logo

Genes within 1Mb (chr6:139508423:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0124 0.08 0.252 B L1
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 2.44e-01 0.0905 0.0775 0.252 B L1
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 6.11e-01 -0.035 0.0687 0.252 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 8.39e-01 0.00821 0.0404 0.252 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 216425 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0877 0.0987 0.252 B L1
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0198 0.0623 0.252 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 237061 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0829 0.069 0.252 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 3.61e-01 0.0803 0.0876 0.252 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 5.56e-01 0.0431 0.0731 0.252 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0385 0.0575 0.252 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00567 0.0422 0.252 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 8.36e-01 0.015 0.0721 0.252 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 268770 sc-eQTL 3.10e-01 0.0722 0.0709 0.252 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 3.24e-01 0.0941 0.0952 0.252 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 5.08e-01 0.0453 0.0682 0.252 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0457 0.0642 0.252 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00291 0.0366 0.252 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 9.68e-01 0.00275 0.0695 0.252 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 268770 sc-eQTL 7.55e-01 0.0263 0.0844 0.252 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 8.25e-01 0.0213 0.0962 0.241 DC L1
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 8.25e-01 0.0176 0.0793 0.241 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 815852 sc-eQTL 5.72e-01 0.0499 0.0882 0.241 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0549 0.078 0.241 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 2.65e-01 0.0852 0.0762 0.241 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 5.62e-01 0.0526 0.0906 0.241 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 815875 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0903 0.092 0.241 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 3.86e-01 0.0605 0.0696 0.252 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 4.18e-01 0.0515 0.0635 0.252 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 815852 sc-eQTL 3.21e-01 0.0904 0.0909 0.252 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 7.00e-01 0.0206 0.0534 0.252 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 5.65e-01 0.04 0.0694 0.252 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 4.42e-01 0.0565 0.0734 0.252 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 815875 sc-eQTL 6.23e-02 -0.176 0.094 0.252 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0232 0.0871 0.249 NK L1
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0381 0.0752 0.249 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 5.59e-01 0.0419 0.0716 0.249 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0439 0.0522 0.249 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 5.68e-01 0.0397 0.0695 0.249 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0547 0.102 0.252 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0175 0.074 0.252 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0127 0.0796 0.252 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0645 0.0519 0.252 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 4.00e-01 0.0514 0.0609 0.252 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 6.40e-01 0.0508 0.108 0.245 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 2.83e-01 0.111 0.103 0.245 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0804 0.108 0.245 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 8.22e-01 0.022 0.0979 0.245 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 216425 sc-eQTL 7.28e-01 0.0292 0.0838 0.245 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0247 0.105 0.245 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 237061 sc-eQTL 9.72e-02 -0.174 0.105 0.245 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0569 0.0975 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 3.83e-01 0.0738 0.0844 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 6.70e-01 0.0389 0.0911 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 7.48e-01 0.025 0.0776 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 216425 sc-eQTL 8.88e-01 0.0134 0.0951 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 9.80e-01 -0.0022 0.0875 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 237061 sc-eQTL 9.79e-01 -0.0025 0.0947 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 5.84e-01 0.0546 0.0995 0.254 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 4.35e-01 0.0672 0.086 0.254 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 9.98e-01 0.000262 0.0933 0.254 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 5.24e-01 0.0471 0.0737 0.254 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 216425 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0195 0.0941 0.254 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 5.80e-01 0.048 0.0865 0.254 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 237061 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00538 0.106 0.254 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 9.04e-01 0.0112 0.093 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 3.55e-01 0.075 0.0809 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 8.91e-02 -0.127 0.0745 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 8.52e-01 0.00981 0.0525 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 216425 sc-eQTL 2.02e-01 -0.125 0.0979 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0396 0.0714 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 237061 sc-eQTL 4.86e-02 -0.184 0.0929 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0826 0.0911 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 1.27e-01 0.131 0.0855 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 4.20e-01 0.0662 0.0819 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 5.86e-01 0.0329 0.0603 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 216425 sc-eQTL 8.85e-02 0.163 0.0949 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 8.78e-01 0.015 0.0975 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 237061 sc-eQTL 1.18e-01 -0.14 0.089 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 8.41e-01 -0.019 0.0945 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0349 0.0954 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 8.04e-01 0.0231 0.0926 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 