logo

Genes within 1Mb (chr6:139521044:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 9.68e-01 -0.0033 0.0835 0.222 B L1
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 3.32e-01 0.0789 0.081 0.222 B L1
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0602 0.0716 0.222 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0137 0.0421 0.222 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 229046 sc-eQTL 2.06e-01 -0.13 0.103 0.222 B L1
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0196 0.065 0.222 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 249682 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0486 0.0723 0.222 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 6.02e-01 0.0479 0.0917 0.222 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 5.39e-01 0.0471 0.0764 0.222 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0585 0.06 0.222 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0372 0.044 0.222 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 6.69e-01 0.0322 0.0753 0.222 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 281391 sc-eQTL 6.78e-01 0.0309 0.0742 0.222 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 8.30e-01 0.0215 0.0998 0.222 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 2.37e-01 0.0844 0.0712 0.222 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0461 0.0671 0.222 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0301 0.0382 0.222 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 8.00e-01 0.0184 0.0726 0.222 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 281391 sc-eQTL 6.97e-01 0.0344 0.0882 0.222 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 7.12e-01 0.0371 0.1 0.216 DC L1
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 7.05e-01 0.0313 0.0825 0.216 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 828473 sc-eQTL 8.28e-01 0.0199 0.0918 0.216 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0525 0.0811 0.216 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 3.04e-01 0.0818 0.0793 0.216 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 3.84e-01 0.0822 0.0942 0.216 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 828496 sc-eQTL 1.25e-01 -0.147 0.0954 0.216 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 9.41e-01 0.00545 0.0731 0.222 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 8.15e-01 0.0156 0.0667 0.222 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 828473 sc-eQTL 5.56e-01 0.0562 0.0954 0.222 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 4.07e-01 0.0464 0.0558 0.222 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 9.78e-01 0.00202 0.0728 0.222 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 5.97e-01 0.0407 0.0769 0.222 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 828496 sc-eQTL 3.65e-02 -0.207 0.0983 0.222 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0222 0.0919 0.219 NK L1
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0249 0.0794 0.219 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 3.60e-01 0.0692 0.0755 0.219 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0682 0.055 0.219 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 1.15e-01 0.116 0.073 0.219 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0234 0.106 0.222 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00522 0.0769 0.222 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0717 0.0825 0.222 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0502 0.054 0.222 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 5.30e-02 0.122 0.0628 0.222 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 6.80e-01 0.047 0.114 0.217 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 2.40e-01 0.127 0.108 0.217 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0847 0.113 0.217 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 8.49e-01 0.0196 0.103 0.217 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 229046 sc-eQTL 1.45e-01 0.128 0.0874 0.217 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 3.36e-01 -0.107 0.11 0.217 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 249682 sc-eQTL 1.95e-02 -0.257 0.109 0.217 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00638 0.102 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 7.29e-01 0.0306 0.0883 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0191 0.0952 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 5.38e-01 -0.05 0.081 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 229046 sc-eQTL 7.63e-01 -0.03 0.0993 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 9.49e-01 0.0059 0.0914 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 249682 sc-eQTL 5.81e-01 0.0547 0.0989 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 7.03e-01 0.0392 0.103 0.224 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 9.80e-01 0.00224 0.0889 0.224 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 8.91e-01 0.0132 0.0964 0.224 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 5.47e-01 0.0459 0.0762 0.224 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 229046 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0809 0.0971 0.224 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 8.75e-01 0.0141 0.0894 0.224 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 249682 sc-eQTL 5.66e-01 -0.063 0.11 0.224 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 8.99e-01 0.0124 0.0973 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 6.03e-01 0.0441 0.0848 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 1.21e-01 -0.122 0.0781 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 9.39e-01 0.00423 0.0549 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 229046 sc-eQTL 9.88e-02 -0.169 0.102 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0245 0.0748 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 249682 sc-eQTL 5.26e-02 -0.19 0.0973 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 5.24e-01 -0.061 0.0956 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 8.64e-02 0.154 0.0894 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 5.82e-01 0.0473 0.0859 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 4.23e-01 0.0507 0.0632 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 229046 sc-eQTL 2.47e-01 0.116 0.0998 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00342 0.102 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 249682 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0778 0.0937 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0689 0.099 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0564 0.1 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 9.22e-01 0.0095 0.0971 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0346 0.0885 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0274 0.0889 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 281391 sc-eQTL 6.66e-02 -0.168 0.091 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 3.34e-01 0.0933 0.0962 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 4.19e-01 0.0606 0.0749 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0731 0.0663 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 7.87e-02 -0.0785 0.0444 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0327 0.076 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 281391 sc-eQTL 5.17e-01 0.0499 0.0768 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 8.54e-01 0.0172 0.0932 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 4.33e-01 0.0585 0.0744 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0948 0.0703 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0686 0.0541 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 7.77e-01 0.023 0.0808 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 281391 sc-eQTL 7.30e-01 0.0302 0.0873 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0229 0.106 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0774 0.0823 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0702 0.0897 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0697 0.0639 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 3.75e-02 0.174 0.0833 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 281391 sc-eQTL 6.44e-01 0.0408 0.088 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0317 0.11 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 7.37e-01 -0.027 0.0803 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0695 0.0858 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0199 0.0695 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 4.29e-01 0.0641 0.0809 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 281391 sc-eQTL 2.93e-01 -0.102 0.0969 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 7.30e-01 0.0359 0.104 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 2.67e-01 0.0889 0.08 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 8.31e-01 0.0172 0.0804 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 4.53e-01 0.0317 0.0421 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 7.60e-01 0.0261 0.0852 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 281391 sc-eQTL 8.55e-01 0.0179 0.0976 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 9.74e-01 0.00372 0.113 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 5.48e-02 0.158 0.0818 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 3.39e-01 0.082 0.0856 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 2.98e-01 0.089 0.0853 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 9.32e-01 0.0075 0.0879 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 281391 sc-eQTL 5.94e-01 0.0495 0.0927 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 6.90e-01 0.0428 0.107 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0258 0.1 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 6.13e-01 0.0528 0.104 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0636 0.0803 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 4.47e-01 0.0666 0.0873 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 281391 sc-eQTL 5.52e-01 0.0591 0.0994 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0505 0.114 0.223 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 8.55e-02 -0.148 0.0859 0.223 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 8.69e-01 0.0153 0.0931 0.223 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 9.81e-01 0.00164 0.0685 0.223 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 9.50e-01 0.00508 0.0806 0.223 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 6.61e-01 0.0462 0.105 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 8.55e-01 0.0175 0.0955 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0524 0.089 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 8.30e-01 0.0176 0.0821 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 1.52e-02 0.212 0.0867 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0511 0.0997 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 1.07e-01 -0.138 0.0853 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 1.03e-01 0.132 0.0809 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0768 0.0548 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 3.63e-01 0.0668 0.0733 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 3.60e-02 0.24 0.114 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00152 0.108 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 9.48e-01 0.00698 0.106 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0291 0.0873 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 2.53e-01 0.107 0.093 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 6.81e-02 -0.184 0.101 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 4.05e-01 0.0727 0.0872 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 8.41e-01 0.0181 0.0901 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0212 0.058 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 4.44e-02 0.152 0.0751 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 4.55e-01 -0.093 0.124 0.185 PB L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 2.78e-01 -0.147 0.135 0.185 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 3.15e-01 0.121 0.12 0.185 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 5.26e-01 0.0535 0.0842 0.185 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 229046 sc-eQTL 1.16e-01 0.193 0.122 0.185 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0434 0.0926 0.185 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 249682 sc-eQTL 5.10e-01 0.0821 0.124 0.185 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 1.03e-01 -0.18 0.11 0.224 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 6.51e-02 0.16 0.0861 0.224 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0524 0.102 0.224 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 5.43e-01 0.0401 0.0659 0.224 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 3.40e-02 0.166 0.0777 0.224 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0851 0.103 0.222 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 5.88e-01 0.0465 0.0856 0.222 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 9.38e-01 0.00688 0.0887 0.222 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0553 0.0755 0.222 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 4.67e-01 0.0614 0.0842 0.222 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 281391 sc-eQTL 3.18e-01 0.0963 0.0962 0.222 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 3.37e-01 0.0964 0.1 0.222 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 2.77e-01 0.104 0.0952 0.222 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 828473 sc-eQTL 7.87e-01 0.0253 0.0934 0.222 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 7.98e-01 0.0276 0.108 0.222 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0437 0.088 0.222 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 5.97e-02 0.175 0.0925 0.222 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 828496 sc-eQTL 1.02e-01 -0.168 0.102 0.222 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0189 0.0793 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 6.02e-01 0.0342 0.0655 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 828473 sc-eQTL 6.06e-02 0.179 0.0947 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 2.80e-01 0.092 0.085 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 2.01e-01 0.0917 0.0714 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 1.25e-01 0.115 0.0746 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 828496 sc-eQTL 1.11e-01 -0.159 0.0994 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0368 0.0907 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 9.72e-01 0.00269 0.0766 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 828473 sc-eQTL 2.40e-01 -0.114 0.0968 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 6.15e-01 0.0462 0.0919 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0433 0.0799 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 6.40e-01 0.0371 0.0791 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 828496 sc-eQTL 7.20e-02 -0.191 0.106 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 8.36e-01 0.0254 0.123 0.218 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 3.15e-01 0.117 0.116 0.218 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 1.79e-01 -0.162 0.12 0.218 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0983 0.0903 0.218 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 1.60e-01 0.147 0.104 0.218 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 5.97e-01 0.0565 0.107 0.218 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00564 0.0878 0.218 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 828473 sc-eQTL 6.17e-01 0.0484 0.0967 0.218 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 6.09e-01 0.0512 0.0999 0.218 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 9.60e-01 0.00462 0.0912 0.218 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 8.81e-01 0.0133 0.0886 0.218 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 828496 sc-eQTL 8.08e-02 -0.189 0.108 0.218 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 7.08e-01 0.0367 0.0979 0.229 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 7.88e-01 0.0241 0.0895 0.229 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 828473 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0538 0.094 0.229 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0728 0.0707 0.229 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 4.67e-01 0.0621 0.0853 0.229 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 9.56e-01 0.00396 0.0725 0.229 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 828496 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0929 0.104 0.229 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 7.90e-01 -0.03 0.112 0.229 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0665 0.0951 0.229 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 828473 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0213 0.0871 0.229 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0223 0.0882 0.229 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 2.47e-01 0.111 0.096 0.229 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 8.72e-01 0.0184 0.113 0.229 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 828496 sc-eQTL 1.64e-01 -0.122 0.0869 0.229 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 9.89e-01 0.00143 0.099 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 1.90e-01 0.115 0.0877 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0171 0.0913 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0167 0.0633 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 229046 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0902 0.105 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00789 0.0889 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 249682 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00289 0.103 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00838 0.0909 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 3.46e-01 0.0801 0.0848 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0941 0.0722 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000309 0.0508 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 229046 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0801 0.106 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00264 0.0773 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 249682 sc-eQTL 8.78e-02 -0.155 0.0902 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 7.13e-01 -0.027 0.0733 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 7.55e-01 0.0205 0.0658 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 828473 sc-eQTL 2.31e-01 0.115 0.0959 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 1.90e-01 0.103 0.0788 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 6.00e-01 0.0369 0.0703 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 1.95e-01 0.0998 0.0768 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 828496 sc-eQTL 2.53e-02 -0.23 0.102 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 8.51e-01 0.0186 0.0984 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 6.81e-01 0.0345 0.084 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 828473 sc-eQTL 6.93e-01 0.037 0.0934 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0164 0.0582 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000135 0.0851 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0142 0.0733 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 828496 sc-eQTL 2.18e-02 -0.236 0.102 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 747535 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0436 0.0956 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 385964 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0413 0.0816 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 532783 sc-eQTL 2.73e-01 0.0873 0.0795 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 492299 sc-eQTL 2.20e-01 -0.063 0.0513 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 146396 sc-eQTL 1.79e-01 0.0999 0.074 0.218 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135597 REPS1 532783 pQTL 0.0132 -0.0715 0.0288 0.00156 0.0 0.223

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina