logo

Genes within 1Mb (chr6:139215419:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 8.89e-01 0.0123 0.088 0.235 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00948 0.0671 0.235 B L1
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0125 0.0855 0.235 B L1
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 3.05e-02 -0.163 0.0748 0.235 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 7.52e-01 -0.014 0.0444 0.235 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -76579 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0729 0.109 0.235 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 3.81e-01 0.06 0.0684 0.235 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -55943 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0442 0.0762 0.235 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 2.34e-01 0.118 0.0987 0.235 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0745 0.0663 0.235 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0119 0.0826 0.235 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0885 0.0647 0.235 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 2.92e-02 -0.103 0.0471 0.235 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0528 0.0812 0.235 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -24234 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0581 0.0801 0.235 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 8.46e-01 0.021 0.108 0.235 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0943 0.0705 0.235 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0524 0.0773 0.235 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 1.24e-01 -0.112 0.0724 0.235 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0362 0.0413 0.235 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0661 0.0785 0.235 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -24234 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0525 0.0955 0.235 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 6.12e-01 0.0548 0.108 0.232 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 6.90e-02 -0.137 0.0751 0.232 DC L1
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 3.27e-01 0.0871 0.0886 0.232 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 522848 sc-eQTL 1.30e-01 0.149 0.0982 0.232 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0368 0.0874 0.232 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0194 0.0856 0.232 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0149 0.102 0.232 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 522871 sc-eQTL 4.52e-02 0.206 0.102 0.232 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 1.45e-01 0.113 0.0769 0.235 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 8.69e-01 -0.00882 0.0535 0.235 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0462 0.0705 0.235 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 522848 sc-eQTL 9.17e-01 0.0105 0.101 0.235 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0317 0.0591 0.235 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0151 0.077 0.235 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 7.36e-01 0.0275 0.0814 0.235 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 522871 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000947 0.105 0.235 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0278 0.095 0.234 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0801 0.0835 0.234 NK L1
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0753 0.0819 0.234 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 5.48e-01 -0.047 0.0781 0.234 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0289 0.057 0.234 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 1.73e-01 -0.103 0.0755 0.234 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 3.72e-01 -0.101 0.113 0.235 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 1.19e-01 -0.114 0.0725 0.235 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 9.01e-02 -0.138 0.0812 0.235 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0692 0.0878 0.235 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0388 0.0575 0.235 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 2.72e-01 -0.074 0.0672 0.235 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 8.91e-02 -0.221 0.129 0.24 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 2.97e-01 -0.119 0.114 0.24 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 2.31e-01 -0.149 0.124 0.24 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 7.66e-01 0.0387 0.13 0.24 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 1.61e-01 0.165 0.117 0.24 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -76579 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0526 0.101 0.24 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0916 0.127 0.24 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -55943 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0607 0.127 0.24 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00531 0.111 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00806 0.0765 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 8.35e-01 0.0199 0.0957 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 4.74e-01 0.0739 0.103 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0491 0.0878 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -76579 sc-eQTL 4.46e-01 0.0821 0.108 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 3.13e-02 0.212 0.098 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -55943 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00685 0.107 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 2.67e-01 0.124 0.112 0.235 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 7.15e-01 0.0308 0.0842 0.235 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0343 0.0968 0.235 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 6.34e-02 -0.194 0.104 0.235 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0759 0.0828 0.235 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -76579 sc-eQTL 9.07e-01 0.0123 0.106 0.235 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000514 0.0973 0.235 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -55943 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0529 0.119 0.235 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0374 0.106 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 7.92e-01 0.0196 0.0742 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 9.75e-01 0.00287 0.092 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 4.26e-02 -0.172 0.0843 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 8.21e-01 0.0135 0.0595 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -76579 sc-eQTL 3.36e-01 -0.107 0.111 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00347 0.0811 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -55943 sc-eQTL 7.78e-02 -0.187 0.106 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0169 0.104 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0644 0.0709 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 7.78e-01 0.0277 0.0978 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 1.43e-01 -0.136 0.0928 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0382 0.0686 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -76579 sc-eQTL 7.79e-01 0.0306 0.109 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 2.57e-01 0.126 0.111 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -55943 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0744 0.102 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 6.65e-01 0.0462 0.106 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0923 0.0917 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 5.09e-01 0.071 0.107 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0602 0.104 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 2.01e-01 -0.121 0.0946 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 9.66e-01 0.00403 0.0955 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -24234 sc-eQTL 4.26e-01 0.0785 0.0983 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 7.64e-01 0.0313 0.104 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0636 0.0647 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 7.60e-01 0.0247 0.0809 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 1.38e-01 -0.106 0.0714 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 3.76e-02 -0.1 0.0478 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0675 0.0819 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -24234 sc-eQTL 8.89e-01 0.0116 0.0829 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 3.25e-01 0.0992 0.101 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0404 0.075 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0375 0.0806 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 7.13e-01 0.0282 0.0765 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 6.83e-02 -0.107 0.0584 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 1.33e-01 -0.131 0.087 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -24234 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0231 0.0945 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 2.72e-01 0.124 0.112 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 1.84e-01 -0.102 0.0765 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 2.98e-01 0.0912 0.0875 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0228 0.0955 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0938 0.0678 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 5.78e-01 0.0497 0.0894 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -24234 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0415 0.0935 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 9.84e-01 0.00233 0.116 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 8.12e-02 -0.144 0.0822 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0304 0.0844 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 2.82e-03 -0.267 0.0885 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 5.31e-02 -0.141 0.0724 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0116 0.0851 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -24234 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0572 0.102 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0652 0.111 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0332 0.071 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0509 0.0858 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 1.20e-01 -0.134 0.0856 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0356 0.0451 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0822 0.0911 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -24234 sc-eQTL 4.39e-01 0.0808 0.104 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 6.30e-01 0.0576 0.119 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 2.30e-01 -0.101 0.0836 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0775 0.0871 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 2.20e-01 0.111 0.0904 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0161 0.0904 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 9.62e-01 0.00448 0.0929 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -24234 sc-eQTL 2.67e-02 -0.216 0.0969 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 5.04e-01 0.0779 0.116 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0899 0.106 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0424 0.109 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0888 0.113 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 7.81e-02 -0.154 0.0867 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0018 0.095 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -24234 sc-eQTL 8.01e-01 0.0273 0.108 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 8.59e-01 0.0214 0.12 0.236 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 1.75e-02 -0.197 0.0822 0.236 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 8.93e-01 0.0123 0.0913 0.236 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 9.10e-01 0.0111 0.0983 0.236 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0314 0.0722 0.236 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 1.24e-01 -0.131 0.0846 0.236 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 8.84e-01 0.0161 0.11 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 2.55e-01 -0.107 0.0937 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 2.97e-01 -0.104 0.0998 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0892 0.0932 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 7.36e-01 -0.029 0.086 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 1.15e-01 -0.145 0.0917 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0783 0.102 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0702 0.0904 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0375 0.0877 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 6.65e-01 0.036 0.0832 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0445 0.0562 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 1.24e-01 -0.115 0.0747 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 4.53e-01 0.0883 0.117 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0815 0.0999 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00374 0.11 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0292 0.108 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 2.29e-01 -0.107 0.0889 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0187 0.0953 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0145 0.106 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0166 0.0912 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0473 0.0911 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0664 0.094 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0161 0.0606 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0614 0.0791 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 3.47e-01 -0.121 0.128 0.237 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0279 0.115 0.237 PB L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00693 0.14 0.237 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 5.92e-01 -0.067 0.125 0.237 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0851 0.0869 0.237 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -76579 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0374 0.127 0.237 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 2.10e-01 -0.12 0.0953 0.237 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -55943 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0176 0.129 0.237 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 1.25e-03 -0.381 0.116 0.235 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0524 0.095 0.235 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 9.73e-02 -0.155 0.0933 0.235 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0806 0.11 0.235 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0357 0.0713 0.235 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0692 0.0848 0.235 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 9.71e-01 -0.0041 0.111 0.235 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0489 0.0756 0.235 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 1.81e-01 0.123 0.0916 0.235 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 1.93e-01 -0.124 0.0949 0.235 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 1.86e-01 -0.107 0.0808 0.235 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00225 0.0906 0.235 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -24234 sc-eQTL 1.10e-01 -0.165 0.103 0.235 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 8.30e-02 0.187 0.107 0.232 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 3.35e-02 -0.164 0.0766 0.232 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 4.29e-01 0.0814 0.103 0.232 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 522848 sc-eQTL 1.93e-01 0.131 0.1 0.232 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0585 0.116 0.232 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 7.67e-02 -0.167 0.094 0.232 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 3.84e-01 0.0876 0.1 0.232 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 522871 sc-eQTL 2.89e-02 0.241 0.11 0.232 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 6.83e-02 0.154 0.084 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0187 0.0608 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0269 0.0699 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 522848 sc-eQTL 6.89e-01 0.0408 0.102 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 5.76e-01 0.0509 0.0909 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 8.71e-01 0.0124 0.0765 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 3.72e-01 0.0714 0.0799 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 522871 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0838 0.107 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 1.95e-01 0.126 0.0971 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0436 0.0666 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 4.52e-01 -0.062 0.0823 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 522848 sc-eQTL 8.02e-01 0.0263 0.104 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0507 0.0987 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0714 0.0857 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 9.32e-01 0.00721 0.085 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 522871 sc-eQTL 8.47e-01 0.0221 0.114 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 1.52e-01 0.188 0.13 0.23 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 3.86e-01 -0.109 0.125 0.23 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0185 0.125 0.23 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 1.20e-02 -0.321 0.126 0.23 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 8.84e-02 -0.165 0.0961 0.23 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 6.45e-01 0.0516 0.112 0.23 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0947 0.113 0.227 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 6.99e-01 0.0294 0.076 0.227 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0512 0.0929 0.227 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 522848 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0155 0.102 0.227 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 3.40e-01 -0.101 0.106 0.227 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 9.73e-01 0.00328 0.0966 0.227 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 5.41e-01 0.0574 0.0937 0.227 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 522871 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0321 0.115 0.227 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0477 0.104 0.229 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0364 0.0618 0.229 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0131 0.0948 0.229 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 522848 sc-eQTL 5.58e-01 0.0584 0.0996 0.229 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 9.16e-01 0.00791 0.0751 0.229 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 1.43e-01 -0.132 0.09 0.229 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 1.91e-01 -0.1 0.0765 0.229 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 522871 sc-eQTL 2.18e-01 -0.136 0.11 0.229 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0817 0.125 0.226 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 5.67e-02 -0.184 0.0959 0.226 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 9.34e-01 0.00876 0.106 0.226 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 522848 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0267 0.0966 0.226 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0425 0.0978 0.226 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 4.73e-01 0.0768 0.107 0.226 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 6.83e-01 0.0514 0.126 0.226 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 522871 sc-eQTL 2.12e-01 -0.121 0.0966 0.226 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0406 0.107 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0535 0.0738 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0012 0.095 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0675 0.0983 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0307 0.0682 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -76579 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0731 0.113 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 5.92e-01 0.0514 0.0958 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -55943 sc-eQTL 8.94e-01 0.0149 0.111 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00668 0.0977 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 9.06e-01 0.00804 0.0677 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 9.24e-01 0.00868 0.0913 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 1.49e-02 -0.189 0.0768 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 8.21e-01 0.0124 0.0546 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -76579 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0387 0.114 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00853 0.0831 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -55943 sc-eQTL 1.05e-01 -0.158 0.097 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 3.23e-02 0.167 0.0776 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00504 0.0585 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0488 0.0703 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 522848 sc-eQTL 7.64e-01 0.0309 0.103 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 7.36e-01 0.0286 0.0846 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0122 0.0752 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 5.16e-01 0.0535 0.0823 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 522871 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00488 0.11 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 1.73e-01 -0.141 0.103 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00325 0.0551 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0229 0.088 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 522848 sc-eQTL 1.90e-01 0.128 0.0975 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 1.22e-01 -0.0942 0.0606 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0454 0.0892 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0968 0.0766 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 522871 sc-eQTL 5.80e-01 -0.06 0.108 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 441910 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0239 0.0987 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 811888 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0641 0.0855 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 80339 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0572 0.0841 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 227158 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0411 0.0822 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 186674 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0521 0.053 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -159229 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0805 0.0765 0.233 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000164442 CITED2 -159229 eQTL 0.0351 0.0567 0.0269 0.00154 0.0 0.256

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N 811888 3.21e-07 1.35e-07 4.98e-08 1.97e-07 9.87e-08 8.21e-08 1.9e-07 5.48e-08 1.45e-07 6.4e-08 1.63e-07 1.05e-07 1.79e-07 7.64e-08 5.98e-08 7.5e-08 4.24e-08 1.51e-07 6.32e-08 5.04e-08 1.25e-07 1.25e-07 1.58e-07 3.17e-08 1.72e-07 1.25e-07 1.18e-07 9.92e-08 1.24e-07 1.05e-07 1.06e-07 3.93e-08 3.73e-08 9.52e-08 3.07e-08 3.28e-08 5.45e-08 8.68e-08 6.57e-08 3.86e-08 5.54e-08 1.46e-07 5.39e-08 7.47e-09 2.64e-08 1.55e-08 1.11e-07 2.02e-09 4.8e-08