logo

Genes within 1Mb (chr6:139454741:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 9.58e-03 -0.328 0.126 0.079 B L1
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 3.26e-01 0.122 0.124 0.079 B L1
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0714 0.11 0.079 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 3.92e-01 0.0552 0.0643 0.079 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 162743 sc-eQTL 2.40e-01 0.186 0.157 0.079 B L1
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 6.44e-02 -0.183 0.0986 0.079 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 183379 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0352 0.111 0.079 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 9.97e-02 -0.234 0.142 0.079 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 2.23e-01 0.145 0.118 0.079 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0236 0.0934 0.079 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 2.25e-01 0.083 0.0683 0.079 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00397 0.117 0.079 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 215088 sc-eQTL 3.63e-01 0.105 0.115 0.079 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 1.19e-01 -0.244 0.156 0.079 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 3.86e-02 0.231 0.111 0.079 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0792 0.106 0.079 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 3.13e-01 0.0606 0.06 0.079 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 1.00e+00 -4.04e-05 0.114 0.079 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 215088 sc-eQTL 2.08e-01 0.174 0.138 0.079 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0435 0.16 0.081 DC L1
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 3.68e-01 0.118 0.131 0.081 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 762170 sc-eQTL 6.73e-01 0.0619 0.146 0.081 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 1.32e-01 0.195 0.129 0.081 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 3.25e-01 -0.125 0.126 0.081 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 6.70e-01 0.0641 0.15 0.081 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 762193 sc-eQTL 6.47e-01 0.0701 0.153 0.081 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0782 0.115 0.079 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 6.15e-01 0.0528 0.105 0.079 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 762170 sc-eQTL 2.59e-02 -0.333 0.148 0.079 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 1.99e-02 0.204 0.0868 0.079 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 1.13e-01 -0.181 0.114 0.079 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0514 0.121 0.079 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 762193 sc-eQTL 7.25e-01 -0.055 0.156 0.079 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 1.09e-01 -0.221 0.137 0.079 NK L1
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 1.01e-01 0.195 0.119 0.079 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0531 0.114 0.079 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0773 0.0827 0.079 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 9.73e-01 0.00378 0.11 0.079 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 9.25e-01 0.0156 0.166 0.079 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 5.94e-01 0.064 0.12 0.079 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 7.45e-01 0.0421 0.129 0.079 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 3.02e-02 -0.183 0.0836 0.079 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 1.30e-01 0.15 0.0985 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 6.56e-01 0.0801 0.18 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 4.69e-01 0.124 0.171 0.082 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0311 0.179 0.082 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 6.16e-01 0.0813 0.162 0.082 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 162743 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0558 0.139 0.082 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 9.12e-01 0.0194 0.175 0.082 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 183379 sc-eQTL 5.58e-01 -0.102 0.174 0.082 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 2.87e-03 -0.475 0.157 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000627 0.139 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0342 0.15 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0572 0.128 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 162743 sc-eQTL 7.22e-01 0.0557 0.157 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 2.63e-01 -0.161 0.144 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 183379 sc-eQTL 6.59e-02 -0.286 0.155 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 8.69e-02 -0.28 0.163 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 2.99e-01 -0.147 0.141 0.08 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 4.13e-01 -0.126 0.153 0.08 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 2.82e-01 0.131 0.121 0.08 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 162743 sc-eQTL 1.55e-01 0.22 0.154 0.08 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 1.02e-01 -0.233 0.141 0.08 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 183379 sc-eQTL 5.85e-01 0.0955 0.175 0.08 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 1.75e-01 -0.208 0.153 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 2.35e-01 0.159 0.133 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 2.78e-01 -0.134 0.123 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 1.80e-01 0.116 0.0862 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 162743 sc-eQTL 3.44e-01 0.153 0.162 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 1.58e-01 -0.166 0.117 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 183379 sc-eQTL 7.92e-01 0.0409 0.155 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0414 0.15 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 3.39e-01 0.135 0.141 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 3.44e-01 -0.127 0.134 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 5.52e-01 0.0589 0.0989 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 162743 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0221 0.157 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 7.77e-01 0.0453 0.16 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 183379 sc-eQTL 9.77e-01 0.00428 0.147 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 4.01e-01 -0.132 0.157 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 9.37e-01 0.0125 0.159 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0902 0.154 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0538 0.141 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 5.35e-01 0.0878 0.141 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 215088 sc-eQTL 2.28e-01 0.175 0.145 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 3.00e-01 -0.156 0.15 