logo

Genes within 1Mb (chr6:139448948:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0355 0.0808 0.286 B L1
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 2.72e-01 0.0864 0.0784 0.286 B L1
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 5.00e-01 0.0468 0.0694 0.286 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 8.04e-01 0.0102 0.0408 0.286 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 156950 sc-eQTL 3.73e-01 0.089 0.0998 0.286 B L1
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0481 0.0629 0.286 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 177586 sc-eQTL 1.79e-01 0.0941 0.0698 0.286 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00597 0.0881 0.286 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 7.78e-02 0.129 0.0729 0.286 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 1.57e-01 0.0816 0.0575 0.286 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 2.82e-01 0.0456 0.0423 0.286 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 1.67e-01 -0.0998 0.072 0.286 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 209295 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00353 0.0713 0.286 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 7.98e-01 0.0248 0.0967 0.286 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 4.59e-02 0.138 0.0686 0.286 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 9.95e-01 0.000401 0.0651 0.286 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000401 0.0371 0.286 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 1.09e-01 -0.113 0.07 0.286 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 209295 sc-eQTL 9.82e-01 0.00197 0.0855 0.286 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 3.67e-01 0.0875 0.0967 0.288 DC L1
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 4.84e-01 0.0559 0.0797 0.288 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 756377 sc-eQTL 3.99e-01 -0.075 0.0887 0.288 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0859 0.0784 0.288 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0477 0.0769 0.288 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 8.96e-01 0.012 0.0913 0.288 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 756400 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0868 0.0927 0.288 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0299 0.0705 0.286 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 2.15e-02 0.147 0.0635 0.286 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 756377 sc-eQTL 8.67e-01 0.0155 0.0921 0.286 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 9.56e-01 0.00295 0.0539 0.286 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0437 0.0701 0.286 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0894 0.074 0.286 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 756400 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0263 0.0958 0.286 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 6.11e-01 0.0437 0.0858 0.288 NK L1
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 3.40e-01 0.0707 0.074 0.288 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0221 0.0706 0.288 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 1.73e-01 0.0702 0.0513 0.288 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0455 0.0685 0.288 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 2.41e-02 0.23 0.101 0.286 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 1.57e-01 0.105 0.0738 0.286 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0671 0.0797 0.286 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 2.98e-01 0.0544 0.0521 0.286 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 5.85e-02 -0.115 0.0607 0.286 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 1.08e-01 -0.187 0.116 0.273 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 5.91e-01 0.0596 0.111 0.273 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 6.09e-01 0.0595 0.116 0.273 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0862 0.105 0.273 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 156950 sc-eQTL 6.51e-01 0.0407 0.0899 0.273 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 8.45e-01 0.0222 0.113 0.273 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 177586 sc-eQTL 7.15e-01 0.0414 0.113 0.273 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 6.44e-01 0.046 0.0993 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 4.02e-02 0.176 0.0852 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 1.90e-01 0.122 0.0924 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0329 0.079 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 156950 sc-eQTL 3.06e-02 0.208 0.0957 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 1.19e-01 -0.138 0.0886 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 177586 sc-eQTL 7.02e-01 0.0369 0.0964 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 5.40e-01 0.0625 0.102 0.287 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 9.24e-01 0.0084 0.0881 0.287 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 5.87e-01 0.0518 0.0954 0.287 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0774 0.0753 0.287 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 156950 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0751 0.0962 0.287 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 1.81e-01 -0.118 0.0882 0.287 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 177586 sc-eQTL 4.26e-02 0.22 0.108 0.287 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 4.53e-01 -0.071 0.0945 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 2.54e-01 0.0941 0.0822 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00835 0.0763 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00651 0.0534 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 156950 sc-eQTL 9.18e-01 0.0103 0.0999 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 1.03e-01 -0.118 0.0723 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 177586 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0639 0.0953 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 7.15e-02 0.168 0.093 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 7.52e-01 0.0279 0.0882 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0424 0.0841 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 2.88e-01 0.0658 0.0618 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 156950 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0957 0.0979 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0277 0.1 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 177586 sc-eQTL 1.82e-01 0.123 0.0915 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0488 0.096 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 3.56e-02 0.203 0.0958 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 8.45e-01 0.0184 0.0941 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 4.42e-01 0.066 0.0856 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 7.32e-01 0.0296 0.0861 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 209295 sc-eQTL 2.08e-01 0.112 0.0885 