logo

Genes within 1Mb (chr6:139296558:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 5.93e-01 0.064 0.12 0.1 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 2.55e-01 0.104 0.0911 0.1 B L1
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 2.69e-01 -0.129 0.116 0.1 B L1
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 2.68e-01 0.114 0.103 0.1 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 6.43e-01 -0.028 0.0604 0.1 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 4560 sc-eQTL 2.98e-01 0.154 0.148 0.1 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 8.45e-02 0.16 0.0926 0.1 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 25196 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0745 0.104 0.1 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0669 0.134 0.1 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 1.27e-01 0.137 0.0894 0.1 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 2.86e-01 -0.119 0.111 0.1 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 5.16e-01 0.0571 0.0877 0.1 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 8.18e-01 0.0149 0.0644 0.1 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 5.94e-02 0.207 0.109 0.1 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 56905 sc-eQTL 7.26e-01 0.038 0.108 0.1 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 4.58e-01 -0.108 0.145 0.1 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 5.93e-01 0.051 0.0953 0.1 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 2.65e-01 -0.116 0.104 0.1 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0357 0.098 0.1 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 6.26e-01 0.0273 0.0558 0.1 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 1.88e-02 0.248 0.105 0.1 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 56905 sc-eQTL 1.04e-01 -0.209 0.128 0.1 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 9.57e-01 0.0077 0.142 0.106 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 1.14e-01 0.157 0.0992 0.106 DC L1
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 2.21e-01 -0.143 0.117 0.106 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 603987 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0161 0.13 0.106 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 4.63e-01 0.0846 0.115 0.106 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 6.42e-01 0.0525 0.113 0.106 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 7.82e-01 0.0371 0.134 0.106 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 604010 sc-eQTL 5.71e-03 -0.373 0.134 0.106 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0181 0.105 0.1 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 2.23e-01 0.0884 0.0722 0.1 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 2.83e-01 -0.103 0.0954 0.1 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 603987 sc-eQTL 1.22e-01 -0.211 0.136 0.1 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 5.49e-01 0.0481 0.0801 0.1 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0503 0.104 0.1 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 9.94e-01 0.000872 0.11 0.1 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 604010 sc-eQTL 1.59e-01 -0.2 0.142 0.1 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 3.58e-01 0.117 0.127 0.101 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 3.04e-02 0.242 0.111 0.101 NK L1
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 2.27e-01 -0.133 0.11 0.101 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0953 0.105 0.101 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 5.52e-01 0.0457 0.0766 0.101 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 6.47e-02 0.188 0.101 0.101 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 9.39e-01 0.0119 0.155 0.1 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 7.97e-01 0.0257 0.0999 0.1 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 8.34e-01 0.0235 0.112 0.1 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 8.79e-01 0.0183 0.12 0.1 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 9.49e-01 0.0051 0.0789 0.1 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 5.88e-02 0.174 0.0915 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 2.28e-01 0.202 0.167 0.107 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 8.33e-02 0.254 0.146 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0796 0.16 0.107 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 6.46e-01 0.0771 0.168 0.107 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 1.70e-01 -0.208 0.151 0.107 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 4560 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0216 0.13 0.107 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 7.38e-01 0.0546 0.163 0.107 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 25196 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0473 0.163 0.107 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 8.82e-01 0.0218 0.146 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 7.23e-02 0.181 0.1 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0582 0.126 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 8.50e-01 0.0259 0.136 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 3.92e-02 0.239 0.115 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 4560 sc-eQTL 1.13e-01 0.225 0.142 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 5.65e-01 0.0754 0.131 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 25196 sc-eQTL 9.85e-01 0.00263 0.142 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0706 0.149 0.101 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 2.72e-01 0.123 0.112 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 8.26e-01 0.0284 0.129 0.101 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 4.21e-01 0.113 0.14 0.101 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000824 0.111 0.101 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 4560 sc-eQTL 4.47e-01 0.108 0.141 0.101 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 4.31e-01 0.102 0.13 0.101 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 25196 sc-eQTL 6.60e-01 0.0701 0.159 0.101 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 9.12e-01 0.0157 0.142 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 4.00e-01 0.0841 0.0997 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 2.03e-01 -0.157 0.123 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 4.59e-01 0.0849 0.114 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 9.15e-01 0.00852 0.0801 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 4560 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0645 0.15 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 3.77e-01 0.0965 0.109 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 25196 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0488 0.143 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 4.29e-01 0.11 0.139 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 5.14e-01 -0.062 0.0948 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 1.16e-01 -0.205 0.13 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 5.19e-01 0.0804 0.124 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 3.60e-01 -0.084 0.0915 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 4560 sc-eQTL 4.37e-02 0.292 0.144 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 7.47e-01 0.0478 0.148 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 25196 sc-eQTL 6.60e-01 -0.06 0.136 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 2.70e-01 0.159 0.143 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 5.40e-01 0.0761 0.124 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0465 0.145 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0942 0.141 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 5.44e-01 0.0779 0.128 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 7.44e-02 0.23 0.128 