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 4.05e-02 0.239 0.116 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 7.53e-01 0.0327 0.104 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 3.08e-02 0.15 0.0691 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 7.74e-01 0.0342 0.119 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 215088 sc-eQTL 1.90e-02 0.28 0.118 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 1.10e-02 -0.373 0.145 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 3.43e-01 0.112 0.118 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0695 0.112 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 9.96e-01 0.000399 0.086 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 6.41e-01 0.0596 0.128 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 215088 sc-eQTL 4.93e-01 0.0948 0.138 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 3.21e-01 -0.168 0.169 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 4.20e-01 0.106 0.131 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 4.45e-02 -0.287 0.142 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0987 0.102 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 2.08e-01 0.169 0.134 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 215088 sc-eQTL 4.41e-01 -0.108 0.14 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 1.47e-01 -0.246 0.169 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 6.52e-02 0.228 0.123 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 8.82e-01 0.0198 0.133 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0443 0.107 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 8.00e-01 0.0317 0.125 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 215088 sc-eQTL 6.98e-01 0.0582 0.15 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 6.90e-01 -0.066 0.165 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 3.29e-01 0.124 0.127 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 7.33e-02 -0.228 0.127 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 6.54e-01 -0.03 0.067 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0791 0.135 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 215088 sc-eQTL 8.72e-01 0.025 0.155 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 5.36e-01 0.115 0.186 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0594 0.136 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0251 0.142 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 1.27e-01 0.216 0.14 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 2.68e-01 0.161 0.145 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 215088 sc-eQTL 3.00e-01 -0.159 0.153 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0832 0.164 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 1.84e-01 0.204 0.153 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0718 0.16 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 2.28e-01 -0.148 0.123 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 4.89e-01 0.0927 0.134 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 215088 sc-eQTL 9.15e-02 0.256 0.151 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0157 0.185 0.08 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 2.40e-01 0.165 0.14 0.08 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 1.66e-01 0.209 0.15 0.08 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 7.40e-02 -0.198 0.11 0.08 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 1.13e-01 0.207 0.13 0.08 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0122 0.171 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0108 0.155 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 9.30e-03 -0.374 0.142 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 8.73e-01 0.0214 0.133 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0192 0.143 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 1.84e-01 -0.199 0.149 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 1.13e-01 0.204 0.128 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 1.45e-01 0.178 0.122 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0424 0.0827 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0907 0.11 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 1.70e-01 -0.238 0.173 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 1.62e-01 0.227 0.161 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 4.28e-01 -0.127 0.16 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 5.08e-01 0.0871 0.132 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0824 0.141 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 3.44e-01 -0.147 0.155 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 8.56e-02 0.23 0.133 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0391 0.138 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 4.73e-01 -0.064 0.0891 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 3.19e-01 0.116 0.116 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 2.10e-01 -0.216 0.172 0.085 PB L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 1.51e-01 -0.269 0.186 0.085 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 3.74e-01 0.149 0.167 0.085 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0249 0.117 0.085 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 162743 sc-eQTL 1.72e-01 -0.233 0.169 0.085 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 7.09e-01 0.0481 0.129 0.085 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 183379 sc-eQTL 5.08e-01 0.114 0.172 0.085 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 5.56e-01 0.102 0.173 0.078 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0511 0.136 0.078 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0599 0.16 0.078 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0538 0.103 0.078 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 2.43e-01 -0.144 0.123 0.078 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 1.13e-01 0.256 0.161 0.079 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 7.29e-01 0.0466 0.134 0.079 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 7.41e-01 -0.046 0.139 0.079 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 2.22e-01 -0.145 0.118 0.079 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 2.58e-01 -0.149 0.132 0.079 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 215088 sc-eQTL 1.71e-01 -0.207 0.151 0.079 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 3.02e-01 -0.17 0.164 0.078 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 4.24e-01 0.125 0.156 0.078 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 762170 sc-eQTL 1.10e-01 0.244 0.152 0.078 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 1.21e-01 0.272 0.175 0.078 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 3.08e-01 -0.147 0.144 0.078 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 5.51e-01 0.0912 0.153 0.078 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 762193 sc-eQTL 2.14e-01 0.21 0.168 0.078 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0611 