logo

Genes within 1Mb (chr6:139348020:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 2.06e-01 0.2 0.158 0.056 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 8.75e-03 0.315 0.119 0.056 B L1
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 2.58e-01 0.174 0.153 0.056 B L1
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 2.27e-01 -0.164 0.136 0.056 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0649 0.0798 0.056 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 56022 sc-eQTL 4.92e-01 0.135 0.196 0.056 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 1.40e-01 0.182 0.123 0.056 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 76658 sc-eQTL 4.67e-01 0.0998 0.137 0.056 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 7.55e-01 0.0544 0.174 0.056 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 9.81e-03 0.299 0.115 0.056 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 2.84e-01 0.155 0.145 0.056 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 4.11e-02 0.232 0.113 0.056 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 3.39e-01 0.08 0.0834 0.056 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 3.22e-02 0.304 0.141 0.056 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 108367 sc-eQTL 7.36e-01 0.0476 0.141 0.056 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 1.27e-01 0.289 0.189 0.056 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 1.17e-01 0.194 0.124 0.056 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 5.86e-01 0.0741 0.136 0.056 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 6.23e-01 0.063 0.128 0.056 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0343 0.0727 0.056 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 2.17e-01 0.17 0.138 0.056 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 108367 sc-eQTL 3.59e-01 0.154 0.167 0.056 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 8.01e-01 0.0473 0.188 0.059 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 5.39e-01 0.081 0.132 0.059 DC L1
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0488 0.155 0.059 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 655449 sc-eQTL 6.95e-01 0.0675 0.172 0.059 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 3.33e-01 -0.147 0.152 0.059 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0173 0.149 0.059 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0589 0.177 0.059 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 655472 sc-eQTL 2.47e-01 -0.208 0.179 0.059 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 1.65e-01 -0.194 0.139 0.056 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0914 0.0967 0.056 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 1.92e-01 -0.167 0.127 0.056 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 655449 sc-eQTL 4.77e-01 0.13 0.183 0.056 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0861 0.107 0.056 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 5.49e-01 0.0836 0.139 0.056 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 1.18e-01 -0.23 0.147 0.056 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 655472 sc-eQTL 1.41e-01 -0.28 0.189 0.056 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0285 0.169 0.056 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 2.31e-01 0.179 0.149 0.056 NK L1
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 6.40e-01 0.0684 0.146 0.056 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 2.68e-01 0.154 0.139 0.056 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 2.62e-01 0.114 0.101 0.056 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0662 0.135 0.056 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 5.03e-01 -0.135 0.202 0.056 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 4.19e-02 0.264 0.129 0.056 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 4.97e-01 0.0994 0.146 0.056 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 1.69e-01 0.216 0.156 0.056 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 2.90e-01 0.109 0.103 0.056 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0201 0.121 0.056 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 5.42e-01 0.118 0.193 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 2.43e-02 0.3 0.132 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 7.85e-01 0.0457 0.167 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 9.33e-01 0.0152 0.181 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 9.86e-01 0.00264 0.154 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 56022 sc-eQTL 5.18e-01 0.122 0.188 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 5.02e-01 0.116 0.173 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 76658 sc-eQTL 3.81e-01 0.165 0.187 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 8.55e-01 0.0367 0.2 0.056 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 1.28e-01 0.228 0.15 0.056 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 2.04e-01 0.219 0.172 0.056 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 1.44e-01 -0.273 0.186 0.056 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0159 0.148 0.056 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 56022 sc-eQTL 4.70e-01 0.136 0.189 0.056 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 5.09e-01 -0.115 0.174 0.056 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 76658 sc-eQTL 3.86e-01 -0.185 0.213 0.056 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 4.99e-01 0.126 0.186 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 4.14e-03 0.373 0.129 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 1.01e-01 0.266 0.162 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 6.02e-01 0.0786 0.15 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 9.53e-01 0.00626 0.105 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 56022 sc-eQTL 5.85e-01 -0.108 0.197 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 4.77e-01 0.102 0.143 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 76658 sc-eQTL 1.94e-01 0.244 0.187 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 4.15e-01 0.148 0.181 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 1.03e-02 0.315 0.122 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 5.50e-01 0.102 0.17 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0453 0.163 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 9.54e-01 0.00694 0.12 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 56022 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0844 0.19 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0494 0.193 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 76658 sc-eQTL 1.49e-01 0.256 0.177 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 5.02e-01 -0.125 0.186 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 8.21e-02 0.279 0.16 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 2.57e-01 -0.213 0.187 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 4.19e-01 0.148 0.182 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 6.61e-01 0.0731 0.166 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 5.93e-01 0.0896 0.167 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 108367 sc-eQTL 2.12e-01 -0.215 0.172 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 5.02e-01 0.123 0.183 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 1.24e-02 0.284 0.113 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 3.11e-01 0.144 0.142 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 8.64e-02 0.216 0.125 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 