logo

Genes within 1Mb (chr6:139447032:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 2.35e-01 0.127 0.106 0.132 B L1
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 2.11e-01 -0.13 0.103 0.132 B L1
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 6.91e-01 0.0365 0.0918 0.132 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 6.68e-01 0.0232 0.0539 0.132 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 155034 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00541 0.132 0.132 B L1
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 4.39e-01 0.0644 0.0831 0.132 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 175670 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0579 0.0925 0.132 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 9.27e-01 0.0109 0.118 0.132 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0545 0.0985 0.132 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 6.34e-01 0.037 0.0775 0.132 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0238 0.0568 0.132 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 4.45e-02 0.194 0.0961 0.132 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 207379 sc-eQTL 9.83e-01 0.002 0.0957 0.132 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 8.84e-02 -0.218 0.128 0.132 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0928 0.0917 0.132 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 4.92e-01 0.0594 0.0864 0.132 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00271 0.0492 0.132 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 1.58e-01 0.132 0.093 0.132 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 207379 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0528 0.113 0.132 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 6.32e-02 -0.236 0.127 0.135 DC L1
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 9.85e-02 -0.173 0.104 0.135 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 754461 sc-eQTL 6.14e-01 0.0591 0.117 0.135 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 2.16e-01 -0.128 0.103 0.135 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 1.96e-01 -0.131 0.101 0.135 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00138 0.12 0.135 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 754484 sc-eQTL 3.48e-02 0.257 0.121 0.135 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0261 0.0933 0.132 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 3.88e-01 0.0735 0.085 0.132 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 754461 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0554 0.122 0.132 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 6.01e-01 0.0373 0.0714 0.132 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 7.47e-01 0.03 0.0929 0.132 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 8.58e-01 0.0176 0.0983 0.132 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 754484 sc-eQTL 1.91e-02 0.296 0.125 0.132 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0175 0.115 0.133 NK L1
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0215 0.0998 0.133 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0272 0.095 0.133 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 6.77e-01 0.0289 0.0693 0.133 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000522 0.0922 0.133 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 1.47e-01 -0.199 0.136 0.132 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0308 0.0992 0.132 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 2.55e-01 0.121 0.106 0.132 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0658 0.0697 0.132 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0661 0.0817 0.132 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 1.28e-01 0.23 0.15 0.13 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 7.29e-02 -0.258 0.143 0.13 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 2.37e-01 0.178 0.15 0.13 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 3.58e-01 0.126 0.136 0.13 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 155034 sc-eQTL 1.60e-01 0.164 0.116 0.13 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 9.33e-01 0.0125 0.147 0.13 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 175670 sc-eQTL 6.50e-01 0.0668 0.147 0.13 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 5.05e-01 -0.088 0.132 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 2.48e-01 -0.132 0.114 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 6.40e-02 0.227 0.122 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 3.55e-02 0.22 0.104 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 155034 sc-eQTL 3.48e-01 -0.121 0.128 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 5.36e-01 0.0733 0.118 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 175670 sc-eQTL 8.68e-01 0.0213 0.128 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0958 0.134 0.134 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 9.89e-01 0.00165 0.116 0.134 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0267 0.125 0.134 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 8.02e-01 0.0249 0.0992 0.134 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 155034 sc-eQTL 8.83e-02 0.215 0.126 0.134 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 3.11e-01 -0.118 0.116 0.134 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 175670 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0685 0.143 0.134 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 2.11e-02 0.291 0.125 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 1.04e-01 -0.179 0.11 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0523 0.102 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0404 0.0715 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 155034 sc-eQTL 2.88e-01 -0.142 0.134 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 1.14e-01 0.154 0.0969 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 175670 sc-eQTL 4.56e-01 0.0953 0.128 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 2.84e-02 -0.272 0.123 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 9.24e-01 0.0113 0.117 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 9.70e-01 -0.0042 0.112 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0238 0.0824 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 155034 sc-eQTL 3.62e-01 0.119 0.13 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 1.22e-01 0.205 0.132 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 175670 sc-eQTL 6.33e-02 -0.226 0.121 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 9.32e-01 0.0113 0.133 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 5.73e-01 0.0756 0.134 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 1.42e-01 0.191 0.13 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 9.86e-01 0.00216 0.119 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 2.77e-01 0.13 0.119 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 207379 