0.126 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 1.65e-01 0.145 0.104 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 762170 sc-eQTL 7.42e-02 -0.271 0.151 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 2.38e-01 0.16 0.135 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 3.40e-02 -0.241 0.113 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0238 0.119 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 762193 sc-eQTL 7.19e-01 0.0574 0.159 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0124 0.145 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0338 0.123 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 762170 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0958 0.155 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 6.21e-01 0.0727 0.147 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0819 0.128 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 9.80e-01 0.00318 0.127 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 762193 sc-eQTL 2.25e-01 -0.206 0.17 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 1.38e-02 -0.518 0.208 0.073 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 1.14e-01 -0.317 0.2 0.073 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 4.65e-01 -0.152 0.208 0.073 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0807 0.157 0.073 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 4.35e-01 0.141 0.18 0.073 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 4.77e-01 -0.118 0.166 0.08 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0489 0.136 0.08 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 762170 sc-eQTL 6.52e-01 0.0678 0.15 0.08 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 3.49e-01 0.145 0.155 0.08 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 1.89e-01 -0.186 0.141 0.08 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 4.00e-01 -0.116 0.137 0.08 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 762193 sc-eQTL 5.24e-01 0.107 0.168 0.08 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 7.57e-01 0.0518 0.167 0.079 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 2.62e-01 -0.171 0.152 0.079 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 762170 sc-eQTL 2.60e-01 -0.181 0.16 0.079 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 7.60e-02 0.214 0.12 0.079 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 2.86e-01 -0.156 0.145 0.079 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 3.50e-01 0.116 0.124 0.079 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 762193 sc-eQTL 2.16e-01 0.221 0.178 0.079 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0215 0.187 0.076 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 8.70e-01 0.026 0.159 0.076 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 762170 sc-eQTL 4.59e-02 -0.288 0.143 0.076 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 3.61e-01 0.134 0.146 0.076 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 3.29e-01 0.157 0.16 0.076 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 1.65e-01 -0.262 0.187 0.076 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 762193 sc-eQTL 9.54e-02 -0.242 0.144 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 1.12e-02 -0.391 0.153 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0215 0.138 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 2.84e-01 -0.154 0.143 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 7.19e-01 0.0357 0.0993 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 162743 sc-eQTL 1.01e-02 0.42 0.162 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 2.00e-01 -0.179 0.139 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 183379 sc-eQTL 4.61e-01 -0.12 0.162 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 3.42e-01 -0.135 0.142 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 1.93e-01 0.173 0.133 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 1.79e-01 -0.153 0.113 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 3.14e-01 0.0802 0.0795 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 162743 sc-eQTL 4.58e-01 0.124 0.167 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 1.43e-01 -0.177 0.121 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 183379 sc-eQTL 9.68e-01 0.00576 0.142 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0804 0.116 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 3.71e-01 0.0935 0.104 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 762170 sc-eQTL 3.82e-02 -0.315 0.151 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 2.55e-01 0.143 0.125 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 1.06e-01 -0.18 0.111 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0344 0.122 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 762193 sc-eQTL 5.35e-01 -0.102 0.164 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0323 0.157 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0133 0.134 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 762170 sc-eQTL 2.35e-01 -0.177 0.149 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 1.52e-02 0.224 0.0916 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 4.19e-01 -0.11 0.136 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 6.94e-01 0.0462 0.117 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 762193 sc-eQTL 4.54e-01 0.124 0.165 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 sc-eQTL 1.06e-01 -0.232 0.143 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 319661 sc-eQTL 6.19e-02 0.229 0.122 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 466480 sc-eQTL 7.24e-01 0.0425 0.12 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 425996 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0157 0.0775 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 80093 sc-eQTL 9.86e-01 0.00192 0.112 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 681232 eQTL 0.00899 -0.0771 0.0295 0.0 0.0 0.077
ENSG00000135597 REPS1 466480 eQTL 0.0186 0.0736 0.0312 0.00131 0.0 0.077

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112406 \N 319661 1.19e-06 9.47e-07 2.29e-07 7.82e-07 3.96e-07 4.79e-07 1.6e-06 3.99e-07 1.5e-06 6.23e-07 1.87e-06 7.84e-07 2.12e-06 3.03e-07 5.69e-07 9.51e-07 9.2e-07 7.83e-07 8.2e-07 6.19e-07 8.11e-07 1.72e-06 8.92e-07 5.66e-07 2.24e-06 7.4e-07 9.62e-07 7.24e-07 1.46e-06 1.27e-06 6.68e-07 2.24e-07 2.61e-07 5.73e-07 5.61e-07 4.91e-07 7.24e-07 2.04e-07 5.03e-07 2.8e-07 2.71e-07 1.51e-06 5.07e-08 3.38e-08 3.24e-07 1.27e-07 2.18e-07 5.35e-08 1.93e-07
ENSG00000164442 \N 80093 6.16e-06 6.81e-06 1.29e-06 4.01e-06 2.44e-06 2.81e-06 9.53e-06 1.93e-06 6.09e-06 4.19e-06 8.95e-06 4.15e-06 1.13e-05 3.18e-06 1.73e-06 5.78e-06 3.71e-06 5.21e-06 2.65e-06 2.85e-06 4.57e-06 7.64e-06 6.55e-06 3.24e-06 1.02e-05 3.49e-06 4.46e-06 2.7e-06 7.59e-06 7.73e-06 3.94e-06 1.09e-06 1.19e-06 3.53e-06 2.82e-06 2.65e-06 1.84e-06 1.84e-06 2.16e-06 1.01e-06 1.44e-06 8.21e-06 1.14e-06 2.8e-07 9.29e-07 1.63e-06 1.38e-06 6.68e-07 4.52e-07