logo

Genes within 1Mb (chr6:139518823:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00452 0.0825 0.226 B L1
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 4.34e-01 0.0628 0.0801 0.226 B L1
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 6.52e-01 -0.032 0.0709 0.226 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 8.59e-01 -0.00741 0.0416 0.226 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 226825 sc-eQTL 2.86e-01 -0.109 0.102 0.226 B L1
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 8.83e-01 -0.00948 0.0643 0.226 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 247461 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0597 0.0714 0.226 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 5.12e-01 0.0593 0.0903 0.226 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 8.14e-01 0.0177 0.0753 0.226 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0474 0.0591 0.226 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 2.79e-01 -0.047 0.0433 0.226 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 7.50e-01 0.0236 0.0742 0.226 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 279170 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0021 0.0731 0.226 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 4.02e-01 0.0826 0.0983 0.226 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 5.76e-01 0.0395 0.0704 0.226 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0295 0.0663 0.226 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0289 0.0377 0.226 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 8.63e-01 0.0124 0.0717 0.226 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 279170 sc-eQTL 9.67e-01 0.00362 0.0871 0.226 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00714 0.0997 0.216 DC L1
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 5.37e-01 0.0508 0.082 0.216 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 826252 sc-eQTL 5.74e-01 0.0514 0.0913 0.216 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0461 0.0808 0.216 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 3.34e-01 0.0765 0.079 0.216 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 4.41e-01 0.0725 0.0938 0.216 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 826275 sc-eQTL 1.58e-01 -0.135 0.0951 0.216 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0059 0.0724 0.226 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 7.89e-01 0.0177 0.066 0.226 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 826252 sc-eQTL 7.08e-01 0.0355 0.0946 0.226 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 4.23e-01 0.0444 0.0553 0.226 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 9.98e-01 0.00016 0.0721 0.226 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 7.40e-01 0.0253 0.0762 0.226 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 826275 sc-eQTL 2.73e-02 -0.216 0.0972 0.226 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0496 0.0903 0.223 NK L1
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0658 0.078 0.223 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 2.05e-01 0.0942 0.0741 0.223 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0703 0.0541 0.223 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 2.93e-01 0.0759 0.072 0.223 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0347 0.105 0.226 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 5.98e-01 -0.04 0.0757 0.226 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0411 0.0814 0.226 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0655 0.0532 0.226 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 7.86e-02 0.11 0.062 0.226 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 6.27e-01 0.0548 0.113 0.219 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 2.30e-01 0.129 0.107 0.219 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0817 0.112 0.219 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 7.11e-01 0.0378 0.102 0.219 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 226825 sc-eQTL 2.74e-01 0.0953 0.0868 0.219 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0527 0.11 0.219 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 247461 sc-eQTL 4.87e-02 -0.215 0.108 0.219 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0107 0.101 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 5.77e-01 0.0486 0.0872 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 7.73e-01 0.0272 0.0941 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0207 0.0801 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 226825 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00403 0.0981 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 9.21e-01 0.00891 0.0903 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 247461 sc-eQTL 8.19e-01 0.0225 0.0978 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 6.85e-01 0.0415 0.102 0.228 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000628 0.0884 0.228 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 8.87e-01 0.0137 0.0958 0.228 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 6.54e-01 0.034 0.0757 0.228 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 226825 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0883 0.0965 0.228 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 5.42e-01 0.0542 0.0888 0.228 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 247461 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0724 0.109 0.228 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 8.55e-01 0.0176 0.0958 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 7.04e-01 0.0318 0.0835 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 2.11e-01 -0.0967 0.077 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00374 0.0541 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 226825 sc-eQTL 1.23e-01 -0.156 0.101 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 6.35e-01 -0.035 0.0736 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 247461 sc-eQTL 5.19e-02 -0.187 0.0958 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0631 0.0943 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 9.67e-02 0.147 0.0883 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 5.82e-01 0.0467 0.0847 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 3.52e-01 0.0581 0.0623 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 226825 sc-eQTL 1.53e-01 0.141 0.0983 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 8.25e-01 0.0223 0.101 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 247461 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0697 0.0924 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0588 0.0977 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0821 0.0985 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 9.91e-01 0.00113 0.0958 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0284 0.0873 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0342 0.0877 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 279170 sc-eQTL 2.34e-01 -0.108 0.0902 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 2.90e-01 0.101 0.0949 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 5.26e-01 0.0469 0.0739 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0541 0.0655 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 3.44e-02 -0.093 0.0437 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0302 0.0749 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 279170 sc-eQTL 9.18e-01 0.00777 0.0758 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 7.66e-01 0.0274 0.0919 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 6.21e-01 0.0364 0.0735 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 2.02e-01 -0.089 0.0695 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0704 0.0534 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 8.52e-01 0.0149 0.0797 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 279170 sc-eQTL 6.64e-01 0.0375 0.0861 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0111 0.105 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 1.82e-01 -0.108 0.081 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 1.21e-01 -0.137 0.0881 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0864 0.0629 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 8.04e-02 0.145 0.0824 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 279170 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0045 0.0868 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0187 0.109 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0381 0.0795 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0527 0.0851 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 8.05e-01 -0.017 0.0689 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 3.78e-01 0.0708 0.0801 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 279170 sc-eQTL 1.02e-01 -0.157 0.0956 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 3.24e-01 0.101 0.102 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 7.41e-01 0.0262 0.0792 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 5.71e-01 0.045 0.0794 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 4.94e-01 0.0285 0.0416 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 8.09e-01 0.0204 0.0842 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 279170 sc-eQTL 7.41e-01 0.0319 0.0964 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 6.05e-01 0.0581 0.112 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 1.49e-01 0.118 0.0816 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 2.49e-01 0.0982 0.085 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 4.51e-01 0.0641 0.0849 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 9.93e-01 0.000761 0.0873 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 279170 sc-eQTL 6.12e-01 0.0468 0.0921 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 4.66e-01 0.077 0.105 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0514 0.0988 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 7.98e-01 0.0264 0.103 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0647 0.0791 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 3.06e-01 0.0883 0.0859 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 279170 sc-eQTL 6.58e-01 0.0434 0.098 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0316 0.113 0.227 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 7.34e-02 -0.153 0.0849 0.227 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 4.18e-01 0.0746 0.092 0.227 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0448 0.0677 0.227 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00097 0.0797 0.227 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 6.17e-01 0.0523 0.104 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00934 0.0946 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0517 0.0882 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 5.60e-01 0.0475 0.0813 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 2.32e-02 0.197 0.0861 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0838 0.0978 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 6.80e-02 -0.153 0.0836 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 2.76e-02 0.175 0.079 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 1.42e-01 -0.0793 0.0538 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 6.76e-01 0.0302 0.0721 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 3.69e-02 0.236 0.112 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0269 0.106 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0268 0.105 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0624 0.086 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 3.60e-01 0.0843 0.0918 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 7.71e-02 -0.176 0.0989 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 8.64e-01 0.0147 0.0858 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 7.58e-01 0.0273 0.0886 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 5.87e-01 -0.031 0.057 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 1.29e-01 0.113 0.0741 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 3.97e-01 -0.106 0.125 0.185 PB L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 3.25e-01 -0.134 0.136 0.185 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 6.01e-01 0.0636 0.121 0.185 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 6.45e-01 0.0393 0.0849 0.185 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 226825 sc-eQTL 1.58e-01 0.175 0.123 0.185 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0546 0.0933 0.185 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 247461 sc-eQTL 4.95e-01 0.0856 0.125 0.185 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 7.20e-02 -0.194 0.107 0.228 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 1.21e-01 0.132 0.0846 0.228 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 2.27e-01 -0.121 0.0998 0.228 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 4.65e-01 0.0472 0.0645 0.228 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 6.77e-02 0.14 0.0763 0.228 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0611 0.102 0.226 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 8.62e-01 0.0148 0.0846 0.226 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 6.67e-01 0.0377 0.0876 0.226 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0603 0.0745 0.226 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 5.22e-01 0.0533 0.0832 0.226 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 279170 sc-eQTL 3.44e-01 0.0901 0.0951 0.226 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 2.69e-01 0.111 0.1 0.22 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 1.98e-01 0.123 0.0951 0.22 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 826252 sc-eQTL 5.91e-01 0.0502 0.0934 0.22 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 9.71e-01 0.0039 0.108 0.22 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0154 0.0881 0.22 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 2.29e-02 0.211 0.0921 0.22 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 826275 sc-eQTL 5.23e-02 -0.199 0.102 0.22 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0251 0.0793 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 5.83e-01 0.036 0.0655 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 826252 sc-eQTL 3.45e-02 0.201 0.0945 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 4.30e-01 0.0673 0.0851 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 2.72e-01 0.0788 0.0715 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 1.50e-01 0.108 0.0746 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 826275 sc-eQTL 1.02e-01 -0.163 0.0993 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 5.87e-01 -0.049 0.09 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 6.67e-01 0.0328 0.076 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 826252 sc-eQTL 1.85e-01 -0.128 0.096 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 5.60e-01 0.0532 0.0912 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0438 0.0793 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 6.87e-01 0.0316 0.0785 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 826275 sc-eQTL 5.89e-02 -0.199 0.105 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0212 0.122 0.221 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 4.73e-01 0.0834 0.116 0.221 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 1.38e-01 -0.178 0.119 0.221 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0554 0.0904 0.221 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 1.04e-01 0.169 0.103 0.221 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 6.45e-01 0.0487 0.106 0.22 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0143 0.0869 0.22 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 826252 sc-eQTL 6.51e-01 0.0434 0.0957 0.22 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 9.04e-01 0.012 0.099 0.22 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 8.41e-01 0.0182 0.0903 0.22 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 9.17e-01 0.00916 0.0877 0.22 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 826275 sc-eQTL 4.54e-02 -0.214 0.106 0.22 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 6.27e-01 0.0467 0.0962 0.231 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 6.75e-01 0.0369 0.0879 0.231 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 826252 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0703 0.0923 0.231 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0411 0.0696 0.231 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 4.03e-01 0.0702 0.0838 0.231 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0218 0.0712 0.231 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 826275 sc-eQTL 1.55e-01 -0.146 0.102 0.231 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 3.63e-01 -0.104 0.114 0.223 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0591 0.0966 0.223 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 826252 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00882 0.0884 0.223 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 9.18e-01 0.00926 0.0895 0.223 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 5.31e-01 0.0614 0.0977 0.223 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 9.61e-01 0.00568 0.115 0.223 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 826275 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0782 0.0886 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 9.92e-01 -0.001 0.0977 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 1.93e-01 0.113 0.0866 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 7.42e-01 0.0297 0.0901 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000292 0.0625 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 226825 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0888 0.103 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 9.53e-01 0.00518 0.0878 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 247461 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0245 0.102 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000566 0.0893 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 4.17e-01 0.0677 0.0833 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 3.76e-01 -0.063 0.071 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 9.81e-01 0.00119 0.0499 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 226825 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0526 0.104 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00914 0.0759 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 247461 sc-eQTL 8.48e-02 -0.153 0.0886 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0407 0.0729 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 6.09e-01 0.0335 0.0654 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 826252 sc-eQTL 1.85e-01 0.127 0.0953 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 2.92e-01 0.083 0.0785 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 6.93e-01 0.0277 0.07 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 2.14e-01 0.0952 0.0764 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 826275 sc-eQTL 3.09e-02 -0.221 0.102 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00455 0.0973 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 7.74e-01 0.0239 0.083 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 826252 sc-eQTL 9.12e-01 0.0102 0.0924 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 8.08e-01 -0.014 0.0575 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 7.61e-01 0.0257 0.0842 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0417 0.0725 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 826275 sc-eQTL 1.22e-02 -0.254 0.101 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 745314 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0617 0.0939 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 383743 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0779 0.08 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 530562 sc-eQTL 1.52e-01 0.112 0.078 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 490078 sc-eQTL 1.85e-01 -0.067 0.0504 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 144175 sc-eQTL 4.16e-01 0.0595 0.073 0.222 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135597 REPS1 530562 pQTL 0.0217 -0.0665 0.029 0.00123 0.0 0.223

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000164442 \N 144175 5.68e-06 4.89e-06 1.58e-06 2.63e-06 8.57e-07 1.53e-06 5.67e-06 8.04e-07 4.76e-06 3.05e-06 4.29e-06 3.54e-06 9.82e-06 2.17e-06 1.58e-06 3.13e-06 2.02e-06 3.85e-06 1.5e-06 2.01e-06 2.66e-06 4.86e-06 4.68e-06 1.43e-06 6.16e-06 1.35e-06 2.41e-06 1.78e-06 4.21e-06 3.41e-06 2.01e-06 5.42e-07 7.34e-07 5.41e-06 2.23e-06 1.18e-06 1.21e-06 1.45e-06 1.61e-06 8.62e-07 4.44e-07 5.58e-06 2.25e-06 1.85e-07 2.74e-07 1.68e-06 7.24e-07 3.18e-07 6.03e-07