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0549 0.123 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0243 0.124 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0344 0.0964 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0356 0.0855 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0247 0.0576 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 5.40e-02 0.188 0.097 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 207379 sc-eQTL 4.41e-01 0.0762 0.0988 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0709 0.121 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0643 0.0969 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 1.31e-01 0.139 0.0915 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 3.46e-01 0.0666 0.0706 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 9.01e-02 0.178 0.104 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 207379 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0596 0.114 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0481 0.138 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 7.25e-01 -0.038 0.108 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0318 0.117 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 7.41e-01 0.0277 0.0836 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 2.95e-01 0.115 0.109 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 207379 sc-eQTL 9.35e-01 0.00931 0.115 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 1.84e-01 -0.187 0.14 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0756 0.103 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 7.90e-01 0.0293 0.11 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0471 0.0888 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 1.88e-01 0.136 0.103 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 207379 sc-eQTL 2.29e-01 0.149 0.124 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 3.64e-01 -0.121 0.133 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0622 0.103 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 6.56e-01 -0.046 0.103 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0539 0.054 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 1.91e-01 0.143 0.109 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 207379 sc-eQTL 3.36e-01 -0.12 0.125 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00564 0.157 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 6.33e-01 0.0549 0.115 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 3.22e-02 0.255 0.118 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0347 0.119 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 6.53e-01 0.0551 0.122 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 207379 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0413 0.129 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 2.41e-01 -0.162 0.138 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 5.77e-01 0.0723 0.129 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 4.12e-01 -0.111 0.135 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 8.82e-01 0.0155 0.104 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 3.75e-01 0.1 0.113 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 207379 sc-eQTL 1.84e-01 -0.17 0.128 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0635 0.15 0.134 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 6.83e-01 0.0466 0.114 0.134 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 3.04e-01 0.126 0.122 0.134 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 1.34e-01 -0.135 0.0897 0.134 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0846 0.106 0.134 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 4.75e-01 0.0996 0.139 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 3.51e-01 0.118 0.126 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0756 0.118 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 4.07e-01 0.0899 0.108 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 3.61e-01 -0.106 0.116 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 8.24e-01 0.0275 0.124 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 7.68e-02 0.188 0.106 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 1.65e-01 -0.14 0.1 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 9.74e-01 0.00221 0.0683 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0171 0.0911 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 4.06e-01 -0.118 0.142 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 2.44e-01 -0.154 0.132 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 8.89e-01 0.0183 0.131 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 6.59e-01 0.0475 0.108 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 1.58e-01 0.162 0.114 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 8.51e-01 -0.024 0.128 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 8.62e-02 -0.189 0.109 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 4.47e-01 0.0865 0.114 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 6.42e-01 0.0341 0.0732 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0106 0.0956 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 6.12e-01 0.0783 0.154 0.137 PB L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 6.01e-01 0.0879 0.168 0.137 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 9.78e-01 0.00416 0.149 0.137 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 1.03e-01 -0.17 0.103 0.137 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 155034 sc-eQTL 7.10e-01 0.0567 0.152 0.137 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 3.44e-01 0.109 0.114 0.137 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 175670 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0601 0.154 0.137 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0672 0.142 0.133 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 6.83e-02 0.203 0.111 0.133 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 1.45e-01 -0.192 0.131 0.133 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 1.02e-01 -0.139 0.0843 0.133 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0865 0.101 0.133 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0325 0.134 0.132 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0288 0.111 0.132 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 7.26e-01 0.0405 0.115 0.132 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 9.62e-01 0.00463 0.0982 0.132 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 2.62e-01 -0.123 0.109 0.132 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 207379 sc-eQTL 9.11e-01 0.0139 0.125 0.132 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 8.51e-02 -0.23 0.133 0.129 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0561 0.127 0.129 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 754461 sc-eQTL 7.30e-01 -0.043 0.124 0.129 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0746 0.143 0.129 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 