logo

Genes within 1Mb (chr6:139342110:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 8.15e-01 0.0179 0.0763 0.271 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 8.95e-01 0.0077 0.0582 0.271 B L1
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0445 0.0741 0.271 B L1
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 5.78e-01 0.0365 0.0655 0.271 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00357 0.0385 0.271 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 50112 sc-eQTL 3.87e-02 0.194 0.0934 0.271 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 4.43e-01 0.0456 0.0593 0.271 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 70748 sc-eQTL 5.47e-01 0.0398 0.066 0.271 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0542 0.0842 0.271 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 3.68e-01 -0.051 0.0565 0.271 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0259 0.0703 0.271 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00122 0.0553 0.271 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00528 0.0405 0.271 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0437 0.0691 0.271 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 102457 sc-eQTL 7.53e-01 0.0215 0.0682 0.271 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0189 0.0934 0.271 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000328 0.0612 0.271 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0287 0.0668 0.271 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 9.28e-02 0.105 0.0625 0.271 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 3.48e-01 0.0336 0.0357 0.271 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 3.41e-01 0.0647 0.0678 0.271 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 102457 sc-eQTL 1.65e-01 -0.115 0.0822 0.271 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 5.92e-01 0.0509 0.0947 0.264 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 7.75e-01 0.0191 0.0666 0.264 DC L1
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 1.80e-01 0.105 0.0777 0.264 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 649539 sc-eQTL 1.17e-01 -0.136 0.0864 0.264 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 1.65e-01 0.107 0.0765 0.264 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 9.88e-01 0.00115 0.0753 0.264 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 1.26e-01 -0.136 0.0888 0.264 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 649562 sc-eQTL 9.37e-01 0.00721 0.0909 0.264 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0229 0.0678 0.271 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 7.92e-01 0.0124 0.0469 0.271 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 1.27e-01 -0.0942 0.0615 0.271 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 649539 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00669 0.0886 0.271 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 2.35e-05 0.215 0.0497 0.271 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 5.62e-01 0.0392 0.0675 0.271 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 3.63e-01 -0.065 0.0713 0.271 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 649562 sc-eQTL 1.62e-01 0.129 0.0918 0.271 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0807 0.0822 0.27 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0295 0.0726 0.27 NK L1
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0941 0.0709 0.27 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0935 0.0675 0.27 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 2.97e-01 0.0517 0.0494 0.27 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 3.86e-01 0.0571 0.0657 0.27 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 4.12e-01 0.0799 0.0972 0.271 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 7.25e-01 0.0222 0.0629 0.271 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0231 0.0705 0.271 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0747 0.0756 0.271 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 7.80e-01 0.0139 0.0496 0.271 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 6.07e-01 0.0299 0.0581 0.271 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 3.19e-01 0.106 0.106 0.276 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0685 0.0932 0.276 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0832 0.101 0.276 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 3.85e-01 0.0923 0.106 0.276 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 7.98e-01 0.0246 0.0961 0.276 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 50112 sc-eQTL 1.80e-01 0.11 0.0819 0.276 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0408 0.103 0.276 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 70748 sc-eQTL 1.91e-01 0.135 0.103 0.276 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 4.17e-01 0.0761 0.0935 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0279 0.0648 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 2.86e-01 0.0865 0.0809 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 9.50e-01 0.0055 0.0875 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00346 0.0745 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 50112 sc-eQTL 2.58e-01 0.103 0.0909 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0213 0.0839 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 70748 sc-eQTL 7.53e-01 0.0287 0.0909 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0809 0.0964 0.269 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 7.94e-01 0.019 0.0727 0.269 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0375 0.0835 0.269 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 4.71e-01 0.0653 0.0904 0.269 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 6.70e-01 0.0305 0.0716 0.269 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 50112 sc-eQTL 9.56e-01 0.00499 0.0913 0.269 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 4.21e-01 0.0676 0.0838 0.269 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 70748 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0861 0.103 0.269 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 6.53e-01 0.0405 0.0899 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 5.21e-01 0.0406 0.0632 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00942 0.0784 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0481 0.0725 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 8.81e-01 0.0076 0.0508 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 50112 sc-eQTL 4.51e-01 0.0716 0.0949 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 9.86e-01 0.00122 0.0691 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 70748 sc-eQTL 1.39e-01 -0.134 0.0903 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 2.13e-01 -0.109 0.0873 0.27 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 8.02e-02 -0.105 0.0595 0.27 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0777 0.0823 0.27 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 2.70e-01 0.0868 0.0785 0.27 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 6.09e-01 0.0297 0.0579 0.27 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 50112 sc-eQTL 1.13e-01 0.145 0.0912 0.27 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0318 0.0936 0.27 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 70748 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0075 0.0859 0.27 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 9.02e-02 -0.157 0.0921 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 9.14e-01 0.00868 0.0801 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 1.32e-01 -0.141 0.0931 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 6.32e-02 -0.168 0.0901 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 2.35e-02 0.187 0.0818 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 