Genes within 1Mb (chr6:139290606:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 4.98e-01 0.066 0.0973 0.139 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0289 0.0743 0.139 B L1
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00601 0.0947 0.139 B L1
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 4.22e-02 -0.169 0.0829 0.139 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 7.98e-02 -0.0859 0.0488 0.139 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -1392 sc-eQTL 1.81e-07 -0.609 0.113 0.139 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 7.94e-02 -0.133 0.0753 0.139 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 19244 sc-eQTL 2.85e-01 0.0903 0.0841 0.139 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 6.53e-02 0.195 0.105 0.139 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 6.16e-02 -0.133 0.0707 0.139 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0813 0.0884 0.139 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0241 0.0696 0.139 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0205 0.0511 0.139 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 1.94e-01 -0.113 0.0869 0.139 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 50953 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0205 0.086 0.139 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 5.96e-01 0.0614 0.116 0.139 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 1.50e-01 -0.109 0.0755 0.139 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0595 0.0828 0.139 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 8.81e-01 0.0117 0.078 0.139 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 1.27e-01 0.0677 0.0442 0.139 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 1.59e-01 -0.119 0.0839 0.139 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 50953 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0789 0.102 0.139 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0994 0.117 0.137 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 7.28e-01 0.0286 0.0822 0.137 DC L1
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0621 0.0962 0.137 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 598035 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0397 0.107 0.137 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 2.85e-01 -0.101 0.0946 0.137 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 5.80e-01 0.0514 0.0928 0.137 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 9.20e-01 0.0111 0.11 0.137 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 598058 sc-eQTL 6.08e-02 0.21 0.111 0.137 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 3.18e-01 0.0843 0.0842 0.139 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0575 0.0582 0.139 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 6.69e-01 0.0329 0.0769 0.139 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 598035 sc-eQTL 1.34e-01 0.165 0.11 0.139 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 6.49e-01 0.0294 0.0645 0.139 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 1.33e-02 0.207 0.0828 0.139 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 1.68e-01 0.122 0.0885 0.139 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 598058 sc-eQTL 9.41e-01 0.00849 0.115 0.139 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 7.62e-02 0.182 0.102 0.139 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 2.19e-01 -0.112 0.0905 0.139 NK L1
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0445 0.089 0.139 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0101 0.0848 0.139 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 2.15e-01 0.0767 0.0617 0.139 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 8.36e-01 0.0171 0.0823 0.139 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 2.47e-01 0.142 0.122 0.139 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0922 0.0789 0.139 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 3.20e-01 0.0882 0.0885 0.139 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 2.93e-01 -0.1 0.0952 0.139 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 9.63e-01 0.00293 0.0625 0.139 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 8.66e-01 0.0124 0.0732 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 3.21e-01 -0.131 0.132 0.148 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 5.89e-01 0.0628 0.116 0.148 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 1.14e-01 -0.199 0.125 0.148 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 3.22e-01 -0.131 0.132 0.148 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0465 0.12 0.148 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -1392 sc-eQTL 1.13e-01 -0.162 0.102 0.148 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 2.97e-02 -0.279 0.127 0.148 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 19244 sc-eQTL 2.92e-01 0.136 0.128 0.148 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 7.93e-01 0.0316 0.12 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 1.10e-01 -0.133 0.0828 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 6.12e-01 0.0529 0.104 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 4.50e-01 -0.085 0.112 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 6.10e-01 0.0489 0.0956 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -1392 sc-eQTL 6.07e-03 -0.319 0.115 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 2.76e-01 -0.117 0.108 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 19244 sc-eQTL 8.88e-01 0.0165 0.117 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 7.58e-01 0.0372 0.12 0.14 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 2.13e-01 -0.113 0.0903 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 2.06e-01 -0.132 0.104 0.14 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 8.18e-01 0.026 0.113 0.14 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 3.07e-01 0.0911 0.0891 0.14 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -1392 sc-eQTL 7.04e-02 -0.206 0.113 0.14 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 8.39e-01 0.0213 0.105 0.14 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 19244 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0141 0.128 0.14 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 1.96e-01 0.147 0.113 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 2.09e-01 -0.1 0.0797 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0848 0.0991 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0651 0.0917 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 4.11e-02 -0.131 0.0636 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -1392 sc-eQTL 1.06e-03 -0.389 0.117 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 2.53e-01 -0.1 0.0872 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 19244 sc-eQTL 2.72e-01 0.126 0.115 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 9.76e-01 0.00333 0.112 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 5.00e-01 0.0515 0.0763 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 5.66e-01 0.0604 0.105 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 2.48e-01 -0.116 0.1 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 5.75e-02 -0.14 0.0732 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -1392 sc-eQTL 1.70e-01 -0.16 0.116 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 6.90e-01 0.0477 0.119 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 19244 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0507 0.109 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 4.23e-01 0.0924 0.115 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 1.40e-01 -0.147 0.0989 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0468 0.116 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 5.10e-01 0.0745 0.113 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 2.52e-01 -0.118 