logo

Genes within 1Mb (chr6:139257572:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00592 0.0938 0.19 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 1.52e-01 -0.103 0.0713 0.19 B L1
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0173 0.0912 0.19 B L1
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0213 0.0806 0.19 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 5.13e-01 0.031 0.0473 0.19 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -34426 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0372 0.116 0.19 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 6.48e-01 0.0334 0.0731 0.19 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -13790 sc-eQTL 1.16e-02 -0.204 0.0801 0.19 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 4.76e-01 0.0741 0.104 0.19 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 3.66e-01 -0.063 0.0696 0.19 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0651 0.0865 0.19 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 4.50e-01 0.0514 0.068 0.19 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 8.47e-01 0.00964 0.0499 0.19 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 4.52e-02 -0.17 0.0845 0.19 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 17919 sc-eQTL 2.11e-01 0.105 0.0838 0.19 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 1.66e-01 -0.159 0.114 0.19 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0825 0.0747 0.19 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0578 0.0818 0.19 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 7.62e-02 -0.136 0.0765 0.19 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0212 0.0439 0.19 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 7.35e-02 -0.149 0.0827 0.19 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 17919 sc-eQTL 3.62e-01 0.0922 0.101 0.19 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 9.60e-01 0.0057 0.114 0.194 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00563 0.08 0.194 DC L1
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 2.84e-01 0.1 0.0934 0.194 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 565001 sc-eQTL 4.30e-01 0.0823 0.104 0.194 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 4.00e-01 0.0776 0.0921 0.194 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0789 0.0901 0.194 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0107 0.107 0.194 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 565024 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0468 0.109 0.194 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 6.90e-01 0.0331 0.0829 0.19 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0424 0.0573 0.19 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 3.85e-01 0.0657 0.0755 0.19 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 565001 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0226 0.108 0.19 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 4.85e-02 0.125 0.0628 0.19 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 5.21e-02 -0.16 0.0818 0.19 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0901 0.0871 0.19 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 565024 sc-eQTL 2.72e-01 0.124 0.112 0.19 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 5.74e-01 0.0569 0.101 0.189 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 5.78e-02 -0.169 0.0884 0.189 NK L1
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 7.92e-01 -0.023 0.0874 0.189 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 1.02e-01 0.136 0.0827 0.189 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0182 0.0607 0.189 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0355 0.0808 0.189 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 4.24e-01 0.0952 0.119 0.19 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 1.69e-02 -0.183 0.0759 0.19 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0562 0.0862 0.19 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 9.94e-02 0.153 0.0922 0.19 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 1.45e-01 -0.0885 0.0604 0.19 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 6.73e-01 0.03 0.0711 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 5.11e-01 -0.093 0.141 0.184 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0356 0.124 0.184 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0423 0.135 0.184 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0501 0.141 0.184 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0396 0.128 0.184 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -34426 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0701 0.109 0.184 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 5.10e-01 0.0907 0.137 0.184 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -13790 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0437 0.137 0.184 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 1.48e-01 -0.167 0.115 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 1.97e-01 -0.103 0.0798 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0114 0.1 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0286 0.108 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 2.13e-01 -0.115 0.0917 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -34426 sc-eQTL 5.59e-01 0.066 0.113 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00453 0.104 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -13790 sc-eQTL 7.83e-03 -0.297 0.111 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0215 0.118 0.19 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 3.10e-02 -0.191 0.0878 0.19 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 2.36e-01 0.121 0.102 0.19 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0809 0.11 0.19 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0224 0.0874 0.19 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -34426 sc-eQTL 7.95e-02 0.195 0.111 0.19 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 3.82e-01 0.0896 0.102 0.19 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -13790 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00995 0.126 0.19 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0121 0.111 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0876 0.0779 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 6.88e-01 0.0389 0.0968 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0824 0.0894 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 6.96e-01 0.0245 0.0627 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -34426 sc-eQTL 1.18e-01 -0.183 0.117 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0433 0.0853 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -13790 sc-eQTL 1.44e-01 -0.164 0.111 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 5.52e-01 0.0649 0.109 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 1.22e-01 -0.115 0.0742 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 3.16e-01 -0.103 0.103 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0628 0.098 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 1.87e-01 0.0952 0.0719 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -34426 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0732 0.114 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0289 0.117 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -13790 sc-eQTL 1.04e-01 -0.174 0.106 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 4.72e-01 0.0807 0.112 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0193 0.0968 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 9.73e-01 0.00383 0.113 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 4.92e-01 0.0755 0.11 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 2.57e-01 0.113 0.0998 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 5.59e-01 0.0588 0.1 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 17919 sc-eQTL 3.93e-01 0.0887 0.104 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 4.14e-01 0.0892 0.109 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0783 0.0679 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0395 0.0849 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 2.65e-01 0.084 0.0751 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 4.04e-01 0.0424 0.0506 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 4.39e-02 -0.173 0.0853 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 17919 sc-eQTL 5.71e-01 0.0494 0.0871 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 2.05e-01 -0.136 0.107 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0956 0.0796 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0928 0.0856 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0784 0.0812 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 6.55e-01 -0.028 0.0626 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0941 0.0928 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 17919 sc-eQTL 2.56e-01 0.114 0.1 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 3.48e-01 -0.113 0.121 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 5.00e-01 0.0556 0.0822 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 9.70e-01 0.0035 0.094 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 4.90e-01 0.0707 0.102 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0797 0.0728 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 6.06e-01 0.0494 0.0958 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 17919 sc-eQTL 5.15e-01 0.0653 0.1 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 3.99e-01 -0.105 0.124 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 1.66e-01 -0.122 0.0881 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0652 0.0901 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 4.66e-02 -0.192 0.0957 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 7.76e-02 -0.138 0.0776 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0132 0.091 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 17919 sc-eQTL 2.45e-01 0.127 0.109 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0434 0.118 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0406 0.0757 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0612 0.0913 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 2.04e-01 -0.116 0.0913 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00389 0.0481 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 1.23e-01 -0.15 0.0967 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 17919 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0881 0.111 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 2.26e-01 -0.159 0.131 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0578 0.0922 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 9.49e-01 0.00617 0.0961 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 6.43e-01 0.0463 0.0998 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 1.45e-01 0.145 0.099 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 1.06e-01 -0.165 0.102 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 17919 sc-eQTL 1.65e-01 0.15 0.107 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 2.08e-01 -0.152 0.12 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0612 0.11 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 8.20e-01 0.0257 0.113 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 9.33e-01 0.00984 0.117 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 5.25e-01 0.0575 0.0904 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0469 0.0983 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 17919 sc-eQTL 2.47e-01 0.129 0.112 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 6.38e-01 0.0608 0.129 0.193 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 6.13e-02 -0.167 0.0888 0.193 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0404 0.098 0.193 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 1.40e-01 0.156 0.105 0.193 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0305 0.0776 0.193 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0145 0.0914 0.193 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 1.45e-01 0.173 0.118 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 9.60e-01 0.00507 0.101 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 2.32e-01 0.128 0.107 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 9.34e-01 0.00835 0.1 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 8.35e-01 0.0192 0.0923 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 4.54e-01 0.0742 0.0988 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 9.56e-01 0.00602 0.11 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 2.85e-02 -0.212 0.0962 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0329 0.0943 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 4.06e-02 0.182 0.0885 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0141 0.0605 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0393 0.0806 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 6.94e-01 0.0498 0.126 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 3.04e-01 -0.111 0.107 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 7.61e-01 -0.036 0.118 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 1.18e-01 0.182 0.116 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0297 0.0959 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 1.74e-01 -0.139 0.102 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 5.64e-01 0.0651 0.112 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 1.02e-01 -0.158 0.0963 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0109 0.0969 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 7.51e-01 0.0319 0.1 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 6.97e-01 0.0251 0.0644 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0351 0.0842 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0762 0.144 0.181 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 2.23e-01 -0.156 0.128 0.181 PB L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 3.83e-01 -0.137 0.157 0.181 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 7.46e-02 0.248 0.138 0.181 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 7.70e-01 0.0287 0.0978 0.181 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -34426 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0332 0.143 0.181 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 9.93e-01 0.000893 0.108 0.181 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -13790 sc-eQTL 4.12e-01 0.119 0.144 0.181 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 6.08e-01 0.0644 0.125 0.189 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 1.91e-01 -0.131 0.0996 0.189 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0151 0.0988 0.189 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0749 0.116 0.189 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 5.54e-02 -0.143 0.0744 0.189 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 8.88e-01 0.0127 0.0894 0.189 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 1.94e-01 0.152 0.116 0.19 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0148 0.0799 0.19 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0597 0.0971 0.19 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 2.29e-01 -0.121 0.1 0.19 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 5.32e-02 -0.165 0.0849 0.19 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 4.00e-01 0.0805 0.0955 0.19 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 17919 sc-eQTL 1.71e-01 -0.15 0.109 0.19 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 5.59e-01 0.0681 0.116 0.198 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 7.76e-01 0.0238 0.0834 0.198 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 5.42e-01 0.0675 0.111 0.198 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 565001 sc-eQTL 1.79e-01 0.145 0.108 0.198 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 3.33e-01 0.121 0.125 0.198 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0131 0.102 0.198 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 1.17e-01 -0.169 0.108 0.198 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 565024 sc-eQTL 3.35e-01 0.115 0.119 0.198 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0242 0.0919 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0159 0.066 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 2.27e-01 0.0916 0.0757 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 565001 sc-eQTL 1.92e-01 -0.144 0.11 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 1.32e-02 0.243 0.0974 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 6.53e-02 -0.153 0.0824 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0888 0.0867 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 565024 sc-eQTL 1.08e-01 0.186 0.115 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 4.66e-02 0.208 0.104 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0698 0.0715 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 5.80e-01 0.0491 0.0885 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 565001 sc-eQTL 1.17e-01 0.175 0.112 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0212 0.106 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0937 0.0921 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 3.52e-01 -0.085 0.0912 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 565024 sc-eQTL 6.70e-01 0.0524 0.123 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 8.77e-01 0.0214 0.138 0.2 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0357 0.132 0.2 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 4.98e-01 0.089 0.131 0.2 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 3.07e-01 0.139 0.135 0.2 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 8.91e-01 -0.014 0.102 0.2 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0268 0.118 0.2 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0134 0.123 0.189 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0795 0.0824 0.189 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 4.84e-01 0.0707 0.101 0.189 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 565001 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0278 0.111 0.189 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0144 0.115 0.189 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0739 0.105 0.189 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0742 0.102 0.189 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 565024 sc-eQTL 8.75e-01 0.0196 0.125 0.189 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 2.80e-02 -0.249 0.113 0.195 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 1.14e-01 -0.107 0.0676 0.195 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 2.50e-01 -0.12 0.104 0.195 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 565001 sc-eQTL 3.78e-01 0.0967 0.109 0.195 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 3.87e-01 0.0714 0.0825 0.195 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 2.68e-01 -0.11 0.0992 0.195 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0816 0.0843 0.195 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 565024 sc-eQTL 7.97e-01 0.0313 0.122 0.195 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 3.36e-01 -0.123 0.128 0.198 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 3.05e-01 0.102 0.0994 0.198 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 7.72e-01 0.0315 0.109 0.198 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 565001 sc-eQTL 3.19e-01 0.0989 0.099 0.198 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0779 0.1 0.198 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 2.20e-01 0.135 0.109 0.198 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 6.16e-01 0.0649 0.129 0.198 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 565024 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0766 0.0995 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 3.27e-01 -0.109 0.111 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 1.42e-01 -0.113 0.0764 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0219 0.0987 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 5.58e-01 -0.06 0.102 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0958 0.0706 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -34426 sc-eQTL 3.26e-02 0.25 0.116 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 6.78e-01 0.0414 0.0996 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -13790 sc-eQTL 2.51e-02 -0.258 0.114 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 8.27e-01 0.0227 0.104 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 1.58e-01 -0.101 0.0714 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00909 0.0968 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0741 0.0824 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 3.93e-01 0.0495 0.0578 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -34426 sc-eQTL 1.09e-01 -0.194 0.12 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 9.74e-01 0.00286 0.088 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -13790 sc-eQTL 4.19e-02 -0.21 0.102 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 3.15e-01 0.0845 0.084 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0372 0.0627 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 1.89e-01 0.0992 0.0752 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 565001 sc-eQTL 7.11e-01 -0.041 0.11 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 1.13e-01 0.144 0.0902 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 6.05e-02 -0.151 0.0801 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0553 0.0883 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 565024 sc-eQTL 9.68e-02 0.196 0.118 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 1.27e-01 -0.173 0.113 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0794 0.0604 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0143 0.097 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 565001 sc-eQTL 6.93e-01 0.0426 0.108 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 3.72e-01 0.06 0.067 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0652 0.0982 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0663 0.0846 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 565024 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0255 0.119 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 sc-eQTL 8.04e-01 0.0261 0.105 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 854041 sc-eQTL 3.12e-02 -0.196 0.0902 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 122492 sc-eQTL 5.70e-01 -0.051 0.0896 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 269311 sc-eQTL 4.46e-02 0.175 0.0868 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 228827 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0132 0.0565 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -117076 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0497 0.0817 0.19 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 484063 pQTL 0.0384 -0.0949 0.0458 0.0 0.0 0.16
ENSG00000226571 AL592429.2 -13790 eQTL 6.57e-07 -0.227 0.0453 0.0196 0.0205 0.156

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000218565 \N -80446 1.07e-05 1.26e-05 1.3e-06 6.02e-06 2.45e-06 4.22e-06 1.14e-05 2.01e-06 1.02e-05 5.36e-06 1.33e-05 6.14e-06 1.71e-05 3.72e-06 3.49e-06 6.37e-06 4.98e-06 6.85e-06 2.62e-06 2.62e-06 5.06e-06 1.06e-05 7.23e-06 3.08e-06 1.65e-05 3.12e-06 4.67e-06 4.25e-06 8.51e-06 8.14e-06 7.67e-06 5.74e-07 6.72e-07 2.75e-06 5.32e-06 2.1e-06 1.61e-06 1.84e-06 1.64e-06 9.06e-07 8.99e-07 1.28e-05 1.29e-06 1.8e-07 7.87e-07 1.42e-06 9.55e-07 7.08e-07 5.83e-07
ENSG00000226571 AL592429.2 -13790 3.59e-05 3.29e-05 5.8e-06 1.51e-05 5.91e-06 1.38e-05 4.47e-05 4.46e-06 3.05e-05 1.54e-05 3.73e-05 1.74e-05 4.74e-05 1.41e-05 6.84e-06 1.77e-05 1.65e-05 2.41e-05 7.62e-06 6.54e-06 1.43e-05 3.27e-05 3.09e-05 8.66e-06 4.33e-05 7.7e-06 1.33e-05 1.24e-05 3.11e-05 2.45e-05 1.96e-05 1.63e-06 2.37e-06 6.69e-06 1.15e-05 5.52e-06 3.1e-06 3.19e-06 4.54e-06 3.19e-06 1.74e-06 3.81e-05 3.46e-06 3.62e-07 2.43e-06 3.67e-06 3.97e-06 1.46e-06 1.51e-06