logo

Genes within 1Mb (chr6:139301798:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 2.81e-01 0.13 0.121 0.096 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 3.05e-01 0.0946 0.0921 0.096 B L1
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 3.55e-01 -0.109 0.117 0.096 B L1
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 3.15e-01 0.105 0.104 0.096 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0225 0.0611 0.096 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 9800 sc-eQTL 2.24e-01 0.182 0.149 0.096 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 6.98e-02 0.17 0.0935 0.096 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 30436 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0547 0.105 0.096 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0879 0.137 0.096 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 1.64e-01 0.128 0.0913 0.096 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0982 0.114 0.096 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 6.38e-01 0.0423 0.0896 0.096 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 8.81e-01 0.00983 0.0657 0.096 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 9.45e-02 0.187 0.111 0.096 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 62145 sc-eQTL 5.95e-01 0.0589 0.111 0.096 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0719 0.148 0.096 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 6.09e-01 0.0496 0.0969 0.096 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0958 0.106 0.096 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0445 0.0997 0.096 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 6.21e-01 0.0281 0.0567 0.096 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 2.10e-02 0.247 0.106 0.096 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 62145 sc-eQTL 1.48e-01 -0.189 0.13 0.096 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 7.04e-01 0.0548 0.144 0.101 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 2.46e-01 0.117 0.101 0.101 DC L1
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 2.13e-01 -0.147 0.118 0.101 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 609227 sc-eQTL 9.12e-01 0.0145 0.132 0.101 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 5.64e-01 0.0674 0.117 0.101 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 8.70e-01 0.0188 0.114 0.101 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 7.50e-01 0.0433 0.136 0.101 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 609250 sc-eQTL 1.42e-02 -0.336 0.136 0.101 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0291 0.106 0.096 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 2.52e-01 0.0841 0.0732 0.096 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 2.98e-01 -0.101 0.0965 0.096 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 609227 sc-eQTL 8.89e-02 -0.235 0.138 0.096 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 7.17e-01 0.0294 0.0811 0.096 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0524 0.106 0.096 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 9.32e-01 0.00959 0.112 0.096 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 609250 sc-eQTL 1.41e-01 -0.212 0.143 0.096 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 3.45e-01 0.123 0.13 0.097 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 4.97e-02 0.224 0.114 0.097 NK L1
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 2.30e-01 -0.135 0.112 0.097 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0958 0.107 0.097 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 7.10e-01 0.0291 0.0781 0.097 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 6.12e-02 0.194 0.103 0.097 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0146 0.157 0.096 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 9.20e-01 0.0102 0.101 0.096 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 9.50e-01 0.00718 0.113 0.096 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0181 0.122 0.096 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00729 0.0798 0.096 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 3.16e-02 0.2 0.0924 0.096 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 1.22e-01 0.264 0.17 0.102 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 1.04e-01 0.243 0.149 0.102 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 4.77e-01 -0.116 0.163 0.102 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 5.42e-01 0.104 0.17 0.102 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 7.74e-02 -0.271 0.153 0.102 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 9800 sc-eQTL 8.74e-01 -0.021 0.132 0.102 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 9.10e-01 0.0189 0.166 0.102 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 30436 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0123 0.166 0.102 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 6.41e-01 0.0696 0.149 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 7.08e-02 0.186 0.102 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0246 0.129 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 8.43e-01 0.0277 0.139 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 4.44e-02 0.237 0.117 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 9800 sc-eQTL 1.02e-01 0.237 0.144 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 3.61e-01 0.122 0.133 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 30436 sc-eQTL 8.83e-01 0.0213 0.145 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 7.87e-01 -0.041 0.151 0.097 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 2.37e-01 0.135 0.114 0.097 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 6.85e-01 0.0531 0.131 0.097 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 4.43e-01 0.109 0.142 0.097 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0102 0.112 0.097 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 9800 sc-eQTL 6.09e-01 0.0734 0.143 0.097 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 3.70e-01 0.118 0.131 0.097 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 30436 sc-eQTL 5.41e-01 0.0989 0.161 0.097 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 6.74e-01 0.0606 0.144 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 4.05e-01 0.0844 0.101 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 1.79e-01 -0.169 0.125 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 4.41e-01 0.0897 0.116 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 9.33e-01 0.0069 0.0814 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 9800 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0448 0.152 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 2.62e-01 0.124 0.111 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 30436 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0328 0.145 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 2.63e-01 0.157 0.14 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0474 0.0959 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 1.96e-01 -0.171 0.132 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 4.80e-01 0.0891 0.126 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0592 0.0927 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 9800 sc-eQTL 5.03e-02 0.287 0.146 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0252 0.15 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 30436 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0648 0.138 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 3.72e-01 0.13 0.146 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 6.95e-01 0.0494 0.126 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0759 0.147 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 3.34e-01 -0.138 0.143 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 6.67e-01 0.0561 0.13 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 6.38e-02 0.242 0.13 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 62145 sc-eQTL 5.60e-01 0.0789 0.135 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0882 0.143 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 1.55e-01 0.127 0.0889 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 2.81e-01 -0.12 0.111 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 6.97e-01 0.0384 0.0987 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0331 0.0664 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 3.36e-01 0.109 0.113 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 62145 sc-eQTL 4.02e-01 0.0957 0.114 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 4.77e-02 -0.276 0.138 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 1.32e-01 0.156 0.103 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0687 0.112 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0466 0.106 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0118 0.0815 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 1.57e-01 0.171 0.121 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 62145 sc-eQTL 4.11e-01 -0.108 0.131 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 5.65e-01 0.0909 0.158 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 2.02e-01 0.137 0.107 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 1.25e-01 -0.189 0.122 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 3.72e-01 0.12 0.134 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 2.19e-01 -0.117 0.0952 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 3.24e-02 0.267 0.124 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 62145 sc-eQTL 9.75e-01 0.00417 0.131 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 5.55e-01 0.0932 0.158 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 2.30e-01 0.135 0.112 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0738 0.115 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0261 0.123 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 9.77e-01 0.00282 0.0995 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 2.11e-01 0.145 0.115 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 62145 sc-eQTL 9.90e-01 0.00171 0.139 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 4.73e-01 -0.11 0.153 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 9.68e-01 0.00398 0.0979 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0959 0.118 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 9.00e-01 0.0149 0.119 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 4.63e-01 0.0456 0.0621 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 2.00e-02 0.291 0.124 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 62145 sc-eQTL 4.28e-01 -0.114 0.144 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 1.19e-01 0.264 0.169 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0214 0.119 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0838 0.124 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 9.14e-01 -0.014 0.129 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 4.46e-01 0.0981 0.128 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 5.30e-02 0.255 0.131 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 62145 sc-eQTL 1.07e-01 -0.224 0.139 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 4.32e-01 -0.128 0.163 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 3.37e-01 0.143 0.148 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 2.87e-01 -0.163 0.152 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 4.13e-02 -0.323 0.157 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0615 0.123 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 1.99e-02 0.308 0.131 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 62145 sc-eQTL 4.32e-01 -0.119 0.151 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 6.83e-01 -0.069 0.168 0.097 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00197 0.117 0.097 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000494 0.128 0.097 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0556 0.138 0.097 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0587 0.101 0.097 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 7.53e-02 0.212 0.119 0.097 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 4.53e-01 -0.123 0.163 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 8.94e-01 0.0185 0.139 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 6.77e-01 0.0619 0.148 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 6.76e-01 0.0579 0.138 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 4.56e-01 -0.095 0.127 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 2.85e-01 0.146 0.136 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 4.00e-01 0.12 0.142 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 1.86e-02 0.295 0.124 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0637 0.122 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 3.68e-01 -0.104 0.116 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 5.59e-01 0.0458 0.0783 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 1.77e-01 0.141 0.104 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0855 0.167 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 4.37e-01 0.111 0.143 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 1.17e-01 -0.245 0.156 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 3.48e-01 0.145 0.154 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 3.52e-01 0.118 0.127 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 2.83e-03 0.402 0.133 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 1.46e-01 0.215 0.147 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 1.40e-01 0.188 0.127 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 1.85e-01 -0.169 0.127 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 1.64e-01 -0.183 0.131 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 1.59e-01 -0.119 0.0842 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 1.13e-01 0.175 0.11 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 2.91e-01 -0.185 0.175 0.093 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 1.60e-01 0.219 0.155 0.093 PB L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 6.34e-01 0.0911 0.191 0.093 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 8.53e-01 0.0315 0.17 0.093 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 9.94e-01 0.000927 0.119 0.093 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 9800 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0506 0.173 0.093 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 8.64e-02 0.223 0.129 0.093 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 30436 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0586 0.175 0.093 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0416 0.16 0.098 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 2.44e-01 -0.149 0.127 0.098 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 8.98e-01 0.0162 0.126 0.098 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 4.03e-01 0.124 0.148 0.098 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 2.66e-01 -0.107 0.0956 0.098 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 5.13e-01 0.0748 0.114 0.098 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 9.97e-02 -0.247 0.149 0.096 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 2.52e-01 0.118 0.102 0.096 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0297 0.125 0.096 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0942 0.129 0.096 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 8.57e-02 0.189 0.109 0.096 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 9.61e-02 0.204 0.122 0.096 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 62145 sc-eQTL 2.36e-01 0.166 0.14 0.096 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0432 0.147 0.1 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 1.36e-01 0.156 0.104 0.1 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 2.84e-01 -0.149 0.139 0.1 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 609227 sc-eQTL 5.81e-01 0.0753 0.136 0.1 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 1.50e-01 0.226 0.156 0.1 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00369 0.129 0.1 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 2.57e-01 -0.154 0.136 0.1 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 609250 sc-eQTL 5.45e-02 -0.288 0.149 0.1 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0144 0.117 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 3.80e-01 0.0735 0.0836 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0863 0.0961 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 609227 sc-eQTL 9.96e-01 0.000678 0.14 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 7.33e-01 0.0427 0.125 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0153 0.105 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 5.98e-01 0.0581 0.11 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 609250 sc-eQTL 1.63e-01 -0.205 0.146 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 1.36e-01 -0.201 0.135 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 4.75e-01 0.0662 0.0925 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0574 0.114 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 609227 sc-eQTL 5.84e-02 -0.274 0.144 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 4.42e-01 -0.106 0.137 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 7.50e-01 0.0381 0.119 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 9.69e-01 0.00454 0.118 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 609250 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0184 0.159 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 7.52e-02 0.327 0.183 0.097 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 2.76e-01 0.192 0.175 0.097 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 7.05e-01 0.0666 0.175 0.097 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0367 0.181 0.097 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 8.28e-01 0.0296 0.137 0.097 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 2.34e-01 0.187 0.157 0.097 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 8.88e-01 -0.022 0.156 0.096 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 3.44e-01 0.0992 0.105 0.096 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 6.02e-01 -0.067 0.128 0.096 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 609227 sc-eQTL 2.25e-01 -0.171 0.141 0.096 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 3.39e-01 -0.14 0.146 0.096 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0621 0.133 0.096 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 7.69e-01 0.038 0.129 0.096 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 609250 sc-eQTL 1.66e-01 -0.219 0.158 0.096 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 1.51e-01 0.22 0.152 0.09 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00317 0.0914 0.09 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 3.11e-01 -0.142 0.14 0.09 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 609227 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0654 0.147 0.09 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 3.97e-01 0.0939 0.111 0.09 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 9.00e-01 0.0168 0.134 0.09 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0295 0.113 0.09 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 609250 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0853 0.163 0.09 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 3.27e-01 -0.174 0.177 0.093 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 9.30e-01 0.0122 0.138 0.093 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0571 0.151 0.093 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 609227 sc-eQTL 7.83e-01 0.0379 0.138 0.093 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 8.50e-01 0.0264 0.14 0.093 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 9.35e-01 0.0124 0.152 0.093 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 4.54e-01 0.135 0.179 0.093 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 609250 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0284 0.138 0.093 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 4.59e-01 0.105 0.142 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 1.19e-02 0.245 0.0967 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0197 0.126 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 2.78e-01 0.142 0.13 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 6.24e-01 0.0445 0.0906 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 9800 sc-eQTL 9.77e-02 0.248 0.149 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 1.21e-01 0.197 0.127 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 30436 sc-eQTL 5.67e-01 0.0849 0.148 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 4.80e-01 0.0946 0.134 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 8.35e-01 0.0194 0.0929 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 1.90e-01 -0.164 0.125 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 4.08e-01 0.0885 0.107 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 6.91e-01 0.0298 0.0749 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 9800 sc-eQTL 3.46e-01 0.148 0.157 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 4.54e-01 0.0854 0.114 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 30436 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0691 0.134 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 1.63e-01 -0.15 0.107 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 5.25e-01 0.0511 0.0802 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0888 0.0964 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 609227 sc-eQTL 3.86e-01 -0.123 0.141 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00328 0.116 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00246 0.103 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 7.70e-01 0.0331 0.113 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 609250 sc-eQTL 3.32e-01 -0.147 0.151 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 1.66e-01 0.2 0.144 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 9.16e-01 0.00812 0.0772 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 5.39e-01 -0.076 0.123 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 609227 sc-eQTL 8.54e-02 -0.236 0.136 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 9.09e-01 0.00974 0.0855 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0305 0.125 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0141 0.108 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 609250 sc-eQTL 5.62e-02 -0.289 0.15 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 528289 sc-eQTL 4.05e-01 0.113 0.135 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 898267 sc-eQTL 4.94e-02 0.23 0.116 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 166718 sc-eQTL 9.91e-02 -0.19 0.115 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 313537 sc-eQTL 3.47e-01 -0.106 0.112 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 273053 sc-eQTL 7.37e-01 0.0244 0.0727 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -72850 sc-eQTL 9.67e-02 0.174 0.104 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000279968 GVQW2 528146 eQTL 0.0373 -0.193 0.0925 0.0 0.0 0.0667

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000225177 \N 609250 4.21e-07 3.35e-07 6.57e-08 2.41e-07 1.03e-07 1.5e-07 2.63e-07 5.89e-08 1.75e-07 1.05e-07 2.18e-07 1.31e-07 3.6e-07 8.42e-08 7.79e-08 8.71e-08 5.57e-08 2.15e-07 7.76e-08 6.29e-08 1.23e-07 1.76e-07 1.81e-07 4.17e-08 2.48e-07 1.51e-07 1.19e-07 1.28e-07 1.32e-07 1.06e-07 1.39e-07 4.71e-08 3.13e-08 1.02e-07 1.33e-07 2.68e-08 5.76e-08 7.51e-08 4.99e-08 7.67e-08 5.39e-08 3.27e-07 3.99e-08 1.72e-08 3.87e-08 9.44e-09 9.96e-08 2.2e-09 4.52e-08