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 56905 sc-eQTL 5.47e-01 0.0803 0.133 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0586 0.14 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 1.35e-01 0.13 0.0869 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 2.46e-01 -0.126 0.109 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 7.58e-01 0.0298 0.0966 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0394 0.065 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 2.26e-01 0.134 0.11 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 56905 sc-eQTL 4.00e-01 0.094 0.111 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 4.39e-02 -0.276 0.136 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 1.03e-01 0.166 0.102 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 4.72e-01 -0.079 0.11 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0177 0.104 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 9.14e-01 0.00867 0.0801 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 9.16e-02 0.2 0.118 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 56905 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0948 0.128 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 4.96e-01 0.106 0.156 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 1.64e-01 0.148 0.106 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 1.13e-01 -0.192 0.12 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 4.68e-01 0.0959 0.132 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 2.42e-01 -0.11 0.0939 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 2.67e-02 0.273 0.122 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 56905 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0132 0.129 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 6.19e-01 0.0771 0.155 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 2.59e-01 0.125 0.11 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 3.51e-01 -0.105 0.113 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0163 0.121 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 9.74e-01 0.00324 0.0977 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 3.15e-01 0.114 0.113 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 56905 sc-eQTL 9.36e-01 -0.011 0.136 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 3.67e-01 -0.136 0.15 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 8.92e-01 0.0131 0.0962 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 3.07e-01 -0.119 0.116 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 9.03e-01 0.0142 0.116 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 5.86e-01 0.0333 0.061 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 1.55e-02 0.297 0.122 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 56905 sc-eQTL 3.45e-01 -0.133 0.141 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 8.91e-02 0.283 0.165 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00595 0.117 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0924 0.122 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0152 0.127 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 6.62e-01 0.0552 0.126 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 6.91e-02 0.235 0.129 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 56905 sc-eQTL 8.98e-02 -0.232 0.136 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 2.98e-01 -0.168 0.162 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 3.22e-01 0.146 0.147 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 3.71e-01 -0.136 0.151 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 4.29e-02 -0.318 0.156 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0724 0.122 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 2.04e-02 0.305 0.13 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 56905 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0941 0.15 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0339 0.166 0.102 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 7.39e-01 0.0385 0.115 0.102 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0116 0.126 0.102 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00907 0.136 0.102 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0451 0.1 0.102 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 8.58e-02 0.202 0.117 0.102 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 4.07e-01 -0.133 0.161 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 5.22e-01 0.0878 0.137 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 8.55e-01 0.0267 0.146 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 6.69e-01 0.0582 0.136 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0948 0.125 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 3.90e-01 0.115 0.134 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 3.81e-01 0.121 0.138 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 1.73e-02 0.291 0.121 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 5.92e-01 -0.064 0.119 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0932 0.113 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 4.87e-01 0.0532 0.0765 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 1.90e-01 0.134 0.102 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0556 0.166 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 3.45e-01 0.133 0.141 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 1.43e-01 -0.226 0.154 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 4.38e-01 0.119 0.153 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 1.37e-01 0.187 0.125 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 2.66e-03 0.399 0.131 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 1.75e-01 0.197 0.145 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 9.13e-02 0.211 0.124 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 1.02e-01 -0.204 0.124 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 1.10e-01 -0.206 0.128 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0862 0.083 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 1.07e-01 0.175 0.108 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 1.62e-01 -0.24 0.171 0.1 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 3.03e-01 0.157 0.152 0.1 PB L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0128 0.187 0.1 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 8.31e-01 0.0357 0.166 0.1 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 9.42e-01 0.0085 0.116 0.1 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 4560 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0665 0.17 0.1 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 7.33e-02 0.228 0.126 0.1 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 25196 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00705 0.172 0.1 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 9.66e-01 0.00679 0.159 0.102 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 2.44e-01 -0.147 0.126 0.102 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 7.74e-01 0.0359 0.125 0.102 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 4.91e-01 0.101 0.147 0.102 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0853 0.0947 0.102 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 5.62e-01 0.0657 0.113 0.102 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 6.07e-02 -0.278 0.147 0.1 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 2.28e-01 0.122 0.101 0.1 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0379 0.123 0.1 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 4.29e-01 -0.101 0.128 0.1 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 7.33e-02 0.194 0.108 0.1 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 7.20e-02 0.218 0.121 0.1 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 56905 sc-eQTL 2.41e-01 0.163 0.138 0.1 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0985 0.144 0.105 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 5.46e-02 0.199 0.103 0.105 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 2.52e-01 -0.157 0.137 0.105 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 603987 sc-eQTL 7.97e-01 0.0347 0.135 0.105 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 1.30e-01 0.234 0.154 0.105 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 7.93e-01 0.0333 0.127 0.105 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 2.27e-01 -0.162 0.134 0.105 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 604010 sc-eQTL 3.31e-02 -0.315 0.147 0.105 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0092 0.115 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 3.31e-01 0.0803 0.0824 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 3.44e-01 -0.09 0.0948 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 603987 sc-eQTL 8.33e-01 0.0292 0.138 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 5.84e-01 0.0678 0.123 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0207 0.104 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 6.60e-01 0.0478 0.109 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 604010 sc-eQTL 2.06e-01 -0.183 0.144 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 2.28e-01 -0.161 0.133 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 3.29e-01 0.0893 0.0912 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0595 0.113 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 603987 sc-eQTL 6.72e-02 -0.261 0.142 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 3.66e-01 -0.122 0.135 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 6.83e-01 0.0481 0.118 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 9.90e-01 0.00143 0.116 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 604010 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0382 0.157 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 1.14e-01 0.283 0.178 0.103 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 2.88e-01 0.182 0.171 0.103 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 6.61e-01 0.075 0.171 0.103 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 9.08e-01 0.0204 0.177 0.103 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 7.76e-01 0.0379 0.133 0.103 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 3.88e-01 0.133 0.153 0.103 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0838 0.154 0.1 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 2.73e-01 0.113 0.103 0.1 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0726 0.126 0.1 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 603987 sc-eQTL 2.82e-01 -0.15 0.139 0.1 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 4.31e-01 -0.113 0.144 0.1 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0388 0.131 0.1 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 8.49e-01 0.0244 0.128 0.1 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 604010 sc-eQTL 2.03e-01 -0.199 0.156 0.1 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 2.06e-01 0.191 0.15 0.095 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0153 0.09 0.095 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 1.93e-01 -0.179 0.137 0.095 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 603987 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0576 0.145 0.095 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 2.94e-01 0.115 0.109 0.095 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 8.96e-01 0.0173 0.132 0.095 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0224 0.112 0.095 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 604010 sc-eQTL 5.13e-01 -0.105 0.161 0.095 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 2.63e-01 -0.194 0.173 0.099 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 6.37e-01 0.0638 0.135 0.099 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 6.11e-01 -0.075 0.147 0.099 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 603987 sc-eQTL 8.52e-01 0.0251 0.134 0.099 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 5.89e-01 0.0738 0.136 0.099 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00485 0.149 0.099 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 3.47e-01 0.165 0.175 0.099 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 604010 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0464 0.135 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 6.82e-01 0.0573 0.14 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 1.09e-02 0.245 0.0952 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0545 0.124 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 2.57e-01 0.146 0.128 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 6.49e-01 0.0406 0.0892 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 4560 sc-eQTL 7.28e-02 0.265 0.147 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 1.81e-01 0.168 0.125 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 25196 sc-eQTL 7.71e-01 0.0425 0.146 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 7.17e-01 0.0479 0.132 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 8.12e-01 0.0218 0.0916 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 1.63e-01 -0.172 0.123 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 4.39e-01 0.0816 0.105 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 8.36e-01 0.0153 0.0739 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 4560 sc-eQTL 3.94e-01 0.132 0.154 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 4.49e-01 0.0851 0.112 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 25196 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0869 0.132 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 2.23e-01 -0.13 0.106 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 4.40e-01 0.0612 0.0791 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0943 0.0952 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 603987 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0934 0.139 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 9.71e-01 0.00419 0.115 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 9.72e-01 0.00352 0.102 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 8.37e-01 0.023 0.112 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 604010 sc-eQTL 3.50e-01 -0.14 0.149 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 2.59e-01 0.161 0.142 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 8.21e-01 0.0173 0.0763 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 3.82e-01 -0.107 0.122 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 603987 sc-eQTL 9.21e-02 -0.228 0.135 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 6.78e-01 0.0351 0.0844 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0193 0.124 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0164 0.106 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 604010 sc-eQTL 5.05e-02 -0.292 0.149 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 523049 sc-eQTL 4.04e-01 0.111 0.132 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 893027 sc-eQTL 3.44e-02 0.242 0.114 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 161478 sc-eQTL 1.01e-01 -0.185 0.112 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 308297 sc-eQTL 3.10e-01 -0.112 0.11 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 267813 sc-eQTL 5.20e-01 0.046 0.0712 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -78090 sc-eQTL 9.92e-02 0.17 0.102 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000225177 \N 604010 2.95e-07 1.59e-07 7.16e-08 2.35e-07 1.1e-07 8.75e-08 1.99e-07 5.56e-08 1.44e-07 6.75e-08 1.62e-07 1.15e-07 2.05e-07 8.15e-08 5.69e-08 8.08e-08 4.31e-08 1.64e-07 7.27e-08 6.73e-08 1.26e-07 1.47e-07 1.58e-07 3.59e-08 1.98e-07 1.26e-07 1.29e-07 1.12e-07 1.34e-07 1.1e-07 1.09e-07 5.54e-08 4.23e-08 9.78e-08 5.24e-08 3.3e-08 5.54e-08 6e-08 5.84e-08 6.31e-08 5.39e-08 1.59e-07 3.37e-08 1.21e-08 3.71e-08 8.31e-09 7.92e-08 0.0 4.61e-08