2.77e-01 -0.127 0.117 0.129 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0616 0.124 0.129 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 754484 sc-eQTL 4.63e-02 0.273 0.136 0.129 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0148 0.102 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 4.98e-01 0.0571 0.0841 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 754461 sc-eQTL 3.31e-01 -0.119 0.122 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 2.96e-01 -0.114 0.109 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 9.32e-01 0.00791 0.092 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 3.97e-01 0.0816 0.0961 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 754484 sc-eQTL 3.86e-02 0.264 0.127 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 9.11e-01 -0.013 0.116 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 9.61e-01 0.0048 0.0981 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 754461 sc-eQTL 4.93e-01 0.0854 0.124 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 2.65e-01 0.131 0.117 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 2.47e-01 0.118 0.102 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 5.00e-01 0.0684 0.101 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 754484 sc-eQTL 6.21e-01 0.0673 0.136 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 1.80e-01 -0.221 0.164 0.13 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 7.46e-01 -0.051 0.157 0.13 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 6.05e-01 0.0841 0.162 0.13 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 7.72e-01 0.0355 0.122 0.13 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 7.08e-01 -0.053 0.141 0.13 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 1.19e-01 -0.209 0.134 0.136 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 8.61e-01 0.0194 0.11 0.136 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 754461 sc-eQTL 7.86e-01 0.033 0.122 0.136 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0418 0.126 0.136 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00159 0.115 0.136 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 6.35e-01 0.0528 0.111 0.136 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 754484 sc-eQTL 8.44e-01 0.0269 0.136 0.136 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 2.91e-01 -0.136 0.128 0.131 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 2.91e-01 0.124 0.117 0.131 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 754461 sc-eQTL 2.62e-01 0.139 0.123 0.131 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0205 0.0931 0.131 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 6.17e-01 0.0561 0.112 0.131 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0481 0.0951 0.131 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 754484 sc-eQTL 4.99e-01 0.0929 0.137 0.131 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 6.26e-01 0.0709 0.145 0.127 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0202 0.123 0.127 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 754461 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0302 0.112 0.127 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0329 0.114 0.127 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 9.83e-01 0.00269 0.125 0.127 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 7.92e-01 0.0387 0.146 0.127 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 754484 sc-eQTL 5.34e-01 0.0704 0.113 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 9.43e-01 0.00907 0.126 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 2.47e-01 -0.13 0.112 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 9.87e-02 0.192 0.116 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 1.57e-01 0.114 0.0802 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 155034 sc-eQTL 5.55e-01 0.0789 0.133 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 9.47e-01 0.00752 0.113 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 175670 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0089 0.132 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 6.27e-01 0.0573 0.118 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 2.63e-01 -0.123 0.11 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00415 0.094 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 4.57e-01 -0.049 0.0658 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 155034 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0444 0.138 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 5.59e-02 0.191 0.0994 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 175670 sc-eQTL 4.81e-01 -0.083 0.118 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 9.75e-01 0.00289 0.0933 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 6.73e-01 0.0354 0.0837 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 754461 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0436 0.122 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 8.81e-01 0.0151 0.101 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 5.13e-01 0.0586 0.0894 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 4.85e-01 0.0684 0.0979 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 754484 sc-eQTL 9.01e-02 0.222 0.13 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 6.22e-02 -0.234 0.125 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 8.04e-01 0.0267 0.107 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 754461 sc-eQTL 1.87e-01 0.158 0.119 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0214 0.0743 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 6.55e-01 0.0487 0.109 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0161 0.0937 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 754484 sc-eQTL 2.86e-01 0.141 0.132 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 673523 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0476 0.12 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 311952 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00159 0.102 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 458771 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0568 0.1 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 418287 sc-eQTL 5.11e-01 0.0425 0.0645 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 72384 sc-eQTL 9.96e-01 0.000478 0.0934 0.131 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000218565 AL592429.1 109014 eQTL 0.0212 -0.0791 0.0343 0.0 0.0 0.107

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000164440 \N 155034 3.64e-06 4.35e-06 6.9e-07 2e-06 8.3e-07 1.05e-06 2.41e-06 9.98e-07 2.88e-06 1.67e-06 4.13e-06 2.74e-06 6.49e-06 1.45e-06 1.1e-06 2.07e-06 1.72e-06 2.03e-06 1.32e-06 1.2e-06 1.4e-06 3.74e-06 3.25e-06 1.6e-06 4.92e-06 1.22e-06 1.79e-06 1.38e-06 3.74e-06 3.75e-06 1.95e-06 3.82e-07 7.53e-07 1.44e-06 1.94e-06 9.24e-07 9.55e-07 4.91e-07 1.23e-06 3.64e-07 1.96e-07 4.65e-06 5.88e-07 1.53e-07 2.96e-07 3.33e-07 8.3e-07 2.4e-07 1.76e-07