Genes within 1Mb (chr6:139212435:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 7.00e-01 0.0448 0.116 0.107 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0259 0.0885 0.107 B L1
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0647 0.113 0.107 B L1
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0894 0.0995 0.107 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0424 0.0585 0.107 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -79563 sc-eQTL 4.43e-01 0.11 0.143 0.107 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 2.65e-01 0.101 0.0901 0.107 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -58927 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0856 0.1 0.107 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 2.54e-01 0.149 0.13 0.107 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0369 0.0877 0.107 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 8.40e-01 0.022 0.109 0.107 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 9.53e-01 -0.005 0.0856 0.107 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0453 0.0627 0.107 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0529 0.107 0.107 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -27218 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0511 0.106 0.107 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 3.51e-01 -0.132 0.141 0.107 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0323 0.0927 0.107 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 2.41e-01 0.119 0.101 0.107 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 2.37e-02 -0.214 0.0942 0.107 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0537 0.0541 0.107 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 2.87e-01 -0.11 0.103 0.107 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -27218 sc-eQTL 9.45e-01 0.00871 0.125 0.107 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 6.00e-02 0.278 0.147 0.101 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0911 0.104 0.101 DC L1
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 4.48e-01 0.0927 0.122 0.101 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 519864 sc-eQTL 7.00e-01 0.0523 0.136 0.101 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 1.19e-03 -0.385 0.117 0.101 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00776 0.118 0.101 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 9.00e-01 0.0175 0.14 0.101 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 519887 sc-eQTL 5.77e-01 0.0792 0.142 0.101 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 3.96e-01 0.0873 0.103 0.107 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 6.78e-01 0.0296 0.0711 0.107 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 8.36e-01 0.0195 0.0938 0.107 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 519864 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0508 0.134 0.107 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 9.54e-01 0.00453 0.0787 0.107 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 2.38e-01 0.121 0.102 0.107 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 6.12e-01 -0.055 0.108 0.107 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 519887 sc-eQTL 6.05e-01 0.0723 0.14 0.107 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 8.00e-01 0.0315 0.124 0.105 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0303 0.109 0.105 NK L1
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 8.38e-01 0.0219 0.107 0.105 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0425 0.102 0.105 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 9.25e-01 0.00705 0.0745 0.105 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 1.67e-01 -0.137 0.0987 0.105 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0823 0.148 0.107 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0829 0.0953 0.107 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0953 0.107 0.107 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0403 0.115 0.107 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 5.79e-01 0.0419 0.0754 0.107 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0934 0.0881 0.107 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 6.02e-02 -0.317 0.167 0.11 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 4.18e-01 0.12 0.148 0.11 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0734 0.161 0.11 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0878 0.168 0.11 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 6.83e-01 0.0623 0.153 0.11 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -79563 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0344 0.131 0.11 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 6.02e-01 0.0857 0.164 0.11 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -58927 sc-eQTL 7.15e-01 -0.06 0.164 0.11 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 6.52e-01 0.0647 0.143 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0707 0.0991 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0242 0.124 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 6.63e-01 0.0584 0.134 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 2.74e-01 -0.125 0.114 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -79563 sc-eQTL 3.73e-01 0.125 0.139 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 6.70e-02 0.235 0.127 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -58927 sc-eQTL 8.24e-01 -0.031 0.139 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 8.47e-01 0.0287 0.148 0.108 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 7.38e-01 0.0374 0.112 0.108 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 3.29e-01 -0.125 0.128 0.108 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 1.55e-01 -0.197 0.138 0.108 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 1.92e-01 0.143 0.109 0.108 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -79563 sc-eQTL 6.09e-01 0.0719 0.14 0.108 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0985 0.129 0.108 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -58927 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00161 0.158 0.108 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 5.22e-01 0.0884 0.138 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00703 0.097 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 9.62e-01 0.00581 0.12 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 1.34e-01 -0.167 0.111 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 8.50e-01 0.0147 0.0779 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -79563 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0335 0.146 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 7.67e-01 0.0315 0.106 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -58927 sc-eQTL 2.36e-01 -0.165 0.139 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 4.88e-01 0.0949 0.137 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 1.91e-02 -0.218 0.0923 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 7.39e-01 0.043 0.129 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0471 0.123 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0706 0.0902 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -79563 sc-eQTL 5.80e-02 0.27 0.142 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 3.99e-01 0.123 0.146 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -58927 sc-eQTL 8.16e-01 0.0312 0.134 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 6.90e-01 0.0578 0.145 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 9.42e-01 0.00904 0.125 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 9.43e-01 0.0104 0.146 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 4.13e-01 -0.116 0.141 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 2.47e-01 -0.149 0.129 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 4.08e-01 -0.107 0.13 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -27218 sc-eQTL 6.52e-01 0.0604 0.134 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 8.63e-01 0.0235 0.136 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0173 0.0848 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 6.72e-01 0.0448 0.106 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0386 0.0937 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0965 0.0627 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 2.88e-01 -0.114 0.107 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -27218 sc-eQTL 9.06e-01 0.0128 0.108 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 4.69e-01 0.0969 0.133 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0615 0.0993 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0399 0.107 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0708 0.101 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 8.94e-02 -0.132 0.0774 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 8.54e-02 -0.199 0.115 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -27218 sc-eQTL 2.77e-01 -0.136 0.125 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 7.39e-03 0.392 0.145 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 3.07e-01 -0.103 0.1 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 8.81e-01 0.0172 0.115 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 7.62e-01 0.0379 0.125 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 3.24e-01 0.0879 0.0889 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0972 0.117 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -27218 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0505 0.122 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0561 0.154 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0788 0.11 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 1.56e-01 0.158 0.111 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 1.45e-01 -0.174 0.119 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 6.64e-02 -0.177 0.0961 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 2.82e-01 -0.121 0.112 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -27218 sc-eQTL 5.95e-01 -0.072 0.135 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 1.93e-01 -0.187 0.143 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0124 0.0919 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 8.98e-01 0.0142 0.111 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 6.97e-03 -0.298 0.109 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 9.77e-01 0.00171 0.0584 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 1.69e-01 -0.162 0.117 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -27218 sc-eQTL 3.67e-01 0.122 0.135 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 8.94e-01 0.0214 0.16 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0141 0.112 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0826 0.117 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 5.00e-01 0.0819 0.121 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 1.26e-01 -0.185 0.12 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0488 0.124 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -27218 sc-eQTL 9.45e-02 -0.219 0.13 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 1.55e-01 -0.226 0.158 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0982 0.145 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 1.10e-01 0.238 0.148 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 7.92e-01 0.041 0.155 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 7.93e-01 0.0314 0.12 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0237 0.13 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -27218 sc-eQTL 9.01e-01 0.0185 0.148 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 5.68e-01 0.0924 0.162 0.106 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 7.94e-03 -0.296 0.11 0.106 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 8.26e-01 0.0271 0.123 0.106 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00617 0.132 0.106 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 8.64e-01 0.0167 0.0973 0.106 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 1.96e-01 -0.148 0.114 0.106 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 6.73e-01 0.0621 0.147 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 1.82e-01 -0.167 0.125 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0253 0.133 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 7.15e-02 -0.223 0.123 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0981 0.114 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 1.90e-01 -0.161 0.122 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 2.91e-01 -0.143 0.135 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0236 0.12 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0826 0.116 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 3.08e-01 0.112 0.11 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00684 0.0746 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 1.59e-01 -0.14 0.099 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 2.33e-01 0.187 0.156 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 5.47e-01 0.0806 0.134 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 7.62e-01 0.0444 0.147 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 3.82e-01 -0.127 0.145 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 4.74e-01 0.0854 0.119 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 1.13e-01 -0.201 0.126 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 6.86e-01 0.0564 0.139 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0601 0.12 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 3.24e-01 0.118 0.12 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 8.15e-01 0.029 0.124 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0925 0.0795 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0613 0.104 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 9.56e-01 0.00891 0.163 0.119 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 6.00e-01 0.0759 0.144 0.119 PB L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 7.54e-01 0.0556 0.177 0.119 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0252 0.157 0.119 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0432 0.11 0.119 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -79563 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0488 0.161 0.119 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 9.63e-02 -0.201 0.12 0.119 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -58927 sc-eQTL 6.52e-01 0.0735 0.162 0.119 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 5.96e-02 -0.291 0.154 0.107 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 9.04e-01 -0.015 0.124 0.107 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 4.25e-01 0.0976 0.122 0.107 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 6.27e-01 0.07 0.144 0.107 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 1.31e-01 0.14 0.0923 0.107 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 5.04e-01 0.0739 0.11 0.107 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 8.10e-01 0.0342 0.142 0.107 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 9.25e-01 0.00912 0.0974 0.107 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 1.11e-01 0.188 0.118 0.107 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 9.19e-01 0.0125 0.123 0.107 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 3.89e-01 0.0899 0.104 0.107 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 3.47e-01 0.11 0.116 0.107 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -27218 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0442 0.133 0.107 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 5.44e-02 0.291 0.15 0.102 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 3.41e-01 -0.104 0.108 0.102 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 2.68e-01 0.16 0.144 0.102 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 519864 sc-eQTL 4.37e-01 0.11 0.141 0.102 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 5.23e-02 -0.315 0.161 0.102 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 4.58e-02 -0.265 0.132 0.102 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 7.05e-01 0.0534 0.141 0.102 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 519887 sc-eQTL 3.31e-01 0.151 0.155 0.102 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 5.78e-02 0.216 0.113 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 4.65e-01 0.06 0.082 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 8.07e-01 0.0231 0.0944 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 519864 sc-eQTL 5.80e-01 0.0763 0.137 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 4.76e-01 0.0875 0.123 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 2.12e-01 0.129 0.103 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0953 0.108 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 519887 sc-eQTL 7.61e-01 0.0439 0.144 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 4.30e-01 0.105 0.133 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 7.58e-01 -0.028 0.0908 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 5.86e-01 0.0612 0.112 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 519864 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0119 0.142 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 5.55e-01 0.0795 0.134 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 6.98e-01 0.0453 0.117 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 8.07e-02 -0.202 0.115 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 519887 sc-eQTL 3.56e-01 0.144 0.155 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 1.81e-01 -0.247 0.184 0.1 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 7.98e-02 -0.308 0.175 0.1 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0467 0.176 0.1 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 1.95e-01 -0.236 0.181 0.1 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 1.02e-01 0.223 0.136 0.1 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0512 0.158 0.1 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 4.21e-02 -0.311 0.152 0.1 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 7.87e-01 0.0279 0.103 0.1 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 4.91e-01 -0.087 0.126 0.1 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 519864 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0546 0.139 0.1 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 1.49e-01 0.207 0.143 0.1 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 1.13e-01 0.207 0.13 0.1 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0537 0.127 0.1 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 519887 sc-eQTL 7.16e-01 0.0569 0.156 0.1 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 9.91e-01 0.00158 0.138 0.104 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0435 0.0821 0.104 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 9.18e-01 0.013 0.126 0.104 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 519864 sc-eQTL 3.06e-01 -0.135 0.132 0.104 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 9.42e-01 0.0073 0.0997 0.104 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0175 0.12 0.104 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 2.00e-01 -0.131 0.102 0.104 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 519887 sc-eQTL 2.13e-01 -0.183 0.146 0.104 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 9.99e-01 0.000266 0.176 0.099 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 2.05e-01 -0.173 0.136 0.099 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0569 0.149 0.099 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 519864 sc-eQTL 3.07e-01 -0.139 0.136 0.099 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 4.34e-02 -0.277 0.136 0.099 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 1.80e-01 0.202 0.15 0.099 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 5.35e-01 0.11 0.177 0.099 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 519887 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0669 0.137 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 8.50e-01 0.0265 0.14 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0573 0.0972 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 3.04e-01 -0.129 0.125 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0651 0.129 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 7.22e-01 0.032 0.0897 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -79563 sc-eQTL 6.60e-01 0.0655 0.149 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 6.23e-01 0.0621 0.126 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -58927 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0952 0.146 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 4.98e-01 0.0873 0.129 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0528 0.0892 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 6.27e-01 0.0585 0.12 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 9.73e-02 -0.17 0.102 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 9.65e-01 0.00312 0.072 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -79563 sc-eQTL 1.73e-01 0.205 0.15 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 7.54e-01 0.0343 0.109 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -58927 sc-eQTL 3.91e-01 -0.111 0.128 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 8.91e-02 0.177 0.103 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 7.64e-01 0.0233 0.0775 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 9.13e-01 0.0102 0.0933 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 519864 sc-eQTL 7.27e-01 0.0477 0.136 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 6.60e-01 0.0494 0.112 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 3.79e-01 0.0878 0.0997 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0923 0.109 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 519887 sc-eQTL 2.04e-01 0.186 0.146 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 3.81e-01 -0.123 0.14 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 7.26e-01 0.0263 0.0749 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0676 0.12 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 519864 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0352 0.133 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0157 0.0829 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 4.47e-01 0.0923 0.121 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 9.37e-02 -0.175 0.104 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 519887 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0898 0.147 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 438926 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00518 0.131 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 808904 sc-eQTL 9.64e-01 0.00516 0.114 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 77355 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0109 0.112 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 224174 sc-eQTL 8.86e-01 0.0157 0.11 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 183690 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0546 0.0706 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -162213 sc-eQTL 2.33e-01 -0.122 0.102 0.106 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000146386 ABRACL 183690 eQTL 0.0271 0.0812 0.0367 0.0 0.0 0.105
ENSG00000164442 CITED2 -162213 eQTL 0.00174 0.112 0.0355 0.00943 0.00314 0.105


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000164440 \N -79563 6.15e-06 5.68e-06 6.33e-07 3.36e-06 1.74e-06 1.91e-06 8.29e-06 1.26e-06 4.5e-06 2.8e-06 7.55e-06 3.18e-06 9.82e-06 2.09e-06 9e-07 4.01e-06 2.72e-06 3.8e-06 1.65e-06 1.7e-06 2.55e-06 5.66e-06 4.87e-06 1.95e-06 9.05e-06 2.32e-06 2.72e-06 1.78e-06 6.12e-06 7.18e-06 2.91e-06 4.86e-07 8.25e-07 2.53e-06 2.07e-06 1.63e-06 1.21e-06 5.43e-07 1.2e-06 7.73e-07 8.81e-07 8.48e-06 6.85e-07 1.79e-07 6.98e-07 1.12e-06 9.99e-07 6.72e-07 5.96e-07