logo

Genes within 1Mb (chr6:139299202:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 5.93e-01 0.064 0.12 0.1 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 2.55e-01 0.104 0.0911 0.1 B L1
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 2.69e-01 -0.129 0.116 0.1 B L1
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 2.68e-01 0.114 0.103 0.1 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 6.43e-01 -0.028 0.0604 0.1 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 7204 sc-eQTL 2.98e-01 0.154 0.148 0.1 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 8.45e-02 0.16 0.0926 0.1 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 27840 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0745 0.104 0.1 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0669 0.134 0.1 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 1.27e-01 0.137 0.0894 0.1 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 2.86e-01 -0.119 0.111 0.1 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 5.16e-01 0.0571 0.0877 0.1 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 8.18e-01 0.0149 0.0644 0.1 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 5.94e-02 0.207 0.109 0.1 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 59549 sc-eQTL 7.26e-01 0.038 0.108 0.1 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 4.58e-01 -0.108 0.145 0.1 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 5.93e-01 0.051 0.0953 0.1 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 2.65e-01 -0.116 0.104 0.1 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0357 0.098 0.1 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 6.26e-01 0.0273 0.0558 0.1 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 1.88e-02 0.248 0.105 0.1 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 59549 sc-eQTL 1.04e-01 -0.209 0.128 0.1 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 9.57e-01 0.0077 0.142 0.106 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 1.14e-01 0.157 0.0992 0.106 DC L1
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 2.21e-01 -0.143 0.117 0.106 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 606631 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0161 0.13 0.106 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 4.63e-01 0.0846 0.115 0.106 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 6.42e-01 0.0525 0.113 0.106 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 7.82e-01 0.0371 0.134 0.106 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 606654 sc-eQTL 5.71e-03 -0.373 0.134 0.106 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0181 0.105 0.1 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 2.23e-01 0.0884 0.0722 0.1 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 2.83e-01 -0.103 0.0954 0.1 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 606631 sc-eQTL 1.22e-01 -0.211 0.136 0.1 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 5.49e-01 0.0481 0.0801 0.1 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0503 0.104 0.1 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 9.94e-01 0.000872 0.11 0.1 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 606654 sc-eQTL 1.59e-01 -0.2 0.142 0.1 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 3.58e-01 0.117 0.127 0.101 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 3.04e-02 0.242 0.111 0.101 NK L1
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 2.27e-01 -0.133 0.11 0.101 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0953 0.105 0.101 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 5.52e-01 0.0457 0.0766 0.101 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 6.47e-02 0.188 0.101 0.101 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 9.39e-01 0.0119 0.155 0.1 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 7.97e-01 0.0257 0.0999 0.1 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 8.34e-01 0.0235 0.112 0.1 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 8.79e-01 0.0183 0.12 0.1 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 9.49e-01 0.0051 0.0789 0.1 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 5.88e-02 0.174 0.0915 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 2.28e-01 0.202 0.167 0.107 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 8.33e-02 0.254 0.146 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0796 0.16 0.107 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 6.46e-01 0.0771 0.168 0.107 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 1.70e-01 -0.208 0.151 0.107 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 7204 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0216 0.13 0.107 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 7.38e-01 0.0546 0.163 0.107 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 27840 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0473 0.163 0.107 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 8.82e-01 0.0218 0.146 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 7.23e-02 0.181 0.1 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0582 0.126 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 8.50e-01 0.0259 0.136 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 3.92e-02 0.239 0.115 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 7204 sc-eQTL 1.13e-01 0.225 0.142 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 5.65e-01 0.0754 0.131 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 27840 sc-eQTL 9.85e-01 0.00263 0.142 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0706 0.149 0.101 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 2.72e-01 0.123 0.112 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 8.26e-01 0.0284 0.129 0.101 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 4.21e-01 0.113 0.14 0.101 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000824 0.111 0.101 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 7204 sc-eQTL 4.47e-01 0.108 0.141 0.101 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 4.31e-01 0.102 0.13 0.101 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 27840 sc-eQTL 6.60e-01 0.0701 0.159 0.101 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 9.12e-01 0.0157 0.142 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 4.00e-01 0.0841 0.0997 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 2.03e-01 -0.157 0.123 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 4.59e-01 0.0849 0.114 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 9.15e-01 0.00852 0.0801 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 7204 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0645 0.15 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 3.77e-01 0.0965 0.109 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 27840 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0488 0.143 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 4.29e-01 0.11 0.139 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 5.14e-01 -0.062 0.0948 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 1.16e-01 -0.205 0.13 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 5.19e-01 0.0804 0.124 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 3.60e-01 -0.084 0.0915 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 7204 sc-eQTL 4.37e-02 0.292 0.144 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 7.47e-01 0.0478 0.148 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 27840 sc-eQTL 6.60e-01 -0.06 0.136 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 2.70e-01 0.159 0.143 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 5.40e-01 0.0761 0.124 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0465 0.145 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0942 0.141 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 5.44e-01 0.0779 0.128 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 7.44e-02 0.23 0.128 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 59549 sc-eQTL 5.47e-01 0.0803 0.133 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0586 0.14 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 1.35e-01 0.13 0.0869 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 2.46e-01 -0.126 0.109 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 7.58e-01 0.0298 0.0966 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0394 0.065 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 2.26e-01 0.134 0.11 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 59549 sc-eQTL 4.00e-01 0.094 0.111 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 4.39e-02 -0.276 0.136 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 1.03e-01 0.166 0.102 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 4.72e-01 -0.079 0.11 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0177 0.104 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 9.14e-01 0.00867 0.0801 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 9.16e-02 0.2 0.118 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 59549 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0948 0.128 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 4.96e-01 0.106 0.156 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 1.64e-01 0.148 0.106 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 1.13e-01 -0.192 0.12 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 4.68e-01 0.0959 0.132 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 2.42e-01 -0.11 0.0939 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 2.67e-02 0.273 0.122 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 59549 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0132 0.129 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 6.19e-01 0.0771 0.155 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 2.59e-01 0.125 0.11 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 3.51e-01 -0.105 0.113 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0163 0.121 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 9.74e-01 0.00324 0.0977 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 3.15e-01 0.114 0.113 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 59549 sc-eQTL 9.36e-01 -0.011 0.136 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 3.67e-01 -0.136 0.15 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 8.92e-01 0.0131 0.0962 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 3.07e-01 -0.119 0.116 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 9.03e-01 0.0142 0.116 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 5.86e-01 0.0333 0.061 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 1.55e-02 0.297 0.122 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 59549 sc-eQTL 3.45e-01 -0.133 0.141 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 8.91e-02 0.283 0.165 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00595 0.117 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0924 0.122 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0152 0.127 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 6.62e-01 0.0552 0.126 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 6.91e-02 0.235 0.129 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 59549 sc-eQTL 8.98e-02 -0.232 0.136 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 2.98e-01 -0.168 0.162 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 3.22e-01 0.146 0.147 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 3.71e-01 -0.136 0.151 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 4.29e-02 -0.318 0.156 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0724 0.122 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 2.04e-02 0.305 0.13 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 59549 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0941 0.15 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0339 0.166 0.102 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 7.39e-01 0.0385 0.115 0.102 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0116 0.126 0.102 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00907 0.136 0.102 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0451 0.1 0.102 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 8.58e-02 0.202 0.117 0.102 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 4.07e-01 -0.133 0.161 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 5.22e-01 0.0878 0.137 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 8.55e-01 0.0267 0.146 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 6.69e-01 0.0582 0.136 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0948 0.125 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 3.90e-01 0.115 0.134 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 3.81e-01 0.121 0.138 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 1.73e-02 0.291 0.121 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 5.92e-01 -0.064 0.119 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0932 0.113 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 4.87e-01 0.0532 0.0765 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 1.90e-01 0.134 0.102 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0556 0.166 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 3.45e-01 0.133 0.141 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 1.43e-01 -0.226 0.154 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 4.38e-01 0.119 0.153 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 1.37e-01 0.187 0.125 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 2.66e-03 0.399 0.131 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 1.75e-01 0.197 0.145 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 9.13e-02 0.211 0.124 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 1.02e-01 -0.204 0.124 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 1.10e-01 -0.206 0.128 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0862 0.083 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 1.07e-01 0.175 0.108 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 1.62e-01 -0.24 0.171 0.1 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 3.03e-01 0.157 0.152 0.1 PB L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0128 0.187 0.1 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 8.31e-01 0.0357 0.166 0.1 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 9.42e-01 0.0085 0.116 0.1 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 7204 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0665 0.17 0.1 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 7.33e-02 0.228 0.126 0.1 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 27840 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00705 0.172 0.1 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 9.66e-01 0.00679 0.159 0.102 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 2.44e-01 -0.147 0.126 0.102 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 7.74e-01 0.0359 0.125 0.102 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 4.91e-01 0.101 0.147 0.102 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0853 0.0947 0.102 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 5.62e-01 0.0657 0.113 0.102 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 6.07e-02 -0.278 0.147 0.1 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 2.28e-01 0.122 0.101 0.1 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0379 0.123 0.1 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 4.29e-01 -0.101 0.128 0.1 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 7.33e-02 0.194 0.108 0.1 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 7.20e-02 0.218 0.121 0.1 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 59549 sc-eQTL 2.41e-01 0.163 0.138 0.1 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0985 0.144 0.105 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 5.46e-02 0.199 0.103 0.105 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 2.52e-01 -0.157 0.137 0.105 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 606631 sc-eQTL 7.97e-01 0.0347 0.135 0.105 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 1.30e-01 0.234 0.154 0.105 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 7.93e-01 0.0333 0.127 0.105 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 2.27e-01 -0.162 0.134 0.105 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 606654 sc-eQTL 3.31e-02 -0.315 0.147 0.105 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0092 0.115 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 3.31e-01 0.0803 0.0824 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 3.44e-01 -0.09 0.0948 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 606631 sc-eQTL 8.33e-01 0.0292 0.138 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 5.84e-01 0.0678 0.123 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0207 0.104 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 6.60e-01 0.0478 0.109 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 606654 sc-eQTL 2.06e-01 -0.183 0.144 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 2.28e-01 -0.161 0.133 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 3.29e-01 0.0893 0.0912 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0595 0.113 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 606631 sc-eQTL 6.72e-02 -0.261 0.142 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 3.66e-01 -0.122 0.135 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 6.83e-01 0.0481 0.118 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 9.90e-01 0.00143 0.116 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 606654 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0382 0.157 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 1.14e-01 0.283 0.178 0.103 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 2.88e-01 0.182 0.171 0.103 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 6.61e-01 0.075 0.171 0.103 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 9.08e-01 0.0204 0.177 0.103 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 7.76e-01 0.0379 0.133 0.103 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 3.88e-01 0.133 0.153 0.103 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0838 0.154 0.1 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 2.73e-01 0.113 0.103 0.1 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0726 0.126 0.1 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 606631 sc-eQTL 2.82e-01 -0.15 0.139 0.1 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 4.31e-01 -0.113 0.144 0.1 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0388 0.131 0.1 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 8.49e-01 0.0244 0.128 0.1 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 606654 sc-eQTL 2.03e-01 -0.199 0.156 0.1 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 2.06e-01 0.191 0.15 0.095 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0153 0.09 0.095 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 1.93e-01 -0.179 0.137 0.095 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 606631 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0576 0.145 0.095 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 2.94e-01 0.115 0.109 0.095 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 8.96e-01 0.0173 0.132 0.095 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0224 0.112 0.095 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 606654 sc-eQTL 5.13e-01 -0.105 0.161 0.095 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 2.63e-01 -0.194 0.173 0.099 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 6.37e-01 0.0638 0.135 0.099 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 6.11e-01 -0.075 0.147 0.099 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 606631 sc-eQTL 8.52e-01 0.0251 0.134 0.099 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 5.89e-01 0.0738 0.136 0.099 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00485 0.149 0.099 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 3.47e-01 0.165 0.175 0.099 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 606654 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0464 0.135 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 6.82e-01 0.0573 0.14 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 1.09e-02 0.245 0.0952 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0545 0.124 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 2.57e-01 0.146 0.128 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 6.49e-01 0.0406 0.0892 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 7204 sc-eQTL 7.28e-02 0.265 0.147 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 1.81e-01 0.168 0.125 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 27840 sc-eQTL 7.71e-01 0.0425 0.146 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 7.17e-01 0.0479 0.132 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 8.12e-01 0.0218 0.0916 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 1.63e-01 -0.172 0.123 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 4.39e-01 0.0816 0.105 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 8.36e-01 0.0153 0.0739 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 7204 sc-eQTL 3.94e-01 0.132 0.154 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 4.49e-01 0.0851 0.112 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 27840 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0869 0.132 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 2.23e-01 -0.13 0.106 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 4.40e-01 0.0612 0.0791 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0943 0.0952 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 606631 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0934 0.139 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 9.71e-01 0.00419 0.115 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 9.72e-01 0.00352 0.102 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 8.37e-01 0.023 0.112 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 606654 sc-eQTL 3.50e-01 -0.14 0.149 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 2.59e-01 0.161 0.142 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 8.21e-01 0.0173 0.0763 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 3.82e-01 -0.107 0.122 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 606631 sc-eQTL 9.21e-02 -0.228 0.135 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 6.78e-01 0.0351 0.0844 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0193 0.124 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0164 0.106 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 606654 sc-eQTL 5.05e-02 -0.292 0.149 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 525693 sc-eQTL 4.04e-01 0.111 0.132 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 895671 sc-eQTL 3.44e-02 0.242 0.114 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 164122 sc-eQTL 1.01e-01 -0.185 0.112 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 310941 sc-eQTL 3.10e-01 -0.112 0.11 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 270457 sc-eQTL 5.20e-01 0.046 0.0712 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -75446 sc-eQTL 9.92e-02 0.17 0.102 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000225177 \N 606654 3.02e-07 1.56e-07 5.49e-08 2.05e-07 9.21e-08 9.9e-08 1.67e-07 5.19e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.57e-07 8.68e-08 2.13e-07 8e-08 6.25e-08 7.36e-08 4.17e-08 1.44e-07 5.97e-08 4.04e-08 1.22e-07 1.24e-07 1.44e-07 3.79e-08 1.68e-07 1.22e-07 1.07e-07 9.61e-08 1.23e-07 1.07e-07 1.07e-07 3.87e-08 3.56e-08 8.89e-08 4.92e-08 2.95e-08 5.51e-08 8.93e-08 6.54e-08 3.18e-08 4.83e-08 1.6e-07 5.39e-08 1.86e-08 7.79e-08 1.92e-08 1.25e-07 3.95e-09 4.85e-08