logo

Genes within 1Mb (chr6:139460882:G:GGCA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 2.40e-02 0.303 0.133 0.079 B L1
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 2.54e-01 -0.15 0.131 0.079 B L1
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 8.05e-01 0.0287 0.116 0.079 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0055 0.0681 0.079 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 168884 sc-eQTL 5.35e-01 0.104 0.167 0.079 B L1
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 5.32e-01 0.0658 0.105 0.079 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 189520 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0571 0.117 0.079 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00858 0.149 0.079 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0924 0.124 0.079 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 5.58e-01 0.0573 0.0978 0.079 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 5.22e-01 0.046 0.0717 0.079 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 4.56e-01 0.0913 0.122 0.079 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 221229 sc-eQTL 6.25e-01 -0.059 0.121 0.079 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 7.68e-02 -0.285 0.16 0.079 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0886 0.116 0.079 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 4.94e-01 0.0745 0.109 0.079 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 3.25e-01 0.061 0.0618 0.079 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 6.07e-01 0.0605 0.118 0.079 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 221229 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0367 0.143 0.079 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 5.32e-03 -0.451 0.16 0.081 DC L1
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 7.56e-02 -0.238 0.134 0.081 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 768311 sc-eQTL 5.43e-01 0.0912 0.15 0.081 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 2.25e-01 -0.161 0.132 0.081 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 2.87e-01 -0.138 0.129 0.081 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0135 0.154 0.081 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 768334 sc-eQTL 7.46e-02 0.278 0.155 0.081 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 2.09e-01 -0.147 0.117 0.079 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 6.92e-01 0.0425 0.107 0.079 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 768311 sc-eQTL 3.14e-01 -0.155 0.153 0.079 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 5.90e-01 0.0484 0.0898 0.079 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 4.00e-01 0.0985 0.117 0.079 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 4.82e-01 -0.087 0.124 0.079 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 768334 sc-eQTL 6.01e-01 0.0835 0.159 0.079 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0444 0.146 0.079 NK L1
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0668 0.126 0.079 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 7.52e-01 -0.038 0.12 0.079 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 1.63e-01 0.122 0.0872 0.079 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0157 0.117 0.079 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 3.54e-01 -0.162 0.174 0.079 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 3.90e-01 -0.108 0.126 0.079 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 7.52e-01 0.043 0.136 0.079 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 9.61e-01 0.0043 0.0889 0.079 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 3.87e-01 -0.09 0.104 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 2.72e-01 0.21 0.191 0.079 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0988 0.182 0.079 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 2.25e-01 0.232 0.19 0.079 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 5.30e-01 0.108 0.172 0.079 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 168884 sc-eQTL 7.82e-02 0.26 0.147 0.079 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0449 0.186 0.079 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 189520 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0982 0.186 0.079 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0488 0.168 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 9.78e-02 -0.241 0.145 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 1.65e-01 0.218 0.157 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 3.34e-01 0.129 0.134 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 168884 sc-eQTL 3.92e-01 -0.14 0.164 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 8.26e-01 0.0331 0.151 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 189520 sc-eQTL 3.01e-01 0.169 0.163 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 8.11e-01 0.0411 0.172 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 1.89e-01 -0.195 0.148 0.08 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0239 0.161 0.08 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 2.33e-01 0.152 0.127 0.08 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 168884 sc-eQTL 1.90e-01 0.213 0.162 0.08 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 2.58e-01 -0.169 0.149 0.08 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 189520 sc-eQTL 1.59e-01 -0.258 0.183 0.08 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 3.31e-02 0.34 0.159 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 1.43e-01 -0.205 0.139 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0205 0.129 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 2.47e-01 -0.105 0.0902 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 168884 sc-eQTL 5.08e-01 -0.112 0.169 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 2.87e-01 0.131 0.123 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 189520 sc-eQTL 5.27e-01 0.103 0.162 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0745 0.156 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 5.79e-01 0.0817 0.147 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0177 0.14 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0578 0.103 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 168884 sc-eQTL 3.30e-01 0.159 0.163 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 3.61e-01 0.152 0.166 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 189520 sc-eQTL 1.72e-01 -0.209 0.152 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 2.76e-01 -0.186 0.17 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0498 0.172 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 2.58e-01 0.189 0.167 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0907 0.152 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 4.52e-01 0.115 0.153 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 221229 sc-eQTL 4.81e-01 -0.111 0.158 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 9.18e-01 0.0161 0.157 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 3.61e-01 -0.111 0.122 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 6.79e-01 0.0447 0.108 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 4.60e-01 0.0537 0.0727 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 5.12e-01 0.0811 0.123 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 221229 sc-eQTL 9.68e-01 0.00495 0.125 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00701 0.153 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0899 0.123 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00348 0.116 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 2.98e-01 0.0932 0.0893 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 7.10e-01 0.0496 0.133 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 221229 sc-eQTL 2.78e-01 -0.156 0.143 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 1.62e-01 -0.243 0.173 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0607 0.135 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 3.58e-01 -0.136 0.147 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 9.27e-01 0.00961 0.105 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 7.39e-01 0.0461 0.138 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 221229 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00583 0.145 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 7.85e-02 -0.309 0.175 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0608 0.128 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0197 0.137 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 6.15e-01 0.056 0.111 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 4.44e-01 0.0992 0.129 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 221229 sc-eQTL 3.41e-01 0.148 0.155 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 6.26e-01 -0.082 0.168 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 2.03e-01 -0.165 0.129 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 9.37e-01 0.0103 0.13 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0279 0.0683 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0098 0.138 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 221229 sc-eQTL 1.69e-01 -0.217 0.157 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 7.93e-01 0.0523 0.199 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 5.84e-01 0.0798 0.145 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 6.28e-02 0.281 0.15 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 1.78e-01 0.203 0.15 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 8.62e-01 0.027 0.155 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 221229 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0223 0.164 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 1.27e-01 -0.266 0.174 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 3.51e-01 0.153 0.163 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 3.51e-01 -0.159 0.17 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 4.94e-01 0.09 0.131 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 3.86e-01 0.124 0.142 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 221229 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0493 0.162 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 6.79e-01 0.0785 0.19 0.08 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 7.80e-01 0.0404 0.144 0.08 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 4.56e-01 0.116 0.155 0.08 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 9.59e-01 0.00595 0.114 0.08 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0449 0.135 0.08 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 6.63e-01 0.0777 0.178 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 9.08e-01 0.0186 0.161 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 4.49e-01 -0.114 0.15 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 1.77e-02 0.327 0.137 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 6.41e-01 0.0693 0.148 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0266 0.157 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 2.56e-01 0.153 0.135 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 2.90e-01 -0.135 0.128 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 3.22e-01 0.0858 0.0864 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0781 0.115 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0605 0.184 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0863 0.172 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0921 0.169 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 6.89e-01 0.0558 0.139 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 1.68e-01 0.205 0.148 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0262 0.163 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 4.96e-02 -0.275 0.139 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 3.62e-01 0.132 0.145 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 5.08e-01 0.0619 0.0934 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 7.75e-01 0.0349 0.122 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 7.95e-02 0.323 0.182 0.085 PB L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 8.19e-01 0.0463 0.201 0.085 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 3.91e-01 0.154 0.178 0.085 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 3.46e-01 -0.118 0.125 0.085 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 168884 sc-eQTL 4.00e-01 0.154 0.182 0.085 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 6.70e-01 0.0587 0.138 0.085 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 189520 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0501 0.185 0.085 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 8.66e-01 -0.03 0.178 0.08 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00768 0.14 0.08 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0841 0.165 0.08 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0718 0.106 0.08 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 2.09e-01 -0.159 0.126 0.08 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0657 0.17 0.079 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 4.15e-01 -0.115 0.141 0.079 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0202 0.146 0.079 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 4.90e-01 0.0858 0.124 0.079 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 3.43e-01 -0.131 0.138 0.079 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 221229 sc-eQTL 3.84e-01 0.138 0.158 0.079 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 4.02e-03 -0.484 0.166 0.076 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0748 0.161 0.076 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 768311 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0614 0.158 0.076 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0397 0.182 0.076 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 2.92e-01 -0.157 0.149 0.076 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0333 0.158 0.076 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 768334 sc-eQTL 1.09e-01 0.279 0.173 0.076 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0713 0.13 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 9.13e-01 0.0117 0.108 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 768311 sc-eQTL 2.67e-01 -0.174 0.156 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0955 0.14 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 6.33e-01 0.0562 0.118 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0495 0.123 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 768334 sc-eQTL 3.75e-01 0.146 0.164 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 4.24e-01 -0.119 0.148 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0582 0.125 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 768311 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0716 0.159 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 1.78e-01 0.202 0.15 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 2.07e-01 0.165 0.13 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0774 0.129 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 768334 sc-eQTL 2.95e-01 -0.182 0.174 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 2.99e-01 -0.211 0.202 0.076 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 9.41e-01 0.0143 0.193 0.076 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 9.90e-01 0.0024 0.199 0.076 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 2.68e-01 0.166 0.149 0.076 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 3.89e-01 -0.149 0.172 0.076 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 4.56e-01 -0.131 0.175 0.08 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 8.68e-01 -0.024 0.144 0.08 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 768311 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0738 0.159 0.08 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 3.51e-01 0.153 0.164 0.08 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 9.58e-01 0.00784 0.15 0.08 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 3.80e-01 -0.128 0.145 0.08 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 768334 sc-eQTL 3.27e-01 -0.175 0.178 0.08 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 9.65e-01 0.00708 0.161 0.081 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 8.96e-01 0.0193 0.147 0.081 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 768311 sc-eQTL 7.27e-01 0.0541 0.154 0.081 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0956 0.116 0.081 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 5.53e-01 0.0832 0.14 0.081 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 2.66e-01 -0.132 0.119 0.081 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 768334 sc-eQTL 6.20e-01 0.085 0.171 0.081 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 9.86e-01 0.00347 0.195 0.071 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 9.38e-01 0.0129 0.165 0.071 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 768311 sc-eQTL 5.53e-01 0.0897 0.151 0.071 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 3.81e-01 -0.134 0.153 0.071 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 2.62e-01 0.187 0.166 0.071 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 9.98e-01 0.000395 0.197 0.071 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 768334 sc-eQTL 8.33e-01 0.032 0.152 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 5.11e-01 0.106 0.161 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 1.16e-01 -0.225 0.142 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 2.09e-01 0.186 0.148 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 3.71e-01 0.0919 0.103 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 168884 sc-eQTL 2.71e-01 0.187 0.17 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0312 0.144 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 189520 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00595 0.168 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 1.70e-01 0.205 0.149 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0715 0.14 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0567 0.119 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0953 0.0833 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 168884 sc-eQTL 7.67e-01 0.0519 0.175 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 2.24e-01 0.154 0.127 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 189520 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0538 0.149 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 3.31e-01 -0.115 0.118 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00419 0.106 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 768311 sc-eQTL 3.80e-01 -0.136 0.155 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 5.42e-01 0.078 0.128 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 3.52e-01 0.106 0.114 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0864 0.124 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 768334 sc-eQTL 8.33e-01 0.0351 0.167 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0744 0.16 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 6.15e-01 -0.069 0.137 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 768311 sc-eQTL 5.39e-01 0.0937 0.152 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 9.47e-01 0.00633 0.0949 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 7.47e-01 0.0449 0.139 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 2.67e-01 -0.133 0.119 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 768334 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0483 0.168 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0847 0.152 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 325802 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0398 0.129 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 472621 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0423 0.126 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 432137 sc-eQTL 1.95e-01 0.106 0.0812 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 86234 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0233 0.118 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 eQTL 0.0104 -0.077 0.03 0.0 0.0 0.0682

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000024862 CCDC28A 687373 1.43e-06 5.67e-07 2.42e-07 2.45e-07 9.16e-08 1.71e-07 4.14e-07 5.33e-08 2.38e-07 4.74e-08 2.84e-07 1.15e-07 3.77e-07 9.18e-08 5.69e-08 1.17e-07 4.12e-08 2.87e-07 7.11e-08 4.04e-08 1.22e-07 2.96e-07 3.77e-07 4.26e-08 3.41e-07 1.14e-07 1.25e-07 9.61e-08 1.6e-07 1.39e-07 1.71e-07 3.19e-08 3.61e-08 8.89e-08 4.04e-08 3.49e-08 4.79e-08 9.62e-08 7.63e-08 3.64e-08 3.44e-08 5.87e-07 4.89e-08 1.43e-08 1.09e-07 6.68e-09 1.22e-07 4.7e-09 4.61e-08