logo

Genes within 1Mb (chr6:139314908:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 2.42e-01 0.147 0.125 0.081 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 1.46e-01 0.139 0.0955 0.081 B L1
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 2.21e-01 -0.15 0.122 0.081 B L1
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 7.55e-01 0.0338 0.108 0.081 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 1.15e-01 -0.0999 0.0631 0.081 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 22910 sc-eQTL 3.17e-01 0.156 0.155 0.081 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 6.83e-01 0.04 0.0979 0.081 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 43546 sc-eQTL 4.31e-01 0.0859 0.109 0.081 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0383 0.141 0.081 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 3.52e-02 0.199 0.094 0.081 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 6.36e-02 -0.218 0.117 0.081 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 5.57e-01 0.0545 0.0927 0.081 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 9.04e-01 0.00821 0.068 0.081 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 1.69e-01 0.16 0.116 0.081 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 75255 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0811 0.114 0.081 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 6.52e-01 0.0703 0.156 0.081 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 3.58e-01 0.0938 0.102 0.081 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 1.66e-01 -0.154 0.111 0.081 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 2.87e-01 0.112 0.105 0.081 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 7.90e-01 0.0159 0.0597 0.081 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 1.09e-01 0.181 0.113 0.081 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 75255 sc-eQTL 9.95e-02 -0.226 0.137 0.081 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0564 0.15 0.086 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 2.07e-01 0.133 0.105 0.086 DC L1
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 1.39e-01 -0.183 0.123 0.086 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 622337 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0367 0.137 0.086 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 2.28e-01 0.146 0.121 0.086 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 3.86e-01 0.103 0.119 0.086 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 6.83e-01 0.0577 0.141 0.086 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 622360 sc-eQTL 2.13e-02 -0.329 0.142 0.086 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 4.96e-01 0.0756 0.111 0.081 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 1.04e-01 0.124 0.0763 0.081 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 1.71e-01 -0.138 0.101 0.081 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 622337 sc-eQTL 2.92e-02 -0.315 0.143 0.081 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 9.61e-01 0.00415 0.0849 0.081 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0664 0.11 0.081 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 9.86e-01 0.00203 0.117 0.081 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 622360 sc-eQTL 5.73e-01 -0.085 0.151 0.081 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 7.91e-01 0.0363 0.136 0.082 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 4.13e-02 0.244 0.119 0.082 NK L1
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 2.58e-01 -0.133 0.118 0.082 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 2.13e-01 -0.14 0.112 0.082 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 6.01e-01 0.0429 0.0819 0.082 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 1.67e-01 0.15 0.108 0.082 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 7.61e-02 0.287 0.161 0.081 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 6.86e-01 0.0423 0.105 0.081 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0402 0.117 0.081 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 3.07e-01 -0.129 0.126 0.081 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0744 0.0824 0.081 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 3.11e-02 0.207 0.0956 0.081 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 3.69e-01 0.16 0.177 0.084 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 1.87e-02 0.364 0.153 0.084 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 9.28e-02 -0.284 0.168 0.084 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 9.19e-01 -0.018 0.177 0.084 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0799 0.16 0.084 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 22910 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0585 0.137 0.084 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 3.76e-01 -0.153 0.172 0.084 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 43546 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0365 0.173 0.084 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 2.94e-01 0.163 0.155 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 1.77e-01 0.145 0.107 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 3.33e-01 -0.13 0.134 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0191 0.145 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 1.75e-01 0.168 0.123 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 22910 sc-eQTL 1.34e-02 0.373 0.149 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00813 0.139 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 43546 sc-eQTL 1.75e-01 0.205 0.15 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 6.56e-01 0.0706 0.159 0.082 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 1.44e-01 0.174 0.119 0.082 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0613 0.137 0.082 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 4.60e-01 0.11 0.149 0.082 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 6.08e-02 -0.22 0.117 0.082 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 22910 sc-eQTL 8.45e-01 0.0294 0.15 0.082 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 3.42e-01 -0.131 0.138 0.082 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 43546 sc-eQTL 7.63e-01 0.0511 0.169 0.082 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0315 0.148 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 1.25e-01 0.159 0.103 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 9.48e-02 -0.214 0.128 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 4.57e-01 0.0886 0.119 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0442 0.0832 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 22910 sc-eQTL 9.75e-01 0.00482 0.156 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 6.33e-01 0.0542 0.113 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 43546 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0165 0.149 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 1.01e-01 0.237 0.144 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0188 0.099 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0996 0.136 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 7.15e-01 0.0476 0.13 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 9.21e-01 0.00945 0.0957 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 22910 sc-eQTL 6.70e-01 0.0646 0.151 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 2.52e-01 -0.177 0.154 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 43546 sc-eQTL 7.80e-01 0.0396 0.142 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 9.56e-02 0.258 0.154 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 5.64e-01 0.0772 0.134 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0561 0.156 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0773 0.152 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 5.09e-01 0.0914 0.138 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 3.16e-02 0.298 0.137 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 75255 sc-eQTL 2.13e-01 0.178 0.143 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0187 0.148 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 4.07e-02 0.188 0.0912 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 4.76e-02 -0.227 0.114 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 9.07e-01 0.0119 0.102 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0315 0.0685 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 4.38e-01 0.0904 0.116 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 75255 sc-eQTL 7.12e-01 0.0436 0.118 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 1.65e-01 -0.201 0.144 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 6.26e-02 0.201 0.107 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 3.86e-02 -0.239 0.115 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0329 0.11 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0352 0.0846 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 4.60e-01 0.0931 0.126 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 75255 sc-eQTL 1.58e-01 -0.192 0.135 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0538 0.165 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 1.22e-01 0.174 0.112 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 1.12e-01 -0.204 0.128 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 5.02e-01 0.0941 0.14 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 2.33e-01 -0.119 0.0996 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 1.55e-01 0.186 0.131 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 75255 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0857 0.137 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 3.34e-01 0.16 0.165 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 2.63e-01 0.132 0.118 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0559 0.121 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 2.09e-01 0.162 0.129 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 5.64e-01 0.0604 0.104 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 5.66e-01 0.0698 0.122 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 75255 sc-eQTL 4.70e-01 -0.105 0.146 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0207 0.158 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 8.30e-01 0.0217 0.101 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 6.20e-02 -0.227 0.121 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 4.14e-01 0.1 0.122 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 9.95e-01 -0.0004 0.0642 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 6.16e-02 0.242 0.129 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 75255 sc-eQTL 4.48e-01 -0.113 0.148 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 1.49e-01 0.253 0.175 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 8.27e-01 -0.027 0.123 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 1.24e-01 -0.197 0.128 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 7.90e-01 0.0356 0.133 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 4.59e-01 0.0985 0.133 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 5.96e-01 0.0726 0.137 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 75255 sc-eQTL 3.78e-02 -0.298 0.143 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 1.07e-01 -0.276 0.171 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 6.96e-01 0.0612 0.156 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 2.80e-01 -0.174 0.16 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 5.44e-01 -0.102 0.167 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0507 0.129 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 2.66e-02 0.309 0.139 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 75255 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0543 0.16 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 6.66e-02 0.317 0.172 0.082 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 9.56e-01 0.00659 0.12 0.082 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00333 0.132 0.082 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 3.05e-01 -0.146 0.142 0.082 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 2.75e-01 -0.114 0.104 0.082 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 7.87e-02 0.216 0.122 0.082 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 2.80e-01 -0.186 0.172 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 7.85e-01 0.0402 0.147 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 8.67e-01 0.0262 0.157 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000764 0.146 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0519 0.135 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 9.47e-01 0.00957 0.144 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0084 0.148 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 1.56e-02 0.316 0.13 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0675 0.127 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 2.50e-01 -0.139 0.12 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 7.44e-01 0.0268 0.0818 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 3.32e-01 0.106 0.109 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 4.94e-01 -0.122 0.178 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 8.98e-01 0.0195 0.152 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 2.77e-01 -0.181 0.166 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 1.71e-01 0.225 0.164 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 9.09e-01 0.0156 0.135 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 2.60e-02 0.32 0.143 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 2.03e-01 0.196 0.153 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 4.13e-01 0.109 0.133 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 8.96e-02 -0.225 0.132 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 5.70e-02 -0.26 0.136 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 8.47e-01 -0.017 0.0882 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 1.67e-01 0.159 0.115 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 2.77e-01 -0.186 0.17 0.085 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 5.75e-02 0.287 0.15 0.085 PB L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 6.68e-01 0.0801 0.186 0.085 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 9.34e-01 0.0137 0.166 0.085 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0487 0.116 0.085 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 22910 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0611 0.169 0.085 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 5.26e-02 0.246 0.125 0.085 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 43546 sc-eQTL 2.69e-01 0.189 0.17 0.085 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 5.22e-01 0.106 0.165 0.083 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 4.17e-01 -0.107 0.131 0.083 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0894 0.13 0.083 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 3.89e-01 0.132 0.153 0.083 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0513 0.0986 0.083 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 2.89e-01 0.125 0.117 0.083 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 5.02e-02 -0.306 0.156 0.081 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 8.86e-02 0.182 0.107 0.081 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 1.83e-01 -0.174 0.13 0.081 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 4.39e-01 -0.105 0.135 0.081 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 1.70e-01 0.158 0.114 0.081 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 4.96e-01 0.0874 0.128 0.081 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 75255 sc-eQTL 5.91e-01 0.079 0.147 0.081 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 7.24e-02 -0.28 0.155 0.083 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 2.23e-01 0.137 0.112 0.083 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 2.72e-02 -0.327 0.147 0.083 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 622337 sc-eQTL 8.96e-01 -0.019 0.145 0.083 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 2.29e-01 0.202 0.167 0.083 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 4.77e-01 0.0975 0.137 0.083 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 2.73e-01 -0.159 0.145 0.083 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 622360 sc-eQTL 1.98e-01 -0.206 0.16 0.083 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 4.94e-01 0.0833 0.122 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 1.03e-01 0.142 0.0869 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 1.73e-01 -0.137 0.1 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 622337 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0256 0.146 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0111 0.131 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0804 0.11 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 9.72e-01 0.00401 0.115 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 622360 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0744 0.153 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0501 0.14 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 1.04e-01 0.156 0.0955 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 4.85e-01 -0.083 0.119 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 622337 sc-eQTL 4.78e-03 -0.421 0.148 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000374 0.142 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 9.73e-01 0.00415 0.124 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 7.60e-01 0.0374 0.122 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 622360 sc-eQTL 6.79e-01 0.0683 0.165 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 6.06e-02 0.353 0.187 0.082 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 3.94e-01 0.154 0.18 0.082 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 2.70e-01 -0.198 0.179 0.082 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 4.50e-01 -0.141 0.185 0.082 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 9.42e-02 -0.233 0.138 0.082 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 5.27e-01 0.102 0.161 0.082 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0745 0.163 0.08 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 1.76e-01 0.148 0.109 0.08 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 8.17e-01 -0.031 0.134 0.08 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 622337 sc-eQTL 1.75e-01 -0.2 0.147 0.08 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0552 0.152 0.08 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 4.48e-01 -0.106 0.139 0.08 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 2.92e-01 0.142 0.135 0.08 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 622360 sc-eQTL 1.98e-01 -0.212 0.165 0.08 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 1.19e-01 0.257 0.164 0.072 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 7.71e-01 0.0286 0.0984 0.072 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 1.68e-01 -0.208 0.15 0.072 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 622337 sc-eQTL 1.39e-01 -0.234 0.158 0.072 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 3.94e-01 0.102 0.119 0.072 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 5.34e-01 0.0897 0.144 0.072 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0446 0.122 0.072 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 622360 sc-eQTL 7.09e-01 0.0658 0.176 0.072 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 5.91e-01 -0.102 0.19 0.073 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 4.13e-01 0.121 0.148 0.073 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 4.55e-01 0.12 0.161 0.073 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 622337 sc-eQTL 9.24e-01 -0.014 0.147 0.073 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 7.73e-01 0.0431 0.149 0.073 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0274 0.163 0.073 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 9.95e-01 0.00127 0.192 0.073 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 622360 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0286 0.148 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 9.53e-02 0.247 0.148 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 8.17e-03 0.27 0.101 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 1.77e-01 -0.178 0.132 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 6.02e-01 0.0716 0.137 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0725 0.0949 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 22910 sc-eQTL 4.91e-02 0.308 0.156 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 9.98e-01 0.000288 0.133 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 43546 sc-eQTL 2.31e-01 0.186 0.155 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 5.60e-01 0.0805 0.138 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 3.64e-01 0.0869 0.0956 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 2.15e-01 -0.16 0.129 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 6.93e-01 0.0435 0.11 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00831 0.0773 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 22910 sc-eQTL 8.63e-01 0.028 0.162 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0105 0.117 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 43546 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0678 0.138 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00508 0.113 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 2.38e-01 0.0993 0.0839 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 1.68e-01 -0.14 0.101 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 622337 sc-eQTL 1.38e-01 -0.219 0.147 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0289 0.122 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0545 0.108 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 9.54e-01 0.0068 0.119 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 622360 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00708 0.159 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 3.14e-01 0.153 0.151 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 2.53e-01 0.0924 0.0806 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 4.11e-01 -0.106 0.129 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 622337 sc-eQTL 1.09e-02 -0.364 0.142 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 7.03e-01 0.0342 0.0895 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 7.84e-01 0.036 0.131 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 9.92e-01 0.00118 0.113 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 622360 sc-eQTL 4.42e-01 -0.122 0.159 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 541399 sc-eQTL 8.37e-01 0.0293 0.142 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 911377 sc-eQTL 6.86e-02 0.224 0.122 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 179828 sc-eQTL 1.47e-01 -0.176 0.12 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 326647 sc-eQTL 2.89e-01 -0.125 0.118 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 286163 sc-eQTL 6.59e-01 0.0338 0.0763 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -59740 sc-eQTL 1.96e-01 0.143 0.11 0.082 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000225177 \N 622360 3.92e-07 1.59e-07 5.35e-08 2.27e-07 9.87e-08 8.33e-08 2.16e-07 5.62e-08 1.54e-07 8.53e-08 1.66e-07 1.2e-07 2.24e-07 8e-08 5.82e-08 7.89e-08 4.31e-08 1.72e-07 6.92e-08 5.46e-08 1.22e-07 1.39e-07 1.68e-07 3.4e-08 2.28e-07 1.26e-07 1.12e-07 1.04e-07 1.31e-07 1.06e-07 1.26e-07 3.93e-08 3.59e-08 9.8e-08 5.16e-08 3.05e-08 4.41e-08 8.63e-08 6.41e-08 4.24e-08 6.28e-08 1.62e-07 5.27e-08 1.3e-08 2.64e-08 1.65e-08 9.29e-08 1.9e-09 5.02e-08