Genes within 1Mb (chr6:139287029:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 5.56e-01 0.057 0.0967 0.141 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0253 0.0738 0.141 B L1
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00841 0.0941 0.141 B L1
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 3.77e-02 -0.172 0.0823 0.141 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0748 0.0486 0.141 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -4969 sc-eQTL 1.80e-07 -0.606 0.112 0.141 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 5.92e-02 -0.142 0.0748 0.141 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 15667 sc-eQTL 2.29e-01 0.101 0.0836 0.141 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 9.34e-02 0.177 0.105 0.141 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 5.04e-02 -0.139 0.0704 0.141 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 3.59e-01 -0.081 0.0881 0.141 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0279 0.0694 0.141 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0198 0.0509 0.141 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 1.42e-01 -0.127 0.0865 0.141 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 47376 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0139 0.0857 0.141 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 7.35e-01 0.039 0.115 0.141 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 1.31e-01 -0.114 0.075 0.141 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0555 0.0823 0.141 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 9.36e-01 0.00622 0.0775 0.141 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 1.09e-01 0.0706 0.0439 0.141 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 1.32e-01 -0.126 0.0833 0.141 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 47376 sc-eQTL 4.74e-01 -0.073 0.102 0.141 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 3.51e-01 -0.109 0.116 0.14 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 9.11e-01 0.00911 0.0817 0.14 DC L1
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0693 0.0956 0.14 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 594458 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0443 0.107 0.14 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0865 0.0941 0.14 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 5.53e-01 0.0548 0.0922 0.14 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000271 0.11 0.14 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 594481 sc-eQTL 6.19e-02 0.207 0.11 0.14 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 3.45e-01 0.0792 0.0838 0.141 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0566 0.058 0.141 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 7.55e-01 0.024 0.0766 0.141 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 594458 sc-eQTL 1.82e-01 0.146 0.109 0.141 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 7.97e-01 0.0166 0.0642 0.141 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 1.14e-02 0.21 0.0823 0.141 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 1.35e-01 0.132 0.088 0.141 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 594481 sc-eQTL 9.62e-01 0.0054 0.114 0.141 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 1.25e-01 0.157 0.102 0.142 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 2.38e-01 -0.107 0.0901 0.142 NK L1
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0449 0.0886 0.142 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0174 0.0844 0.142 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 1.97e-01 0.0794 0.0614 0.142 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 8.62e-01 0.0143 0.0819 0.142 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 3.51e-01 0.114 0.122 0.141 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0944 0.0785 0.141 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 4.10e-01 0.0727 0.0882 0.141 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0775 0.0948 0.141 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 8.86e-01 -0.00896 0.0622 0.141 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00386 0.0728 0.141 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 3.21e-01 -0.131 0.132 0.148 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 5.89e-01 0.0628 0.116 0.148 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 1.14e-01 -0.199 0.125 0.148 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 3.22e-01 -0.131 0.132 0.148 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0465 0.12 0.148 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -4969 sc-eQTL 1.13e-01 -0.162 0.102 0.148 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 2.97e-02 -0.279 0.127 0.148 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 15667 sc-eQTL 2.92e-01 0.136 0.128 0.148 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 7.73e-01 0.0344 0.119 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 1.28e-01 -0.126 0.0822 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 6.22e-01 0.051 0.103 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0978 0.111 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 4.84e-01 0.0665 0.0949 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -4969 sc-eQTL 8.01e-03 -0.306 0.114 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 2.41e-01 -0.125 0.107 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 15667 sc-eQTL 8.75e-01 0.0183 0.116 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 7.25e-01 0.0422 0.12 0.142 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 1.69e-01 -0.124 0.0898 0.142 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 2.02e-01 -0.132 0.103 0.142 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 7.52e-01 0.0356 0.112 0.142 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 3.37e-01 0.0852 0.0886 0.142 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -4969 sc-eQTL 8.78e-02 -0.193 0.113 0.142 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 7.83e-01 0.0287 0.104 0.142 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 15667 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0102 0.128 0.142 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 2.41e-01 0.133 0.113 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0995 0.0791 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0894 0.0983 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0653 0.0911 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 4.89e-02 -0.125 0.0632 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -4969 sc-eQTL 1.13e-03 -0.384 0.116 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 2.23e-01 -0.106 0.0866 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 15667 sc-eQTL 2.03e-01 0.145 0.114 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 9.51e-01 0.00684 0.111 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 4.08e-01 0.0626 0.0756 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 5.65e-01 0.0601 0.104 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 2.44e-01 -0.116 0.0991 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 9.54e-02 -0.122 0.0727 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -4969 sc-eQTL 1.23e-01 -0.178 0.115 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 6.95e-01 0.0464 0.118 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 15667 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0771 0.108 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 2.47e-01 0.132 0.114 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 7.17e-02 -0.178 0.0981 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0294 0.116 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 3.69e-01 0.101 0.112 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0903 0.102 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 2.24e-01 -0.125 0.102 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 47376 sc-eQTL 1.28e-01 -0.161 0.105 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 2.30e-01 0.134 0.111 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 7.23e-02 -0.124 0.0688 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 8.92e-02 -0.147 0.0858 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 6.87e-01 -0.031 0.0766 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0625 0.0514 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 2.98e-02 -0.19 0.0866 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 47376 sc-eQTL 6.70e-01 0.0378 0.0886 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 6.05e-02 0.205 0.109 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 9.19e-02 -0.137 0.0809 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 5.22e-01 0.056 0.0874 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0674 0.0829 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 4.73e-01 0.0458 0.0637 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 8.01e-01 0.024 0.0949 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 47376 sc-eQTL 3.17e-01 -0.103 0.102 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0138 0.123 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 1.63e-01 -0.117 0.0836 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 5.43e-01 0.0584 0.0958 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 3.24e-01 0.103 0.104 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 7.04e-02 0.134 0.0739 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0299 0.0978 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 47376 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0693 0.102 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 1.46e-01 0.182 0.125 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 6.27e-01 0.0436 0.0897 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 7.74e-01 0.0263 0.0914 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00769 0.0979 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 1.20e-02 0.198 0.078 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0656 0.0921 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 47376 sc-eQTL 8.88e-02 -0.188 0.11 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 4.34e-01 0.0938 0.12 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 1.21e-01 -0.119 0.0762 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 2.14e-01 -0.115 0.0923 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0531 0.0928 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 7.45e-01 0.0158 0.0487 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 3.00e-02 -0.213 0.0973 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 47376 sc-eQTL 1.54e-01 -0.161 0.112 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 2.74e-01 -0.144 0.132 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0259 0.0928 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0196 0.0966 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 5.72e-01 0.0569 0.1 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 9.37e-01 0.00786 0.1 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 7.21e-01 0.0368 0.103 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 47376 sc-eQTL 1.95e-02 0.252 0.107 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 8.89e-01 0.0175 0.125 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 5.35e-02 -0.218 0.112 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 3.22e-01 0.116 0.116 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00813 0.122 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 2.41e-02 0.21 0.0924 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0312 0.102 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 47376 sc-eQTL 1.97e-01 0.149 0.115 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000414 0.132 0.141 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 1.58e-01 -0.129 0.0909 0.141 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 3.75e-01 0.0889 0.0999 0.141 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 7.32e-01 -0.037 0.108 0.141 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 9.46e-01 0.00537 0.0793 0.141 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0111 0.0933 0.141 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 1.08e-01 0.193 0.119 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 3.86e-01 0.0886 0.102 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 2.49e-01 -0.125 0.108 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 7.71e-01 0.0296 0.101 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 3.61e-01 0.0854 0.0933 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 6.15e-01 0.0505 0.1 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 2.91e-01 0.117 0.111 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 2.65e-01 -0.11 0.0981 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0366 0.0954 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 2.49e-01 -0.104 0.0901 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 4.06e-01 0.0509 0.0611 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 9.02e-01 -0.01 0.0816 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0101 0.13 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00798 0.111 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 3.50e-01 -0.114 0.121 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 1.60e-01 -0.168 0.119 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 3.76e-01 0.0873 0.0985 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0253 0.105 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 2.11e-01 0.145 0.115 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0823 0.0996 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 7.67e-01 0.0296 0.0997 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 5.20e-01 0.0663 0.103 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 2.30e-01 0.0796 0.0661 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 5.70e-01 0.0492 0.0865 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 3.69e-01 0.125 0.139 0.159 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 4.25e-02 0.249 0.121 0.159 PB L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 3.35e-01 -0.146 0.151 0.159 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 2.28e-01 -0.162 0.134 0.159 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 9.95e-01 0.000536 0.0942 0.159 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -4969 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0871 0.137 0.159 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 8.39e-01 0.0211 0.104 0.159 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 15667 sc-eQTL 9.83e-01 0.0029 0.139 0.159 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 1.38e-01 0.189 0.127 0.139 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0345 0.102 0.139 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 2.07e-01 -0.127 0.1 0.139 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 5.36e-02 -0.228 0.117 0.139 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 4.35e-02 0.154 0.0757 0.139 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 7.31e-01 0.0313 0.091 0.139 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 6.43e-01 0.0553 0.119 0.141 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 2.10e-01 -0.102 0.081 0.141 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0631 0.0988 0.141 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 9.26e-01 0.00946 0.102 0.141 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0455 0.0871 0.141 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 2.76e-01 -0.106 0.0971 0.141 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 47376 sc-eQTL 5.76e-01 0.0624 0.111 0.141 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0278 0.115 0.139 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 6.52e-01 0.0373 0.0827 0.139 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0427 0.11 0.139 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 594458 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0952 0.107 0.139 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 3.29e-01 -0.121 0.123 0.139 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 6.34e-01 0.0483 0.101 0.139 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 7.64e-01 0.0322 0.107 0.139 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 594481 sc-eQTL 3.59e-01 0.109 0.118 0.139 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 3.01e-01 0.0953 0.0919 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0777 0.066 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0225 0.0761 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 594458 sc-eQTL 6.24e-02 0.206 0.11 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0994 0.0988 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 1.43e-02 0.203 0.0821 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 4.08e-01 0.0721 0.0869 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 594481 sc-eQTL 8.14e-01 0.0273 0.116 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 5.17e-01 0.0683 0.105 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00188 0.072 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 3.04e-01 0.0913 0.0887 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 594458 sc-eQTL 4.73e-01 0.081 0.113 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 1.77e-02 0.252 0.105 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 2.94e-02 0.201 0.0917 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 4.71e-02 0.182 0.0909 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 594481 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0207 0.123 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0361 0.142 0.155 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 2.39e-01 -0.16 0.135 0.155 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 9.24e-01 -0.013 0.135 0.155 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 3.56e-01 0.129 0.14 0.155 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 2.59e-01 -0.119 0.105 0.155 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 3.26e-01 -0.119 0.121 0.155 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0107 0.121 0.142 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0509 0.0814 0.142 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0715 0.0996 0.142 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 594458 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0786 0.11 0.142 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 6.98e-01 0.0442 0.114 0.142 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 6.39e-01 0.0487 0.104 0.142 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 7.38e-01 0.0337 0.101 0.142 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 594481 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0484 0.123 0.142 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 7.35e-01 0.0385 0.114 0.138 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 1.37e-02 -0.166 0.0669 0.138 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 6.97e-01 0.0406 0.104 0.138 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 594458 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00811 0.109 0.138 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 1.86e-01 -0.109 0.0821 0.138 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 2.79e-01 0.107 0.099 0.138 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 3.95e-01 0.0717 0.0841 0.138 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 594481 sc-eQTL 5.59e-01 -0.071 0.121 0.138 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 9.05e-01 0.0157 0.131 0.141 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 1.41e-01 -0.15 0.101 0.141 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 5.77e-01 0.0621 0.111 0.141 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 594458 sc-eQTL 8.59e-01 -0.018 0.102 0.141 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00835 0.103 0.141 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 4.14e-01 0.0919 0.112 0.141 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 4.02e-01 -0.111 0.132 0.141 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 594481 sc-eQTL 6.17e-01 0.051 0.102 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 8.85e-01 0.0163 0.113 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 1.48e-01 -0.113 0.078 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0479 0.101 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0963 0.104 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 5.43e-01 0.044 0.0723 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -4969 sc-eQTL 9.45e-04 -0.391 0.117 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 3.11e-01 -0.103 0.101 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 15667 sc-eQTL 8.47e-01 0.0229 0.118 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 5.11e-01 0.0689 0.105 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0294 0.0727 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0603 0.098 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0772 0.0834 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 5.68e-03 -0.161 0.0576 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -4969 sc-eQTL 1.23e-04 -0.464 0.119 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0752 0.089 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 15667 sc-eQTL 4.78e-01 0.0743 0.105 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 1.71e-01 0.116 0.0845 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0678 0.0631 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 8.51e-01 0.0143 0.0762 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 594458 sc-eQTL 1.02e-01 0.182 0.111 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 3.78e-01 0.0809 0.0914 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 9.93e-03 0.209 0.0802 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 1.33e-01 0.134 0.0887 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 594481 sc-eQTL 9.42e-01 0.00864 0.12 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0398 0.113 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 1.02e-01 -0.0989 0.0602 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 7.29e-01 0.0336 0.0968 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 594458 sc-eQTL 2.80e-01 -0.116 0.107 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0536 0.067 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 3.16e-01 0.0985 0.0979 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 4.98e-01 0.0574 0.0845 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 594481 sc-eQTL 6.82e-01 0.0488 0.119 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 513520 sc-eQTL 2.08e-01 0.134 0.106 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 883498 sc-eQTL 1.79e-01 -0.125 0.0923 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 151949 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00315 0.0911 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 298768 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0591 0.089 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 258284 sc-eQTL 1.16e-01 0.0902 0.0571 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -87619 sc-eQTL 9.60e-01 0.00417 0.0831 0.142 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112406 HECA 151949 eQTL 0.0376 0.0269 0.0129 0.0 0.0 0.148
ENSG00000164440 TXLNB -4969 eQTL 4.33e-05 -0.147 0.0358 0.00107 0.00133 0.148


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina