Genes within 1Mb (chr6:139385396:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0425 0.157 0.051 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 1.75e-01 -0.162 0.119 0.051 B L1
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 4.50e-01 0.115 0.153 0.051 B L1
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 1.97e-01 0.174 0.134 0.051 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 8.16e-03 -0.208 0.078 0.051 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 93398 sc-eQTL 4.01e-01 -0.163 0.194 0.051 B L1
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0949 0.122 0.051 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 114034 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0877 0.136 0.051 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 7.42e-02 -0.315 0.176 0.051 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 1.87e-01 -0.157 0.118 0.051 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 8.15e-01 0.0346 0.148 0.051 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 5.82e-01 0.0639 0.116 0.051 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0501 0.0851 0.051 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 1.04e-01 -0.236 0.145 0.051 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 145743 sc-eQTL 8.42e-01 0.0287 0.143 0.051 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0122 0.192 0.051 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 8.03e-02 -0.219 0.125 0.051 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00539 0.137 0.051 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 3.47e-01 0.122 0.129 0.051 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 9.84e-02 -0.121 0.0731 0.051 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 2.32e-01 -0.167 0.139 0.051 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 145743 sc-eQTL 5.80e-01 0.0941 0.17 0.051 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 6.67e-01 0.0799 0.186 0.052 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 7.37e-02 -0.233 0.13 0.052 DC L1
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 4.90e-01 -0.106 0.153 0.052 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 692825 sc-eQTL 9.88e-01 0.00248 0.17 0.052 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 3.88e-01 0.13 0.15 0.052 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 4.63e-01 -0.108 0.147 0.052 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 3.59e-01 0.161 0.175 0.052 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 692848 sc-eQTL 4.92e-01 0.122 0.178 0.052 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 3.82e-01 0.121 0.138 0.051 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 1.46e-01 -0.139 0.0954 0.051 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 1.83e-01 -0.168 0.126 0.051 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 692825 sc-eQTL 4.54e-01 -0.136 0.181 0.051 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0755 0.106 0.051 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 5.57e-01 0.0812 0.138 0.051 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 1.04e-01 0.237 0.145 0.051 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 692848 sc-eQTL 2.19e-01 0.232 0.188 0.051 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 1.18e-01 -0.264 0.168 0.052 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 3.85e-01 -0.129 0.148 0.052 NK L1
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 8.64e-01 0.025 0.146 0.052 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 5.37e-01 0.0857 0.139 0.052 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 5.74e-01 -0.057 0.101 0.052 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0316 0.135 0.052 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 4.66e-01 -0.146 0.2 0.051 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 1.90e-01 -0.169 0.129 0.051 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0843 0.145 0.051 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 5.37e-01 0.096 0.155 0.051 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0786 0.102 0.051 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0387 0.119 0.051 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 2.38e-02 -0.442 0.194 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0576 0.136 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 7.50e-01 0.0544 0.17 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 5.36e-01 -0.114 0.183 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0553 0.156 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 93398 sc-eQTL 6.78e-01 0.0797 0.191 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 5.20e-01 0.113 0.176 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 114034 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0615 0.191 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 7.47e-01 0.0607 0.188 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 3.80e-02 -0.273 0.131 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 4.98e-01 0.111 0.164 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 3.98e-01 0.128 0.151 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 1.66e-01 -0.147 0.106 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 93398 sc-eQTL 4.41e-01 0.153 0.198 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0141 0.145 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 114034 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0278 0.19 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0122 0.186 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 3.74e-01 -0.113 0.127 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 4.82e-01 0.123 0.175 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 6.55e-02 0.307 0.166 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 1.47e-01 -0.178 0.122 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 93398 sc-eQTL 3.01e-03 -0.572 0.191 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0559 0.199 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 114034 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0603 0.182 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 4.23e-01 0.15 0.187 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 3.81e-01 -0.142 0.161 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 6.89e-01 0.0756 0.189 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 2.82e-01 0.197 0.183 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 8.14e-01 0.0394 0.167 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 4.71e-01 -0.121 0.168 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 145743 sc-eQTL 2.65e-01 -0.193 0.173 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 1.88e-01 -0.243 0.184 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 2.19e-01 -0.142 0.115 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0467 0.144 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 5.00e-01 0.0861 0.127 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0295 0.0858 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 1.94e-01 -0.189 0.145 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 145743 sc-eQTL 9.86e-01 0.00257 0.147 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 1.61e-01 -0.254 0.181 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 1.26e-01 -0.206 0.134 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 3.11e-01 0.147 0.145 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 4.57e-01 -0.103 0.137 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0489 0.106 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0953 0.157 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 145743 sc-eQTL 2.17e-01 0.21 0.17 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 4.34e-01 -0.158 0.201 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 2.60e-03 -0.41 0.134 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 4.83e-01 0.11 0.157 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 8.06e-01 -0.042 0.171 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 8.64e-01 0.0208 0.122 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 5.58e-01 0.0939 0.16 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 145743 sc-eQTL 6.51e-01 0.0757 0.167 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 8.25e-01 0.0457 0.206 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 2.56e-02 -0.327 0.146 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 4.37e-01 -0.117 0.15 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 2.72e-01 0.177 0.16 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 1.71e-02 -0.309 0.128 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 1.38e-01 -0.224 0.151 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 145743 sc-eQTL 5.28e-01 -0.115 0.182 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 2.95e-01 -0.207 0.197 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0934 0.126 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0593 0.152 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0235 0.153 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0612 0.08 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 3.16e-01 -0.162 0.162 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 145743 sc-eQTL 5.16e-01 0.12 0.185 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0276 0.217 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 4.63e-01 -0.112 0.152 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 9.95e-02 -0.26 0.157 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 8.31e-01 0.0353 0.165 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 3.79e-01 -0.145 0.164 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0927 0.169 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 145743 sc-eQTL 2.99e-03 0.523 0.174 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 2.93e-01 -0.236 0.224 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 3.82e-03 -0.585 0.2 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 4.52e-01 0.158 0.21 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 3.96e-01 0.186 0.218 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 4.65e-01 0.123 0.168 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 3.55e-01 -0.169 0.183 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 145743 sc-eQTL 6.42e-01 -0.097 0.208 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 4.42e-01 -0.164 0.213 0.052 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 6.96e-02 -0.268 0.147 0.052 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0483 0.162 0.052 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 4.42e-01 -0.134 0.175 0.052 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 4.65e-01 -0.094 0.128 0.052 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 4.67e-01 0.11 0.151 0.052 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 2.60e-01 -0.232 0.206 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 8.88e-02 -0.298 0.174 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 2.39e-01 -0.22 0.186 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 8.13e-01 0.0412 0.174 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 2.89e-01 -0.17 0.16 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0254 0.172 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 4.60e-01 -0.133 0.18 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0963 0.16 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 5.75e-01 0.0872 0.155 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 4.57e-01 -0.11 0.147 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 8.18e-01 -0.023 0.0997 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0389 0.133 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 1.25e-01 -0.338 0.219 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 3.44e-01 -0.178 0.188 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0304 0.206 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 9.16e-03 0.527 0.2 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 3.28e-01 -0.164 0.167 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 5.06e-01 0.119 0.179 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 3.09e-01 -0.188 0.184 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 4.67e-01 -0.116 0.159 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0163 0.159 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0244 0.164 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00382 0.106 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 8.11e-01 -0.033 0.138 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 2.86e-01 0.222 0.207 0.05 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 1.64e-01 -0.23 0.165 0.05 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0111 0.164 0.05 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 3.78e-01 0.17 0.192 0.05 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0736 0.124 0.05 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0401 0.148 0.05 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 3.00e-01 -0.202 0.194 0.051 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0126 0.133 0.051 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0261 0.162 0.051 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00326 0.167 0.051 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0808 0.142 0.051 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 7.87e-01 -0.043 0.159 0.051 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 145743 sc-eQTL 8.84e-01 0.0266 0.182 0.051 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 6.87e-01 0.0739 0.183 0.056 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0719 0.131 0.056 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 9.36e-02 -0.291 0.173 0.056 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 692825 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00314 0.17 0.056 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 2.30e-01 0.235 0.195 0.056 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 1.24e-01 -0.247 0.159 0.056 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 1.75e-01 0.23 0.169 0.056 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 692848 sc-eQTL 5.09e-01 0.124 0.188 0.056 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 6.24e-01 0.0746 0.152 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0755 0.109 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 3.67e-02 -0.262 0.124 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 692825 sc-eQTL 7.78e-01 0.0517 0.183 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 2.21e-02 -0.372 0.161 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 3.41e-01 0.131 0.137 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 2.26e-01 0.174 0.143 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 692848 sc-eQTL 1.37e-01 0.284 0.191 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 4.68e-01 0.125 0.172 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 4.37e-02 -0.237 0.117 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0368 0.146 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 692825 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0653 0.185 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 1.05e-01 0.283 0.174 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 9.70e-01 0.00571 0.152 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 3.29e-02 0.319 0.149 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 692848 sc-eQTL 3.59e-01 0.186 0.202 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 4.83e-01 0.167 0.237 0.052 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 3.14e-01 -0.228 0.225 0.052 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 9.70e-01 0.00851 0.225 0.052 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 1.88e-01 0.307 0.232 0.052 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 2.15e-01 -0.217 0.175 0.052 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 7.96e-01 0.0523 0.202 0.052 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 4.01e-01 -0.168 0.199 0.051 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 4.11e-01 -0.11 0.134 0.051 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 1.10e-01 -0.261 0.163 0.051 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 692825 sc-eQTL 6.07e-02 -0.337 0.179 0.051 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 1.48e-01 -0.27 0.186 0.051 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0428 0.17 0.051 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 6.79e-02 0.301 0.164 0.051 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 692848 sc-eQTL 6.74e-01 0.0852 0.202 0.051 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0767 0.232 0.051 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 1.43e-02 -0.439 0.177 0.051 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 5.48e-01 0.118 0.196 0.051 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 692825 sc-eQTL 6.79e-01 0.0744 0.18 0.051 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0397 0.182 0.051 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 8.94e-01 0.0265 0.199 0.051 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 6.84e-01 0.0952 0.234 0.051 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 692848 sc-eQTL 5.65e-01 0.104 0.18 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 6.69e-02 -0.346 0.188 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 1.88e-01 -0.173 0.131 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 7.11e-01 0.0624 0.168 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 5.22e-01 0.112 0.175 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 8.88e-02 -0.206 0.12 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 93398 sc-eQTL 6.63e-01 0.0873 0.2 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 6.22e-01 0.0839 0.17 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 114034 sc-eQTL 2.82e-01 -0.213 0.197 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 8.78e-01 0.0268 0.175 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 4.21e-02 -0.245 0.12 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 5.89e-01 0.0884 0.163 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 1.55e-01 0.198 0.139 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 1.43e-01 -0.143 0.0971 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 93398 sc-eQTL 2.25e-01 -0.248 0.204 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0226 0.148 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 114034 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000345 0.174 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 1.86e-01 0.185 0.139 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 2.04e-01 -0.132 0.104 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 1.48e-01 -0.181 0.125 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 692825 sc-eQTL 9.81e-01 0.00436 0.184 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 4.36e-01 -0.118 0.151 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 5.34e-01 0.0835 0.134 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 1.60e-01 0.206 0.146 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 692848 sc-eQTL 1.30e-01 0.298 0.196 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 2.33e-01 -0.224 0.187 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0864 0.1 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 5.88e-01 -0.087 0.16 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 692825 sc-eQTL 5.95e-02 -0.335 0.177 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 2.69e-01 -0.123 0.111 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 8.11e-01 0.039 0.163 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 1.85e-02 0.328 0.138 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 692848 sc-eQTL 7.59e-01 0.0606 0.197 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 sc-eQTL 2.54e-01 -0.201 0.176 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 981865 sc-eQTL 4.98e-01 -0.104 0.153 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 250316 sc-eQTL 3.68e-01 0.136 0.15 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 397135 sc-eQTL 7.96e-01 0.0381 0.147 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 356651 sc-eQTL 9.90e-01 0.00115 0.0949 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 10748 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0165 0.137 0.052 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 611887 pQTL 0.0471 -0.233 0.117 0.0 0.0 0.0228


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N 981865 2.74e-07 1.25e-07 3.56e-08 2.01e-07 8.83e-08 1e-07 1.42e-07 5.49e-08 1.41e-07 4.57e-08 1.62e-07 8.14e-08 1.52e-07 6.76e-08 5.53e-08 7.5e-08 4.17e-08 1.14e-07 5.36e-08 4e-08 1.04e-07 1.27e-07 1.26e-07 4.05e-08 1.37e-07 1.14e-07 1.11e-07 9.32e-08 1.03e-07 1.1e-07 9.64e-08 3.84e-08 3.61e-08 9.52e-08 6.34e-08 3.94e-08 5.58e-08 8.63e-08 6.86e-08 6.43e-08 5.34e-08 1.35e-07 5.08e-08 7.61e-09 5.7e-08 1.84e-08 1.25e-07 1.88e-09 4.85e-08