1.24e-01 0.13 0.0845 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 3.00e-02 0.312 0.143 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 108367 sc-eQTL 3.70e-01 0.131 0.146 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 6.93e-01 0.0713 0.181 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 2.94e-02 0.291 0.133 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 1.52e-01 0.207 0.144 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 1.66e-01 0.19 0.136 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 3.96e-01 0.0894 0.105 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 2.96e-01 0.164 0.156 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 108367 sc-eQTL 2.93e-01 -0.178 0.169 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0262 0.203 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 4.40e-01 0.107 0.138 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 2.77e-01 0.172 0.158 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 9.06e-01 0.0205 0.172 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0573 0.123 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 6.16e-01 0.0809 0.161 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 108367 sc-eQTL 2.89e-02 0.367 0.167 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 3.17e-01 0.205 0.204 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 7.95e-01 0.038 0.146 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 3.33e-01 0.144 0.149 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 4.97e-01 0.109 0.159 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0898 0.129 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0615 0.15 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 108367 sc-eQTL 7.38e-01 0.0604 0.18 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 7.11e-01 0.0739 0.199 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 2.57e-01 0.144 0.127 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 4.17e-01 0.125 0.153 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 5.38e-01 0.0948 0.154 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 8.94e-01 0.0108 0.0807 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 1.17e-01 0.256 0.162 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 108367 sc-eQTL 1.04e-01 0.303 0.186 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0513 0.217 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 9.19e-02 0.256 0.151 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 9.37e-02 -0.265 0.157 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0546 0.165 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0313 0.164 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0325 0.169 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 108367 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0466 0.178 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 2.19e-01 0.249 0.202 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 7.71e-01 0.0538 0.185 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 4.40e-01 -0.147 0.19 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 4.73e-01 -0.142 0.198 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 8.22e-01 0.0343 0.153 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 5.53e-01 0.0984 0.166 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 108367 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0175 0.189 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 3.35e-01 -0.209 0.217 0.054 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 1.83e-01 0.2 0.15 0.054 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 6.33e-01 0.0788 0.165 0.054 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 3.88e-01 0.154 0.177 0.054 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 7.96e-03 0.344 0.128 0.054 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 5.46e-01 0.093 0.154 0.054 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 5.82e-01 -0.113 0.204 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 2.94e-01 -0.183 0.174 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 8.67e-01 -0.031 0.185 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 2.28e-01 0.208 0.172 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 1.35e-01 0.238 0.158 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 6.39e-01 0.0802 0.171 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 7.02e-01 0.0701 0.183 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 6.91e-01 0.0648 0.163 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 5.46e-01 0.0954 0.158 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 5.92e-01 0.0802 0.149 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 6.57e-01 0.045 0.101 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 3.13e-01 -0.136 0.135 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 3.47e-02 0.462 0.217 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 4.80e-01 0.132 0.187 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 8.18e-03 0.539 0.202 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 9.40e-01 0.0154 0.203 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 4.64e-01 0.122 0.166 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 4.90e-01 -0.123 0.178 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 3.79e-01 -0.165 0.188 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 2.60e-01 0.182 0.161 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0479 0.162 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 5.70e-01 0.095 0.167 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 6.72e-01 0.0457 0.108 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0208 0.141 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 6.05e-01 0.114 0.219 0.063 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 5.66e-01 -0.112 0.195 0.063 PB L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 9.41e-01 0.0178 0.239 0.063 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 5.37e-02 -0.407 0.209 0.063 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0182 0.149 0.063 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 56022 sc-eQTL 9.27e-01 0.0199 0.217 0.063 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 4.87e-01 0.114 0.163 0.063 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 76658 sc-eQTL 3.90e-02 -0.449 0.215 0.063 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 1.93e-01 0.267 0.205 0.057 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 2.74e-01 0.179 0.163 0.057 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0122 0.162 0.057 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 1.17e-02 0.477 0.188 0.057 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 8.39e-01 0.025 0.123 0.057 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 8.07e-01 0.0358 0.146 0.057 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 2.56e-01 -0.223 0.196 0.056 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 1.45e-02 0.326 0.132 0.056 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 7.07e-01 0.0613 0.163 0.056 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 7.81e-01 0.047 0.169 0.056 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 4.78e-01 -0.102 0.144 0.056 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 7.26e-01 0.0563 0.161 0.056 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 108367 sc-eQTL 4.86e-01 0.128 0.184 0.056 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 3.38e-01 -0.181 0.188 0.059 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 2.93e-01 