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0125 0.0926 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 1.17e-01 0.112 0.0715 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 1.36e-01 0.0949 0.0635 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 2.12e-01 0.0536 0.0428 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0693 0.0728 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 209295 sc-eQTL 7.64e-01 0.0222 0.0738 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 3.16e-01 0.0906 0.0902 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 3.04e-01 0.0743 0.0722 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 5.18e-01 0.0443 0.0685 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 9.63e-01 0.00247 0.0528 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 5.56e-02 -0.15 0.0778 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 209295 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0824 0.0846 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 2.80e-01 0.112 0.104 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 2.94e-02 0.175 0.0799 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00396 0.088 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 1.41e-01 0.0923 0.0624 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 1.80e-01 -0.11 0.082 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 209295 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0181 0.0862 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 2.15e-02 0.239 0.103 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 9.05e-03 0.197 0.0749 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0294 0.0815 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0542 0.0658 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0898 0.0765 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 209295 sc-eQTL 5.12e-01 0.0604 0.092 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 2.44e-01 -0.117 0.1 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 1.20e-02 0.194 0.0765 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 6.56e-01 0.0347 0.0778 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 1.14e-01 0.0644 0.0406 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0987 0.0823 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 209295 sc-eQTL 2.29e-01 0.114 0.0942 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0456 0.112 0.294 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 2.05e-01 0.103 0.0814 0.294 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 9.00e-01 0.0107 0.085 0.294 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 1.39e-01 -0.125 0.0842 0.294 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 1.10e-01 -0.139 0.0864 0.294 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 209295 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0793 0.0917 0.294 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 4.35e-01 -0.081 0.104 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0764 0.097 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0735 0.101 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 3.26e-01 0.0766 0.0778 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0321 0.0847 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 209295 sc-eQTL 2.08e-01 -0.121 0.096 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 1.63e-01 0.154 0.11 0.281 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 5.30e-02 0.162 0.0832 0.281 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 2.23e-01 -0.11 0.0901 0.281 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 9.16e-01 0.00706 0.0665 0.281 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0976 0.078 0.281 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 9.59e-01 0.00517 0.101 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 4.36e-01 0.0712 0.0912 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0348 0.0851 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0838 0.0783 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0567 0.0841 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 4.55e-01 0.0701 0.0937 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 7.97e-01 0.0208 0.0807 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 7.64e-01 0.023 0.0765 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 2.28e-01 0.0624 0.0516 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0289 0.069 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 4.50e-01 0.0828 0.109 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 8.23e-02 0.177 0.102 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00349 0.101 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 4.70e-01 -0.06 0.083 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0892 0.0885 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0535 0.0955 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 3.68e-01 0.0741 0.0821 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 7.77e-01 -0.024 0.085 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 2.31e-01 0.0655 0.0545 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0439 0.0714 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 1.09e-01 0.191 0.118 0.281 PB L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 2.62e-02 0.287 0.128 0.281 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 9.88e-03 -0.295 0.112 0.281 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0608 0.0809 0.281 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 156950 sc-eQTL 7.31e-01 0.0408 0.118 0.281 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 1.86e-01 0.118 0.0885 0.281 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 177586 sc-eQTL 5.21e-01 0.0769 0.119 0.281 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 8.18e-01 0.0241 0.105 0.289 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 1.23e-01 -0.127 0.082 0.289 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0785 0.097 0.289 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 1.33e-02 0.154 0.0617 0.289 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 9.54e-01 0.00434 0.0746 0.289 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0165 0.0992 0.286 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 7.07e-02 0.149 0.0818 0.286 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 8.43e-01 0.017 0.0853 0.286 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 1.56e-01 0.103 0.0723 0.286 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00108 0.0811 0.286 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 209295 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000394 0.0928 0.286 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 2.05e-01 0.122 0.0962 0.298 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0117 0.0919 0.298 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 756377 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000562 0.0899 0.298 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 1.13e-01 -0.164 0.103 0.298 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 5.51e-01 0.0506 0.0847 0.298 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0888 0.0897 0.298 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 756400 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0659 0.0991 0.298 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 3.17e-01 0.0765 0.0762 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 7.19e-02 0.113 0.0626 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 756377 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0205 0.0919 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0398 0.082 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 2.24e-01 -0.084 0.0688 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 6.88e-01 -0.029 0.0721 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 756400 sc-eQTL 2.16e-01 -0.119 0.0959 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 9.60e-02 -0.146 0.0873 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 1.17e-02 0.186 0.0732 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 756377 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0144 0.0942 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000502 0.0891 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 3.18e-01 0.0774 0.0773 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 5.93e-01 -0.041 0.0766 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 756400 sc-eQTL 8.54e-01 -0.019 0.103 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 1.76e-01 0.158 0.116 0.288 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 4.05e-01 0.0922 0.11 0.288 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 9.74e-01 0.00371 0.115 0.288 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 1.10e-02 0.217 0.0843 0.288 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 2.49e-01 -0.115 0.0989 0.288 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00244 0.103 0.291 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 2.02e-01 0.107 0.0839 0.291 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 756377 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0489 0.0928 0.291 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 2.82e-01 0.103 0.0957 0.291 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00508 0.0875 0.291 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 5.70e-01 0.0484 0.0849 0.291 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 756400 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0376 0.104 0.291 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 1.18e-02 -0.236 0.0928 0.29 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 1.75e-01 0.117 0.0858 0.29 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 756377 sc-eQTL 4.32e-01 0.0713 0.0905 0.29 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 3.98e-01 0.0578 0.0682 0.29 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 9.82e-01 0.00189 0.0823 0.29 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00233 0.0698 0.29 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 756400 sc-eQTL 7.61e-01 0.0307 0.101 0.29 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 7.79e-01 0.0307 0.109 0.291 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 1.17e-01 0.145 0.0917 0.291 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 756377 sc-eQTL 8.82e-02 -0.144 0.0837 0.291 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 8.70e-01 0.014 0.0856 0.291 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 9.57e-01 0.00506 0.0935 0.291 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 3.85e-01 0.0956 0.11 0.291 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 756400 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0351 0.0848 0.291 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0383 0.0958 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 2.48e-01 0.0985 0.085 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 2.00e-01 0.113 0.0881 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0534 0.0611 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 156950 sc-eQTL 2.59e-01 0.114 0.101 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 2.12e-01 -0.107 0.0857 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 177586 sc-eQTL 3.20e-01 0.0995 0.0998 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 6.20e-01 0.0439 0.0884 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 2.94e-01 0.0867 0.0824 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0249 0.0705 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 6.49e-01 0.0225 0.0494 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 156950 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000652 0.104 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0858 0.075 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 177586 sc-eQTL 5.49e-01 0.053 0.0883 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0123 0.0704 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 3.40e-02 0.133 0.0625 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 756377 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0232 0.0923 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0389 0.0759 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0259 0.0675 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0385 0.0739 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 756400 sc-eQTL 3.03e-01 -0.102 0.0988 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 2.53e-01 -0.11 0.0963 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 2.36e-01 0.0977 0.0822 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 756377 sc-eQTL 2.21e-01 0.112 0.0914 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 3.82e-01 0.0499 0.057 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0645 0.0834 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0149 0.072 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 756400 sc-eQTL 8.08e-01 0.0247 0.101 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 675439 sc-eQTL 8.05e-01 0.0222 0.0902 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 313868 sc-eQTL 5.20e-01 0.0495 0.0768 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 460687 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00359 0.0751 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 420203 sc-eQTL 2.17e-01 0.0598 0.0483 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 74300 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0403 0.07 0.289 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000218565 AL592429.1 110930 eQTL 0.000283 0.083 0.0228 0.0103 0.0125 0.303
ENSG00000279968 GVQW2 675296 eQTL 0.0488 -0.0923 0.0468 0.0 0.0 0.303

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000225177 \N 756400 2.8e-07 1.35e-07 5.72e-08 1.9e-07 1.01e-07 9.48e-08 1.67e-07 5.66e-08 1.47e-07 6.08e-08 1.63e-07 1.05e-07 1.69e-07 7.37e-08 6.12e-08 7.74e-08 4.24e-08 1.51e-07 6.32e-08 4.3e-08 1.25e-07 1.25e-07 1.58e-07 2.87e-08 1.65e-07 1.22e-07 1.13e-07 9.92e-08 1.24e-07 9.88e-08 1.08e-07 2.93e-08 3.96e-08 8.89e-08 4.92e-08 2.99e-08 5.3e-08 8.72e-08 6.71e-08 3.92e-08 5.03e-08 1.46e-07 5.22e-08 1.27e-08 3.83e-08 1.89e-08 1.11e-07 1.89e-09 5e-08