7.14e-01 0.031 0.0844 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0826 0.0846 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 268770 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0981 0.0872 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 2.07e-01 0.116 0.092 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 4.50e-01 0.0543 0.0717 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 4.42e-01 -0.049 0.0636 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 1.58e-01 -0.0605 0.0427 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 7.21e-01 -0.026 0.0728 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 268770 sc-eQTL 2.37e-01 0.0871 0.0734 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 6.39e-01 0.042 0.0893 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 5.11e-01 0.047 0.0714 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0482 0.0677 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0358 0.052 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 9.17e-01 0.0081 0.0775 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 268770 sc-eQTL 6.65e-01 0.0363 0.0837 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 4.29e-01 0.0803 0.101 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0534 0.0788 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 2.21e-01 -0.105 0.0856 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0297 0.0612 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 2.26e-01 0.0973 0.0801 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 268770 sc-eQTL 7.07e-01 0.0317 0.0841 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 6.39e-01 0.0496 0.106 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 7.92e-01 0.0203 0.0769 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0277 0.0823 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 9.83e-01 0.00143 0.0666 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 3.55e-01 0.0717 0.0774 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 268770 sc-eQTL 9.64e-02 -0.154 0.0924 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 2.31e-01 0.119 0.0993 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 4.39e-01 0.0595 0.0768 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 8.35e-01 0.0161 0.0771 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 2.21e-01 0.0495 0.0403 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 8.14e-01 0.0193 0.0818 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 268770 sc-eQTL 3.05e-01 0.096 0.0934 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 8.42e-01 0.0217 0.109 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 1.29e-01 0.121 0.0791 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 2.86e-01 0.0883 0.0824 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 4.43e-01 0.0632 0.0823 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 6.36e-01 0.0401 0.0846 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 268770 sc-eQTL 3.60e-01 0.0818 0.0892 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 3.32e-01 0.0991 0.102 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0725 0.0956 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 7.79e-01 -0.028 0.0996 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 9.49e-01 0.00489 0.0768 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 2.02e-01 0.106 0.0831 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 268770 sc-eQTL 7.80e-01 0.0265 0.0949 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0453 0.109 0.253 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 8.77e-02 -0.142 0.0825 0.253 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 4.20e-01 0.0722 0.0894 0.253 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 7.38e-01 -0.022 0.0658 0.253 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0677 0.0774 0.253 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 6.18e-01 0.0502 0.1 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 6.80e-01 0.0376 0.0911 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00185 0.085 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 3.21e-01 0.0777 0.0781 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 5.67e-02 0.159 0.0832 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0308 0.0944 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 1.88e-01 -0.107 0.0809 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 1.97e-01 0.0992 0.0767 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0607 0.0519 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 9.55e-01 0.00393 0.0695 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 6.88e-02 0.197 0.108 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0872 0.101 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0365 0.1 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00849 0.0824 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 3.01e-01 0.0909 0.0877 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 1.79e-01 -0.129 0.0956 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 5.54e-01 0.049 0.0826 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0265 0.0853 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0126 0.055 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 3.00e-01 0.0745 0.0716 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0953 0.125 0.204 PB L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 2.33e-01 -0.162 0.136 0.204 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 5.88e-01 0.0657 0.121 0.204 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 7.31e-01 0.0292 0.0848 0.204 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 216425 sc-eQTL 4.28e-01 0.0982 0.123 0.204 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0294 0.0932 0.204 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 237061 sc-eQTL 3.56e-01 0.115 0.125 0.204 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 1.81e-01 -0.14 0.105 0.252 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 9.99e-02 0.136 0.0821 0.252 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 1.50e-01 -0.14 0.0969 0.252 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 8.81e-01 0.0094 0.0628 0.252 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 1.76e-01 0.101 0.0745 0.252 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0484 0.0983 0.252 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 5.17e-01 0.053 0.0816 0.252 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 6.89e-01 0.0339 0.0845 0.252 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 8.78e-01 0.0111 0.072 0.252 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 9.50e-01 0.005 0.0804 0.252 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 268770 sc-eQTL 1.57e-01 0.13 0.0915 0.252 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 8.83e-02 