483 0.109 0.113 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 9.94e-01 0.000654 0.0924 0.113 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 834036 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0265 0.133 0.113 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 6.93e-02 0.262 0.143 0.116 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 4.61e-01 0.0904 0.122 0.116 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 834013 sc-eQTL 3.64e-01 -0.102 0.112 0.116 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0407 0.113 0.116 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0779 0.124 0.116 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0326 0.146 0.116 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 834036 sc-eQTL 4.51e-01 0.0849 0.112 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 9.35e-01 0.0103 0.125 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 4.78e-01 0.0791 0.111 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0124 0.115 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 3.60e-01 0.0732 0.0798 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 234586 sc-eQTL 2.64e-01 -0.148 0.132 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0423 0.112 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 255222 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00252 0.131 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 8.70e-01 0.019 0.116 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 1.96e-01 -0.14 0.108 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 1.50e-01 -0.133 0.0919 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 3.82e-01 0.0566 0.0646 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 234586 sc-eQTL 3.47e-01 -0.127 0.135 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 2.70e-01 -0.109 0.0982 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 255222 sc-eQTL 3.55e-01 0.107 0.115 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 6.09e-01 0.0476 0.093 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0704 0.0834 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 834013 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0666 0.122 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0993 0.1 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 5.81e-02 0.169 0.0885 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0725 0.0977 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 834036 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0266 0.131 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 4.22e-01 0.101 0.126 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 6.48e-01 0.0491 0.108 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 834013 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0103 0.12 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 9.45e-01 0.00511 0.0745 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 3.29e-01 0.106 0.109 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 8.06e-01 0.0231 0.0939 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 834036 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0654 0.132 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 753075 sc-eQTL 1.79e-02 0.279 0.117 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 391504 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0638 0.101 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 538323 sc-eQTL 8.78e-01 0.0151 0.0987 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 497839 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00168 0.0637 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 151936 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0351 0.092 0.112 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112406 HECA 391504 eQTL 0.0409 -0.0265 0.0129 0.0 0.0 0.142
ENSG00000164440 TXLNB 234586 eQTL 0.0155 -0.0875 0.0361 0.0013 0.0 0.142
ENSG00000164442 CITED2 151936 eQTL 0.0608 -0.0575 0.0306 0.0011 0.0 0.142

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112406 HECA 391504 9.39e-07 6.78e-07 1e-07 4.31e-07 1.12e-07 2.86e-07 6.02e-07 1.76e-07 5.3e-07 2.8e-07 9e-07 4.94e-07 9.57e-07 1.57e-07 2.86e-07 2.69e-07 4.3e-07 4.11e-07 2.65e-07 1.67e-07 2.48e-07 4.14e-07 4e-07 2.22e-07 9.71e-07 2.6e-07 3.16e-07 2.69e-07 4.22e-07 6.73e-07 3.66e-07 6.31e-08 4.83e-08 1.77e-07 3.82e-07 1.44e-07 1.4e-07 1.02e-07 8.26e-08 1.6e-08 1.23e-07 6.49e-07 5.58e-08 1.99e-08 1.48e-07 1.46e-08 1.01e-07 2.35e-08 5.96e-08
ENSG00000164440 TXLNB 234586 1.31e-06 1.3e-06 3.18e-07 1.26e-06 3.36e-07 6.12e-07 1.48e-06 4.11e-07 1.66e-06 5.93e-07 2.1e-06 9.29e-07 2.53e-06 3.36e-07 4.95e-07 9.48e-07 9.41e-07 9.1e-07 8.2e-07 5.97e-07 8.18e-07 1.8e-06 1.04e-06 5.3e-07 2.49e-06 6.42e-07 9.31e-07 9.36e-07 1.55e-06 1.16e-06 7.8e-07 2.52e-07 2.75e-07 6.29e-07 5.52e-07 4.32e-07 6.79e-07 2.78e-07 4.63e-07 3.35e-07 3.05e-07 1.67e-06 2.33e-07 5.7e-08 2.47e-07 1.72e-07 2.24e-07 4.82e-08 1.56e-07