logo

Genes within 1Mb (chr6:139250003:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00486 0.0913 0.214 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 3.08e-01 -0.071 0.0695 0.214 B L1
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00612 0.0888 0.214 B L1
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 8.39e-01 -0.016 0.0785 0.214 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 6.71e-01 0.0196 0.0461 0.214 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -41995 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0456 0.113 0.214 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 3.84e-01 0.062 0.071 0.214 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -21359 sc-eQTL 5.65e-02 -0.15 0.0784 0.214 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 3.14e-01 0.102 0.101 0.214 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0532 0.068 0.214 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0503 0.0845 0.214 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 2.10e-01 0.0833 0.0662 0.214 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 5.72e-01 0.0276 0.0487 0.214 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 1.97e-01 -0.107 0.0829 0.214 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 10350 sc-eQTL 3.86e-01 0.0712 0.0819 0.214 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0626 0.113 0.214 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0722 0.0736 0.214 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0575 0.0805 0.214 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 9.96e-02 -0.125 0.0754 0.214 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0259 0.0431 0.214 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 1.50e-01 -0.118 0.0816 0.214 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 10350 sc-eQTL 5.42e-01 0.0608 0.0995 0.214 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 7.61e-01 0.0342 0.112 0.218 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 7.20e-01 0.0283 0.0789 0.218 DC L1
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 1.39e-01 0.136 0.0919 0.218 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 557432 sc-eQTL 5.94e-01 0.0548 0.103 0.218 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 3.33e-01 0.0881 0.0908 0.218 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0202 0.0891 0.218 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 3.84e-01 0.0922 0.106 0.218 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 557455 sc-eQTL 1.77e-01 -0.145 0.107 0.218 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 9.84e-01 0.00159 0.0808 0.214 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0397 0.0559 0.214 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 2.29e-01 0.0887 0.0735 0.214 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 557432 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0357 0.106 0.214 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 2.44e-02 0.139 0.0611 0.214 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 4.54e-02 -0.161 0.0798 0.214 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0602 0.0851 0.214 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 557455 sc-eQTL 7.37e-01 0.037 0.11 0.214 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0199 0.0983 0.212 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 1.28e-01 -0.132 0.0861 0.212 NK L1
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0414 0.0849 0.212 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 5.46e-02 0.155 0.0802 0.212 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 8.77e-01 -0.00919 0.0591 0.212 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 8.80e-01 0.0118 0.0785 0.212 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 4.05e-01 0.0972 0.117 0.214 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 1.85e-02 -0.177 0.0744 0.214 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 5.70e-01 -0.048 0.0844 0.214 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 2.11e-01 0.114 0.0905 0.214 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0679 0.0593 0.214 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 3.56e-01 0.0643 0.0695 0.214 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0737 0.139 0.209 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 5.27e-01 0.0771 0.122 0.209 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00358 0.132 0.209 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 2.91e-01 0.146 0.138 0.209 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 7.82e-01 0.0348 0.125 0.209 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -41995 sc-eQTL 3.92e-01 -0.092 0.107 0.209 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 4.21e-01 0.109 0.135 0.209 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -21359 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0337 0.135 0.209 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 2.55e-01 -0.128 0.112 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0641 0.0779 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00461 0.0976 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 9.16e-01 0.0111 0.105 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0539 0.0895 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -41995 sc-eQTL 2.45e-01 0.128 0.109 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 9.58e-01 0.00526 0.101 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -21359 sc-eQTL 4.45e-02 -0.219 0.108 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0162 0.114 0.213 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 5.30e-02 -0.166 0.0853 0.213 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 1.48e-01 0.143 0.0984 0.213 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0905 0.107 0.213 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0364 0.0848 0.213 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -41995 sc-eQTL 6.49e-02 0.199 0.107 0.213 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 3.65e-01 0.0901 0.0992 0.213 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -21359 sc-eQTL 6.47e-01 0.056 0.122 0.213 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 9.11e-01 0.0121 0.108 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 5.01e-01 -0.051 0.0756 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 5.91e-01 0.0505 0.0938 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 2.24e-01 -0.106 0.0866 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 5.81e-01 0.0335 0.0607 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -41995 sc-eQTL 1.19e-01 -0.177 0.113 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0381 0.0827 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -21359 sc-eQTL 2.82e-01 -0.117 0.108 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 5.47e-01 0.0639 0.106 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0697 0.0724 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0615 0.0998 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0636 0.0952 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 2.35e-01 0.0833 0.0699 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -41995 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0789 0.111 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 8.15e-01 0.0266 0.113 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -21359 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0974 0.104 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 4.70e-01 0.0784 0.108 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0234 0.0936 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 4.72e-01 0.0788 0.109 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 3.60e-01 0.0972 0.106 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 6.34e-01 0.0462 0.0968 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 1.64e-01 0.135 0.0968 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 10350 sc-eQTL 6.26e-01 0.049 0.1 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 2.31e-01 0.128 0.106 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0775 0.0664 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0277 0.083 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 1.82e-01 0.0982 0.0733 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 1.59e-01 0.0698 0.0493 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 1.24e-01 -0.129 0.0837 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 10350 sc-eQTL 7.39e-01 0.0284 0.0851 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0908 0.104 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0661 0.0778 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0639 0.0836 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0423 0.0793 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0378 0.061 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0225 0.0908 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 10350 sc-eQTL 3.20e-01 0.0976 0.0979 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 3.27e-01 -0.115 0.117 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 3.75e-01 0.071 0.08 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00839 0.0915 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 4.71e-01 0.0718 0.0995 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0633 0.0709 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 3.10e-01 0.0946 0.0931 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 10350 sc-eQTL 3.49e-01 0.0914 0.0974 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0609 0.121 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 1.39e-01 -0.127 0.0857 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0421 0.0878 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 2.92e-02 -0.204 0.093 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 6.43e-02 -0.14 0.0755 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00365 0.0886 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 10350 sc-eQTL 5.16e-01 0.0691 0.106 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 8.90e-01 0.016 0.115 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0189 0.0737 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0789 0.0889 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0603 0.0892 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 7.38e-01 0.0157 0.0468 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 2.28e-01 -0.114 0.0943 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 10350 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0768 0.108 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0529 0.127 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0442 0.0894 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0111 0.0931 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 4.72e-01 0.0697 0.0966 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 2.39e-01 0.113 0.0961 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0891 0.0989 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 10350 sc-eQTL 2.40e-01 0.123 0.104 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 1.78e-01 -0.157 0.116 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0125 0.106 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 9.05e-01 0.0131 0.109 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0221 0.114 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 7.35e-01 0.0296 0.0875 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 8.54e-01 0.0175 0.0951 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 10350 sc-eQTL 2.77e-01 0.118 0.108 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 4.91e-01 0.087 0.126 0.216 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 5.87e-02 -0.165 0.0868 0.216 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0442 0.0959 0.216 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 3.79e-01 0.091 0.103 0.216 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0261 0.076 0.216 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 6.21e-01 0.0442 0.0894 0.216 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 3.78e-01 0.102 0.115 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 6.75e-01 0.0413 0.0983 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 2.09e-01 0.131 0.104 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 8.78e-01 -0.015 0.0976 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 9.74e-01 0.00296 0.09 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 3.17e-01 0.0966 0.0962 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0548 0.107 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 7.12e-02 -0.17 0.0939 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0452 0.0916 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 6.16e-03 0.236 0.0854 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00409 0.0588 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0124 0.0785 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 5.49e-01 0.0736 0.123 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0547 0.105 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0269 0.115 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 1.36e-01 0.169 0.113 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0176 0.0933 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0933 0.0994 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 9.06e-01 0.013 0.109 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 1.40e-01 -0.139 0.0935 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0355 0.0939 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00655 0.097 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 4.30e-01 0.0493 0.0624 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 6.97e-01 0.0318 0.0816 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 2.62e-01 -0.157 0.139 0.211 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 4.11e-01 -0.102 0.124 0.211 PB L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 1.67e-01 -0.21 0.151 0.211 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 1.13e-01 0.214 0.134 0.211 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 9.12e-01 0.0105 0.0948 0.211 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -41995 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0187 0.138 0.211 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 7.70e-01 0.0305 0.104 0.211 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -21359 sc-eQTL 1.71e-01 0.191 0.139 0.211 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0522 0.122 0.213 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0955 0.0972 0.213 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0278 0.0963 0.213 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0846 0.113 0.213 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 7.60e-02 -0.129 0.0726 0.213 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 6.75e-01 0.0366 0.0871 0.213 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 2.82e-01 0.123 0.114 0.214 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0198 0.0781 0.214 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0663 0.0949 0.214 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 2.37e-01 -0.116 0.098 0.214 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 5.06e-02 -0.163 0.083 0.214 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 1.08e-01 0.15 0.0929 0.214 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 10350 sc-eQTL 6.90e-02 -0.194 0.106 0.214 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 6.03e-01 0.0589 0.113 0.22 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 5.52e-01 0.0482 0.081 0.22 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 4.03e-01 0.09 0.107 0.22 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 557432 sc-eQTL 3.19e-01 0.105 0.105 0.22 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 2.70e-01 0.134 0.121 0.22 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 8.78e-01 0.0153 0.0992 0.22 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 3.13e-01 -0.106 0.105 0.22 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 557455 sc-eQTL 8.94e-01 0.0155 0.116 0.22 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 8.75e-01 -0.014 0.0892 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0254 0.064 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 2.22e-01 0.0899 0.0734 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 557432 sc-eQTL 2.31e-01 -0.128 0.107 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 1.00e-02 0.245 0.0943 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 8.06e-02 -0.14 0.08 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0339 0.0842 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 557455 sc-eQTL 2.80e-01 0.121 0.112 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 1.54e-01 0.145 0.101 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0866 0.0693 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 4.41e-01 0.0663 0.0858 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 557432 sc-eQTL 2.21e-01 0.133 0.109 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0208 0.103 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0902 0.0894 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0561 0.0886 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 557455 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0203 0.119 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 7.77e-01 0.038 0.134 0.215 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 8.36e-01 0.0264 0.127 0.215 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 3.09e-01 0.129 0.127 0.215 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 3.24e-01 0.13 0.131 0.215 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 7.66e-01 0.0295 0.0989 0.215 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0192 0.114 0.215 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00979 0.119 0.213 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 3.83e-01 -0.07 0.0801 0.213 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 3.27e-01 0.0961 0.0979 0.213 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 557432 sc-eQTL 6.22e-01 0.0533 0.108 0.213 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 7.85e-01 0.0305 0.112 0.213 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 2.33e-01 -0.121 0.102 0.213 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 2.78e-01 -0.107 0.0987 0.213 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 557455 sc-eQTL 5.59e-01 -0.071 0.121 0.213 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 3.11e-02 -0.238 0.11 0.215 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0633 0.0661 0.215 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 3.65e-01 -0.092 0.101 0.215 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 557432 sc-eQTL 5.30e-01 0.067 0.107 0.215 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 2.20e-01 0.0986 0.0801 0.215 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0849 0.0967 0.215 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0974 0.0819 0.215 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 557455 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0294 0.118 0.215 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 1.97e-01 -0.163 0.126 0.22 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 2.29e-01 0.118 0.098 0.22 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 8.60e-01 0.019 0.107 0.22 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 557432 sc-eQTL 1.91e-01 0.128 0.0975 0.22 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0367 0.0993 0.22 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 1.71e-01 0.148 0.108 0.22 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 2.27e-01 0.154 0.127 0.22 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 557455 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0517 0.0984 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0849 0.108 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0806 0.0746 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 9.27e-01 0.00879 0.0961 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0218 0.0996 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0671 0.0689 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -41995 sc-eQTL 1.94e-02 0.266 0.113 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 5.48e-01 0.0582 0.0969 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -21359 sc-eQTL 1.20e-01 -0.175 0.112 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 6.33e-01 0.0481 0.1 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0607 0.0695 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 8.13e-01 0.0222 0.0939 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0898 0.0798 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 3.52e-01 0.0523 0.056 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -41995 sc-eQTL 8.23e-02 -0.204 0.117 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 9.06e-01 0.0101 0.0854 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -21359 sc-eQTL 1.34e-01 -0.15 0.0998 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 6.37e-01 0.0386 0.0816 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0489 0.0608 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 1.28e-01 0.111 0.0728 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 557432 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0401 0.107 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 1.47e-01 0.128 0.0876 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 5.96e-02 -0.147 0.0777 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000547 0.0858 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 557455 sc-eQTL 3.21e-01 0.114 0.115 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 1.42e-01 -0.162 0.11 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 4.15e-01 -0.048 0.0588 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 5.62e-01 0.0547 0.0941 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 557432 sc-eQTL 6.20e-01 0.052 0.105 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 1.34e-01 0.0975 0.0648 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0765 0.0953 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 2.10e-01 -0.103 0.0819 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 557455 sc-eQTL 3.21e-01 -0.115 0.115 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0479 0.102 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 846472 sc-eQTL 7.44e-02 -0.158 0.0881 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 114923 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0604 0.0872 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 261742 sc-eQTL 2.24e-02 0.194 0.0842 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 221258 sc-eQTL 9.09e-01 0.00632 0.055 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -124645 sc-eQTL 9.99e-01 0.000135 0.0795 0.213 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 476494 pQTL 0.0277 -0.0978 0.0444 0.0 0.0 0.174
ENSG00000226571 AL592429.2 -21359 eQTL 2.89e-07 -0.229 0.0443 0.0469 0.0441 0.167

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000226571 AL592429.2 -21359 7.24e-05 2.24e-05 2.48e-06 1.21e-05 2.7e-06 1.28e-05 2.26e-05 2.25e-06 1.77e-05 8.28e-06 2e-05 8.22e-06 2.99e-05 6.06e-06 5.11e-06 1.03e-05 9.24e-06 2.1e-05 3.53e-06 3.27e-06 7.53e-06 2.08e-05 1.66e-05 4.48e-06 2.89e-05 5.33e-06 8e-06 5.98e-06 1.53e-05 1.4e-05 1.19e-05 9.7e-07 1.19e-06 3.7e-06 7.35e-06 2.87e-06 1.71e-06 1.99e-06 2.66e-06 2.01e-06 9.3e-07 2.55e-05 2.71e-06 1.6e-07 9.34e-07 1.96e-06 2.57e-06 7.8e-07 4.39e-07