0.103 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 3.15e-01 -0.104 0.103 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 50953 sc-eQTL 1.29e-01 -0.161 0.106 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 1.74e-01 0.152 0.111 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 8.44e-02 -0.12 0.0692 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 9.62e-02 -0.144 0.0862 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0231 0.077 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0643 0.0516 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 4.13e-02 -0.179 0.0872 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 50953 sc-eQTL 7.02e-01 0.0341 0.089 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 3.34e-02 0.233 0.109 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 9.84e-02 -0.135 0.0812 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 4.67e-01 0.0639 0.0877 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0722 0.0831 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 4.57e-01 0.0477 0.064 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 6.75e-01 0.04 0.0952 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 50953 sc-eQTL 2.83e-01 -0.11 0.103 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0201 0.124 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 2.18e-01 -0.104 0.0842 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 5.32e-01 0.0604 0.0964 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 4.11e-01 0.0864 0.105 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 6.83e-02 0.136 0.0744 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0295 0.0984 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 50953 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0615 0.103 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 1.23e-01 0.195 0.126 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 5.42e-01 0.055 0.0901 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 8.05e-01 0.0228 0.0919 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0109 0.0984 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 1.43e-02 0.194 0.0785 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0589 0.0926 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 50953 sc-eQTL 1.05e-01 -0.18 0.111 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 3.10e-01 0.122 0.12 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 1.12e-01 -0.122 0.0766 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 2.42e-01 -0.109 0.0927 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0444 0.0932 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 6.64e-01 0.0213 0.0489 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 4.02e-02 -0.202 0.0979 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 50953 sc-eQTL 1.05e-01 -0.183 0.113 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 3.87e-01 -0.115 0.132 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00619 0.0933 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0442 0.097 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 4.54e-01 0.0756 0.101 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 8.68e-01 0.0168 0.101 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 6.80e-01 0.0427 0.103 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 50953 sc-eQTL 3.71e-02 0.226 0.108 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 9.39e-01 0.00963 0.125 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 7.96e-02 -0.199 0.113 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 2.64e-01 0.131 0.117 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00884 0.122 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 4.69e-02 0.187 0.0932 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0428 0.102 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 50953 sc-eQTL 2.21e-01 0.142 0.116 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 9.34e-01 0.011 0.133 0.139 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 1.78e-01 -0.124 0.0916 0.139 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 2.65e-01 0.112 0.101 0.139 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0271 0.109 0.139 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 7.85e-01 0.0218 0.0798 0.139 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0154 0.094 0.139 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 9.57e-02 0.201 0.12 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 4.54e-01 0.0771 0.103 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 2.67e-01 -0.122 0.109 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 8.28e-01 0.0222 0.102 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 4.92e-01 0.0648 0.0941 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 5.43e-01 0.0615 0.101 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 3.34e-01 0.108 0.111 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 1.95e-01 -0.128 0.0986 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0507 0.0959 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0753 0.0908 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 3.83e-01 0.0537 0.0615 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0115 0.0821 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00993 0.13 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 9.64e-01 0.00505 0.111 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 3.66e-01 -0.11 0.122 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 1.40e-01 -0.177 0.12 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 4.14e-01 0.081 0.0989 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0348 0.106 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 8.29e-02 0.201 0.115 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 3.48e-01 -0.094 0.1 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 7.98e-01 0.0257 0.1 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 4.21e-01 0.0833 0.103 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 2.91e-01 0.0704 0.0664 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 4.82e-01 0.0612 0.0869 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 2.71e-01 0.154 0.14 0.156 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 6.68e-02 0.227 0.123 0.156 PB L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 3.69e-01 -0.137 0.152 0.156 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 2.71e-01 -0.149 0.135 0.156 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 9.78e-01 0.00262 0.095 0.156 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -1392 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0449 0.139 0.156 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 9.59e-01 0.00541 0.104 0.156 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 19244 sc-eQTL 1.00e+00 5.41e-05 0.14 0.156 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 1.38e-01 0.189 0.127 0.139 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0345 0.102 0.139 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 2.07e-01 -0.127 0.1 0.139 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 5.36e-02 -0.228 0.117 0.139 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 4.35e-02 0.154 0.0757 0.139 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 7.31e-01 0.0313 0.091 0.139 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 5.42e-01 0.073 0.12 0.139 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0928 0.0815 0.139 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0739 0.0993 0.139 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00514 0.103 0.139 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0481 0.0876 0.139 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0949 0.0977 0.139 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 50953 sc-eQTL 6.48e-01 0.0512 0.112 0.139 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0352 0.116 0.137 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 5.28e-01 0.0526 0.0833 0.137 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0193 0.111 0.137 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 598035 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0987 0.108 0.137 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 2.34e-01 -0.148 0.124 0.137 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 6.13e-01 0.0516 0.102 0.137 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 6.44e-01 0.0501 0.108 0.137 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 598058 sc-eQTL 3.36e-01 0.115 0.119 0.137 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 2.77e-01 0.101 0.0923 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0774 0.0663 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0136 0.0765 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 598035 sc-eQTL 5.43e-02 0.214 0.11 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0591 0.0994 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 2.13e-02 0.192 0.0826 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 4.56e-01 0.0653 0.0873 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 598058 sc-eQTL 7.57e-01 0.0361 0.117 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 5.00e-01 0.0712 0.105 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 9.85e-01 0.0014 0.0723 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 3.07e-01 0.0911 0.089 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 598035 sc-eQTL 4.17e-01 0.0919 0.113 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 2.21e-02 0.244 0.106 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 3.09e-02 0.2 0.092 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 6.59e-02 0.169 0.0914 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 598058 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0122 0.124 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0178 0.143 0.152 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 2.21e-01 -0.166 0.135 0.152 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 9.79e-01 0.00363 0.136 0.152 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 5.27e-01 0.0889 0.14 0.152 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 2.65e-01 -0.118 0.105 0.152 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 3.19e-01 -0.121 0.121 0.152 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00496 0.122 0.14 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0544 0.0818 0.14 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0538 0.1 0.14 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 598035 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0694 0.11 0.14 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 5.97e-01 0.0603 0.114 0.14 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 7.04e-01 0.0397 0.104 0.14 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 7.51e-01 0.0321 0.101 0.14 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 598058 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0751 0.124 0.14 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 7.35e-01 0.0385 0.114 0.138 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 1.37e-02 -0.166 0.0669 0.138 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 6.97e-01 0.0406 0.104 0.138 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 598035 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00811 0.109 0.138 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 1.86e-01 -0.109 0.0821 0.138 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 2.79e-01 0.107 0.099 0.138 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 3.95e-01 0.0717 0.0841 0.138 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 598058 sc-eQTL 5.59e-01 -0.071 0.121 0.138 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 7.64e-01 0.0398 0.132 0.138 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 1.88e-01 -0.135 0.102 0.138 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 5.89e-01 0.0606 0.112 0.138 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 598035 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00656 0.103 0.138 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0157 0.104 0.138 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 4.17e-01 0.0922 0.113 0.138 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 4.27e-01 -0.106 0.133 0.138 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 598058 sc-eQTL 5.77e-01 0.0575 0.103 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 9.26e-01 0.0107 0.114 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 1.62e-01 -0.11 0.0786 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0472 0.101 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 3.88e-01 -0.091 0.105 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 6.80e-01 0.0301 0.0729 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -1392 sc-eQTL 5.84e-04 -0.41 0.117 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0987 0.102 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 19244 sc-eQTL 8.99e-01 0.0151 0.119 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 4.43e-01 0.081 0.106 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0321 0.0733 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0572 0.0987 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0784 0.0841 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 3.40e-03 -0.172 0.0579 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -1392 sc-eQTL 1.58e-04 -0.46 0.12 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0704 0.0897 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 19244 sc-eQTL 5.36e-01 0.0655 0.106 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 1.65e-01 0.118 0.0849 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0675 0.0634 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 7.93e-01 0.0201 0.0765 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 598035 sc-eQTL 7.61e-02 0.198 0.111 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 2.79e-01 0.0996 0.0917 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 1.23e-02 0.204 0.0806 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 1.59e-01 0.126 0.0892 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 598058 sc-eQTL 8.59e-01 0.0213 0.12 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0208 0.114 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 1.04e-01 -0.0988 0.0606 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 7.11e-01 0.0361 0.0974 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 598035 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0989 0.108 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0359 0.0674 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 3.66e-01 0.0893 0.0986 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 4.74e-01 0.0609 0.085 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 598058 sc-eQTL 8.53e-01 0.0223 0.12 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 517097 sc-eQTL 1.34e-01 0.16 0.107 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 887075 sc-eQTL 1.59e-01 -0.131 0.0926 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 155526 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0108 0.0915 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 302345 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0392 0.0893 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 261861 sc-eQTL 1.42e-01 0.0845 0.0574 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -84042 sc-eQTL 9.65e-01 0.0037 0.0834 0.14 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112406 HECA 155526 eQTL 0.0392 0.0267 0.0129 0.0 0.0 0.148
ENSG00000164440 TXLNB -1392 eQTL 4.03e-05 -0.148 0.0358 0.00112 0.00141 0.148


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina