logo

Genes within 1Mb (chr6:139206443:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 4.63e-01 0.0666 0.0905 0.199 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 6.79e-01 0.0286 0.0691 0.199 B L1
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0763 0.088 0.199 B L1
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0816 0.0777 0.199 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 9.15e-01 0.00487 0.0458 0.199 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -85555 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0975 0.112 0.199 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 1.37e-01 0.105 0.0703 0.199 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -64919 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0396 0.0785 0.199 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 7.48e-02 0.179 0.0997 0.199 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 9.02e-01 0.0083 0.0674 0.199 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0759 0.0836 0.199 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 4.12e-01 -0.054 0.0658 0.199 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 1.24e-02 -0.12 0.0476 0.199 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 7.86e-01 0.0224 0.0825 0.199 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -33210 sc-eQTL 1.65e-01 -0.113 0.081 0.199 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 2.43e-01 0.129 0.11 0.199 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0248 0.0724 0.199 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 5.81e-02 -0.149 0.0785 0.199 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 6.11e-01 -0.038 0.0744 0.199 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0248 0.0424 0.199 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 9.29e-01 0.0072 0.0805 0.199 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -33210 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0453 0.0977 0.199 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 5.54e-01 0.0656 0.111 0.194 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0957 0.0776 0.194 DC L1
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 6.95e-01 0.0358 0.0913 0.194 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 513872 sc-eQTL 3.22e-01 0.101 0.101 0.194 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 7.79e-01 0.0253 0.0899 0.194 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 9.66e-01 0.00376 0.088 0.194 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 7.43e-01 0.0343 0.104 0.194 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 513895 sc-eQTL 3.27e-01 0.104 0.106 0.194 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 1.94e-01 0.103 0.0788 0.199 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00035 0.0547 0.199 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0605 0.072 0.199 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 513872 sc-eQTL 7.77e-01 0.0293 0.103 0.199 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 7.10e-01 0.0225 0.0605 0.199 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0789 0.0786 0.199 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 7.38e-01 0.0279 0.0833 0.199 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 513895 sc-eQTL 8.80e-01 0.0162 0.107 0.199 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 3.87e-01 0.0839 0.0968 0.197 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0378 0.0854 0.197 NK L1
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 7.72e-02 -0.148 0.0832 0.197 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 7.26e-01 -0.028 0.0798 0.197 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0695 0.0581 0.197 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0805 0.0773 0.197 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0271 0.115 0.199 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0473 0.0742 0.199 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 1.15e-01 -0.131 0.0828 0.199 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0349 0.0895 0.199 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0723 0.0584 0.199 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0337 0.0686 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 1.74e-01 -0.183 0.134 0.204 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 3.01e-01 -0.122 0.118 0.204 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 4.12e-02 -0.261 0.127 0.204 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 2.17e-01 0.166 0.134 0.204 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 2.93e-01 0.128 0.121 0.204 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -85555 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0607 0.104 0.204 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 1.06e-01 -0.212 0.13 0.204 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -64919 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0305 0.131 0.204 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00285 0.115 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 7.94e-01 0.0207 0.0795 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0205 0.0994 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 4.28e-01 0.085 0.107 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0445 0.0912 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -85555 sc-eQTL 5.54e-01 0.0663 0.112 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 7.21e-03 0.274 0.101 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -64919 sc-eQTL 3.08e-01 0.114 0.111 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 3.30e-01 0.112 0.115 0.198 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 1.44e-01 0.126 0.086 0.198 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 1.92e-01 -0.129 0.0989 0.198 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 2.78e-02 -0.236 0.106 0.198 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0914 0.0849 0.198 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -85555 sc-eQTL 8.06e-01 0.0267 0.109 0.198 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 7.33e-01 0.0342 0.0998 0.198 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -64919 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0862 0.122 0.198 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0259 0.11 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 5.65e-01 0.0444 0.0772 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0927 0.0956 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0615 0.0885 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 3.84e-01 0.054 0.0619 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -85555 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0444 0.116 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 5.27e-01 0.0534 0.0844 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -64919 sc-eQTL 8.39e-02 -0.191 0.11 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0255 0.108 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0428 0.0735 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0165 0.101 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0598 0.0965 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00442 0.0711 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -85555 sc-eQTL 9.58e-01 -0.006 0.113 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 3.51e-01 0.107 0.115 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -64919 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0844 0.105 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 4.72e-01 0.0787 0.109 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 9.14e-01 0.0102 0.0945 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 9.09e-01 0.0126 0.11 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 3.28e-01 -0.105 0.107 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 2.78e-01 -0.106 0.0974 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 4.37e-01 0.0763 0.098 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -33210 sc-eQTL 7.54e-01 0.0317 0.101 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 5.06e-01 0.0707 0.106 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 8.09e-01 0.016 0.0662 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0371 0.0825 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0958 0.0729 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 5.09e-02 -0.0959 0.0488 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 9.35e-01 0.00681 0.0837 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -33210 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0165 0.0846 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 1.33e-01 0.154 0.102 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 8.31e-01 0.0163 0.0763 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0897 0.0817 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 4.38e-01 0.0604 0.0776 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 6.96e-03 -0.16 0.0587 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0653 0.0888 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -33210 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0899 0.0958 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 1.99e-01 0.148 0.115 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0497 0.0784 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0354 0.0896 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 7.05e-01 -0.037 0.0976 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 8.01e-02 -0.122 0.0692 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 3.71e-01 0.0818 0.0913 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -33210 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0721 0.0955 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 3.20e-01 0.118 0.119 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0357 0.0848 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 5.61e-02 -0.165 0.0858 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 1.44e-02 -0.225 0.0913 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 1.67e-01 -0.104 0.0746 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0181 0.0873 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -33210 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0159 0.105 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 6.42e-01 0.0526 0.113 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 6.84e-01 0.0295 0.0723 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 1.79e-01 -0.117 0.0869 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0435 0.0875 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0305 0.0459 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 7.85e-01 0.0253 0.0928 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -33210 sc-eQTL 7.71e-01 0.0309 0.106 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 4.45e-01 0.0941 0.123 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 2.39e-01 -0.102 0.0862 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0661 0.0899 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 3.40e-02 0.198 0.0925 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 7.37e-01 0.0313 0.0933 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 5.97e-01 0.0507 0.0958 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -33210 sc-eQTL 6.01e-02 -0.19 0.1 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 3.63e-01 0.107 0.118 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0241 0.107 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0945 0.11 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 1.00e-01 -0.189 0.114 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 5.14e-02 -0.172 0.0878 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 9.86e-01 0.00163 0.0963 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -33210 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0205 0.11 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 8.39e-01 0.0252 0.124 0.201 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 2.44e-01 -0.1 0.0855 0.201 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0377 0.0939 0.201 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 4.75e-01 0.0724 0.101 0.201 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0365 0.0744 0.201 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 2.29e-01 -0.105 0.0873 0.201 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 9.57e-01 0.00612 0.114 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0735 0.0973 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 2.81e-02 -0.227 0.102 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 7.02e-01 -0.037 0.0967 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0473 0.0891 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 1.42e-01 -0.14 0.0951 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0186 0.104 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 6.12e-01 -0.047 0.0926 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 1.14e-01 -0.142 0.0892 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 5.96e-01 0.0451 0.085 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0616 0.0574 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0997 0.0765 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 2.07e-01 0.151 0.119 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0156 0.102 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0855 0.112 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0361 0.11 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 1.45e-01 -0.132 0.0903 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 6.88e-01 0.0389 0.0969 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 2.51e-01 0.125 0.108 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 9.70e-01 0.00356 0.0935 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0812 0.0933 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0369 0.0965 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 3.11e-01 -0.063 0.062 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 8.44e-01 -0.016 0.0812 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0836 0.133 0.2 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0668 0.118 0.2 PB L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0101 0.145 0.2 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 9.20e-01 -0.013 0.129 0.2 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0898 0.0897 0.2 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -85555 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000447 0.132 0.2 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0763 0.0988 0.2 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -64919 sc-eQTL 8.28e-01 -0.029 0.133 0.2 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 4.28e-03 -0.337 0.117 0.202 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0802 0.0946 0.202 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 1.68e-01 -0.129 0.0932 0.202 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0595 0.11 0.202 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0703 0.071 0.202 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 2.57e-01 -0.096 0.0845 0.202 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000116 0.113 0.199 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 8.25e-01 -0.017 0.077 0.199 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 8.89e-01 0.0131 0.0936 0.199 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0312 0.0969 0.199 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 1.73e-01 -0.113 0.0822 0.199 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 6.88e-01 -0.037 0.0921 0.199 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -33210 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0923 0.105 0.199 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 1.19e-01 0.173 0.11 0.193 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 1.42e-01 -0.117 0.0791 0.193 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 4.78e-01 0.0749 0.105 0.193 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 513872 sc-eQTL 6.79e-01 0.0428 0.103 0.193 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0363 0.119 0.193 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 1.43e-01 -0.142 0.0967 0.193 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 2.13e-01 0.128 0.103 0.193 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 513895 sc-eQTL 1.94e-01 0.148 0.113 0.193 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 6.04e-02 0.163 0.0861 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0121 0.0624 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0432 0.0717 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 513872 sc-eQTL 3.74e-01 0.0929 0.104 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 4.18e-01 0.0755 0.0931 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0206 0.0784 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 2.81e-01 0.0883 0.0818 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 513895 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0588 0.109 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 3.55e-01 0.0921 0.0992 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0673 0.0679 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0767 0.0839 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 513872 sc-eQTL 4.53e-01 0.0799 0.106 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 7.89e-01 -0.027 0.101 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 6.35e-02 -0.162 0.0869 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 1.00e+00 -1.25e-05 0.0867 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 513895 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00147 0.117 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 4.60e-02 0.273 0.136 0.188 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00148 0.131 0.188 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 8.47e-01 0.0252 0.131 0.188 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 5.03e-02 -0.264 0.134 0.188 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 4.91e-02 -0.199 0.1 0.188 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 7.31e-01 0.0404 0.117 0.188 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0248 0.117 0.191 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 5.57e-01 0.0461 0.0783 0.191 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0125 0.0958 0.191 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 513872 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0128 0.106 0.191 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 5.70e-01 -0.062 0.109 0.191 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0676 0.0995 0.191 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 4.51e-01 0.073 0.0966 0.191 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 513895 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00376 0.119 0.191 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0549 0.106 0.192 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 9.81e-01 0.00149 0.0634 0.192 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0314 0.0972 0.192 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 513872 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0227 0.102 0.192 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 4.19e-01 0.0623 0.0769 0.192 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 8.37e-02 -0.16 0.0921 0.192 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0907 0.0785 0.192 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 513895 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0911 0.113 0.192 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0752 0.129 0.186 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 1.24e-01 -0.155 0.1 0.186 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0184 0.11 0.186 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 513872 sc-eQTL 9.46e-01 0.00674 0.1 0.186 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0118 0.102 0.186 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 5.37e-01 0.0686 0.111 0.186 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 3.32e-01 0.127 0.13 0.186 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 513895 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0528 0.101 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0276 0.111 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00247 0.0767 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0956 0.0983 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 6.04e-01 -0.053 0.102 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0547 0.0707 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -85555 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0637 0.117 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 3.22e-01 0.0985 0.0992 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -64919 sc-eQTL 6.28e-01 0.056 0.116 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 9.10e-01 0.0115 0.101 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 6.33e-01 0.0336 0.0703 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 4.80e-01 -0.067 0.0947 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0846 0.0806 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 4.06e-01 0.0471 0.0566 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -85555 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0362 0.119 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 5.60e-01 0.0503 0.0861 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -64919 sc-eQTL 6.33e-02 -0.188 0.1 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 5.24e-02 0.155 0.0795 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 9.86e-01 0.00109 0.0598 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0642 0.0719 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 513872 sc-eQTL 2.93e-01 0.111 0.105 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 5.47e-01 0.0522 0.0865 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0725 0.0768 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 4.19e-01 0.0682 0.0842 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 513895 sc-eQTL 9.90e-01 0.00139 0.113 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 2.00e-01 -0.136 0.105 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 5.44e-01 0.0344 0.0565 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0121 0.0904 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 513872 sc-eQTL 5.17e-01 0.0651 0.1 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0111 0.0626 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 2.50e-01 -0.105 0.0913 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0848 0.0787 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 513895 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0381 0.111 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 432934 sc-eQTL 3.20e-01 0.101 0.101 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 802912 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0288 0.0878 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 71363 sc-eQTL 1.21e-01 -0.134 0.0858 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 218182 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0263 0.0843 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 177698 sc-eQTL 8.48e-02 -0.0936 0.054 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -168205 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0604 0.0786 0.196 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000279968 GVQW2 432791 eQTL 0.201 0.0723 0.0565 0.00102 0.0 0.217

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N 802912 2.91e-07 1.33e-07 4.69e-08 2.05e-07 9.24e-08 8.45e-08 1.81e-07 5.43e-08 1.45e-07 6.08e-08 1.63e-07 9.19e-08 1.59e-07 7.13e-08 6.18e-08 7.49e-08 4.09e-08 1.4e-07 6.75e-08 4.31e-08 1.22e-07 1.26e-07 1.5e-07 2.79e-08 1.68e-07 1.26e-07 1.13e-07 9.61e-08 1.2e-07 9.88e-08 1.08e-07 3.59e-08 3.66e-08 8.56e-08 4.84e-08 3.2e-08 5.74e-08 9.23e-08 6.39e-08 3.67e-08 5.44e-08 1.5e-07 5.22e-08 7.61e-09 3.83e-08 1.87e-08 1.22e-07 3.8e-09 4.8e-08