logo

Genes within 1Mb (chr6:139278072:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0135 0.0939 0.194 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 1.59e-01 -0.101 0.0713 0.194 B L1
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 8.26e-01 -0.02 0.0913 0.194 B L1
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 9.98e-01 0.000175 0.0807 0.194 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 4.36e-01 0.037 0.0473 0.194 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -13926 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0469 0.116 0.194 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 7.10e-01 0.0272 0.0731 0.194 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 6710 sc-eQTL 1.09e-02 -0.206 0.0801 0.194 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 7.58e-01 0.032 0.104 0.194 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 4.06e-01 -0.058 0.0696 0.194 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0595 0.0865 0.194 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 4.59e-01 0.0505 0.068 0.194 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 9.00e-01 0.00629 0.0499 0.194 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 4.80e-02 -0.168 0.0844 0.194 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 38419 sc-eQTL 3.25e-01 0.0826 0.0838 0.194 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 1.15e-01 -0.18 0.114 0.194 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0746 0.0747 0.194 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 5.83e-01 -0.045 0.0818 0.194 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 9.80e-02 -0.127 0.0765 0.194 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0183 0.0438 0.194 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 7.89e-02 -0.146 0.0826 0.194 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 38419 sc-eQTL 2.89e-01 0.107 0.101 0.194 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00828 0.114 0.198 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0166 0.0801 0.198 DC L1
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 2.60e-01 0.106 0.0936 0.198 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 585501 sc-eQTL 3.48e-01 0.0981 0.104 0.198 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 2.13e-01 0.115 0.0921 0.198 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0877 0.0903 0.198 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0495 0.107 0.198 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 585524 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0246 0.109 0.198 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 8.43e-01 0.0164 0.0827 0.194 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0439 0.0572 0.194 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 3.83e-01 0.066 0.0754 0.194 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 585501 sc-eQTL 8.46e-01 -0.021 0.108 0.194 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 5.73e-02 0.12 0.0628 0.194 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 3.74e-02 -0.171 0.0816 0.194 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 2.31e-01 -0.104 0.0869 0.194 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 585524 sc-eQTL 3.22e-01 0.111 0.112 0.194 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 7.10e-01 0.0375 0.101 0.193 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 7.23e-02 -0.159 0.0883 0.193 NK L1
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0232 0.0872 0.193 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 9.72e-02 0.138 0.0825 0.193 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0217 0.0606 0.193 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0422 0.0806 0.193 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 5.46e-01 0.0719 0.119 0.194 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 3.22e-02 -0.164 0.076 0.194 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0412 0.0861 0.194 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 1.04e-01 0.15 0.092 0.194 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 1.23e-01 -0.0934 0.0603 0.194 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 7.29e-01 0.0246 0.071 0.194 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 4.29e-01 -0.111 0.14 0.186 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0267 0.123 0.186 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 7.15e-01 -0.049 0.134 0.186 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 8.03e-01 -0.035 0.14 0.186 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0704 0.127 0.186 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -13926 sc-eQTL 7.20e-01 -0.039 0.109 0.186 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 5.97e-01 0.0724 0.137 0.186 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 6710 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0757 0.137 0.186 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 1.00e-01 -0.19 0.115 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 1.93e-01 -0.104 0.0799 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0202 0.1 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0524 0.108 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0923 0.0919 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -13926 sc-eQTL 7.30e-01 0.0389 0.113 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0339 0.104 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 6710 sc-eQTL 7.03e-03 -0.301 0.111 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 9.71e-01 0.00432 0.118 0.194 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 3.43e-02 -0.187 0.0877 0.194 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 1.81e-01 0.136 0.101 0.194 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 4.42e-01 -0.085 0.11 0.194 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0263 0.0873 0.194 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -13926 sc-eQTL 1.25e-01 0.171 0.111 0.194 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 4.46e-01 0.0781 0.102 0.194 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 6710 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0324 0.126 0.194 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0267 0.111 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0879 0.0779 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 6.27e-01 0.0472 0.0969 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0645 0.0896 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 5.63e-01 0.0363 0.0627 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -13926 sc-eQTL 1.73e-01 -0.16 0.117 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0456 0.0854 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 6710 sc-eQTL 1.20e-01 -0.174 0.112 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 4.60e-01 0.0806 0.109 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 1.32e-01 -0.112 0.0742 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 2.67e-01 -0.114 0.102 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0301 0.098 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 1.90e-01 0.0944 0.0718 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -13926 sc-eQTL 4.84e-01 -0.08 0.114 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0334 0.117 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 6710 sc-eQTL 1.31e-01 -0.161 0.106 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 4.29e-01 0.0886 0.112 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00619 0.0967 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 1.00e+00 -5.53e-05 0.113 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 2.87e-01 0.117 0.109 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 3.00e-01 0.104 0.0997 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 6.62e-01 0.044 0.1 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 38419 sc-eQTL 4.50e-01 0.0783 0.103 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 6.89e-01 0.0438 0.109 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0758 0.068 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0321 0.085 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 2.74e-01 0.0825 0.0752 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 4.68e-01 0.0369 0.0507 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 4.22e-02 -0.174 0.0854 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 38419 sc-eQTL 8.36e-01 0.0181 0.0872 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 1.16e-01 -0.168 0.107 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0758 0.0796 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0824 0.0855 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 3.44e-01 -0.077 0.0811 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0272 0.0625 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0978 0.0927 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 38419 sc-eQTL 2.56e-01 0.114 0.1 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 3.42e-01 -0.115 0.12 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 5.06e-01 0.0548 0.0821 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 9.72e-01 0.00327 0.0939 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 4.32e-01 0.0804 0.102 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 3.10e-01 -0.074 0.0728 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 6.97e-01 0.0374 0.0957 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 38419 sc-eQTL 5.46e-01 0.0606 0.1 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 2.71e-01 -0.136 0.123 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 1.10e-01 -0.141 0.0879 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0589 0.0901 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 6.13e-02 -0.18 0.0957 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 8.72e-02 -0.133 0.0775 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 8.18e-01 -0.021 0.0909 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 38419 sc-eQTL 1.15e-01 0.171 0.108 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0651 0.118 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0351 0.0757 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0509 0.0914 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 2.32e-01 -0.11 0.0914 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 8.72e-01 -0.00775 0.0481 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 1.32e-01 -0.146 0.0967 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 38419 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0993 0.111 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 1.95e-01 -0.17 0.131 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0532 0.092 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 7.43e-01 0.0315 0.0959 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 7.44e-01 0.0326 0.0996 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 1.58e-01 0.14 0.0988 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 1.07e-01 -0.164 0.101 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 38419 sc-eQTL 1.04e-01 0.175 0.107 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 1.26e-01 -0.184 0.12 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0618 0.109 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 5.42e-01 0.0688 0.113 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 9.81e-01 0.00274 0.117 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 3.44e-01 0.0855 0.0902 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0475 0.0981 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 38419 sc-eQTL 2.86e-01 0.119 0.111 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 7.49e-01 0.0413 0.129 0.197 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 6.45e-02 -0.165 0.0887 0.197 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0323 0.098 0.197 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 1.36e-01 0.157 0.105 0.197 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0344 0.0776 0.197 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0127 0.0914 0.197 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 1.27e-01 0.181 0.118 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 7.63e-01 0.0304 0.101 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 2.24e-01 0.13 0.107 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 8.16e-01 0.0233 0.1 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00318 0.0922 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 5.31e-01 0.062 0.0988 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00243 0.109 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 3.02e-02 -0.21 0.096 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0198 0.0941 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 3.39e-02 0.188 0.0882 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 8.86e-01 -0.00868 0.0604 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0439 0.0804 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 5.83e-01 0.0689 0.125 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 2.84e-01 -0.115 0.107 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0838 0.117 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 7.83e-02 0.203 0.115 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0166 0.0952 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 1.06e-01 -0.164 0.101 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 8.14e-01 0.0265 0.112 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 1.39e-01 -0.143 0.0963 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0245 0.0967 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 8.49e-01 0.0191 0.0999 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 7.56e-01 0.02 0.0643 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0409 0.084 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0762 0.144 0.181 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 2.23e-01 -0.156 0.128 0.181 PB L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 3.83e-01 -0.137 0.157 0.181 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 7.46e-02 0.248 0.138 0.181 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 7.70e-01 0.0287 0.0978 0.181 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -13926 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0332 0.143 0.181 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 9.93e-01 0.000893 0.108 0.181 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 6710 sc-eQTL 4.12e-01 0.119 0.144 0.181 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 4.49e-01 0.0951 0.125 0.193 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 2.77e-01 -0.109 0.0998 0.193 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0154 0.0989 0.193 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 4.61e-01 -0.086 0.116 0.193 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 4.13e-02 -0.153 0.0744 0.193 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 7.55e-01 -0.028 0.0895 0.193 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 1.93e-01 0.152 0.116 0.194 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 8.41e-01 -0.016 0.0799 0.194 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0447 0.0971 0.194 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 1.37e-01 -0.149 0.1 0.194 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 3.85e-02 -0.177 0.0848 0.194 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 3.93e-01 0.0817 0.0954 0.194 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 38419 sc-eQTL 1.61e-01 -0.153 0.109 0.194 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 6.63e-01 0.0507 0.116 0.202 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0117 0.0833 0.202 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 8.60e-01 0.0195 0.11 0.202 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 585501 sc-eQTL 2.62e-01 0.121 0.108 0.202 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 3.09e-01 0.127 0.124 0.202 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0332 0.102 0.202 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 5.33e-02 -0.208 0.107 0.202 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 585524 sc-eQTL 3.78e-01 0.105 0.119 0.202 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0397 0.0918 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0127 0.0659 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 1.88e-01 0.0999 0.0755 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 585501 sc-eQTL 1.70e-01 -0.152 0.11 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 2.34e-02 0.223 0.0974 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 6.01e-02 -0.156 0.0823 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 2.46e-01 -0.101 0.0865 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 585524 sc-eQTL 1.56e-01 0.164 0.115 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 7.41e-02 0.186 0.104 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0821 0.0713 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 6.02e-01 0.0461 0.0882 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 585501 sc-eQTL 8.61e-02 0.192 0.111 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0195 0.106 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 2.34e-01 -0.11 0.0917 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0937 0.0909 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 585524 sc-eQTL 5.93e-01 0.0656 0.123 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0208 0.138 0.206 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0374 0.132 0.206 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 3.42e-01 0.125 0.131 0.206 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 3.23e-01 0.134 0.136 0.206 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00389 0.102 0.206 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0613 0.118 0.206 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 9.45e-01 0.00843 0.123 0.193 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0946 0.0823 0.193 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 4.39e-01 0.0782 0.101 0.193 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 585501 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0119 0.111 0.193 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0214 0.115 0.193 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 2.86e-01 -0.112 0.105 0.193 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 3.12e-01 -0.103 0.102 0.193 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 585524 sc-eQTL 8.78e-01 0.0192 0.125 0.193 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 2.15e-02 -0.261 0.113 0.199 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 1.04e-01 -0.11 0.0676 0.199 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 2.35e-01 -0.124 0.104 0.199 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 585501 sc-eQTL 4.81e-01 0.0772 0.109 0.199 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 3.83e-01 0.072 0.0824 0.199 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 2.32e-01 -0.119 0.0991 0.199 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 2.76e-01 -0.092 0.0842 0.199 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 585524 sc-eQTL 9.45e-01 0.00848 0.122 0.199 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 2.76e-01 -0.14 0.128 0.203 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 2.14e-01 0.124 0.0993 0.203 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 4.94e-01 0.0743 0.109 0.203 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 585501 sc-eQTL 1.30e-01 0.15 0.0986 0.203 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0311 0.101 0.203 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 1.66e-01 0.152 0.109 0.203 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 7.45e-01 0.0421 0.129 0.203 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 585524 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0242 0.0998 0.203 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 3.05e-01 -0.114 0.111 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 1.57e-01 -0.108 0.0764 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0218 0.0986 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0752 0.102 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0902 0.0706 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -13926 sc-eQTL 6.46e-02 0.216 0.116 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 8.14e-01 0.0235 0.0996 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 6710 sc-eQTL 1.92e-02 -0.27 0.114 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 8.93e-01 0.0139 0.104 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0996 0.0716 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0108 0.0969 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0464 0.0826 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 3.56e-01 0.0536 0.0578 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -13926 sc-eQTL 1.38e-01 -0.18 0.121 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00161 0.0882 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 6710 sc-eQTL 4.49e-02 -0.207 0.103 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 4.47e-01 0.0639 0.0839 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0422 0.0625 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 1.72e-01 0.103 0.075 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 585501 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0412 0.11 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 1.54e-01 0.129 0.0902 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 4.84e-02 -0.159 0.0799 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0692 0.0881 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 585524 sc-eQTL 1.18e-01 0.185 0.118 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 1.29e-01 -0.172 0.113 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0843 0.0604 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0102 0.097 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 585501 sc-eQTL 7.37e-01 0.0363 0.108 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 3.47e-01 0.0631 0.067 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0795 0.0981 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0808 0.0845 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 585524 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0323 0.119 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 sc-eQTL 9.75e-01 0.00326 0.105 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 874541 sc-eQTL 3.74e-02 -0.189 0.09 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 142992 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0518 0.0894 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 289811 sc-eQTL 4.94e-02 0.171 0.0866 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 249327 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0126 0.0564 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -96576 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0548 0.0814 0.194 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 504563 pQTL 0.0362 -0.0922 0.044 0.0 0.0 0.162
ENSG00000226571 AL592429.2 6710 eQTL 8.01e-07 -0.216 0.0436 0.0161 0.0171 0.159

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000218565 \N -59946 1.3e-05 1.27e-05 1.34e-06 6.74e-06 2.18e-06 4.9e-06 1.16e-05 1.93e-06 1.05e-05 5.39e-06 1.39e-05 5.74e-06 1.7e-05 3.59e-06 3.01e-06 6.44e-06 4.38e-06 7.72e-06 2.63e-06 2.59e-06 4.7e-06 1.03e-05 8.67e-06 2.82e-06 1.7e-05 4.41e-06 5.21e-06 3.34e-06 1.02e-05 8.01e-06 7.35e-06 7.36e-07 6.67e-07 2.86e-06 4.89e-06 1.7e-06 1.55e-06 1.81e-06 1.72e-06 1e-06 7.81e-07 1.57e-05 1.38e-06 1.9e-07 7.77e-07 1.49e-06 1.12e-06 6.09e-07 5.85e-07
ENSG00000226571 AL592429.2 6710 4.29e-05 3.04e-05 5.99e-06 1.45e-05 5.1e-06 1.44e-05 4.02e-05 3.78e-06 2.88e-05 1.39e-05 3.44e-05 1.44e-05 4.46e-05 1.24e-05 6.33e-06 1.72e-05 1.47e-05 2.39e-05 7.56e-06 5.62e-06 1.39e-05 3.06e-05 2.86e-05 8.06e-06 3.87e-05 7.46e-06 1.21e-05 1.1e-05 2.89e-05 2.23e-05 1.83e-05 1.58e-06 2.39e-06 6.67e-06 1.01e-05 4.81e-06 2.78e-06 2.99e-06 4.16e-06 3.14e-06 1.66e-06 3.61e-05 3.58e-06 2.73e-07 2.23e-06 3.29e-06 3.85e-06 1.42e-06 1.4e-06