logo

Genes within 1Mb (chr6:139525244:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 5.62e-02 -0.156 0.0814 0.252 B L1
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 1.43e-02 0.194 0.0787 0.252 B L1
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 8.52e-01 0.0132 0.0705 0.252 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0372 0.0413 0.252 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 233246 sc-eQTL 7.55e-02 0.18 0.101 0.252 B L1
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 5.31e-02 0.123 0.0634 0.252 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 253882 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0627 0.071 0.252 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00718 0.0915 0.252 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 7.46e-02 0.136 0.0757 0.252 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 3.93e-01 0.0512 0.0599 0.252 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 3.01e-01 0.0455 0.0439 0.252 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 6.99e-01 -0.029 0.0751 0.252 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 285591 sc-eQTL 4.04e-01 0.0618 0.0739 0.252 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0778 0.101 0.252 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 1.30e-01 0.109 0.0718 0.252 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 7.18e-02 -0.122 0.0674 0.252 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 9.15e-02 0.0651 0.0384 0.252 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0516 0.0733 0.252 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 285591 sc-eQTL 1.17e-01 0.139 0.0887 0.252 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 5.44e-01 0.0629 0.103 0.259 DC L1
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 2.83e-01 0.0914 0.0849 0.259 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 832673 sc-eQTL 1.12e-01 -0.15 0.0942 0.259 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 3.03e-01 0.0863 0.0836 0.259 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 4.95e-01 0.0561 0.082 0.259 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 1.41e-01 0.143 0.0969 0.259 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 832696 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0431 0.0991 0.259 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 6.76e-02 -0.131 0.0715 0.252 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 9.64e-02 0.109 0.0653 0.252 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 832673 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00746 0.0942 0.252 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 6.55e-01 0.0247 0.0551 0.252 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 1.37e-01 -0.107 0.0714 0.252 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 9.84e-01 0.00149 0.0759 0.252 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 832696 sc-eQTL 4.57e-01 0.0728 0.0978 0.252 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 8.41e-01 0.0176 0.0879 0.253 NK L1
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 1.09e-01 0.121 0.0755 0.253 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0918 0.072 0.253 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 3.59e-01 0.0484 0.0527 0.253 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 3.10e-01 0.0713 0.07 0.253 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 6.98e-01 0.041 0.106 0.252 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 5.82e-01 0.0421 0.0764 0.252 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0452 0.0821 0.252 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 2.02e-01 0.0686 0.0536 0.252 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 4.73e-01 0.0452 0.0629 0.252 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 1.93e-01 -0.151 0.116 0.247 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 9.53e-01 0.00661 0.111 0.247 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 9.49e-01 0.00744 0.116 0.247 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 6.59e-01 0.0465 0.105 0.247 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 233246 sc-eQTL 1.99e-01 -0.115 0.0896 0.247 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 6.42e-01 0.0528 0.113 0.247 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 253882 sc-eQTL 2.44e-01 -0.132 0.113 0.247 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 1.92e-02 -0.241 0.102 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 1.21e-01 0.139 0.0893 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 9.17e-02 0.163 0.0962 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 1.67e-01 0.114 0.0821 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 233246 sc-eQTL 3.33e-01 0.0977 0.101 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 1.87e-01 0.123 0.0925 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 253882 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0897 0.1 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 2.70e-02 -0.234 0.105 0.248 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 1.60e-01 0.129 0.0916 0.248 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0657 0.0996 0.248 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 8.21e-01 0.0179 0.0789 0.248 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 233246 sc-eQTL 7.96e-01 0.0261 0.101 0.248 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 1.13e-01 0.146 0.0919 0.248 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 253882 sc-eQTL 9.99e-01 0.000118 0.114 0.248 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0391 0.0979 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 1.53e-02 0.206 0.0842 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 9.93e-01 0.000741 0.079 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 9.20e-01 0.00552 0.0553 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 233246 sc-eQTL 3.06e-01 0.106 0.103 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 8.01e-01 0.019 0.0753 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 253882 sc-eQTL 1.73e-01 0.135 0.0983 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00785 0.0947 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 8.49e-02 0.153 0.0885 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0571 0.0849 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 1.46e-02 -0.152 0.0617 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 233246 sc-eQTL 7.10e-01 0.0369 0.0991 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 4.25e-01 0.0806 0.101 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 253882 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0258 0.0928 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 9.06e-01 0.0118 0.0996 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 2.85e-01 0.108 0.1 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0208 0.0977 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 5.30e-01 0.0559 0.0889 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 