0.166 0.0967 0.246 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 5.57e-01 0.0545 0.0926 0.246 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 815852 sc-eQTL 4.05e-01 0.0755 0.0905 0.246 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 7.19e-01 0.0376 0.104 0.246 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0145 0.0855 0.246 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 2.48e-02 0.202 0.0894 0.246 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 815875 sc-eQTL 1.42e-01 -0.147 0.0995 0.246 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 7.69e-01 0.0225 0.0764 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 2.90e-01 0.0668 0.063 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 815852 sc-eQTL 2.18e-02 0.21 0.0909 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 7.42e-01 0.0271 0.0821 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 1.19e-01 0.107 0.0687 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 5.35e-02 0.139 0.0716 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 815875 sc-eQTL 8.46e-02 -0.166 0.0957 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0134 0.0869 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 3.00e-01 0.0761 0.0733 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 815852 sc-eQTL 6.21e-01 -0.046 0.093 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 3.90e-01 0.0757 0.0879 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 8.48e-01 0.0147 0.0766 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 4.32e-01 0.0596 0.0757 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 815875 sc-eQTL 1.48e-01 -0.147 0.101 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0488 0.117 0.248 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 4.51e-01 0.0835 0.111 0.248 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 3.01e-01 -0.119 0.114 0.248 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0546 0.0862 0.248 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 6.88e-02 0.18 0.0983 0.248 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 5.48e-01 0.0613 0.102 0.247 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0377 0.0837 0.247 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 815852 sc-eQTL 4.53e-01 0.0693 0.0921 0.247 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0375 0.0953 0.247 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 5.03e-01 0.0583 0.0869 0.247 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 6.50e-01 0.0384 0.0844 0.247 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 815875 sc-eQTL 1.99e-01 -0.133 0.103 0.247 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 5.10e-01 0.0615 0.0933 0.251 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 4.30e-01 0.0674 0.0852 0.251 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 815852 sc-eQTL 3.97e-01 -0.076 0.0895 0.251 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0415 0.0675 0.251 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 5.24e-01 0.0519 0.0814 0.251 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0344 0.0691 0.251 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 815875 sc-eQTL 3.99e-01 -0.084 0.0994 0.251 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 2.52e-01 -0.127 0.111 0.249 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0676 0.0941 0.249 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 815852 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0382 0.0861 0.249 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0234 0.0873 0.249 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 4.86e-01 0.0665 0.0952 0.249 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0275 0.112 0.249 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 815875 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0758 0.0864 0.249 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0538 0.0947 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 7.27e-02 0.151 0.0837 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 5.62e-01 0.0508 0.0874 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 6.39e-01 0.0285 0.0606 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 216425 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0813 0.1 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 9.82e-01 0.00195 0.0851 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 237061 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0212 0.099 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0238 0.0866 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 2.43e-01 0.0945 0.0807 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0755 0.0689 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 8.95e-01 0.00641 0.0484 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 216425 sc-eQTL 9.84e-01 0.00205 0.101 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0136 0.0737 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 237061 sc-eQTL 3.81e-02 -0.179 0.0857 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 6.99e-01 0.0272 0.0704 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 2.47e-01 0.073 0.0629 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 815852 sc-eQTL 7.02e-02 0.167 0.0916 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 3.36e-01 0.073 0.0758 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 2.97e-01 0.0704 0.0674 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 8.80e-02 0.126 0.0734 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 815875 sc-eQTL 4.34e-02 -0.199 0.0981 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 6.91e-01 0.0375 0.0944 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 7.26e-01 0.0283 0.0806 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 815852 sc-eQTL 7.73e-01 0.0259 0.0896 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0434 0.0557 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 6.70e-01 0.0348 0.0817 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 7.23e-01 -0.025 0.0704 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 815875 sc-eQTL 1.10e-01 -0.158 0.0985 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 734914 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0289 0.0906 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 373343 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0464 0.0772 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 520162 sc-eQTL 6.50e-01 0.0344 0.0755 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 479678 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0408 0.0487 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 133775 sc-eQTL 7.17e-01 0.0256 0.0704 0.248 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135597 REPS1 520162 pQTL 0.0427 -0.057 0.0281 0.0 0.0 0.249

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina