logo

Genes within 1Mb (chr6:139271734:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00738 0.0938 0.192 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 1.25e-01 -0.11 0.0712 0.192 B L1
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00695 0.0913 0.192 B L1
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0236 0.0806 0.192 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 3.77e-01 0.0419 0.0473 0.192 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -20264 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0478 0.116 0.192 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 7.26e-01 0.0257 0.0731 0.192 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 372 sc-eQTL 9.20e-03 -0.21 0.08 0.192 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 8.35e-01 0.0217 0.104 0.192 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0619 0.0696 0.192 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0505 0.0865 0.192 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 5.70e-01 0.0387 0.068 0.192 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 8.13e-01 0.0118 0.0499 0.192 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 7.42e-02 -0.152 0.0846 0.192 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 32081 sc-eQTL 3.09e-01 0.0855 0.0838 0.192 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 6.99e-02 -0.207 0.113 0.192 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0792 0.0746 0.192 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 6.25e-01 -0.04 0.0817 0.192 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 8.11e-02 -0.134 0.0764 0.192 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0211 0.0438 0.192 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 7.66e-02 -0.147 0.0825 0.192 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 32081 sc-eQTL 2.32e-01 0.121 0.101 0.192 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 9.05e-01 0.0136 0.114 0.196 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 6.91e-01 -0.032 0.0803 0.196 DC L1
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 2.09e-01 0.118 0.0938 0.196 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 579163 sc-eQTL 3.63e-01 0.0953 0.105 0.196 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 1.70e-01 0.127 0.0922 0.196 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0796 0.0906 0.196 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0454 0.108 0.196 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 579186 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0136 0.11 0.196 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 6.80e-01 0.0341 0.0827 0.192 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0442 0.0572 0.192 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 3.00e-01 0.0782 0.0753 0.192 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 579163 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00819 0.108 0.192 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 9.05e-02 0.107 0.0629 0.192 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 3.03e-02 -0.178 0.0815 0.192 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 1.74e-01 -0.118 0.0868 0.192 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 579186 sc-eQTL 3.24e-01 0.111 0.112 0.192 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 7.14e-01 0.0371 0.101 0.191 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 7.69e-02 -0.157 0.0884 0.191 NK L1
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0235 0.0873 0.191 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 1.51e-01 0.119 0.0828 0.191 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0188 0.0607 0.191 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0546 0.0807 0.191 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 5.53e-01 0.0708 0.119 0.192 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 2.59e-02 -0.171 0.0761 0.192 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0336 0.0863 0.192 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 8.77e-02 0.158 0.0922 0.192 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0879 0.0605 0.192 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 7.44e-01 0.0232 0.0711 0.192 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 4.29e-01 -0.111 0.14 0.186 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0267 0.123 0.186 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 7.15e-01 -0.049 0.134 0.186 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 8.03e-01 -0.035 0.14 0.186 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0704 0.127 0.186 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -20264 sc-eQTL 7.20e-01 -0.039 0.109 0.186 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 5.97e-01 0.0724 0.137 0.186 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 372 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0757 0.137 0.186 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 9.84e-02 -0.191 0.115 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 1.71e-01 -0.11 0.0798 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0157 0.1 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0439 0.108 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0795 0.0919 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -20264 sc-eQTL 6.27e-01 0.0549 0.113 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00576 0.104 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 372 sc-eQTL 3.55e-03 -0.325 0.11 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 9.38e-01 0.00925 0.118 0.192 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 4.99e-02 -0.173 0.0879 0.192 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 1.79e-01 0.137 0.101 0.192 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 2.90e-01 -0.117 0.11 0.192 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0257 0.0874 0.192 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -20264 sc-eQTL 1.56e-01 0.158 0.111 0.192 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 4.82e-01 0.0721 0.102 0.192 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 372 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0094 0.126 0.192 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0186 0.111 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0947 0.0779 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 5.09e-01 0.064 0.0968 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 3.10e-01 -0.091 0.0895 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 5.57e-01 0.0369 0.0627 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -20264 sc-eQTL 1.63e-01 -0.164 0.117 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0607 0.0854 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 372 sc-eQTL 1.30e-01 -0.169 0.112 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 4.83e-01 0.0766 0.109 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 1.19e-01 -0.116 0.0742 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 2.43e-01 -0.12 0.102 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0574 0.0979 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 2.28e-01 0.087 0.0719 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -20264 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0803 0.114 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0192 0.117 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 372 sc-eQTL 1.51e-01 -0.153 0.106 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 4.69e-01 0.0813 0.112 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 8.69e-01 -0.016 0.0969 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 9.39e-01 0.00869 0.113 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 3.44e-01 0.104 0.11 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 3.05e-01 0.103 0.0999 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 6.64e-01 0.0438 0.101 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 32081 sc-eQTL 4.90e-01 0.0717 0.104 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 8.03e-01 0.0273 0.109 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0741 0.068 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0275 0.0849 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 3.63e-01 0.0686 0.0752 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 5.07e-01 0.0337 0.0507 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 5.32e-02 -0.166 0.0854 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 32081 sc-eQTL 8.86e-01 0.0125 0.0871 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 1.44e-01 -0.156 0.107 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0782 0.0795 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0818 0.0855 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0948 0.081 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0251 0.0624 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0945 0.0927 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 32081 sc-eQTL 2.39e-01 0.118 0.1 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 2.97e-01 -0.126 0.12 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 5.84e-01 0.045 0.0821 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 9.23e-01 0.00904 0.0938 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 4.25e-01 0.0815 0.102 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0674 0.0727 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 6.62e-01 0.0418 0.0956 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 32081 sc-eQTL 4.13e-01 0.082 0.0999 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 2.21e-01 -0.152 0.124 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 1.06e-01 -0.143 0.088 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0524 0.0902 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 4.85e-02 -0.19 0.0958 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 6.48e-02 -0.144 0.0775 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0205 0.091 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 32081 sc-eQTL 9.35e-02 0.183 0.108 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0889 0.118 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0364 0.0758 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0497 0.0915 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 1.79e-01 -0.123 0.0914 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0135 0.0481 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 1.39e-01 -0.144 0.0968 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 32081 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0707 0.111 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 1.35e-01 -0.196 0.131 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0646 0.0922 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 7.45e-01 0.0313 0.096 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 8.49e-01 0.019 0.0998 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 1.48e-01 0.144 0.099 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 1.68e-01 -0.141 0.102 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 32081 sc-eQTL 8.42e-02 0.186 0.107 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 9.52e-02 -0.2 0.119 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0558 0.109 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 4.65e-01 0.0823 0.112 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 9.41e-01 0.00871 0.117 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 3.55e-01 0.0836 0.0901 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0431 0.0981 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 32081 sc-eQTL 2.63e-01 0.125 0.111 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 7.86e-01 0.0351 0.129 0.195 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 5.48e-02 -0.171 0.0887 0.195 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0216 0.0981 0.195 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 1.26e-01 0.161 0.105 0.195 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0387 0.0776 0.195 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00981 0.0914 0.195 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 1.35e-01 0.177 0.118 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 8.60e-01 0.0178 0.101 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 1.80e-01 0.144 0.107 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00769 0.1 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00527 0.0922 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 5.02e-01 0.0665 0.0988 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0142 0.109 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 3.42e-02 -0.205 0.0961 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0171 0.0941 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 4.89e-02 0.175 0.0884 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0115 0.0604 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0622 0.0804 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 5.43e-01 0.0765 0.126 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 2.68e-01 -0.119 0.107 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 3.18e-01 -0.117 0.117 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 6.87e-02 0.211 0.115 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0138 0.0955 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 8.26e-02 -0.177 0.101 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 7.02e-01 0.043 0.112 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 1.71e-01 -0.132 0.0965 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0239 0.0969 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 9.45e-01 0.00691 0.1 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 6.72e-01 0.0273 0.0644 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0512 0.0841 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0494 0.144 0.178 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 2.13e-01 -0.159 0.127 0.178 PB L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 4.84e-01 -0.11 0.156 0.178 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 6.41e-02 0.256 0.137 0.178 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 6.39e-01 0.0458 0.0974 0.178 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -20264 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0378 0.142 0.178 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 9.16e-01 0.0113 0.107 0.178 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 372 sc-eQTL 3.79e-01 0.126 0.143 0.178 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 4.16e-01 0.102 0.126 0.191 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 2.79e-01 -0.108 0.1 0.191 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00881 0.0991 0.191 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0756 0.117 0.191 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 3.70e-02 -0.156 0.0745 0.191 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0358 0.0896 0.191 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 1.56e-01 0.165 0.116 0.192 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0109 0.0796 0.192 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0172 0.0968 0.192 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 1.81e-01 -0.134 0.0998 0.192 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 4.36e-02 -0.172 0.0845 0.192 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 3.58e-01 0.0876 0.0951 0.192 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 32081 sc-eQTL 1.51e-01 -0.156 0.108 0.192 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 5.72e-01 0.0657 0.116 0.2 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 8.57e-01 -0.015 0.0833 0.2 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 9.23e-01 0.0106 0.11 0.2 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 579163 sc-eQTL 2.08e-01 0.136 0.108 0.2 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 2.41e-01 0.146 0.124 0.2 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0501 0.102 0.2 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 5.01e-02 -0.211 0.107 0.2 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 579186 sc-eQTL 3.54e-01 0.111 0.119 0.2 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0233 0.0917 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0123 0.0659 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 1.39e-01 0.112 0.0754 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 579163 sc-eQTL 1.88e-01 -0.145 0.11 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 2.17e-02 0.225 0.0973 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 5.18e-02 -0.161 0.0821 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 1.97e-01 -0.112 0.0863 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 579186 sc-eQTL 1.55e-01 0.164 0.115 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 5.87e-02 0.197 0.104 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0855 0.0714 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 5.74e-01 0.0498 0.0884 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 579163 sc-eQTL 1.08e-01 0.18 0.111 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0425 0.106 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 2.50e-01 -0.106 0.0919 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 2.60e-01 -0.103 0.091 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 579186 sc-eQTL 6.22e-01 0.0607 0.123 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0598 0.138 0.203 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0444 0.132 0.203 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 3.88e-01 0.114 0.131 0.203 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 4.80e-01 0.0963 0.136 0.203 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00597 0.102 0.203 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0551 0.118 0.203 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 7.70e-01 0.0361 0.123 0.191 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 1.75e-01 -0.112 0.0824 0.191 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 2.75e-01 0.11 0.101 0.191 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 579163 sc-eQTL 9.99e-01 0.000209 0.112 0.191 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 7.22e-01 -0.041 0.115 0.191 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 3.05e-01 -0.108 0.105 0.191 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 3.05e-01 -0.105 0.102 0.191 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 579186 sc-eQTL 7.72e-01 0.0363 0.125 0.191 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 3.16e-02 -0.245 0.113 0.197 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 9.26e-02 -0.114 0.0677 0.197 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0888 0.104 0.197 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 579163 sc-eQTL 4.08e-01 0.091 0.11 0.197 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 3.66e-01 0.0749 0.0826 0.197 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 1.74e-01 -0.135 0.0993 0.197 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 2.61e-01 -0.095 0.0844 0.197 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 579186 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0249 0.122 0.197 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 2.76e-01 -0.14 0.128 0.203 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 2.14e-01 0.124 0.0993 0.203 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 4.94e-01 0.0743 0.109 0.203 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 579163 sc-eQTL 1.30e-01 0.15 0.0986 0.203 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0311 0.101 0.203 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 1.66e-01 0.152 0.109 0.203 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 7.45e-01 0.0421 0.129 0.203 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 579186 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0242 0.0998 0.203 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 2.69e-01 -0.123 0.111 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 1.31e-01 -0.116 0.0764 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0125 0.0987 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0873 0.102 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0872 0.0706 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -20264 sc-eQTL 5.08e-02 0.229 0.116 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 6.97e-01 0.0388 0.0996 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 372 sc-eQTL 1.51e-02 -0.28 0.114 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 8.59e-01 0.0185 0.104 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 1.22e-01 -0.111 0.0715 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00321 0.0969 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0723 0.0825 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 3.66e-01 0.0524 0.0578 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -20264 sc-eQTL 1.36e-01 -0.181 0.121 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0129 0.0881 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 372 sc-eQTL 5.75e-02 -0.196 0.103 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 3.59e-01 0.0771 0.0839 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0442 0.0626 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 1.39e-01 0.111 0.075 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 579163 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0381 0.11 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 2.12e-01 0.113 0.0903 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 4.56e-02 -0.161 0.0798 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0815 0.0881 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 579186 sc-eQTL 1.24e-01 0.181 0.118 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 1.88e-01 -0.15 0.113 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 1.22e-01 -0.0938 0.0603 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 7.98e-01 0.0249 0.097 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 579163 sc-eQTL 6.11e-01 0.0549 0.108 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 4.09e-01 0.0554 0.0671 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0873 0.0981 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0798 0.0845 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 579186 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0398 0.119 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 sc-eQTL 9.96e-01 0.000467 0.105 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 868203 sc-eQTL 4.29e-02 -0.184 0.0902 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 136654 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0543 0.0895 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 283473 sc-eQTL 7.62e-02 0.155 0.0869 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 242989 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0109 0.0565 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -102914 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0681 0.0815 0.192 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 498225 pQTL 0.0369 -0.094 0.045 0.0 0.0 0.159
ENSG00000226571 AL592429.2 372 eQTL 3.32e-07 -0.229 0.0445 0.0386 0.0396 0.156

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000218565 \N -66284 7.37e-05 9.23e-06 1.89e-06 2.95e-06 2.58e-06 1.07e-05 9.71e-06 8.93e-07 5.23e-06 3.25e-06 7.19e-06 3.54e-06 9.98e-06 3.5e-06 3.17e-06 5.67e-06 2.92e-06 6.55e-06 2.2e-06 9.74e-07 3.52e-06 8.97e-06 6.71e-06 1.46e-06 8.98e-06 2.07e-06 2.68e-06 1.49e-06 7.34e-06 5.03e-06 2.56e-06 3.22e-07 5.74e-07 2.54e-06 2.26e-06 9.36e-07 9.88e-07 4.71e-07 8.94e-07 3.22e-07 2.1e-07 1.36e-05 2.67e-06 1.91e-07 8.27e-07 9.77e-07 1.06e-06 4.27e-07 3.89e-07