logo

Genes within 1Mb (chr6:139257872:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00592 0.0938 0.19 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 1.52e-01 -0.103 0.0713 0.19 B L1
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0173 0.0912 0.19 B L1
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0213 0.0806 0.19 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 5.13e-01 0.031 0.0473 0.19 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -34126 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0372 0.116 0.19 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 6.48e-01 0.0334 0.0731 0.19 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -13490 sc-eQTL 1.16e-02 -0.204 0.0801 0.19 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 4.76e-01 0.0741 0.104 0.19 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 3.66e-01 -0.063 0.0696 0.19 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0651 0.0865 0.19 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 4.50e-01 0.0514 0.068 0.19 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 8.47e-01 0.00964 0.0499 0.19 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 4.52e-02 -0.17 0.0845 0.19 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 18219 sc-eQTL 2.11e-01 0.105 0.0838 0.19 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 1.66e-01 -0.159 0.114 0.19 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0825 0.0747 0.19 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0578 0.0818 0.19 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 7.62e-02 -0.136 0.0765 0.19 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0212 0.0439 0.19 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 7.35e-02 -0.149 0.0827 0.19 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 18219 sc-eQTL 3.62e-01 0.0922 0.101 0.19 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 9.60e-01 0.0057 0.114 0.194 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00563 0.08 0.194 DC L1
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 2.84e-01 0.1 0.0934 0.194 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 565301 sc-eQTL 4.30e-01 0.0823 0.104 0.194 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 4.00e-01 0.0776 0.0921 0.194 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0789 0.0901 0.194 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0107 0.107 0.194 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 565324 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0468 0.109 0.194 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 6.90e-01 0.0331 0.0829 0.19 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0424 0.0573 0.19 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 3.85e-01 0.0657 0.0755 0.19 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 565301 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0226 0.108 0.19 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 4.85e-02 0.125 0.0628 0.19 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 5.21e-02 -0.16 0.0818 0.19 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0901 0.0871 0.19 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 565324 sc-eQTL 2.72e-01 0.124 0.112 0.19 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 5.74e-01 0.0569 0.101 0.189 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 5.78e-02 -0.169 0.0884 0.189 NK L1
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 7.92e-01 -0.023 0.0874 0.189 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 1.02e-01 0.136 0.0827 0.189 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0182 0.0607 0.189 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0355 0.0808 0.189 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 4.24e-01 0.0952 0.119 0.19 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 1.69e-02 -0.183 0.0759 0.19 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0562 0.0862 0.19 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 9.94e-02 0.153 0.0922 0.19 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 1.45e-01 -0.0885 0.0604 0.19 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 6.73e-01 0.03 0.0711 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 5.11e-01 -0.093 0.141 0.184 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0356 0.124 0.184 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0423 0.135 0.184 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0501 0.141 0.184 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0396 0.128 0.184 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -34126 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0701 0.109 0.184 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 5.10e-01 0.0907 0.137 0.184 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -13490 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0437 0.137 0.184 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 1.48e-01 -0.167 0.115 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 1.97e-01 -0.103 0.0798 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0114 0.1 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0286 0.108 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 2.13e-01 -0.115 0.0917 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -34126 sc-eQTL 5.59e-01 0.066 0.113 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00453 0.104 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -13490 sc-eQTL 7.83e-03 -0.297 0.111 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0215 0.118 0.19 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 3.10e-02 -0.191 0.0878 0.19 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 2.36e-01 0.121 0.102 0.19 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0809 0.11 0.19 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0224 0.0874 0.19 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -34126 sc-eQTL 7.95e-02 0.195 0.111 0.19 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 3.82e-01 0.0896 0.102 0.19 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -13490 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00995 0.126 0.19 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0121 0.111 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0876 0.0779 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 6.88e-01 0.0389 0.0968 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0824 0.0894 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 6.96e-01 0.0245 0.0627 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -34126 sc-eQTL 1.18e-01 -0.183 0.117 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0433 0.0853 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -13490 sc-eQTL 1.44e-01 -0.164 0.111 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 5.52e-01 0.0649 0.109 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 1.22e-01 -0.115 0.0742 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 3.16e-01 -0.103 0.103 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0628 0.098 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 1.87e-01 0.0952 0.0719 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -34126 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0732 0.114 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0289 0.117 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -13490 sc-eQTL 1.04e-01 -0.174 0.106 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 4.72e-01 0.0807 0.112 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0193 0.0968 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 9.73e-01 0.00383 0.113 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 4.92e-01 0.0755 0.11 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 2.57e-01 0.113 0.0998 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 5.59e-01 0.0588 0.1 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 18219 sc-eQTL 3.93e-01 0.0887 0.104 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 4.14e-01 0.0892 0.109 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0783 0.0679 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0395 0.0849 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 2.65e-01 0.084 0.0751 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 4.04e-01 0.0424 0.0506 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 4.39e-02 -0.173 0.0853 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 18219 sc-eQTL 5.71e-01 0.0494 0.0871 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 2.05e-01 -0.136 0.107 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0956 0.0796 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0928 0.0856 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0784 0.0812 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 6.55e-01 -0.028 0.0626 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0941 0.0928 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 18219 sc-eQTL 2.56e-01 0.114 0.1 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 3.48e-01 -0.113 0.121 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 5.00e-01 0.0556 0.0822 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 9.70e-01 0.0035 0.094 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 4.90e-01 0.0707 0.102 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0797 0.0728 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 6.06e-01 0.0494 0.0958 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 18219 sc-eQTL 5.15e-01 0.0653 0.1 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 3.99e-01 -0.105 0.124 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 1.66e-01 -0.122 0.0881 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0652 0.0901 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 4.66e-02 -0.192 0.0957 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 7.76e-02 -0.138 0.0776 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0132 0.091 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 18219 sc-eQTL 2.45e-01 0.127 0.109 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0434 0.118 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0406 0.0757 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0612 0.0913 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 2.04e-01 -0.116 0.0913 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00389 0.0481 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 1.23e-01 -0.15 0.0967 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 18219 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0881 0.111 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 2.26e-01 -0.159 0.131 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0578 0.0922 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 9.49e-01 0.00617 0.0961 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 6.43e-01 0.0463 0.0998 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 1.45e-01 0.145 0.099 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 1.06e-01 -0.165 0.102 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 18219 sc-eQTL 1.65e-01 0.15 0.107 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 2.08e-01 -0.152 0.12 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0612 0.11 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 8.20e-01 0.0257 0.113 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 9.33e-01 0.00984 0.117 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 5.25e-01 0.0575 0.0904 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0469 0.0983 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 18219 sc-eQTL 2.47e-01 0.129 0.112 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 6.38e-01 0.0608 0.129 0.193 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 6.13e-02 -0.167 0.0888 0.193 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0404 0.098 0.193 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 1.40e-01 0.156 0.105 0.193 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0305 0.0776 0.193 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0145 0.0914 0.193 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 1.45e-01 0.173 0.118 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 9.60e-01 0.00507 0.101 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 2.32e-01 0.128 0.107 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 9.34e-01 0.00835 0.1 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 8.35e-01 0.0192 0.0923 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 4.54e-01 0.0742 0.0988 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 9.56e-01 0.00602 0.11 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 2.85e-02 -0.212 0.0962 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0329 0.0943 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 4.06e-02 0.182 0.0885 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0141 0.0605 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0393 0.0806 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 6.94e-01 0.0498 0.126 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 3.04e-01 -0.111 0.107 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 7.61e-01 -0.036 0.118 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 1.18e-01 0.182 0.116 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0297 0.0959 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 1.74e-01 -0.139 0.102 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 5.64e-01 0.0651 0.112 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 1.02e-01 -0.158 0.0963 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0109 0.0969 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 7.51e-01 0.0319 0.1 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 6.97e-01 0.0251 0.0644 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0351 0.0842 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0762 0.144 0.181 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 2.23e-01 -0.156 0.128 0.181 PB L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 3.83e-01 -0.137 0.157 0.181 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 7.46e-02 0.248 0.138 0.181 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 7.70e-01 0.0287 0.0978 0.181 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -34126 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0332 0.143 0.181 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 9.93e-01 0.000893 0.108 0.181 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -13490 sc-eQTL 4.12e-01 0.119 0.144 0.181 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 6.08e-01 0.0644 0.125 0.189 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 1.91e-01 -0.131 0.0996 0.189 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0151 0.0988 0.189 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0749 0.116 0.189 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 5.54e-02 -0.143 0.0744 0.189 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 8.88e-01 0.0127 0.0894 0.189 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 1.94e-01 0.152 0.116 0.19 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0148 0.0799 0.19 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0597 0.0971 0.19 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 2.29e-01 -0.121 0.1 0.19 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 5.32e-02 -0.165 0.0849 0.19 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 4.00e-01 0.0805 0.0955 0.19 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 18219 sc-eQTL 1.71e-01 -0.15 0.109 0.19 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 5.59e-01 0.0681 0.116 0.198 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 7.76e-01 0.0238 0.0834 0.198 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 5.42e-01 0.0675 0.111 0.198 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 565301 sc-eQTL 1.79e-01 0.145 0.108 0.198 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 3.33e-01 0.121 0.125 0.198 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0131 0.102 0.198 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 1.17e-01 -0.169 0.108 0.198 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 565324 sc-eQTL 3.35e-01 0.115 0.119 0.198 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0242 0.0919 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0159 0.066 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 2.27e-01 0.0916 0.0757 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 565301 sc-eQTL 1.92e-01 -0.144 0.11 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 1.32e-02 0.243 0.0974 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 6.53e-02 -0.153 0.0824 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0888 0.0867 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 565324 sc-eQTL 1.08e-01 0.186 0.115 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 4.66e-02 0.208 0.104 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0698 0.0715 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 5.80e-01 0.0491 0.0885 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 565301 sc-eQTL 1.17e-01 0.175 0.112 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0212 0.106 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0937 0.0921 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 3.52e-01 -0.085 0.0912 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 565324 sc-eQTL 6.70e-01 0.0524 0.123 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 8.77e-01 0.0214 0.138 0.2 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0357 0.132 0.2 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 4.98e-01 0.089 0.131 0.2 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 3.07e-01 0.139 0.135 0.2 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 8.91e-01 -0.014 0.102 0.2 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0268 0.118 0.2 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0134 0.123 0.189 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0795 0.0824 0.189 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 4.84e-01 0.0707 0.101 0.189 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 565301 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0278 0.111 0.189 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0144 0.115 0.189 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0739 0.105 0.189 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0742 0.102 0.189 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 565324 sc-eQTL 8.75e-01 0.0196 0.125 0.189 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 2.80e-02 -0.249 0.113 0.195 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 1.14e-01 -0.107 0.0676 0.195 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 2.50e-01 -0.12 0.104 0.195 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 565301 sc-eQTL 3.78e-01 0.0967 0.109 0.195 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 3.87e-01 0.0714 0.0825 0.195 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 2.68e-01 -0.11 0.0992 0.195 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0816 0.0843 0.195 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 565324 sc-eQTL 7.97e-01 0.0313 0.122 0.195 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 3.36e-01 -0.123 0.128 0.198 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 3.05e-01 0.102 0.0994 0.198 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 7.72e-01 0.0315 0.109 0.198 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 565301 sc-eQTL 3.19e-01 0.0989 0.099 0.198 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0779 0.1 0.198 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 2.20e-01 0.135 0.109 0.198 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 6.16e-01 0.0649 0.129 0.198 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 565324 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0766 0.0995 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 3.27e-01 -0.109 0.111 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 1.42e-01 -0.113 0.0764 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0219 0.0987 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 5.58e-01 -0.06 0.102 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0958 0.0706 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -34126 sc-eQTL 3.26e-02 0.25 0.116 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 6.78e-01 0.0414 0.0996 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -13490 sc-eQTL 2.51e-02 -0.258 0.114 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 8.27e-01 0.0227 0.104 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 1.58e-01 -0.101 0.0714 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00909 0.0968 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0741 0.0824 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 3.93e-01 0.0495 0.0578 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -34126 sc-eQTL 1.09e-01 -0.194 0.12 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 9.74e-01 0.00286 0.088 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -13490 sc-eQTL 4.19e-02 -0.21 0.102 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 3.15e-01 0.0845 0.084 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0372 0.0627 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 1.89e-01 0.0992 0.0752 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 565301 sc-eQTL 7.11e-01 -0.041 0.11 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 1.13e-01 0.144 0.0902 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 6.05e-02 -0.151 0.0801 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0553 0.0883 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 565324 sc-eQTL 9.68e-02 0.196 0.118 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 1.27e-01 -0.173 0.113 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0794 0.0604 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0143 0.097 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 565301 sc-eQTL 6.93e-01 0.0426 0.108 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 3.72e-01 0.06 0.067 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0652 0.0982 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0663 0.0846 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 565324 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0255 0.119 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 sc-eQTL 8.04e-01 0.0261 0.105 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 854341 sc-eQTL 3.12e-02 -0.196 0.0902 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 122792 sc-eQTL 5.70e-01 -0.051 0.0896 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 269611 sc-eQTL 4.46e-02 0.175 0.0868 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 229127 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0132 0.0565 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -116776 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0497 0.0817 0.19 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 484363 pQTL 0.0251 -0.103 0.0459 0.0 0.0 0.158
ENSG00000226571 AL592429.2 -13490 eQTL 4.88e-07 -0.23 0.0455 0.0267 0.0274 0.154

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000218565 \N -80146 7.78e-06 9.23e-06 5.92e-07 3.85e-06 1.72e-06 3.71e-06 9.23e-06 1.25e-06 5.2e-06 3.3e-06 8.8e-06 3.68e-06 1.04e-05 3.27e-06 1.67e-06 4.41e-06 3.72e-06 3.84e-06 1.72e-06 1.4e-06 2.93e-06 7.4e-06 5.58e-06 1.87e-06 1.05e-05 2.45e-06 3.08e-06 1.73e-06 6.87e-06 6.83e-06 4.02e-06 5.57e-07 7.39e-07 2.18e-06 2.44e-06 1.07e-06 1.02e-06 5.58e-07 1.35e-06 5.93e-07 6.93e-07 8.05e-06 1.28e-06 1.59e-07 6.98e-07 1.16e-06 1.02e-06 7.14e-07 3.29e-07
ENSG00000226571 AL592429.2 -13490 3.08e-05 2.83e-05 4.84e-06 1.34e-05 4.62e-06 1.26e-05 3.74e-05 3.75e-06 2.47e-05 1.19e-05 3.16e-05 1.35e-05 4.02e-05 1.15e-05 6.04e-06 1.45e-05 1.44e-05 2.1e-05 6.78e-06 5.36e-06 1.15e-05 2.64e-05 2.61e-05 7.36e-06 3.73e-05 6.55e-06 1.02e-05 9.99e-06 2.73e-05 2.21e-05 1.61e-05 1.63e-06 2.24e-06 5.81e-06 9.74e-06 4.59e-06 2.68e-06 2.97e-06 3.99e-06 2.86e-06 1.64e-06 3.29e-05 2.95e-06 3.24e-07 2.08e-06 2.95e-06 3.46e-06 1.48e-06 1.27e-06