Genes within 1Mb (chr6:139214254:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 8.89e-01 0.0123 0.088 0.235 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00948 0.0671 0.235 B L1
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0125 0.0855 0.235 B L1
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 3.05e-02 -0.163 0.0748 0.235 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 7.52e-01 -0.014 0.0444 0.235 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -77744 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0729 0.109 0.235 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 3.81e-01 0.06 0.0684 0.235 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -57108 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0442 0.0762 0.235 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 2.34e-01 0.118 0.0987 0.235 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0745 0.0663 0.235 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0119 0.0826 0.235 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0885 0.0647 0.235 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 2.92e-02 -0.103 0.0471 0.235 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0528 0.0812 0.235 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -25399 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0581 0.0801 0.235 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 8.46e-01 0.021 0.108 0.235 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0943 0.0705 0.235 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0524 0.0773 0.235 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 1.24e-01 -0.112 0.0724 0.235 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0362 0.0413 0.235 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0661 0.0785 0.235 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -25399 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0525 0.0955 0.235 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 6.12e-01 0.0548 0.108 0.232 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 6.90e-02 -0.137 0.0751 0.232 DC L1
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 3.27e-01 0.0871 0.0886 0.232 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 521683 sc-eQTL 1.30e-01 0.149 0.0982 0.232 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0368 0.0874 0.232 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0194 0.0856 0.232 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0149 0.102 0.232 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 521706 sc-eQTL 4.52e-02 0.206 0.102 0.232 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 1.45e-01 0.113 0.0769 0.235 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 8.69e-01 -0.00882 0.0535 0.235 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0462 0.0705 0.235 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 521683 sc-eQTL 9.17e-01 0.0105 0.101 0.235 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0317 0.0591 0.235 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0151 0.077 0.235 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 7.36e-01 0.0275 0.0814 0.235 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 521706 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000947 0.105 0.235 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0278 0.095 0.234 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0801 0.0835 0.234 NK L1
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0753 0.0819 0.234 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 5.48e-01 -0.047 0.0781 0.234 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0289 0.057 0.234 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 1.73e-01 -0.103 0.0755 0.234 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 3.72e-01 -0.101 0.113 0.235 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 1.19e-01 -0.114 0.0725 0.235 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 9.01e-02 -0.138 0.0812 0.235 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0692 0.0878 0.235 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0388 0.0575 0.235 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 2.72e-01 -0.074 0.0672 0.235 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 8.91e-02 -0.221 0.129 0.24 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 2.97e-01 -0.119 0.114 0.24 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 2.31e-01 -0.149 0.124 0.24 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 7.66e-01 0.0387 0.13 0.24 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 1.61e-01 0.165 0.117 0.24 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -77744 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0526 0.101 0.24 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0916 0.127 0.24 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -57108 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0607 0.127 0.24 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00531 0.111 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00806 0.0765 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 8.35e-01 0.0199 0.0957 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 4.74e-01 0.0739 0.103 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0491 0.0878 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -77744 sc-eQTL 4.46e-01 0.0821 0.108 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 3.13e-02 0.212 0.098 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -57108 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00685 0.107 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 2.67e-01 0.124 0.112 0.235 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 7.15e-01 0.0308 0.0842 0.235 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0343 0.0968 0.235 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 6.34e-02 -0.194 0.104 0.235 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0759 0.0828 0.235 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -77744 sc-eQTL 9.07e-01 0.0123 0.106 0.235 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000514 0.0973 0.235 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -57108 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0529 0.119 0.235 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0374 0.106 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 7.92e-01 0.0196 0.0742 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 9.75e-01 0.00287 0.092 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 4.26e-02 -0.172 0.0843 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 8.21e-01 0.0135 0.0595 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -77744 sc-eQTL 3.36e-01 -0.107 0.111 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00347 0.0811 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -57108 sc-eQTL 7.78e-02 -0.187 0.106 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0169 0.104 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0644 0.0709 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 7.78e-01 0.0277 0.0978 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 1.43e-01 -0.136 0.0928 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0382 0.0686 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -77744 sc-eQTL 7.79e-01 0.0306 0.109 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 2.57e-01 0.126 0.111 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -57108 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0744 0.102 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 6.65e-01 0.0462 0.106 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0923 0.0917 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 5.09e-01 0.071 0.107 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0602 0.104 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 2.01e-01 -0.121 0.0946 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 9.66e-01 0.00403 0.0955 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -25399 sc-eQTL 4.26e-01 0.0785 0.0983 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 7.64e-01 0.0313 0.104 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0636 0.0647 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 7.60e-01 0.0247 0.0809 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 1.38e-01 -0.106 0.0714 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 3.76e-02 -0.1 0.0478 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0675 0.0819 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -25399 sc-eQTL 8.89e-01 0.0116 0.0829 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 3.25e-01 0.0992 0.101 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0404 0.075 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0375 0.0806 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 7.13e-01 0.0282 0.0765 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 6.83e-02 -0.107 0.0584 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 1.33e-01 -0.131 0.087 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -25399 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0231 0.0945 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 2.72e-01 0.124 0.112 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 1.84e-01 -0.102 0.0765 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 2.98e-01 0.0912 0.0875 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0228 0.0955 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0938 0.0678 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 5.78e-01 0.0497 0.0894 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -25399 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0415 0.0935 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 9.84e-01 0.00233 0.116 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 8.12e-02 -0.144 0.0822 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0304 0.0844 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 2.82e-03 -0.267 0.0885 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 5.31e-02 -0.141 0.0724 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0116 0.0851 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -25399 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0572 0.102 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0652 0.111 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0332 0.071 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0509 0.0858 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 1.20e-01 -0.134 0.0856 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0356 0.0451 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0822 0.0911 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -25399 sc-eQTL 4.39e-01 0.0808 0.104 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 6.30e-01 0.0576 0.119 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 2.30e-01 -0.101 0.0836 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0775 0.0871 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 2.20e-01 0.111 0.0904 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0161 0.0904 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 9.62e-01 0.00448 0.0929 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -25399 sc-eQTL 2.67e-02 -0.216 0.0969 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 5.04e-01 0.0779 0.116 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0899 0.106 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0424 0.109 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0888 0.113 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 7.81e-02 -0.154 0.0867 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0018 0.095 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -25399 sc-eQTL 8.01e-01 0.0273 0.108 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 8.59e-01 0.0214 0.12 0.236 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 1.75e-02 -0.197 0.0822 0.236 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 8.93e-01 0.0123 0.0913 0.236 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 9.10e-01 0.0111 0.0983 0.236 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0314 0.0722 0.236 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 1.24e-01 -0.131 0.0846 0.236 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 8.84e-01 0.0161 0.11 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 2.55e-01 -0.107 0.0937 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 2.97e-01 -0.104 0.0998 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0892 0.0932 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 7.36e-01 -0.029 0.086 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 1.15e-01 -0.145 0.0917 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0783 0.102 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0702 0.0904 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0375 0.0877 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 6.65e-01 0.036 0.0832 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0445 0.0562 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 1.24e-01 -0.115 0.0747 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 4.53e-01 0.0883 0.117 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0815 0.0999 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00374 0.11 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0292 0.108 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 2.29e-01 -0.107 0.0889 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0187 0.0953 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0145 0.106 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0166 0.0912 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0473 0.0911 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0664 0.094 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0161 0.0606 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0614 0.0791 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 3.47e-01 -0.121 0.128 0.237 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0279 0.115 0.237 PB L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00693 0.14 0.237 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 5.92e-01 -0.067 0.125 0.237 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0851 0.0869 0.237 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -77744 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0374 0.127 0.237 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 2.10e-01 -0.12 0.0953 0.237 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -57108 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0176 0.129 0.237 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 1.25e-03 -0.381 0.116 0.235 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0524 0.095 0.235 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 9.73e-02 -0.155 0.0933 0.235 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0806 0.11 0.235 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0357 0.0713 0.235 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0692 0.0848 0.235 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 9.71e-01 -0.0041 0.111 0.235 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0489 0.0756 0.235 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 1.81e-01 0.123 0.0916 0.235 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 1.93e-01 -0.124 0.0949 0.235 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 1.86e-01 -0.107 0.0808 0.235 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00225 0.0906 0.235 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -25399 sc-eQTL 1.10e-01 -0.165 0.103 0.235 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 8.30e-02 0.187 0.107 0.232 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 3.35e-02 -0.164 0.0766 0.232 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 4.29e-01 0.0814 0.103 0.232 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 521683 sc-eQTL 1.93e-01 0.131 0.1 0.232 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0585 0.116 0.232 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 7.67e-02 -0.167 0.094 0.232 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 3.84e-01 0.0876 0.1 0.232 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 521706 sc-eQTL 2.89e-02 0.241 0.11 0.232 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 6.83e-02 0.154 0.084 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0187 0.0608 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0269 0.0699 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 521683 sc-eQTL 6.89e-01 0.0408 0.102 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 5.76e-01 0.0509 0.0909 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 8.71e-01 0.0124 0.0765 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 3.72e-01 0.0714 0.0799 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 521706 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0838 0.107 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 1.95e-01 0.126 0.0971 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0436 0.0666 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 4.52e-01 -0.062 0.0823 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 521683 sc-eQTL 8.02e-01 0.0263 0.104 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0507 0.0987 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0714 0.0857 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 9.32e-01 0.00721 0.085 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 521706 sc-eQTL 8.47e-01 0.0221 0.114 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 1.52e-01 0.188 0.13 0.23 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 3.86e-01 -0.109 0.125 0.23 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0185 0.125 0.23 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 1.20e-02 -0.321 0.126 0.23 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 8.84e-02 -0.165 0.0961 0.23 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 6.45e-01 0.0516 0.112 0.23 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0947 0.113 0.227 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 6.99e-01 0.0294 0.076 0.227 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0512 0.0929 0.227 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 521683 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0155 0.102 0.227 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 3.40e-01 -0.101 0.106 0.227 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 9.73e-01 0.00328 0.0966 0.227 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 5.41e-01 0.0574 0.0937 0.227 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 521706 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0321 0.115 0.227 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0477 0.104 0.229 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0364 0.0618 0.229 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0131 0.0948 0.229 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 521683 sc-eQTL 5.58e-01 0.0584 0.0996 0.229 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 9.16e-01 0.00791 0.0751 0.229 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 1.43e-01 -0.132 0.09 0.229 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 1.91e-01 -0.1 0.0765 0.229 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 521706 sc-eQTL 2.18e-01 -0.136 0.11 0.229 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0817 0.125 0.226 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 5.67e-02 -0.184 0.0959 0.226 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 9.34e-01 0.00876 0.106 0.226 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 521683 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0267 0.0966 0.226 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0425 0.0978 0.226 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 4.73e-01 0.0768 0.107 0.226 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 6.83e-01 0.0514 0.126 0.226 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 521706 sc-eQTL 2.12e-01 -0.121 0.0966 0.226 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0406 0.107 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0535 0.0738 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0012 0.095 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0675 0.0983 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0307 0.0682 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -77744 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0731 0.113 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 5.92e-01 0.0514 0.0958 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -57108 sc-eQTL 8.94e-01 0.0149 0.111 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00668 0.0977 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 9.06e-01 0.00804 0.0677 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 9.24e-01 0.00868 0.0913 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 1.49e-02 -0.189 0.0768 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 8.21e-01 0.0124 0.0546 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -77744 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0387 0.114 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00853 0.0831 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -57108 sc-eQTL 1.05e-01 -0.158 0.097 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 3.23e-02 0.167 0.0776 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00504 0.0585 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0488 0.0703 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 521683 sc-eQTL 7.64e-01 0.0309 0.103 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 7.36e-01 0.0286 0.0846 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0122 0.0752 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 5.16e-01 0.0535 0.0823 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 521706 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00488 0.11 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 1.73e-01 -0.141 0.103 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00325 0.0551 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0229 0.088 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 521683 sc-eQTL 1.90e-01 0.128 0.0975 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 1.22e-01 -0.0942 0.0606 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0454 0.0892 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0968 0.0766 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 521706 sc-eQTL 5.80e-01 -0.06 0.108 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 440745 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0239 0.0987 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 810723 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0641 0.0855 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 79174 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0572 0.0841 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 225993 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0411 0.0822 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 185509 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0521 0.053 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -160394 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0805 0.0765 0.233 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000164442 CITED2 -160394 eQTL 0.0416 0.0549 0.0269 0.0014 0.0 0.255


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N 810723 2.77e-07 1.34e-07 5.72e-08 1.9e-07 9.8e-08 8.45e-08 1.67e-07 5.85e-08 1.5e-07 6.75e-08 1.73e-07 1.11e-07 1.69e-07 7.37e-08 6.25e-08 7.74e-08 4.18e-08 1.51e-07 6.75e-08 4.8e-08 1.25e-07 1.26e-07 1.5e-07 3.17e-08 1.65e-07 1.23e-07 1.18e-07 9.92e-08 1.24e-07 1e-07 1.08e-07 2.96e-08 3.43e-08 8.89e-08 3.63e-08 3.05e-08 5.3e-08 8.76e-08 6.57e-08 4.47e-08 5.24e-08 1.46e-07 5.27e-08 1.55e-08 3.4e-08 1.92e-08 1.15e-07 1.89e-09 4.99e-08