6.84e-01 0.0339 0.0832 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 102457 sc-eQTL 8.62e-01 -0.015 0.0858 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 1.14e-01 -0.14 0.088 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0325 0.0552 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0456 0.0688 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 8.47e-01 0.0118 0.061 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0112 0.0411 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 3.30e-01 -0.068 0.0696 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 102457 sc-eQTL 7.18e-01 0.0255 0.0706 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0281 0.0875 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 2.89e-01 -0.069 0.0649 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0723 0.0698 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00863 0.0664 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0204 0.051 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0613 0.0758 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 102457 sc-eQTL 5.94e-01 0.0438 0.0819 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0962 0.097 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0658 0.0661 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 1.49e-01 0.109 0.0753 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 9.61e-01 0.004 0.0824 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 3.66e-01 0.0532 0.0587 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 5.96e-01 -0.041 0.0771 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 102457 sc-eQTL 7.47e-01 -0.026 0.0807 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 6.85e-01 0.041 0.101 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00364 0.072 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0713 0.0732 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 6.39e-01 0.0369 0.0786 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 9.74e-01 0.00206 0.0636 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 4.74e-01 0.0531 0.0739 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 102457 sc-eQTL 5.89e-01 -0.048 0.0887 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0711 0.0959 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 6.85e-01 0.0249 0.0614 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 4.82e-01 0.0521 0.074 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 7.05e-01 0.0282 0.0743 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 4.08e-01 0.0323 0.0389 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 8.36e-01 0.0163 0.0788 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 102457 sc-eQTL 2.51e-01 -0.104 0.0899 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0489 0.11 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0953 0.0768 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 2.31e-01 0.0962 0.08 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 4.05e-02 0.17 0.0825 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 5.16e-02 0.161 0.0823 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 4.81e-01 0.0602 0.0853 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 102457 sc-eQTL 5.22e-01 0.0578 0.0901 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 2.36e-01 -0.117 0.0988 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00212 0.0901 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 4.84e-01 -0.065 0.0927 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 3.39e-01 0.0925 0.0964 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0165 0.0744 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0279 0.0809 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 102457 sc-eQTL 4.74e-02 0.182 0.0911 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 7.62e-01 0.032 0.105 0.268 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 5.77e-01 0.0408 0.0731 0.268 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 4.08e-01 0.0662 0.08 0.268 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0224 0.0863 0.268 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0349 0.0634 0.268 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0335 0.0746 0.268 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 9.10e-01 0.011 0.0973 0.271 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0153 0.0829 0.271 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 6.34e-01 0.042 0.0882 0.271 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 1.07e-01 -0.133 0.0817 0.271 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0169 0.0758 0.271 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 3.98e-01 0.0687 0.0812 0.271 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 6.82e-02 -0.162 0.0886 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0331 0.0792 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0923 0.0766 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0169 0.0728 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 2.17e-01 0.0608 0.0491 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 7.42e-01 0.0217 0.0657 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 4.70e-01 0.0739 0.102 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 2.51e-01 -0.1 0.0869 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0753 0.0955 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 1.97e-01 -0.122 0.094 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 8.30e-02 0.134 0.0771 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 1.77e-01 -0.112 0.0826 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 7.61e-01 0.0278 0.0913 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0351 0.0787 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 7.98e-01 0.0202 0.0787 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0293 0.0812 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 2.80e-01 0.0566 0.0522 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 1.26e-01 0.104 0.068 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 2.54e-01 0.12 0.105 0.3 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 2.81e-01 -0.101 0.0931 0.3 PB L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0216 0.115 0.3 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 8.53e-01 0.0189 0.102 0.3 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0109 0.0713 0.3 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 50112 sc-eQTL 7.93e-01 0.0274 0.104 0.3 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0924 0.0779 0.3 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 70748 sc-eQTL 4.95e-01 0.0719 0.105 0.3 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 1.50e-01 0.147 0.102 0.27 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 3.54e-01 0.0753 0.0811 0.27 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0303 0.0803 0.27 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 3.02e-01 0.0976 0.0944 0.27 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 9.63e-01 0.00285 0.061 0.27 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 7.05e-01 0.0276 0.0727 0.27 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 4.28e-03 0.27 0.0934 0.271 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0121 0.0651 0.271 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 6.41e-01 0.037 0.0791 0.271 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 7.46e-01 0.0265 0.0819 0.271 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 6.43e-01 0.0323 0.0697 0.271 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0784 0.0777 0.271 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 102457 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0114 0.0891 0.271 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 5.94e-01 0.0517 0.0967 0.266 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 6.73e-01 0.0293 0.0694 0.266 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 9.14e-01 0.00997 0.0921 0.266 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 649539 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0857 0.0899 0.266 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0662 0.104 0.266 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 5.91e-01 0.0456 0.0848 0.266 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 1.49e-01 -0.13 0.0895 0.266 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 649562 sc-eQTL 4.67e-01 0.0724 0.0993 0.266 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 3.13e-01 0.0741 0.0733 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 8.59e-01 -0.00939 0.0528 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0589 0.0606 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 649539 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0472 0.0884 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 1.26e-04 0.298 0.0762 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 5.79e-01 0.0369 0.0664 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0758 0.0692 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 649562 sc-eQTL 3.24e-01 0.0914 0.0924 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 5.65e-01 -0.049 0.085 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0297 0.0582 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0839 0.0716 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 649539 sc-eQTL 8.41e-01 0.0183 0.0911 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 1.60e-01 0.121 0.0858 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 9.73e-01 0.00256 0.0749 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0637 0.0741 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 649562 sc-eQTL 5.79e-01 0.0554 0.0997 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 3.06e-01 -0.118 0.115 0.279 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 7.33e-01 0.0376 0.11 0.279 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 1.26e-01 -0.167 0.109 0.279 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 1.94e-01 -0.147 0.113 0.279 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0292 0.0853 0.279 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 7.92e-01 0.0259 0.0983 0.279 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 2.72e-01 -0.11 0.0999 0.269 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 4.13e-01 0.0551 0.0672 0.269 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 2.57e-01 0.0932 0.082 0.269 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 649539 sc-eQTL 7.59e-01 0.0279 0.0907 0.269 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 1.24e-01 0.144 0.0932 0.269 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 9.94e-02 0.141 0.0849 0.269 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 7.17e-01 0.0301 0.083 0.269 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 649562 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0167 0.102 0.269 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0781 0.0946 0.269 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 9.45e-01 0.00387 0.0565 0.269 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 8.15e-01 0.0203 0.0866 0.269 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 649539 sc-eQTL 6.26e-01 0.0444 0.091 0.269 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 1.84e-01 0.0911 0.0683 0.269 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 2.83e-01 0.0887 0.0824 0.269 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0221 0.0701 0.269 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 649562 sc-eQTL 8.74e-01 0.016 0.101 0.269 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0347 0.105 0.26 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 4.10e-01 0.0674 0.0817 0.26 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 7.36e-02 0.159 0.0882 0.26 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 649539 sc-eQTL 1.89e-01 -0.107 0.081 0.26 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 1.53e-01 0.118 0.082 0.26 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0721 0.09 0.26 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0692 0.106 0.26 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 649562 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0419 0.0818 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 6.56e-01 0.0405 0.0906 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0356 0.0627 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 7.67e-01 0.024 0.0807 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 7.33e-01 0.0285 0.0836 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 5.55e-01 0.0342 0.0579 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 50112 sc-eQTL 1.92e-01 0.125 0.0956 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 9.68e-01 0.0033 0.0814 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 70748 sc-eQTL 5.64e-01 0.0547 0.0946 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00989 0.0835 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 9.89e-01 -0.000798 0.0579 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0405 0.078 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000441 0.0666 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00174 0.0467 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 50112 sc-eQTL 1.77e-01 0.132 0.0974 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 8.48e-01 0.0136 0.071 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 70748 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0966 0.0832 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 5.31e-01 0.0427 0.068 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 7.17e-01 0.0184 0.0507 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 9.88e-02 -0.101 0.0607 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 649539 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0358 0.0892 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 1.79e-04 0.271 0.071 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 7.97e-01 0.0168 0.0653 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0931 0.0712 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 649562 sc-eQTL 4.57e-01 0.0713 0.0956 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 2.26e-02 -0.21 0.0917 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 8.43e-01 0.0098 0.0496 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 8.50e-01 0.015 0.0792 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 649539 sc-eQTL 3.81e-01 0.0772 0.0879 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 5.01e-03 0.153 0.0538 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 1.16e-01 0.126 0.0798 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 8.90e-01 -0.00954 0.0692 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 649562 sc-eQTL 2.48e-01 0.112 0.0971 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 568601 sc-eQTL 1.71e-01 -0.117 0.0852 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 938579 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0474 0.0742 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 207030 sc-eQTL 1.05e-01 -0.118 0.0726 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 353849 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0506 0.0713 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 313365 sc-eQTL 2.92e-01 0.0485 0.0459 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -32538 sc-eQTL 5.76e-01 0.0372 0.0665 0.272 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000218565 AL592429.1 4092 eQTL 0.038 -0.0491 0.0236 0.0 0.0 0.3
ENSG00000279968 GVQW2 568458 eQTL 0.0109 0.123 0.0483 0.0 0.0 0.3

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina