Genes within 1Mb (chr6:139240299:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 2.49e-01 0.143 0.124 0.088 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 1.13e-01 0.15 0.0943 0.088 B L1
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0279 0.121 0.088 B L1
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 2.00e-01 0.137 0.106 0.088 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0637 0.0626 0.088 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -51699 sc-eQTL 2.23e-01 0.187 0.153 0.088 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 1.86e-01 0.128 0.0965 0.088 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -31063 sc-eQTL 1.07e-01 -0.173 0.107 0.088 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 1.61e-01 0.192 0.137 0.088 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 2.06e-02 0.212 0.091 0.088 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0465 0.114 0.088 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0532 0.0899 0.088 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0284 0.066 0.088 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 2.73e-01 0.123 0.112 0.088 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 646 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0294 0.111 0.088 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 4.12e-01 0.122 0.149 0.088 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 2.01e-01 0.125 0.0973 0.088 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00744 0.107 0.088 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0458 0.1 0.088 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0235 0.0571 0.088 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 7.12e-01 0.0401 0.108 0.088 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 646 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0217 0.132 0.088 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 9.72e-01 0.00516 0.144 0.092 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 1.82e-01 0.135 0.101 0.092 DC L1
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 9.19e-01 0.0121 0.119 0.092 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 547728 sc-eQTL 1.12e-01 -0.21 0.132 0.092 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0419 0.117 0.092 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 5.37e-01 0.0709 0.115 0.092 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 6.21e-02 0.253 0.135 0.092 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 547751 sc-eQTL 2.37e-01 -0.164 0.138 0.092 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 6.81e-01 0.0446 0.108 0.088 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 2.63e-01 0.0838 0.0747 0.088 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 5.96e-01 0.0524 0.0987 0.088 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 547728 sc-eQTL 4.85e-02 -0.278 0.14 0.088 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 8.40e-01 0.0167 0.0828 0.088 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0744 0.108 0.088 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 5.11e-01 0.075 0.114 0.088 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 547751 sc-eQTL 9.07e-01 0.0172 0.147 0.088 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 6.74e-02 0.244 0.133 0.088 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 2.72e-01 0.13 0.118 0.088 NK L1
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0662 0.116 0.088 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0719 0.11 0.088 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 1.56e-01 -0.114 0.08 0.088 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 8.09e-01 0.0259 0.107 0.088 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 2.47e-01 -0.189 0.162 0.088 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 4.72e-01 0.0756 0.105 0.088 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 9.42e-01 0.00865 0.118 0.088 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 2.61e-01 0.142 0.126 0.088 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 6.39e-01 -0.039 0.083 0.088 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 5.67e-01 0.0557 0.0971 0.088 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0339 0.172 0.092 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 6.66e-01 0.0651 0.151 0.092 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 3.38e-01 0.157 0.163 0.092 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 3.61e-01 0.157 0.171 0.092 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 6.05e-02 -0.29 0.154 0.092 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -51699 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0783 0.133 0.092 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 9.79e-01 0.00435 0.167 0.092 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -31063 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0923 0.167 0.092 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 4.94e-01 0.103 0.151 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 5.21e-02 0.203 0.104 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00934 0.131 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 6.53e-01 0.0636 0.141 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0446 0.12 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -51699 sc-eQTL 4.92e-01 0.101 0.147 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 4.55e-01 0.101 0.135 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -31063 sc-eQTL 2.47e-01 -0.17 0.146 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 3.85e-01 -0.133 0.153 0.088 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 1.18e-02 0.289 0.114 0.088 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0313 0.133 0.088 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0405 0.144 0.088 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 8.38e-01 0.0232 0.114 0.088 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -51699 sc-eQTL 4.17e-01 0.118 0.145 0.088 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 5.54e-01 0.0789 0.133 0.088 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -31063 sc-eQTL 4.83e-01 -0.115 0.163 0.088 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 4.66e-01 0.107 0.147 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 3.50e-01 0.0967 0.103 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 4.00e-01 -0.108 0.128 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 1.54e-01 0.169 0.118 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0423 0.083 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -51699 sc-eQTL 5.24e-01 0.0991 0.155 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 3.85e-01 0.0983 0.113 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -31063 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0191 0.148 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 1.30e-01 0.216 0.142 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 2.56e-01 0.111 0.0974 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 2.82e-01 -0.145 0.134 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0495 0.128 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 2.10e-02 -0.217 0.0933 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -51699 sc-eQTL 1.18e-01 0.234 0.149 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 4.64e-02 0.303 0.151 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -31063 sc-eQTL 9.99e-01 0.000142 0.14 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 3.65e-01 0.131 0.144 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 3.36e-01 0.12 0.124 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 1.84e-01 0.193 0.145 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0348 0.141 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 3.03e-01 -0.133 0.129 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 3.46e-01 0.122 0.129 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 646 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00384 0.134 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 2.28e-01 0.175 0.145 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 1.10e-01 0.145 0.0899 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0449 0.113 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0598 0.1 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0315 0.0673 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 3.61e-01 0.104 0.114 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 646 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0736 0.116 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 9.43e-01 0.01 0.141 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 8.58e-03 0.274 0.103 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0493 0.113 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 2.38e-01 -0.126 0.107 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 9.92e-01 0.000791 0.0823 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 1.54e-01 0.174 0.122 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 646 sc-eQTL 7.47e-01 0.0428 0.132 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 2.56e-01 0.179 0.157 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 2.42e-02 0.241 0.106 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 7.93e-02 -0.215 0.122 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 1.71e-01 0.183 0.133 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 1.67e-01 -0.132 0.095 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 2.50e-01 0.144 0.125 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 646 sc-eQTL 5.54e-01 0.0777 0.131 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 9.54e-01 0.00936 0.163 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 2.88e-01 0.123 0.116 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 8.81e-01 0.0178 0.119 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0385 0.127 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 9.64e-01 0.00469 0.103 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 6.23e-01 0.0589 0.119 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 646 sc-eQTL 9.17e-01 0.0149 0.143 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 3.65e-01 0.139 0.153 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 6.95e-02 0.178 0.0975 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0445 0.119 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 9.32e-01 0.0102 0.119 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0325 0.0624 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 2.45e-01 0.147 0.126 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 646 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0549 0.144 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 2.08e-01 0.208 0.165 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 3.94e-01 0.0992 0.116 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0947 0.121 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 6.06e-01 -0.065 0.126 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0927 0.125 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 2.59e-01 0.145 0.129 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 646 sc-eQTL 8.92e-01 0.0185 0.136 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 2.73e-01 0.175 0.159 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 4.80e-02 0.286 0.144 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 1.77e-01 0.201 0.149 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0981 0.155 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 7.93e-01 0.0315 0.12 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0103 0.13 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 646 sc-eQTL 2.05e-01 -0.188 0.147 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 2.61e-01 -0.194 0.172 0.089 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 1.80e-02 0.281 0.118 0.089 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 6.37e-01 -0.062 0.131 0.089 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 5.61e-01 0.0822 0.141 0.089 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0874 0.104 0.089 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 5.02e-01 0.0822 0.122 0.089 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 2.50e-01 -0.18 0.156 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 5.05e-02 0.26 0.132 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0685 0.142 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000783 0.133 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 3.00e-01 -0.127 0.122 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 6.25e-02 0.243 0.13 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 1.50e-01 0.208 0.144 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 4.48e-01 0.0976 0.129 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 6.34e-01 0.0594 0.125 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 9.87e-01 0.00191 0.118 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 2.08e-01 -0.101 0.0797 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 9.68e-01 0.00433 0.107 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 8.09e-01 0.0411 0.17 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 3.96e-01 0.123 0.144 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 1.05e-01 -0.257 0.157 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 5.61e-01 0.0911 0.156 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 9.31e-01 0.0111 0.129 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 3.06e-01 0.141 0.137 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 1.76e-02 0.349 0.146 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 6.34e-02 0.235 0.126 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 2.46e-01 -0.148 0.127 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 7.27e-01 0.0459 0.131 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0663 0.0845 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0408 0.11 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 3.01e-01 -0.183 0.176 0.081 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 2.85e-01 0.168 0.157 0.081 PB L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 9.13e-01 0.0211 0.193 0.081 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0881 0.171 0.081 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 3.80e-01 -0.105 0.12 0.081 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -51699 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0173 0.175 0.081 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 2.32e-01 0.158 0.131 0.081 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -31063 sc-eQTL 5.02e-01 -0.119 0.177 0.081 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0502 0.164 0.089 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0158 0.13 0.089 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 7.87e-01 0.0348 0.129 0.089 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0603 0.152 0.089 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0493 0.0979 0.089 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 3.53e-02 -0.245 0.115 0.089 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00801 0.151 0.088 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 2.25e-02 0.234 0.102 0.088 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 3.52e-01 -0.117 0.125 0.088 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 5.62e-01 0.0753 0.13 0.088 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0482 0.111 0.088 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 8.34e-02 0.213 0.123 0.088 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 646 sc-eQTL 2.67e-01 -0.157 0.141 0.088 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0917 0.152 0.09 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 3.40e-01 0.104 0.109 0.09 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 1.72e-01 0.197 0.144 0.09 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 547728 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0607 0.141 0.09 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 3.81e-01 0.143 0.163 0.09 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 2.34e-01 0.158 0.133 0.09 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 1.74e-01 0.192 0.14 0.09 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 547751 sc-eQTL 9.11e-02 -0.263 0.155 0.09 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 2.85e-01 0.127 0.118 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 1.31e-01 0.128 0.0847 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 4.41e-01 0.0755 0.0978 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 547728 sc-eQTL 8.62e-02 -0.244 0.142 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 8.88e-01 0.018 0.127 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0731 0.107 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 3.87e-01 0.0969 0.112 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 547751 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0736 0.149 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 2.48e-01 -0.157 0.136 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 2.78e-01 0.101 0.0928 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 2.58e-01 -0.13 0.115 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 547728 sc-eQTL 4.52e-01 -0.11 0.146 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 1.58e-01 -0.194 0.137 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 9.30e-01 0.0106 0.12 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 6.80e-01 0.049 0.119 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 547751 sc-eQTL 2.31e-01 0.191 0.159 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0991 0.184 0.091 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 5.34e-01 0.11 0.176 0.091 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0318 0.175 0.091 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 8.71e-02 0.309 0.18 0.091 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 9.43e-02 0.228 0.135 0.091 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 1.66e-01 0.218 0.156 0.091 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00433 0.155 0.091 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 5.29e-01 0.0655 0.104 0.091 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 8.25e-01 0.0282 0.127 0.091 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 547728 sc-eQTL 9.18e-02 -0.236 0.139 0.091 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 6.44e-01 -0.067 0.145 0.091 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0944 0.132 0.091 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00157 0.128 0.091 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 547751 sc-eQTL 8.62e-01 0.0274 0.157 0.091 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 5.37e-01 0.0891 0.144 0.09 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 3.01e-01 0.0889 0.0859 0.09 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 9.84e-01 0.00261 0.132 0.09 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 547728 sc-eQTL 3.38e-01 0.133 0.138 0.09 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00513 0.104 0.09 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0643 0.126 0.09 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 4.20e-01 0.0862 0.107 0.09 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 547751 sc-eQTL 1.87e-01 -0.203 0.153 0.09 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 2.09e-01 0.211 0.168 0.093 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0127 0.131 0.093 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0579 0.143 0.093 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 547728 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0297 0.13 0.093 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0562 0.132 0.093 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 3.87e-01 0.125 0.144 0.093 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 2.93e-01 0.178 0.169 0.093 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 547751 sc-eQTL 8.58e-01 0.0235 0.131 0.093 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0622 0.146 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 8.31e-03 0.265 0.0994 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 5.73e-01 0.0733 0.13 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 3.39e-01 0.129 0.134 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0823 0.0931 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -51699 sc-eQTL 5.22e-01 0.0989 0.154 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 6.42e-01 0.061 0.131 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -31063 sc-eQTL 1.33e-01 -0.229 0.152 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 2.18e-01 0.169 0.137 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 3.74e-01 0.0846 0.0949 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 3.66e-01 -0.116 0.128 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 1.78e-01 0.147 0.109 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0643 0.0765 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -51699 sc-eQTL 6.43e-02 0.296 0.159 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 2.51e-01 0.134 0.116 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -31063 sc-eQTL 8.49e-01 0.0261 0.137 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0147 0.109 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 1.95e-01 0.105 0.0811 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 9.41e-01 0.00728 0.098 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 547728 sc-eQTL 9.33e-02 -0.24 0.142 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0737 0.118 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0424 0.105 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 3.98e-01 0.0971 0.115 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 547751 sc-eQTL 5.71e-01 0.0871 0.154 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 4.97e-01 0.0982 0.144 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 6.69e-01 0.0331 0.0772 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 7.85e-01 0.0337 0.123 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 547728 sc-eQTL 4.33e-01 -0.108 0.137 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 5.82e-01 0.0471 0.0854 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0811 0.125 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 4.37e-01 0.0839 0.108 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 547751 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0668 0.152 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 466790 sc-eQTL 3.89e-02 0.285 0.137 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 836768 sc-eQTL 3.84e-01 0.105 0.12 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 105219 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0577 0.118 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 252038 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0532 0.115 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 211554 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0794 0.0743 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -134349 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0136 0.108 0.088 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000146386 ABRACL 211554 eQTL 0.0235 -0.106 0.0465 0.0 0.0 0.0584
ENSG00000164440 TXLNB -51699 eQTL 0.00523 0.149 0.0532 0.0 0.0 0.0584
ENSG00000226571 AL592429.2 -31063 eQTL 2.19e-02 -0.154 0.0671 0.00188 0.0 0.0584


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146386 ABRACL 211554 4.91e-06 5.83e-06 1.3e-06 4.27e-06 1.47e-06 1.52e-06 6.11e-06 1.03e-06 4.83e-06 2.82e-06 7.42e-06 3.52e-06 9.86e-06 3.14e-06 1.91e-06 4.87e-06 2.96e-06 3.75e-06 1.49e-06 2.11e-06 3.15e-06 5.98e-06 4.79e-06 1.93e-06 8.14e-06 1.95e-06 3.47e-06 1.83e-06 4.46e-06 5.55e-06 2.63e-06 9.46e-07 1.22e-06 2.26e-06 3.01e-06 2.11e-06 1.35e-06 6.96e-07 1.62e-06 9.85e-07 9.55e-07 7.76e-06 1.39e-06 1.74e-07 7.85e-07 1.29e-06 9.85e-07 7.2e-07 5.87e-07
ENSG00000218565 \N -97719 1.26e-05 1.48e-05 2.64e-06 1.03e-05 2.39e-06 6.21e-06 1.84e-05 2.58e-06 1.44e-05 6.68e-06 1.91e-05 7.68e-06 2.53e-05 5.81e-06 4.83e-06 9.51e-06 8.14e-06 1.12e-05 3.55e-06 4.11e-06 6.73e-06 1.36e-05 1.33e-05 4.71e-06 2.26e-05 4.49e-06 7.58e-06 6.54e-06 1.45e-05 1.22e-05 8.99e-06 1.25e-06 1.68e-06 3.91e-06 7.16e-06 3.76e-06 1.78e-06 2.38e-06 2.84e-06 2.44e-06 1.25e-06 1.88e-05 2.64e-06 1.58e-07 1.13e-06 2.52e-06 2.46e-06 1.24e-06 7.09e-07