2.47e-01 0.104 0.0891 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 285591 sc-eQTL 3.62e-01 0.0841 0.092 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 5.06e-01 0.0639 0.0959 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 8.34e-02 0.129 0.0741 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 9.03e-01 0.00805 0.0662 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0105 0.0446 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0484 0.0756 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 285591 sc-eQTL 1.58e-01 0.108 0.0762 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 8.78e-02 -0.159 0.0929 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 3.27e-01 0.0734 0.0747 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 5.53e-01 0.0422 0.0709 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 1.60e-01 0.0766 0.0543 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 7.63e-01 0.0245 0.0812 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 285591 sc-eQTL 1.40e-01 -0.129 0.0872 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 2.77e-01 -0.117 0.107 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 4.54e-01 0.0626 0.0835 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0384 0.091 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 1.93e-01 0.0844 0.0647 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 2.53e-01 0.0975 0.085 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 285591 sc-eQTL 5.79e-01 0.0495 0.0891 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 1.85e-01 -0.146 0.11 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 1.99e-01 0.103 0.0798 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0442 0.0858 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 8.57e-01 0.0125 0.0694 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 6.82e-01 0.0331 0.0808 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 285591 sc-eQTL 7.44e-01 0.0317 0.0969 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0748 0.104 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 3.60e-01 0.0734 0.0799 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 1.36e-01 -0.119 0.0798 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 5.86e-01 0.023 0.0421 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0328 0.0851 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 285591 sc-eQTL 2.47e-02 0.218 0.0962 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 5.35e-01 0.0743 0.12 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 7.84e-01 -0.024 0.0876 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 1.09e-01 -0.146 0.0905 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0315 0.0907 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 7.46e-01 0.0302 0.0932 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 285591 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0123 0.0985 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 4.56e-01 0.081 0.108 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00986 0.102 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 9.34e-02 -0.177 0.105 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 4.99e-01 0.0552 0.0815 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 4.30e-01 0.0699 0.0885 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 285591 sc-eQTL 3.90e-01 0.0866 0.101 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 9.60e-01 0.00573 0.114 0.251 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 6.89e-01 0.0347 0.0865 0.251 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0862 0.093 0.251 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 6.11e-01 0.0349 0.0685 0.251 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 2.99e-02 0.174 0.0798 0.251 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 2.72e-01 -0.113 0.103 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 5.06e-01 0.0622 0.0934 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 6.31e-01 0.0419 0.0871 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 6.07e-01 0.0414 0.0803 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 6.72e-01 0.0365 0.0861 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0296 0.0958 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 1.85e-01 0.109 0.0821 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0996 0.0778 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 5.49e-01 0.0317 0.0528 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 2.58e-01 0.0797 0.0703 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 2.85e-01 -0.118 0.11 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 2.09e-01 0.13 0.103 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 6.97e-01 0.0397 0.102 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 2.07e-01 0.106 0.0834 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0585 0.0894 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 3.14e-01 0.0987 0.0978 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 4.46e-01 0.0643 0.0843 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0581 0.0871 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0286 0.0561 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 5.53e-01 0.0436 0.0733 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 7.48e-02 -0.206 0.115 0.244 PB L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0119 0.127 0.244 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 4.30e-01 0.0887 0.112 0.244 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0826 0.0783 0.244 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 233246 sc-eQTL 7.84e-01 0.0315 0.115 0.244 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0157 0.0865 0.244 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 253882 sc-eQTL 1.43e-01 -0.169 0.115 0.244 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00748 0.109 0.254 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 2.30e-01 -0.104 0.0859 0.254 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 2.60e-01 -0.114 0.101 0.254 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0606 0.0654 0.254 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0695 0.0779 0.254 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 8.23e-01 0.0226 0.101 0.252 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 7.72e-02 0.148 0.0833 0.252 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 3.08e-01 0.0885 0.0866 0.252 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 4.48e-01 0.0561 0.0738 0.252 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 6.97e-01 0.0322 0.0825 0.252 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 285591 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00222 0.0944 0.252 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0124 0.103 0.254 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 4.59e-01 0.0728 0.0981 0.254 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 832673 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0937 0.0958 0.254 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 9.64e-02 0.184 0.11 0.254 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 5.97e-02 0.17 0.0897 0.254 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 9.40e-01 0.00726 0.096 0.254 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 832696 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0156 0.106 0.254 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 1.21e-01 -0.121 0.0777 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 2.11e-01 0.0807 0.0644 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 832673 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0442 0.094 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0622 0.0839 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 1.47e-01 -0.102 0.0703 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00979 0.0739 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 832696 sc-eQTL 4.64e-01 0.0722 0.0984 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 2.44e-01 -0.105 0.09 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 6.27e-01 0.0371 0.0763 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 832673 sc-eQTL 2.77e-01 -0.105 0.0965 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 2.74e-01 0.1 0.0913 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 1.94e-01 -0.103 0.0793 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 4.11e-01 0.0648 0.0787 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 832696 sc-eQTL 8.52e-01 0.0198 0.106 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0974 0.129 0.236 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00418 0.123 0.236 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00594 0.127 0.236 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 5.39e-02 0.183 0.0943 0.236 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 2.85e-01 0.118 0.11 0.236 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 9.21e-01 0.0107 0.108 0.247 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 1.33e-01 -0.133 0.0882 0.247 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 832673 sc-eQTL 1.33e-01 0.147 0.0973 0.247 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0375 0.101 0.247 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0162 0.0922 0.247 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 2.33e-01 0.107 0.0892 0.247 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 832696 sc-eQTL 3.67e-01 0.0991 0.109 0.247 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 1.19e-01 -0.155 0.099 0.251 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 6.75e-02 0.166 0.0902 0.251 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 832673 sc-eQTL 2.26e-01 -0.116 0.0953 0.251 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 2.75e-01 0.0787 0.0719 0.251 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0475 0.0868 0.251 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 4.83e-01 0.0518 0.0736 0.251 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 832696 sc-eQTL 5.57e-01 0.0624 0.106 0.251 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0552 0.12 0.251 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 7.19e-01 0.0368 0.102 0.251 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 832673 sc-eQTL 5.64e-02 -0.177 0.0922 0.251 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 7.25e-01 0.0333 0.0945 0.251 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 2.38e-01 -0.122 0.103 0.251 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 7.04e-02 0.219 0.12 0.251 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 832696 sc-eQTL 2.50e-01 -0.108 0.0934 0.251 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 1.94e-04 -0.362 0.0954 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 1.37e-01 0.13 0.0873 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 7.46e-02 0.162 0.0903 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 3.70e-01 0.0565 0.0629 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 233246 sc-eQTL 8.01e-01 0.0263 0.104 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 4.01e-02 0.181 0.0877 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 253882 sc-eQTL 1.39e-01 -0.152 0.102 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0186 0.0912 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 1.44e-02 0.207 0.084 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0575 0.0726 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0653 0.0508 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 233246 sc-eQTL 3.36e-01 0.103 0.107 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 3.99e-01 0.0654 0.0774 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 253882 sc-eQTL 3.30e-01 0.0887 0.0909 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 6.12e-02 -0.135 0.0719 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 2.03e-01 0.0827 0.0648 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 832673 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0744 0.0949 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 9.93e-01 0.000726 0.0782 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 1.50e-01 -0.1 0.0692 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 7.53e-01 -0.024 0.0761 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 832696 sc-eQTL 6.06e-01 0.0527 0.102 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0277 0.0994 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 4.06e-01 0.0705 0.0847 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 832673 sc-eQTL 2.48e-01 0.109 0.094 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 4.61e-01 0.0433 0.0587 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0486 0.0859 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 5.53e-01 0.0439 0.074 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 832696 sc-eQTL 4.15e-01 0.0851 0.104 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 751735 sc-eQTL 6.94e-01 0.0359 0.0912 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 390164 sc-eQTL 1.01e-01 0.127 0.0773 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 536983 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0976 0.0757 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 496499 sc-eQTL 5.58e-01 0.0287 0.049 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 150596 sc-eQTL 2.55e-01 0.0806 0.0707 0.252 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135540 NHSL1 832673 eQTL 0.0292 -0.0599 0.0274 0.0 0.0 0.243

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135540 NHSL1 832673 3.1e-07 2.67e-07 6.04e-08 2.31e-07 1.02e-07 7.75e-08 2.4e-07 7.12e-08 2.01e-07 1.11e-07 2.84e-07 1.52e-07 4.11e-07 8.54e-08 6.53e-08 9.48e-08 6.81e-08 2.15e-07 7.29e-08 6.16e-08 1.33e-07 2.24e-07 1.75e-07 3.42e-08 2.59e-07 1.26e-07 1.29e-07 1.54e-07 1.39e-07 1.69e-07 1.88e-07 3.9e-08 4.37e-08 9.5e-08 4.41e-08 3.36e-08 5.26e-08 8.68e-08 6.28e-08 5.24e-08 4.88e-08 2.72e-07 3.99e-08 1.43e-08 3.81e-08 8.31e-09 9.29e-08 2e-09 4.81e-08