0.143 0.135 0.059 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 9.81e-01 0.00418 0.18 0.059 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 655449 sc-eQTL 6.16e-01 0.0882 0.176 0.059 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 4.03e-01 -0.169 0.202 0.059 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0869 0.166 0.059 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 1.11e-01 -0.28 0.174 0.059 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 655472 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0956 0.194 0.059 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 8.81e-02 -0.259 0.151 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 1.43e-01 -0.16 0.109 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 2.95e-01 -0.132 0.125 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 655449 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0405 0.183 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 5.13e-01 -0.107 0.163 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 4.11e-01 0.113 0.137 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 2.02e-01 -0.183 0.143 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 655472 sc-eQTL 4.18e-01 -0.156 0.192 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 7.15e-01 0.0637 0.175 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0746 0.119 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 3.43e-01 -0.14 0.147 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 655449 sc-eQTL 7.93e-02 0.327 0.186 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 1.10e-01 -0.282 0.176 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 5.40e-01 0.0944 0.154 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 1.67e-01 -0.21 0.152 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 655472 sc-eQTL 2.49e-01 -0.236 0.204 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 8.02e-01 0.0604 0.24 0.052 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 6.25e-02 0.425 0.226 0.052 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 7.75e-01 0.0653 0.228 0.052 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0995 0.236 0.052 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 5.54e-01 -0.105 0.177 0.052 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 9.61e-01 0.00998 0.205 0.052 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0901 0.199 0.058 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 8.47e-01 0.0259 0.134 0.058 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 3.34e-01 -0.158 0.163 0.058 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 655449 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0981 0.18 0.058 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0125 0.186 0.058 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 8.18e-01 0.0391 0.17 0.058 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0696 0.165 0.058 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 655472 sc-eQTL 7.40e-02 -0.36 0.2 0.058 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 4.27e-01 -0.153 0.192 0.054 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 7.53e-01 0.0362 0.115 0.054 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 8.42e-01 -0.035 0.176 0.054 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 655449 sc-eQTL 8.97e-01 0.0241 0.185 0.054 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 9.08e-01 0.0162 0.14 0.054 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 4.51e-01 0.127 0.168 0.054 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0331 0.143 0.054 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 655472 sc-eQTL 3.33e-01 0.199 0.205 0.054 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 2.68e-01 -0.239 0.215 0.062 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0257 0.168 0.062 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0116 0.183 0.062 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 655449 sc-eQTL 3.80e-01 0.147 0.167 0.062 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 7.95e-01 0.0441 0.169 0.062 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 9.26e-01 0.0173 0.185 0.062 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0928 0.217 0.062 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 655472 sc-eQTL 2.71e-01 -0.185 0.167 0.062 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 4.24e-01 0.15 0.187 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 1.65e-02 0.309 0.128 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 4.87e-01 0.116 0.166 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 2.03e-01 -0.22 0.172 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0619 0.12 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 56022 sc-eQTL 2.99e-01 0.206 0.198 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 3.71e-01 0.15 0.168 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 76658 sc-eQTL 9.65e-01 0.00855 0.195 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 2.56e-01 0.197 0.173 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 1.51e-03 0.378 0.117 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 8.45e-02 0.279 0.161 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0252 0.138 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 6.95e-01 0.0381 0.097 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 56022 sc-eQTL 4.24e-01 -0.163 0.203 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 5.56e-01 0.0871 0.147 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 76658 sc-eQTL 1.48e-01 0.251 0.173 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 2.03e-01 -0.179 0.14 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 2.37e-01 -0.124 0.105 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 2.59e-01 -0.143 0.126 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 655449 sc-eQTL 2.27e-01 0.223 0.184 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 1.18e-01 -0.237 0.151 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 4.56e-01 0.101 0.135 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 2.40e-01 -0.174 0.147 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 655472 sc-eQTL 1.96e-01 -0.256 0.197 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 5.71e-01 -0.107 0.188 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 9.73e-01 0.00338 0.101 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0355 0.161 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 655449 sc-eQTL 3.09e-01 -0.182 0.179 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 9.40e-01 0.00844 0.111 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 7.67e-01 0.0485 0.163 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 8.65e-01 0.0239 0.14 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 655472 sc-eQTL 3.27e-01 -0.194 0.197 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 574511 sc-eQTL 9.40e-01 0.0134 0.176 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 944489 sc-eQTL 1.91e-01 0.2 0.152 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 212940 sc-eQTL 5.80e-01 0.0832 0.15 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 359759 sc-eQTL 4.00e-01 0.123 0.147 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 319275 sc-eQTL 4.61e-01 0.0698 0.0946 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -26628 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0751 0.137 0.056 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135597 REPS1 359759 eQTL 0.0342 -0.0853 0.0402 0.00128 0.0 0.0486

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina