logo

Genes within 1Mb (chr6:139246271:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0068 0.0923 0.203 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0815 0.0702 0.203 B L1
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 7.93e-01 0.0236 0.0898 0.203 B L1
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0267 0.0793 0.203 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 8.38e-01 0.00955 0.0466 0.203 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -45727 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0651 0.114 0.203 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 5.09e-01 0.0476 0.0719 0.203 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -25091 sc-eQTL 2.72e-02 -0.176 0.0791 0.203 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 4.31e-01 0.0804 0.102 0.203 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0658 0.0684 0.203 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0231 0.0851 0.203 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 2.33e-01 0.0797 0.0667 0.203 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 5.97e-01 0.0259 0.049 0.203 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 1.04e-01 -0.136 0.0833 0.203 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 6618 sc-eQTL 2.53e-01 0.0945 0.0824 0.203 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0858 0.113 0.203 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0884 0.0738 0.203 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0374 0.0809 0.203 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 8.35e-02 -0.132 0.0756 0.203 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0395 0.0433 0.203 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 4.66e-02 -0.163 0.0816 0.203 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 6618 sc-eQTL 3.32e-01 0.0971 0.0998 0.203 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 7.44e-01 0.037 0.113 0.207 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 8.73e-01 0.0127 0.0794 0.207 DC L1
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 2.09e-01 0.117 0.0927 0.207 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 553700 sc-eQTL 4.63e-01 0.0761 0.103 0.207 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 4.60e-01 0.0678 0.0915 0.207 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0353 0.0897 0.207 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 7.72e-01 0.0309 0.106 0.207 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 553723 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0909 0.108 0.207 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 7.10e-01 0.0304 0.0816 0.203 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0478 0.0564 0.203 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 2.57e-01 0.0845 0.0743 0.203 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 553700 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0331 0.107 0.203 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 4.52e-02 0.125 0.0619 0.203 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 6.75e-02 -0.148 0.0807 0.203 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0823 0.0858 0.203 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 553723 sc-eQTL 7.57e-01 0.0344 0.111 0.203 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 9.92e-01 0.000971 0.0994 0.202 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 8.07e-02 -0.153 0.0869 0.202 NK L1
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00431 0.0859 0.202 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 4.55e-02 0.163 0.081 0.202 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 9.73e-01 -0.002 0.0597 0.202 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0176 0.0794 0.202 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 3.49e-01 0.11 0.117 0.203 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 2.66e-02 -0.167 0.0747 0.203 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0373 0.0846 0.203 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 1.87e-01 0.12 0.0907 0.203 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0513 0.0595 0.203 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 4.30e-01 0.0552 0.0697 0.203 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0301 0.141 0.196 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 9.34e-01 0.0102 0.124 0.196 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 9.01e-01 0.0167 0.134 0.196 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 9.73e-01 0.00485 0.141 0.196 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 9.69e-01 0.00503 0.127 0.196 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -45727 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0889 0.109 0.196 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 5.14e-01 0.0894 0.137 0.196 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -25091 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0116 0.137 0.196 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 2.39e-01 -0.134 0.113 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0837 0.0783 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 7.68e-01 0.029 0.0982 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 9.03e-01 0.013 0.106 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0827 0.09 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -45727 sc-eQTL 5.70e-01 0.0628 0.11 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 9.00e-01 0.0129 0.102 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -25091 sc-eQTL 1.79e-02 -0.259 0.109 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 9.12e-01 0.0127 0.115 0.203 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 4.62e-02 -0.172 0.0859 0.203 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 1.94e-01 0.129 0.0992 0.203 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0814 0.108 0.203 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0566 0.0853 0.203 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -45727 sc-eQTL 1.05e-01 0.176 0.108 0.203 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 4.67e-01 0.0728 0.1 0.203 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -25091 sc-eQTL 9.49e-01 0.00789 0.123 0.203 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 9.08e-01 0.0126 0.109 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0657 0.0765 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 2.99e-01 0.0988 0.0948 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 1.68e-01 -0.121 0.0876 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 8.17e-01 0.0143 0.0615 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -45727 sc-eQTL 7.52e-02 -0.204 0.114 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0477 0.0837 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -25091 sc-eQTL 1.95e-01 -0.143 0.11 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 6.61e-01 0.047 0.107 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0819 0.0731 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0471 0.101 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0551 0.0962 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 2.40e-01 0.0832 0.0706 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -45727 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0765 0.112 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0117 0.114 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -25091 sc-eQTL 2.65e-01 -0.117 0.105 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 4.76e-01 0.0782 0.11 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0358 0.0947 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 4.52e-01 0.0833 0.111 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 2.98e-01 0.112 0.107 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 5.54e-01 0.0579 0.0979 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 3.77e-01 0.087 0.0982 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 6618 sc-eQTL 5.25e-01 0.0645 0.101 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 3.55e-01 0.0995 0.107 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0837 0.0668 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00523 0.0835 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 1.27e-01 0.113 0.0737 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 1.93e-01 0.0649 0.0497 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 7.23e-02 -0.152 0.0841 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 6618 sc-eQTL 8.02e-01 0.0215 0.0857 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0998 0.105 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0869 0.0782 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0457 0.0842 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 4.09e-01 -0.066 0.0798 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0299 0.0614 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0602 0.0913 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 6618 sc-eQTL 2.17e-01 0.122 0.0984 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 2.46e-01 -0.137 0.118 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 4.04e-01 0.0672 0.0803 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 7.69e-01 0.0271 0.0919 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 5.67e-01 0.0574 0.1 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0519 0.0713 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 4.94e-01 0.0641 0.0936 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 6618 sc-eQTL 3.85e-01 0.0853 0.0979 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0669 0.121 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 1.34e-01 -0.13 0.0863 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0158 0.0884 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 1.87e-02 -0.221 0.0934 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 3.46e-02 -0.161 0.0758 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 7.63e-01 -0.027 0.0891 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 6618 sc-eQTL 3.92e-01 0.0915 0.107 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 9.56e-01 0.00641 0.116 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0431 0.0743 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0537 0.0897 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0819 0.0899 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 9.43e-01 0.00336 0.0472 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 9.39e-02 -0.16 0.0948 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 6618 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0192 0.109 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 3.19e-01 -0.128 0.128 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0648 0.0904 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 9.98e-01 0.000221 0.0942 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 5.75e-01 0.055 0.0978 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 3.13e-01 0.0985 0.0973 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 1.92e-01 -0.131 0.0998 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 6618 sc-eQTL 3.72e-01 0.0945 0.106 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 2.24e-01 -0.143 0.117 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0657 0.107 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 9.03e-01 0.0135 0.11 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 9.25e-01 0.0108 0.115 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 6.85e-01 0.0359 0.0884 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 9.07e-01 0.0113 0.0961 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 6618 sc-eQTL 3.63e-01 0.0995 0.109 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 5.41e-01 0.0773 0.126 0.206 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 6.93e-02 -0.159 0.087 0.206 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 9.71e-01 0.00347 0.0961 0.206 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 3.96e-01 0.0879 0.103 0.206 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00962 0.0761 0.206 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 6.74e-01 0.0378 0.0896 0.206 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 2.54e-01 0.132 0.115 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 9.51e-01 0.00602 0.0986 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 9.77e-02 0.174 0.104 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 9.50e-01 0.0061 0.0979 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 7.59e-01 0.0277 0.0902 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 4.37e-01 0.0752 0.0966 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0122 0.108 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 4.16e-02 -0.194 0.0947 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0122 0.0927 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 1.88e-02 0.205 0.0867 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 8.85e-01 0.00859 0.0595 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0331 0.0793 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 4.76e-01 0.0888 0.124 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0897 0.106 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 8.61e-01 0.0204 0.116 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 1.14e-01 0.181 0.114 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0516 0.0944 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 1.17e-01 -0.158 0.1 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 9.21e-01 -0.011 0.11 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 7.70e-02 -0.168 0.0944 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00338 0.0951 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 8.54e-01 0.018 0.0982 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 5.85e-01 0.0345 0.0632 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00299 0.0826 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 4.59e-01 -0.107 0.144 0.193 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 1.57e-01 -0.181 0.127 0.193 PB L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 3.95e-01 -0.133 0.156 0.193 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 1.21e-01 0.216 0.138 0.193 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 8.06e-01 0.024 0.0976 0.193 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -45727 sc-eQTL 9.30e-01 0.0125 0.143 0.193 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 7.30e-01 0.0371 0.107 0.193 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -25091 sc-eQTL 3.48e-01 0.135 0.143 0.193 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 8.83e-01 0.0181 0.123 0.202 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0909 0.0982 0.202 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 8.70e-01 -0.016 0.0972 0.202 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0643 0.114 0.202 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 9.17e-02 -0.124 0.0734 0.202 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 8.58e-01 0.0157 0.088 0.202 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 3.05e-01 0.117 0.114 0.203 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 8.09e-01 -0.019 0.0783 0.203 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0304 0.0952 0.203 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 3.07e-01 -0.101 0.0983 0.203 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 4.25e-02 -0.17 0.0831 0.203 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 2.49e-01 0.108 0.0934 0.203 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 6618 sc-eQTL 2.08e-01 -0.135 0.107 0.203 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 4.65e-01 0.0832 0.114 0.21 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 8.59e-01 0.0145 0.0816 0.21 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 3.68e-01 0.0974 0.108 0.21 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 553700 sc-eQTL 2.07e-01 0.134 0.105 0.21 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 4.23e-01 0.0977 0.122 0.21 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00649 0.0998 0.21 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 1.87e-01 -0.139 0.105 0.21 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 553723 sc-eQTL 6.00e-01 0.0613 0.117 0.21 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0114 0.0903 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0173 0.0648 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 3.35e-01 0.0719 0.0744 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 553700 sc-eQTL 2.08e-01 -0.137 0.108 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 1.31e-02 0.239 0.0956 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 1.37e-01 -0.121 0.0811 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0857 0.0851 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 553723 sc-eQTL 2.84e-01 0.122 0.113 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 5.87e-02 0.194 0.102 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0812 0.0702 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 3.02e-01 0.0898 0.0868 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 553700 sc-eQTL 1.83e-01 0.147 0.11 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0376 0.104 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0866 0.0905 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0813 0.0897 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 553723 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0231 0.121 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 7.43e-01 0.0443 0.135 0.212 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 8.24e-01 0.0285 0.128 0.212 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 4.07e-01 0.106 0.128 0.212 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 2.30e-01 0.159 0.132 0.212 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 8.00e-01 0.0252 0.0995 0.212 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00368 0.115 0.212 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0139 0.121 0.202 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 4.15e-01 -0.066 0.0809 0.202 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 3.44e-01 0.0937 0.0989 0.202 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 553700 sc-eQTL 8.55e-01 -0.02 0.109 0.202 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 9.43e-01 0.00804 0.113 0.202 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 3.08e-01 -0.105 0.103 0.202 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 2.48e-01 -0.116 0.0997 0.202 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 553723 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0656 0.122 0.202 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 4.00e-02 -0.229 0.111 0.206 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0898 0.0664 0.206 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0927 0.102 0.206 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 553700 sc-eQTL 4.27e-01 0.0853 0.107 0.206 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 1.75e-01 0.11 0.0806 0.206 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0974 0.0973 0.206 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0778 0.0826 0.206 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 553723 sc-eQTL 9.90e-01 0.00146 0.119 0.206 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 1.82e-01 -0.169 0.126 0.209 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 1.48e-01 0.143 0.0982 0.209 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 9.79e-01 0.00287 0.108 0.209 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 553700 sc-eQTL 2.44e-01 0.115 0.098 0.209 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0713 0.0995 0.209 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 1.48e-01 0.157 0.108 0.209 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 4.65e-01 0.0936 0.128 0.209 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 553723 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0753 0.0987 0.209 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0666 0.109 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0896 0.075 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 8.95e-01 0.0128 0.0967 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0266 0.1 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 1.80e-01 -0.0931 0.0692 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -45727 sc-eQTL 6.81e-02 0.209 0.114 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 5.77e-01 0.0544 0.0975 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -25091 sc-eQTL 4.70e-02 -0.225 0.112 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 6.85e-01 0.0412 0.102 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0699 0.0703 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 5.34e-01 0.0592 0.0949 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 2.08e-01 -0.102 0.0807 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 4.94e-01 0.0389 0.0568 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -45727 sc-eQTL 5.86e-02 -0.224 0.118 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00916 0.0864 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -25091 sc-eQTL 9.20e-02 -0.171 0.101 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 3.76e-01 0.0733 0.0825 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0458 0.0616 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 1.39e-01 0.109 0.0738 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 553700 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0425 0.108 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 1.59e-01 0.125 0.0888 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 9.93e-02 -0.131 0.0788 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 6.21e-01 -0.043 0.0868 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 553723 sc-eQTL 3.37e-01 0.112 0.116 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 1.98e-01 -0.143 0.111 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0677 0.0592 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 7.43e-01 0.0312 0.0949 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 553700 sc-eQTL 7.33e-01 0.036 0.106 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 1.66e-01 0.091 0.0654 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0828 0.0961 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0871 0.0827 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 553723 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0772 0.117 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0234 0.103 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 842740 sc-eQTL 4.67e-02 -0.178 0.0888 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 111191 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0269 0.0882 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 258010 sc-eQTL 2.48e-02 0.193 0.0851 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 217526 sc-eQTL 9.17e-01 0.00579 0.0556 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -128377 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0256 0.0804 0.203 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 472762 pQTL 0.0288 -0.0984 0.0449 0.0 0.0 0.167
ENSG00000164440 TXLNB -45727 eQTL 0.048 -0.0706 0.0357 0.0 0.0 0.162
ENSG00000226571 AL592429.2 -25091 eQTL 6.19e-07 -0.223 0.0445 0.0208 0.0215 0.162
ENSG00000279968 GVQW2 472619 eQTL 0.0409 -0.123 0.0601 0.0 0.0 0.162

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina