logo

Genes within 1Mb (chr6:139526156:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 5.80e-02 -0.157 0.0822 0.25 B L1
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 1.94e-02 0.188 0.0796 0.25 B L1
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 9.43e-01 0.0051 0.0713 0.25 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0395 0.0418 0.25 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 234158 sc-eQTL 8.38e-02 0.177 0.102 0.25 B L1
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 6.03e-02 0.121 0.0641 0.25 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 254794 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0662 0.0717 0.25 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0208 0.093 0.25 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 9.05e-02 0.131 0.077 0.25 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 3.58e-01 0.0561 0.0608 0.25 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 3.80e-01 0.0392 0.0446 0.25 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0279 0.0763 0.25 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 286503 sc-eQTL 4.83e-01 0.0528 0.0752 0.25 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0924 0.102 0.25 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 1.18e-01 0.115 0.073 0.25 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 9.53e-02 -0.115 0.0686 0.25 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 1.39e-01 0.0581 0.0391 0.25 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0504 0.0745 0.25 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 286503 sc-eQTL 1.62e-01 0.126 0.0902 0.25 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 3.97e-01 0.0888 0.105 0.257 DC L1
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 1.94e-01 0.112 0.086 0.257 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 833585 sc-eQTL 1.39e-01 -0.142 0.0956 0.257 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 3.47e-01 0.0799 0.0848 0.257 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 5.85e-01 0.0455 0.0832 0.257 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 1.46e-01 0.143 0.0983 0.257 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 833608 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0653 0.1 0.257 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 4.11e-02 -0.149 0.0723 0.25 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 8.48e-02 0.115 0.0662 0.25 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 833585 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0262 0.0954 0.25 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 6.21e-01 0.0277 0.0558 0.25 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 1.25e-01 -0.111 0.0723 0.25 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 9.59e-01 -0.004 0.0769 0.25 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 833608 sc-eQTL 5.18e-01 0.0643 0.0991 0.25 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 7.55e-01 0.0279 0.0891 0.251 NK L1
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 1.30e-01 0.117 0.0766 0.251 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0874 0.0731 0.251 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 4.38e-01 0.0415 0.0535 0.251 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 3.21e-01 0.0707 0.071 0.251 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 8.20e-01 0.0244 0.107 0.25 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 6.17e-01 0.0388 0.0775 0.25 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0499 0.0833 0.25 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 1.87e-01 0.072 0.0544 0.25 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 4.42e-01 0.0492 0.0638 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 1.82e-01 -0.158 0.118 0.245 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0123 0.113 0.245 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 8.86e-01 -0.017 0.118 0.245 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 6.20e-01 0.053 0.107 0.245 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 234158 sc-eQTL 2.35e-01 -0.109 0.0911 0.245 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 7.39e-01 0.0383 0.115 0.245 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 254794 sc-eQTL 3.00e-01 -0.119 0.115 0.245 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 2.07e-02 -0.241 0.103 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 1.20e-01 0.141 0.0901 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 7.61e-02 0.173 0.0971 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 1.60e-01 0.117 0.0828 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 234158 sc-eQTL 3.95e-01 0.0869 0.102 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 2.44e-01 0.109 0.0935 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 254794 sc-eQTL 2.96e-01 -0.106 0.101 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 2.80e-02 -0.234 0.106 0.246 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 1.35e-01 0.138 0.0922 0.246 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0575 0.1 0.246 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 6.57e-01 0.0353 0.0794 0.246 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 234158 sc-eQTL 8.06e-01 0.025 0.101 0.246 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 1.43e-01 0.136 0.0927 0.246 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 254794 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0186 0.114 0.246 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0376 0.0992 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 2.04e-02 0.2 0.0854 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00694 0.08 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00467 0.056 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 234158 sc-eQTL 3.32e-01 0.102 0.105 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 8.44e-01 0.015 0.0763 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 254794 sc-eQTL 1.98e-01 0.129 0.0997 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00531 0.0958 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 1.07e-01 0.145 0.0896 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0735 0.0859 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 2.00e-02 -0.147 0.0625 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 234158 sc-eQTL 6.29e-01 0.0485 0.1 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 4.10e-01 0.0843 0.102 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 254794 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0059 0.0939 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 8.79e-01 0.0155 0.101 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 2.16e-01 0.126 0.102 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0211 0.0992 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 7.62e-01 0.0274 0.0904 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 2.78e-01 0.0985 0.0906 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 286503 sc-eQTL 4.41e-01 0.0722 0.0935 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 6.44e-01 0.0451 0.0974 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 9.86e-02 0.125 0.0753 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 8.69e-01 0.0111 0.0672 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 8.44e-01 -0.00892 0.0452 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0468 0.0768 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 286503 sc-eQTL 1.85e-01 0.103 0.0774 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 7.11e-02 -0.171 0.0941 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 3.52e-01 0.0706 0.0757 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 4.60e-01 0.0532 0.0718 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 1.88e-01 0.0728 0.0551 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 6.99e-01 0.0319 0.0822 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 286503 sc-eQTL 1.27e-01 -0.135 0.0884 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 1.77e-01 -0.147 0.108 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 5.34e-01 0.0527 0.0846 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0611 0.0922 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 1.92e-01 0.0857 0.0655 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 1.82e-01 0.115 0.086 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 286503 sc-eQTL 6.91e-01 0.036 0.0903 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 1.60e-01 -0.157 0.111 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 2.17e-01 0.101 0.0812 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 5.00e-01 -0.059 0.0872 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 9.35e-01 0.0058 0.0706 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 6.85e-01 0.0334 0.0822 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 286503 sc-eQTL 9.06e-01 0.0116 0.0986 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0819 0.105 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 4.18e-01 0.0657 0.081 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 1.72e-01 -0.111 0.081 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 6.51e-01 0.0194 0.0427 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0306 0.0862 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 286503 sc-eQTL 3.69e-02 0.205 0.0977 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 5.35e-01 0.0743 0.12 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 7.84e-01 -0.024 0.0876 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 1.09e-01 -0.146 0.0905 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0315 0.0907 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 7.46e-01 0.0302 0.0932 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 286503 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0123 0.0985 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 5.33e-01 0.0688 0.11 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00923 0.103 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 1.16e-01 -0.169 0.107 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 6.25e-01 0.0405 0.0828 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 4.98e-01 0.0611 0.0899 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 286503 sc-eQTL 4.23e-01 0.0821 0.102 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 9.18e-01 -0.012 0.116 0.249 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 5.62e-01 0.0511 0.0879 0.249 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 2.50e-01 -0.109 0.0945 0.249 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 7.23e-01 0.0248 0.0697 0.249 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 2.77e-02 0.18 0.0811 0.249 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 2.56e-01 -0.119 0.104 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 5.73e-01 0.0535 0.0947 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 7.20e-01 0.0317 0.0884 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 7.81e-01 0.0227 0.0814 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 8.54e-01 0.016 0.0873 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0213 0.0972 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 2.22e-01 0.102 0.0834 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0939 0.079 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 7.18e-01 0.0194 0.0537 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 2.88e-01 0.0761 0.0714 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 3.45e-01 -0.106 0.112 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 2.11e-01 0.131 0.104 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 7.07e-01 0.0388 0.103 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 2.55e-01 0.0966 0.0846 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0609 0.0906 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 2.86e-01 0.106 0.0992 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 4.31e-01 0.0674 0.0855 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 5.27e-01 -0.056 0.0884 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0244 0.0569 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 5.42e-01 0.0454 0.0743 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 5.74e-02 -0.225 0.117 0.241 PB L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0351 0.13 0.241 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 4.27e-01 0.0917 0.115 0.241 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0955 0.0802 0.241 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 234158 sc-eQTL 7.73e-01 0.0341 0.118 0.241 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0164 0.0888 0.241 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 254794 sc-eQTL 1.61e-01 -0.167 0.118 0.241 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0233 0.111 0.252 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 2.14e-01 -0.109 0.0872 0.252 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 2.60e-01 -0.116 0.103 0.252 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0606 0.0664 0.252 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0723 0.0791 0.252 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 7.83e-01 0.0282 0.102 0.25 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 9.36e-02 0.142 0.0846 0.25 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 2.52e-01 0.101 0.0878 0.25 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 5.19e-01 0.0485 0.075 0.25 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 5.99e-01 0.0441 0.0837 0.25 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 286503 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00809 0.0958 0.25 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 9.41e-01 0.0078 0.105 0.251 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 3.38e-01 0.0957 0.0997 0.251 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 833585 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0865 0.0975 0.251 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 9.00e-02 0.191 0.112 0.251 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 7.19e-02 0.165 0.0913 0.251 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 9.86e-01 0.00166 0.0977 0.251 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 833608 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0488 0.108 0.251 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 1.10e-01 -0.126 0.0788 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 2.33e-01 0.078 0.0652 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 833585 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0455 0.0953 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0568 0.085 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 1.35e-01 -0.107 0.0712 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0183 0.0749 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 833608 sc-eQTL 4.77e-01 0.0711 0.0997 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 1.71e-01 -0.125 0.0911 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 5.23e-01 0.0494 0.0773 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 833585 sc-eQTL 1.54e-01 -0.14 0.0976 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 3.36e-01 0.0893 0.0925 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 1.68e-01 -0.111 0.0803 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 4.76e-01 0.057 0.0797 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 833608 sc-eQTL 9.12e-01 0.0119 0.107 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0974 0.129 0.236 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00418 0.123 0.236 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00594 0.127 0.236 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 5.39e-02 0.183 0.0943 0.236 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 2.85e-01 0.118 0.11 0.236 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00803 0.11 0.244 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 1.89e-01 -0.118 0.0897 0.244 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 833585 sc-eQTL 1.08e-01 0.159 0.0987 0.244 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 7.56e-01 -0.032 0.103 0.244 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0261 0.0937 0.244 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 2.31e-01 0.109 0.0906 0.244 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 833608 sc-eQTL 4.39e-01 0.0863 0.111 0.244 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 1.66e-01 -0.14 0.101 0.249 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 8.09e-02 0.161 0.0917 0.249 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 833585 sc-eQTL 1.88e-01 -0.128 0.0967 0.249 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 2.89e-01 0.0776 0.073 0.249 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0384 0.0882 0.249 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 4.07e-01 0.0621 0.0747 0.249 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 833608 sc-eQTL 7.71e-01 0.0314 0.108 0.249 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0552 0.12 0.251 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 7.19e-01 0.0368 0.102 0.251 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 833585 sc-eQTL 5.64e-02 -0.177 0.0922 0.251 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 7.25e-01 0.0333 0.0945 0.251 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 2.38e-01 -0.122 0.103 0.251 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 7.04e-02 0.219 0.12 0.251 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 833608 sc-eQTL 2.50e-01 -0.108 0.0934 0.251 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 3.23e-04 -0.353 0.0966 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 1.52e-01 0.127 0.0882 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 8.02e-02 0.16 0.0912 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 2.61e-01 0.0715 0.0635 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 234158 sc-eQTL 7.89e-01 0.0282 0.105 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 6.07e-02 0.167 0.0887 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 254794 sc-eQTL 1.28e-01 -0.158 0.103 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0127 0.0923 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 1.86e-02 0.202 0.0852 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0653 0.0734 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 1.72e-01 -0.0705 0.0514 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 234158 sc-eQTL 3.60e-01 0.0989 0.108 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 4.77e-01 0.0559 0.0784 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 254794 sc-eQTL 3.60e-01 0.0845 0.092 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 3.59e-02 -0.153 0.0727 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 1.93e-01 0.0857 0.0656 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 833585 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0956 0.0961 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000589 0.0792 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 1.37e-01 -0.105 0.0701 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0327 0.0771 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 833608 sc-eQTL 6.30e-01 0.0498 0.103 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0469 0.101 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 3.46e-01 0.0811 0.0858 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 833585 sc-eQTL 2.27e-01 0.115 0.0953 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 4.25e-01 0.0475 0.0595 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0542 0.0871 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 5.09e-01 0.0497 0.075 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 833608 sc-eQTL 5.55e-01 0.0624 0.106 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 752647 sc-eQTL 6.03e-01 0.0482 0.0925 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 391076 sc-eQTL 1.22e-01 0.122 0.0785 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 537895 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0922 0.0768 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 497411 sc-eQTL 6.60e-01 0.0219 0.0497 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 151508 sc-eQTL 2.55e-01 0.0818 0.0717 0.25 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135540 NHSL1 833585 eQTL 0.0243 -0.062 0.0275 0.0 0.0 0.241

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135540 NHSL1 833585 2.64e-07 1.11e-07 3.62e-08 1.78e-07 9.02e-08 9.71e-08 1.38e-07 5.33e-08 1.41e-07 4.4e-08 1.59e-07 7.78e-08 1.3e-07 6.21e-08 5.4e-08 7.5e-08 4.48e-08 1.14e-07 5.19e-08 4.03e-08 1.04e-07 1.27e-07 1.26e-07 4.13e-08 1.33e-07 1.19e-07 1.12e-07 9.15e-08 1.03e-07 1.12e-07 9.58e-08 3.68e-08 2.92e-08 8.68e-08 8.87e-08 3.97e-08 4.75e-08 9.6e-08 7.92e-08 3.01e-08 4.83e-08 1.35e-07 3.91e-08 1.66e-08 7.26e-08 1.7e-08 1.22e-07 4.04e-09 5.04e-08